Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F48 I1 R1
|
66 |
101.5 |
3442112 |
98.9% |
3404248 |
139.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,338,167 |
G→T |
L99M (CTG→ATG) |
mlaD ← |
intermembrane phospholipid transport system, substrate binding protein MlaD |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,338,167 | 0 | G | T | 100.0%
| 320.0
/ NA
| 91 | L99M (CTG→ATG) | mlaD | intermembrane phospholipid transport system, substrate binding protein MlaD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (39/52); total (39/52) |
TTCCAGCACCATCGCAGACTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAGCGTAATATCCGCCACCCGACCCACAACAACGCCACCAATACTGACCGGAGAGCGCGC > NC_000913/3338030‑3338302
|
ttCCAGCACCATCGCAGACTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCg < 2:1086780/140‑1 (MQ=255)
ttCCAGCACCATCGCAGACTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCg > 1:1254187/1‑140 (MQ=255)
ccAGCACCATCGCAGACTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGaa < 1:1564516/140‑1 (MQ=255)
gCACCATCGCAGACTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCACCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTg < 2:549275/140‑1 (MQ=255)
aCCATCGCAGACTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGt < 1:1083296/140‑1 (MQ=255)
aCCATCGCAGACTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGt > 1:43227/1‑140 (MQ=255)
aCCATCGCAGACTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGAATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGt < 1:471739/140‑1 (MQ=255)
aCCATCGCAGACTTAGTGTCCTGAAGTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGt < 2:1637496/140‑1 (MQ=255)
cATCGCAGACTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTAt < 2:196389/140‑1 (MQ=255)
cATCGCAGACTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTAt > 2:1090167/1‑140 (MQ=255)
tCGCAGACTTAGTGTCCTGTATTGTAGCACCATCCTTCAGGATAGCTGTCCCCAGTTCCGGGACTGCAATACCGGCGTTTAGTACCAGATATGGTTCCCCCAGCAGGCCTGAATTACGTTTTCTCATCGGACTGTTATCt > 2:1349578/1‑140 (MQ=255)
tCGCAGACTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCt > 1:34456/1‑140 (MQ=255)
tCGCAGACTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAAATGGTATCt > 2:1188071/1‑140 (MQ=255)
gCAGACTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTgg < 1:15485/140‑1 (MQ=255)
gACTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAAt < 1:881791/140‑1 (MQ=255)
gACTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAAt < 2:781478/140‑1 (MQ=255)
gACTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAAt < 2:43227/140‑1 (MQ=255)
gACTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAAt < 2:34456/140‑1 (MQ=255)
gACTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCC‑GGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAAtg < 1:1005939/140‑1 (MQ=255)
aCTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAAtg < 2:285470/140‑1 (MQ=255)
aCTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAAtg < 1:1605520/140‑1 (MQ=255)
cTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAAtgt < 1:259157/140‑1 (MQ=255)
cTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAAtgt < 1:247350/140‑1 (MQ=255)
tgtCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTta < 1:446757/140‑1 (MQ=255)
tCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTtata > 1:1682290/1‑140 (MQ=255)
ccTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATaa < 2:666737/140‑1 (MQ=255)
tGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGTCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAAtgt > 1:759155/1‑130 (MQ=255)
tGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAAtgt < 2:759155/130‑1 (MQ=255)
tGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACg < 1:1043877/140‑1 (MQ=255)
tGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACg > 2:1553509/1‑140 (MQ=255)
tGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACg < 1:1272186/140‑1 (MQ=255)
aaTTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACgtt > 2:1390769/1‑140 (MQ=255)
aTCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCa < 2:1682290/140‑1 (MQ=255)
aTAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTAcgcg < 1:1349578/140‑1 (MQ=255)
aTAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTAcgcg < 2:1254187/140‑1 (MQ=255)
aTAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTAcgcg < 1:423915/140‑1 (MQ=255)
aTAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTAcgcg < 1:1203720/140‑1 (MQ=255)
aGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTAcgcgcg > 1:1701520/1‑140 (MQ=255)
aGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTAcgcgcg > 1:1536155/1‑140 (MQ=255)
aGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTAcgcgcg > 1:474397/1‑140 (MQ=255)
cAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCg < 1:293451/129‑1 (MQ=255)
cAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCg > 2:293451/1‑129 (MQ=255)
cAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGc > 2:1342742/1‑140 (MQ=255)
tCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGa > 1:110679/1‑140 (MQ=255)
cccAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATa > 2:52953/1‑140 (MQ=255)
aGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCTGCGTTACGCGCGGCAGATAGGt > 1:1438670/1‑140 (MQ=255)
aGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGt > 2:1154507/1‑140 (MQ=255)
ggTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCggg < 1:357770/140‑1 (MQ=255)
ggTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCggg < 1:241913/140‑1 (MQ=255)
ggTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCggg < 1:1360065/140‑1 (MQ=255)
ggTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCggg > 2:241913/1‑140 (MQ=255)
ggTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCggg > 2:270215/1‑140 (MQ=255)
gTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGt < 1:1090167/140‑1 (MQ=255)
tCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTc < 1:1016780/140‑1 (MQ=255)
tCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTc < 1:551473/140‑1 (MQ=255)
ttCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCa < 1:1538875/140‑1 (MQ=255)
tCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAg > 2:354586/1‑140 (MQ=255)
tCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAg > 2:444328/1‑140 (MQ=255)
aCGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAGCGTAATATc > 2:495706/1‑140 (MQ=255)
gTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAGCGTAATATCCg < 2:110679/140‑1 (MQ=255)
gTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAGCGTAATATCCg < 1:1390769/140‑1 (MQ=255)
ttAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAGCGTAATATCCGcc < 2:1179289/140‑1 (MQ=255)
aTGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAGCGTAATATCCGCCAcc < 1:495706/140‑1 (MQ=255)
aTGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAGCGTAATATCCGCCAcc < 2:474397/140‑1 (MQ=255)
aTGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAGCGTAATATCCGCCAcc < 1:1154507/140‑1 (MQ=255)
ttGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAGCGTAATATCCGCCACCCGACCCacaa < 1:354586/140‑1 (MQ=255)
tCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAGCGTAATATCCGCCACCCGACCCACaacaac < 1:52953/140‑1 (MQ=255)
tCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAGCGTAATATCCGCCACCCGACCCACaacaac < 2:129445/140‑1 (MQ=255)
cccAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAGCGTAATATCCGCCACCCGACCCACaacaac < 2:1433592/137‑1 (MQ=255)
cccAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAGCGTAATATCCGCCACCCGACCCACaacaac > 1:1433592/1‑137 (MQ=255)
cccAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAGCGTAATATCCGCCACCCGACCCACAACAACGcc > 1:826764/1‑140 (MQ=255)
ccAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAGCGTAATATCCGCCACCCGACCCACAACAACGcca > 1:1099573/1‑140 (MQ=255)
ccAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAGCGTAATATCCGCCACCCGACCCACAACAACGcca > 2:413378/1‑140 (MQ=255)
ccAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAGCGTAACATCCGCCACCCGACCCACAACAACGcca > 1:1657516/1‑140 (MQ=255)
cagcagGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAGCGTAATATCCGCCACCCGACCCACAACAACGccac < 2:812173/140‑1 (MQ=255)
cagcagGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAGCGTAATATCCGCCACCCGACCCACAACAACGccac < 1:1342742/140‑1 (MQ=255)
cagcagGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAGCGTAATATCCGCCACCCGACCCACAACAACGccac < 1:1030188/140‑1 (MQ=255)
cagcagGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAGCGTAATATCCGCCACCCGACCCACAACAACGccac < 1:1553509/140‑1 (MQ=255)
cagcagGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAGCGTAATATCCGCCACCCGACCCACAACAACGccac < 1:444328/140‑1 (MQ=255)
gcagGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAGCGTAATATCCGCCACCCGACCCACAACAACGccacca > 2:718886/1‑140 (MQ=255)
cagGCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAGCGTAATATCCGCCACCCGACCCACAACAACGCCACCaa > 2:1143638/1‑140 (MQ=255)
gCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAGCGTAATATCCGCCACCCGACCCACAACAACGCCACCAATAc > 1:1398655/1‑140 (MQ=255)
gCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAGCGTAATATCCGCCACCCGACCCACAACAACGCCACCAATAc > 2:249046/1‑140 (MQ=255)
gCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAGCGTAATATCCGCCACCCGACCCACAACAACGCCACCAATAc > 2:617989/1‑140 (MQ=255)
gCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAGCGTAATATCCGCCACCCGACCCACAACAACGCCACCAATAc > 2:652184/1‑140 (MQ=255)
gCCGGAAGTACGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAGCGTAATATCCGCCACCCGACCCACAACAACGCCACCAATAc > 2:114936/1‑140 (MQ=255)
cGAATGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAGCGTAATATCCGCCACCCGACCCACAACAACGCCACCAATACTGACCGgaga > 1:1416074/1‑140 (MQ=255)
aTGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAGCGTAATATCCGCCACCCGACCCACAACAACGCCACCAATACTGACCGGAGAgcg < 2:1438670/140‑1 (MQ=255)
aTGCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAGCGTAATATCCGCCACCCGACCCACAACAACGCCACCAATACTGACCGGAGAgcg < 1:1045303/140‑1 (MQ=255)
gCTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAGCGTAATATCCGCCACCCGACCCACAACAACGCCACCAATACTGACCGGAGAgcgcg > 2:375521/1‑140 (MQ=255)
cTCATCGCATTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAGCGTAATATCCTCCACCCGACCCACAACAACGCCACCATTACTGACCGGAGAgcgcgc > 2:402484/1‑140 (MQ=255)
cTCATCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAGCGTAATATCCGCCACCCGACCCACAACAACGCCACCAATACTGACCGGAGAgcgcgc > 2:1420052/1‑140 (MQ=255)
|
TTCCAGCACCATCGCAGACTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAGGTTTTCGGGTCCAGCGTAATATCCGCCACCCGACCCACAACAACGCCACCAATACTGACCGGAGAGCGCGC > NC_000913/3338030‑3338302
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
