Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A19 F48 I1 R1
|
83 |
81.6 |
2760494 |
99.1% |
2735649 |
139.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,021,441 |
G→T |
G42G (GGG→GGT) |
xdhD → |
fused putative xanthine/hypoxanthine oxidase: molybdopterin‑binding subunit and Fe‑S binding subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,021,441 | 0 | G | T | 100.0%
| 351.8
/ NA
| 98 | G42G (GGG→GGT) | xdhD | fused putative xanthine/hypoxanthine oxidase: molybdopterin‑binding subunit and Fe‑S binding subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (55/43); total (55/43) |
GGAAGCCGTATGATCATCCACTTTACTTTAAATGGCGCGCCTCAGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCA > NC_000913/3021307‑3021575
|
ggaAGCCGTATGATCATCCACTTTACTTTAAATGGCGCGCCTCAGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGc < 1:287717/140‑1 (MQ=255)
ggaAGCCGTATGATCATCCACTTTACTTTAAATGGCGCGCCTCAGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGc < 1:124134/140‑1 (MQ=255)
gaAGCCGTATGATCATCCACTTTACTTTAAATGGCGCGCCTCAGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGcc < 2:59975/140‑1 (MQ=255)
gTATGATCATCCACTTTACTTTAAATGGCGCGCCTCAGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCt > 2:951388/1‑140 (MQ=255)
tATGATCATCCACTTTACTTTAAATGGCGCGCCTCAGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTg < 2:122521/140‑1 (MQ=255)
tATGATCATCCACTTTACTTTAAATGGCGCGCCTCAGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTg < 1:951388/140‑1 (MQ=255)
aTGATCATCCACTTTACTTTAAATGGCGCGCCTCAGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGa < 1:189654/140‑1 (MQ=255)
atcCACTTTACTTTAAATGGCGCGCCTTAGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCaat > 2:514642/1‑140 (MQ=255)
atcCACTTTACTTTAAATGGCGCGCCTCAGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCaat > 1:698999/1‑140 (MQ=255)
atcCACTTTACTTTAAATGGCGCGCCTCAGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCaat > 2:598958/1‑140 (MQ=255)
tcCACTTTACTTTAAATGGCGCGCCTCAGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCaata > 1:442374/1‑140 (MQ=255)
tcCACTTTACTTTAAATGGCGCGCCTCAGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCaata > 2:959266/1‑140 (MQ=255)
ctttactttaAATGGCGCGCCTCAGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCt < 1:91412/140‑1 (MQ=255)
ctttactttaAATGGCGCGCCTCAGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCt < 2:322204/140‑1 (MQ=255)
tttactttaAATGGCGCGCCTCAGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCtt > 2:1202860/1‑140 (MQ=255)
ttactttaAATGGCGCGCCTCAGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGTATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCttt < 2:1074008/140‑1 (MQ=255)
ttactttaAATGGCGCGCCTCAGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATACACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCttt < 2:169907/140‑1 (MQ=255)
ctttaAATGGCGCGCCTCAGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATACACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAAc > 1:746308/1‑140 (MQ=255)
aaTGGCGCGCCTCAGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTaa < 1:567788/140‑1 (MQ=255)
aaTGGCGCGCCTCAGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTaa < 1:1202860/140‑1 (MQ=255)
aaTGGCGCGCCTCAGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTaa > 2:400845/1‑140 (MQ=255)
aaTGGCGCGCCTCAGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTaa > 2:871312/1‑140 (MQ=255)
aaTGGCGCGCCTCAGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTaa > 2:227916/1‑140 (MQ=255)
aaTGGCGCGCCTCAGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTaa > 1:880214/1‑140 (MQ=255)
cgcgcCTCAGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATct > 2:850059/1‑139 (MQ=255)
cgcgcCTCAGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCg > 1:929495/1‑140 (MQ=255)
cgcgcCTCAGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCg > 1:325199/1‑140 (MQ=255)
cgcgcCTCAGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCg > 1:950082/1‑140 (MQ=255)
cgcgcCTCAGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCg > 2:1056605/1‑140 (MQ=255)
cgcgcCTCAGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCAGATGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCg > 1:1020833/1‑140 (MQ=255)
gcCTCAGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTa < 1:771857/140‑1 (MQ=255)
cTCAGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAAc < 1:144604/140‑1 (MQ=255)
tCAGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAAcg < 1:36347/140‑1 (MQ=255)
tCAGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAAcg < 2:1152254/140‑1 (MQ=255)
aGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAAcgcg < 1:598958/140‑1 (MQ=255)
aGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAAcgcg < 2:1045413/140‑1 (MQ=255)
aGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTcc < 2:664370/140‑1 (MQ=255)
cTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCtt > 1:666069/1‑140 (MQ=255)
aaCCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTgt > 2:1045501/1‑139 (MQ=255)
aaCCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGc > 1:956102/1‑140 (MQ=255)
aaCCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGc > 1:1000429/1‑140 (MQ=255)
cGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTa > 1:257838/1‑140 (MQ=255)
ttAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTAtt > 2:688525/1‑140 (MQ=255)
aTCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGcc > 2:810132/1‑140 (MQ=255)
aTCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGcc > 2:995341/1‑140 (MQ=255)
tCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCg < 2:1367926/140‑1 (MQ=255)
tCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCg > 1:651603/1‑140 (MQ=255)
tCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCg < 2:268054/140‑1 (MQ=255)
tCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCg < 2:666069/140‑1 (MQ=255)
tCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCg < 2:950082/140‑1 (MQ=255)
ccAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGc < 1:871312/140‑1 (MQ=255)
ccAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGc < 1:810132/140‑1 (MQ=255)
cAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGca < 2:1335814/140‑1 (MQ=255)
aGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGcac < 1:959266/140‑1 (MQ=255)
ggCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACGGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGcaca > 1:297104/1‑140 (MQ=255)
ggCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGcaca > 2:468881/1‑140 (MQ=255)
ggCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGca > 2:452119/1‑138 (MQ=255)
ggCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGca < 1:452119/138‑1 (MQ=255)
gCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAg < 1:1180343/140‑1 (MQ=255)
gCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAg < 2:482257/140‑1 (MQ=255)
gCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAg < 2:196480/140‑1 (MQ=255)
aaaaCGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTa < 2:929495/140‑1 (MQ=255)
aaCGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTaga < 2:956102/140‑1 (MQ=255)
aaCGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTaga > 1:414246/1‑140 (MQ=255)
aaCGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTaga > 1:1083984/1‑140 (MQ=255)
gCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAgg < 2:785232/140‑1 (MQ=255)
gCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAgg < 2:1155907/140‑1 (MQ=255)
gCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAgg < 1:893932/140‑1 (MQ=255)
cAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGc < 1:1045501/140‑1 (MQ=255)
aaaaGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCa < 1:109688/140‑1 (MQ=255)
aaaaGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCa < 2:442374/140‑1 (MQ=255)
gAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAAtct > 1:217542/1‑140 (MQ=255)
gAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAAtct > 1:1157542/1‑140 (MQ=255)
cACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTggg > 2:402579/1‑140 (MQ=255)
cACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTggg < 1:1056605/140‑1 (MQ=255)
tGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAAt > 1:554435/1‑140 (MQ=255)
tGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAAt > 2:1182967/1‑140 (MQ=255)
tGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAAt > 2:1005380/1‑140 (MQ=255)
tGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAAt > 1:1245787/1‑140 (MQ=255)
tACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATgg > 1:904460/1‑140 (MQ=255)
aCGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGa < 2:600283/140‑1 (MQ=255)
cGCAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGaa < 1:688525/140‑1 (MQ=255)
cAACAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCTCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACg > 1:1127775/1‑140 (MQ=255)
aCAGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAg > 2:106402/1‑140 (MQ=255)
aGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGtt > 1:138629/1‑140 (MQ=255)
aGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGtt > 2:702241/1‑140 (MQ=255)
aGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGtt > 2:8490/1‑140 (MQ=255)
aGTGATGATGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGtt > 2:425364/1‑140 (MQ=255)
tgatgaTGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTaa > 2:319334/1‑140 (MQ=255)
tgatgaTGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTaa > 1:726777/1‑140 (MQ=255)
tgatgaTGGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCGCTGGGCAAATGGAACGAGTTaa > 1:1151085/1‑140 (MQ=255)
atgatgGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGt > 1:147530/1‑140 (MQ=255)
atgatgGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGt > 2:508481/1‑140 (MQ=255)
atgatgGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGt > 1:1007584/1‑140 (MQ=255)
atgGTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTg > 1:886508/1‑140 (MQ=255)
ggTTTCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGATTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGt > 2:302983/1‑140 (MQ=255)
ttCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCa > 1:306473/1‑140 (MQ=255)
ttCGGTTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCa < 2:1007584/140‑1 (MQ=255)
|
GGAAGCCGTATGATCATCCACTTTACTTTAAATGGCGCGCCTCAGGAGCTAACCGTTAATCCAGGCGAAAACGTGCAAAAGCTGTTGTTTAACATGGGAATGCACTCTGTACGCAACAGTGATGATGGTTTCGGGTTTGCCGGTTCTGACGCAATAATCTTTAACGGTAATATCGTTAACGCGTCCTTGCTTATTGCCGCACAGTTAGAGAAGGCAGATATTCGTACCGCAGAATCTCTGGGCAAATGGAACGAGTTAAGTCTGGTTCA > NC_000913/3021307‑3021575
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
