Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A16 F48 I1 R1
|
61 |
131.2 |
4447032 |
99.1% |
4407008 |
139.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,232,170 |
G→T |
T355N (ACC→AAC) |
lysC ← |
aspartate kinase III |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,232,170 | 0 | G | T | 100.0%
| 372.8
/ NA
| 108 | T355N (ACC→AAC) | lysC | aspartate kinase III |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (38/70); total (38/70) |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
CAGGCTTTTGACAGGTCATTGCCAATCAACGCGACCAGCGCCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCA > NC_000913/4232035‑4232305
|
cAGGCTTTTGACAGGTCATTGCCAATCAACGCGACCAGCGCCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATc < 2:817985/140‑1 (MQ=255)
aGGCTTTTGACAGGTCATTGCCAATCAACGCGACCAGCGCCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCa < 2:2011227/140‑1 (MQ=255)
aGGCTTTTGACAGGTCATTGCCAATCAACGCGACCAGCGCCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCa > 2:579196/1‑140 (MQ=255)
aGGCTTTTGACAGGTCATTGCCAATCAACGCGACCAGCGCCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCa < 1:1546300/140‑1 (MQ=255)
aGGCTTTTGACAGGTCATTGCCAATCAACGCGACCAGCGCCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCa < 1:147045/140‑1 (MQ=255)
tttGACAGGTCATTGCCAATCAACGCGACCAGCGCCAGACCTTCTTCCGCCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGt > 2:579894/1‑140 (MQ=255)
ggTCATTGCCAATCAACGCGACCAGCGCCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGcc > 2:1236747/1‑140 (MQ=255)
ggTCATTGCCAATCAACGCGACCAGCGCCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGcc > 2:143846/1‑140 (MQ=255)
ggTCATTGCCAATCAACGCGACCAGCGCCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGcc > 1:778894/1‑140 (MQ=255)
tCATTGCCAATCAACGCGACCAGCGCCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCAc > 2:2123008/1‑140 (MQ=255)
aTTGCCAATCACCGCGACCAGCGCCAGACCTCCTTCCACCTCCA‑CCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCt < 2:1766695/140‑1 (MQ=255)
aTTGCCAATCAACGCGACCAGCGCCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGc < 1:888983/140‑1 (MQ=255)
aTTGCCAATCAACGCGACCAGCGCCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGc > 1:2128200/1‑140 (MQ=255)
ttGCCAATCAACGCGACCAGGGCCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCt < 2:2203205/140‑1 (MQ=255)
ttGCCAATCAACGCGACCAGCGCCAGTCCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCt < 2:1510974/140‑1 (MQ=255)
ttGCCAATCAACGCGACCAGCGCCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCt < 1:1473350/140‑1 (MQ=255)
ttGCCAATCAACGCGACCAGCGCCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCt < 2:2156621/140‑1 (MQ=255)
ttGCCAATCAACGCGACCAGCGCCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCt < 2:1703951/140‑1 (MQ=255)
atGCCAATCAACGCGACCAGCGCCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCt < 2:1777808/139‑1 (MQ=255)
tGCCAATCAACGCGACCAGCGCCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTc < 1:1850465/140‑1 (MQ=255)
aTCAACGCGACCAGCGCCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACttt > 2:2026154/1‑139 (MQ=255)
tCAACGCGACCAGCGCCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCt < 2:623465/140‑1 (MQ=255)
aaaCGCGACCAGCGCCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTg < 2:185006/139‑1 (MQ=255)
cgcgACCAGCGCCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGAct > 2:621757/1‑139 (MQ=255)
cgcgACCAGCGCCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGAct > 2:85007/1‑139 (MQ=255)
cgcgACCAGCGCCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACg > 1:1698906/1‑140 (MQ=255)
cgcgACCAGCGCCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACg < 2:1942098/140‑1 (MQ=255)
cgcgACCAGCGCCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACg < 1:621757/140‑1 (MQ=255)
agcgACCTGCGCCAGACCTTCTTCCCCCTCCCCCCGACACAGTCCGGACAGCTCCATCTGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACg < 2:1737964/139‑1 (MQ=255)
agcgACCAGCGCCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACg < 2:1777329/139‑1 (MQ=255)
gcgACCAGCGCCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACgt < 1:1236747/140‑1 (MQ=255)
cgACCAGCGCCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACgtg < 1:85007/140‑1 (MQ=255)
cgACCAGCGCCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACgtg < 2:333788/140‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGAt < 2:931038/140‑1 (MQ=255)
gcgcCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGAtt < 1:343620/140‑1 (MQ=255)
gcCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACgtg < 2:411745/132‑1 (MQ=255)
gcCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACgtg > 1:411745/1‑132 (MQ=255)
cAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGt < 1:380667/140‑1 (MQ=255)
cAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGt < 2:1877453/140‑1 (MQ=255)
cAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGt < 2:2128200/140‑1 (MQ=255)
aGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTc < 1:1003444/140‑1 (MQ=255)
aGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTc < 2:934790/140‑1 (MQ=255)
aGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTc < 1:139555/140‑1 (MQ=255)
aGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTc < 1:2123008/140‑1 (MQ=255)
aGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTc < 2:551034/140‑1 (MQ=255)
gACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCt > 2:73585/1‑140 (MQ=255)
aCCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTa < 2:474854/140‑1 (MQ=255)
ttcttcCACCTCCGCCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCg < 1:709072/140‑1 (MQ=255)
ttcttcCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCg < 1:579100/140‑1 (MQ=255)
ttcttcCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCg < 2:1822974/140‑1 (MQ=255)
ttcttcCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCg < 2:1151655/140‑1 (MQ=255)
ttcttcCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCg < 1:819218/140‑1 (MQ=255)
ttcttcCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCg < 2:778894/140‑1 (MQ=255)
ttcttcCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCg < 1:637686/140‑1 (MQ=255)
ttcttcCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCg < 1:579196/140‑1 (MQ=255)
ttcttcCACCTCAGCCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAAACGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCg < 1:715605/140‑1 (MQ=255)
cctccaccCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAAtatta > 1:1889240/1‑140 (MQ=255)
cctccaccCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAAtatta > 1:1869004/1‑140 (MQ=255)
accCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCcg > 2:203616/1‑140 (MQ=255)
accCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTAGCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCcg > 1:2073002/1‑140 (MQ=255)
acacAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGa > 1:1085225/1‑140 (MQ=255)
cacaGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAg < 1:2026154/140‑1 (MQ=255)
cacaGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACG‑‑TCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAgg > 2:350661/1‑139 (MQ=255)
cacaGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACG‑‑TCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAgg < 1:350661/139‑1 (MQ=255)
tGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTTTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCGACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGc > 2:124581/1‑140 (MQ=255)
tGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGc > 2:25981/1‑140 (MQ=255)
tGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGc > 2:575662/1‑140 (MQ=255)
tGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGc > 2:936305/1‑140 (MQ=255)
tGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGc > 2:1083386/1‑140 (MQ=255)
tGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGc > 1:1647722/1‑140 (MQ=255)
gCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGcc > 1:2126536/1‑140 (MQ=255)
aaaGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGaaa > 2:898594/1‑140 (MQ=255)
aaaGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGaaa > 2:66091/1‑140 (MQ=255)
aGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAAc > 1:1676299/1‑140 (MQ=255)
tCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTc < 1:145744/140‑1 (MQ=255)
tCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCcgcg > 2:2139000/1‑140 (MQ=255)
tCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCcgcg < 1:2039016/140‑1 (MQ=255)
agcagAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAg < 2:2073002/140‑1 (MQ=255)
gagaTTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGaaa > 2:1991600/1‑140 (MQ=255)
gTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCgaga < 2:525314/140‑1 (MQ=255)
gTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCgaga > 2:845785/1‑140 (MQ=255)
tCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGaa < 1:2152798/140‑1 (MQ=255)
cAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAAt < 1:25981/140‑1 (MQ=255)
aaCGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATgcag < 1:1776587/140‑1 (MQ=255)
aaCGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATgcag < 1:1991600/140‑1 (MQ=255)
aaCGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATgcag < 1:1083386/140‑1 (MQ=255)
aaCGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATgcag < 2:101843/140‑1 (MQ=255)
ccAGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAg < 1:466720/140‑1 (MQ=255)
aGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGc < 2:292235/140‑1 (MQ=255)
aGTGGAGGTTGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGc < 1:1167586/140‑1 (MQ=255)
tGAACCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATGAAGTCTACCGAAATATTATTCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAg > 2:1133830/1‑140 (MQ=255)
aaCCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTg > 2:556310/1‑140 (MQ=255)
aaCCGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTg < 1:845785/140‑1 (MQ=255)
ccGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAg < 1:2139000/140‑1 (MQ=255)
ccGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAg < 1:2185237/140‑1 (MQ=255)
ccGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAg < 2:2210561/140‑1 (MQ=255)
ccGGTGTTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAg < 2:1134700/140‑1 (MQ=255)
ggtgttATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCa < 1:575662/140‑1 (MQ=255)
ggtgttATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCa < 1:1973815/140‑1 (MQ=255)
ggtgttATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCa < 2:2126536/140‑1 (MQ=255)
|
CAGGCTTTTGACAGGTCATTGCCAATCAACGCGACCAGCGCCAGACCTTCTTCCACCTCCACCCGACACAGTGCGGAAAGCTCCATCAGCAGAGATTGCGTCAGCAACGTATCGCCAGTGGAGGTTGAACCGGTGGTATCAAGGGTTAATGCCACGCTCACTTCTGACGTGGTGATTAAGTCTACCGAAATATTATGCCGCGCGAGGATGCCGAAAACTTCCGCGAGGAAACCGCGAGAATGCAGCATATTCAGGCTGTGCAAAGTGAGCA > NC_000913/4232035‑4232305
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
