Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A12 F48 I1 R1
|
76 |
74.1 |
2532288 |
99.0% |
2506965 |
139.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,438,249 |
G→T |
R181R (CGG→CGT) |
ytfI → |
protein YtfI |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,438,249 | 0 | G | T | 98.8%
| 303.6
/ ‑2.7
| 86 | R181R (CGG→CGT) | ytfI | protein YtfI |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base T (43/42); total (43/43) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.42e-01 |
CGATTGTATGCCTGGGATATTCTACAGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGG > NC_000913/4438112‑4438385
|
cGATTGTATGCCTGGGATATTCTACAGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACgtgg < 1:708011/140‑1 (MQ=255)
tGTATGCCTGGGATATTCTACAGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTaaa > 1:163327/1‑140 (MQ=255)
tGCCTGGGATATTCTACAGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGC‑AATTAAAACGTGGTAAATTTGa > 2:1077143/1‑140 (MQ=255)
ccTGGGATATTCTACAGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGaa < 1:1068856/140‑1 (MQ=255)
ccTGGGATATTCTACAGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGaa > 2:173429/1‑140 (MQ=255)
gggATATTCTACAGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAATGGATTAAAGGTTATACTCACCAGGCGATTGGGGACGTTTCTTTAGGTTATGCCTTATTGCAGGTTATAGTAAGCAACTTTAAACGTGGTAAATTTGAACtt > 2:435536/1‑139 (MQ=255)
gggATATTCTACAGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTc > 2:697788/1‑140 (MQ=255)
gggATATTCTACAGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTc > 1:78010/1‑140 (MQ=255)
gggATATTCTACAGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTc > 1:234089/1‑140 (MQ=255)
gggATATTCTACAGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTc > 2:1217218/1‑140 (MQ=255)
gggATATTCTACAGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACATGGTAAATTTGAACTc > 1:379655/1‑140 (MQ=255)
gggATAGTCTACAGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGAGATTGGTGACGTGCCTTTAGATTATGCCTTATTGTAGGATATAGTAAGCAATTTAAAACGGGGTAAATTTGTACTc > 2:1143791/1‑140 (MQ=255)
ggATATTCTACAGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGaa < 2:224907/136‑1 (MQ=255)
ggATATTCTACAGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGaa > 1:224907/1‑136 (MQ=255)
ggATATTCTACAGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTcc < 1:562237/140‑1 (MQ=255)
ggATATTCTACAGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTcc < 1:1089192/140‑1 (MQ=255)
atatTCTACAGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCaa > 1:62129/1‑140 (MQ=255)
tatTCTACAGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCaaa < 1:60681/140‑1 (MQ=255)
tCTACAGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATAc > 1:600351/1‑140 (MQ=255)
tACAGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCa < 1:33273/140‑1 (MQ=255)
cAGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCagg > 2:1056446/1‑140 (MQ=255)
aaaaaaCAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCaggagg < 1:173429/140‑1 (MQ=255)
aaaaaaCAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCaggagg < 2:849161/140‑1 (MQ=255)
aaaaaaCAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCaggagg < 1:1154280/140‑1 (MQ=255)
aCAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGaa < 2:865650/140‑1 (MQ=255)
gTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTa < 2:62129/140‑1 (MQ=255)
gACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGa < 2:234089/140‑1 (MQ=255)
cATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAAt > 2:835131/1‑140 (MQ=255)
aTACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATg < 2:78010/140‑1 (MQ=255)
aCCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCg < 1:396680/140‑1 (MQ=255)
aCCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCAACAGGCGATTCGTGACGTGTCTTTAGATTATGGCTTATTGGAGCATCTAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACGCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATACg < 2:1215748/140‑1 (MQ=255)
ccGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCga < 2:313344/140‑1 (MQ=255)
cGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCgat < 2:37360/140‑1 (MQ=255)
cGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCg > 1:949714/1‑138 (MQ=255)
cGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCg < 2:949714/138‑1 (MQ=255)
agAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCgat < 2:11007/139‑1 (MQ=255)
gAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCgatg < 1:1248111/140‑1 (MQ=255)
gAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCgatg < 1:1143791/140‑1 (MQ=255)
aaaGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCgatgga < 2:163327/140‑1 (MQ=255)
aaaGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCgatgga < 2:735351/140‑1 (MQ=255)
aaaGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCgatgga < 1:1218294/140‑1 (MQ=255)
aaaGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCgatgga < 2:600351/140‑1 (MQ=255)
aaaGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGAAAATCGTAAGCAAATTAAATCGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCgatgga < 1:206195/140‑1 (MQ=255)
aaGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCgatggat > 1:138909/1‑140 (MQ=255)
gTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTAc < 1:1056446/140‑1 (MQ=255)
tataTTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGa > 2:488642/1‑140 (MQ=255)
tataTTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGa > 2:39799/1‑140 (MQ=255)
tataTTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGa > 2:336597/1‑140 (MQ=255)
tataTTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGa > 1:233954/1‑140 (MQ=255)
tCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGaaaaaa < 2:138909/140‑1 (MQ=255)
ccAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAaataa > 1:1190509/1‑140 (MQ=255)
ccAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAaataa > 1:326629/1‑140 (MQ=255)
cAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAaataat > 1:369038/1‑140 (MQ=255)
gCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATtga > 1:902744/1‑140 (MQ=255)
gtgtCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGc < 1:1217218/140‑1 (MQ=255)
tgtCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGC‑AATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCa < 1:1077143/140‑1 (MQ=255)
gtCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGACTTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCa < 2:1190509/140‑1 (MQ=255)
gtCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCa < 1:697788/140‑1 (MQ=255)
gtCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCa < 1:162725/140‑1 (MQ=255)
gtCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCa > 2:154099/1‑140 (MQ=255)
tCTTTAGGATAGGCCTTATTGGAGGATATAGCAGGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACCCCATTAACCAGGAGGTGGAATTAAAGATTGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCAt > 2:316185/1‑140 (MQ=255)
ttAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGt > 2:781074/1‑140 (MQ=255)
ttATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAg < 2:949320/140‑1 (MQ=255)
aTGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGaa > 2:263500/1‑140 (MQ=255)
aTGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGaa > 1:673077/1‑140 (MQ=255)
aTGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGaa > 2:355154/1‑140 (MQ=255)
tGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAAt > 1:481648/1‑140 (MQ=255)
tGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAAt > 2:691207/1‑140 (MQ=255)
ccTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCt > 2:333395/1‑140 (MQ=255)
tATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAg < 1:610460/132‑1 (MQ=255)
tATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAg > 2:610460/1‑132 (MQ=255)
aTTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTgg > 1:863073/1‑140 (MQ=255)
ggaTATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTg < 2:481648/140‑1 (MQ=255)
agaTATAGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTg < 2:673077/139‑1 (MQ=255)
tataGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTgcgc > 2:627216/1‑140 (MQ=255)
taGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCtt < 1:154099/140‑1 (MQ=255)
taGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCtt < 2:326629/140‑1 (MQ=255)
aGTAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTa > 2:60909/1‑140 (MQ=255)
tAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTg > 1:573015/1‑132 (MQ=255)
tAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTg < 2:573015/132‑1 (MQ=255)
tAAGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTaaa > 1:170464/1‑140 (MQ=255)
aaGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTaaaa > 1:889057/1‑140 (MQ=255)
aGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAAt > 1:871568/1‑140 (MQ=255)
aGCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAAt < 1:762761/140‑1 (MQ=255)
gCAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATc > 1:675981/1‑140 (MQ=255)
cAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCt > 2:551118/1‑140 (MQ=255)
cAAATTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCt > 1:271171/1‑140 (MQ=255)
aTTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATg > 2:809311/1‑140 (MQ=255)
aTTAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGATTAAAATCTATg < 1:435536/140‑1 (MQ=255)
ttAAAACGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATgg < 2:245644/140‑1 (MQ=255)
aCGTGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAgggg < 1:888316/140‑1 (MQ=255)
|
CGATTGTATGCCTGGGATATTCTACAGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGG > NC_000913/4438112‑4438385
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
