Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A19 F48 I1 R1
|
83 |
81.6 |
2760494 |
99.1% |
2735649 |
139.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,431,245 |
C→A |
G57G (GGG→GGT) |
tsaC ← |
threonylcarbamoyl‑AMP synthase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,431,245 | 0 | C | A | 98.6%
| 250.9
/ ‑5.7
| 73 | G57G (GGG→GGT) | tsaC | threonylcarbamoyl‑AMP synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base A (45/27); minor base G (0/1); total (45/28) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.84e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GTTGTCGCAGGCGCGGGAAAGACAAAGGTGACAGGACCTGGCCAGCGGGAAAAAATGGTTTCACGCTGCACGTCAGTCAACATGGTGTCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGCCCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGTTGGATAGGCGATGACACGTTCTTCATTGAGAACATC > NC_000913/3431108‑3431373
|
gttgtCGCAGGCGCGGGAAAGACAAAGGTGACAGGACCTGGCCAGCGGGAAAAAATGGTTTCACGCTGCACGTCAGTCAACATGGTGTCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGacc > 1:1242216/1‑140 (MQ=255)
gttgtCGCAGGCGCGGGAAAGACAAAGGTGACAGGACCTGGCCAGCGGGAAAAAATGGTTTCACGCTGCACGTCAGTCAACATGGTGTCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGacc < 2:372411/140‑1 (MQ=255)
ggCGCGGGAAAGACAAAGGTGACAGGACCTGGCCAGCGGGAAAAAATGGTTTCACGCTGCACGTCAGTCAACATGGTGTCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAAc > 1:920558/1‑140 (MQ=255)
ggCGCGGGAAAGACAAAGGTGACAGGACCTGGCCAGCGGGAAAAAATGGTTTCACGCTGCACGTCAGTCAACATGGTGTCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAAc > 2:226105/1‑140 (MQ=255)
gggAAAGACAAAGGTGACAGGACCTGGCCAGCGGGAAAAAATGGTTTCACGCTGCACGTCAGTCAACATGGTGTCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGAc < 1:226105/140‑1 (MQ=255)
ggAAAGACAAAGGTGACAGGACCTGGCCAGCGGGAAAAAATGGTTTCACGCTGCACGTCAGTCAACATGGTGTCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACg < 1:865125/140‑1 (MQ=255)
aaCAAAGGTGACAGGACCTGGCCAGCGGGAAAAAATGGTTTCACGCTGCACGTCAGTCAACATGGTGTCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGtt < 2:451992/139‑1 (MQ=255)
ggTGACAGGACCTGGCCAGCGGGAAAAAATGGTTTCACGCTGCACGTCAGTCAACATGGTGTCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACt > 2:842023/1‑140 (MQ=255)
aCAGGACCTGGCCAGCGGGAAAAAATGGTTTCACGCTGCACGTCAGTCAACATGGTGTCATCAATATATGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCaa < 2:387301/140‑1 (MQ=255)
aCAGGACCTGGCCAGCGGGAAAAAATGGTTTCACGCTGCACGTCAGTCAACATGGTGTCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCaa > 2:469520/1‑140 (MQ=255)
cAGGACCTGGCCAGCGGGAAAAAATGGTTTCACGCTGCACGTCAGTCAACATGGTGTCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAAc > 2:1246747/1‑140 (MQ=255)
gACCTGGCCAGCGGGAAAAAATGGTTTCACGCTGCACGTCAGTCAACATGGTGTCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGt < 1:1190405/140‑1 (MQ=255)
gCCAGCGGGAAAAAATGGTTTCACGCTGCACGTCAGTCAACATGGTGTCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATc > 2:595512/1‑140 (MQ=255)
cGGGAAAAAATGGTTTCACGCTGCACGTCAGTCAACATGGTGTCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCActgc > 1:423342/1‑140 (MQ=255)
cGGGAAAAAATGGTTTCACGCTGCACGTCAGTCAACATGGTGTCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCActgc > 1:795401/1‑140 (MQ=255)
cGGGAAAAAATGGTTTCACGCTGCACGTCAGTCAACATGGTGTCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCActgc > 1:1161096/1‑140 (MQ=255)
cGGGAAAAAATGGTTTCACGCTGCACGTCAGTCAACATGGTGTCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCActgc > 2:99143/1‑140 (MQ=255)
cGGGAAAAAATGGTTTCACGCTGCACGTCAGTCAACATGGTGTCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCActgc > 1:1039373/1‑140 (MQ=255)
aaaaaaTGGTTTCACGCTGCACGTCAGTCAACATGGTGTCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGtt < 1:764888/140‑1 (MQ=255)
aaaaaTGGTTTCACGCTGCACGTCAGTCAACATGGTGTCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGttt < 1:1077839/140‑1 (MQ=255)
aaaaTGGTTTCACGCTGCACGTCAGTCAACATGGTGTCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTc < 2:559739/140‑1 (MQ=255)
ggTTTCACGCTGCACGTCAGTCAACATGGTGTCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTAt < 1:1081031/140‑1 (MQ=255)
cACGCTGCACGTCAGTCAACATGGTGTCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGa < 1:469520/140‑1 (MQ=255)
agCTGCACGTCAGTCAACATGGTGTCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATc < 2:154792/139‑1 (MQ=255)
aCGTCAGTCAACATGGTGTCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCAccc < 1:595512/140‑1 (MQ=255)
tcaACATGGTGTCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCg > 2:1135973/1‑140 (MQ=255)
aaCATGGTGTCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGaa > 2:86109/1‑140 (MQ=255)
aaTGGTGTCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGaaaa < 2:563779/139‑1 (MQ=255)
aTGGTGTCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAAc > 1:1361770/1‑140 (MQ=255)
ggTGTCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACgg > 2:842564/1‑140 (MQ=255)
gtgtCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGc < 2:1274147/140‑1 (MQ=255)
gtgtCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGc < 2:1242216/140‑1 (MQ=255)
gtgtCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGc < 1:842023/140‑1 (MQ=255)
tgtCATCAATTTAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCt > 1:879745/1‑140 (MQ=255)
tgtCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCTGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCt > 1:985654/1‑140 (MQ=255)
ggtCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCt > 2:1294907/2‑140 (MQ=255)
gtCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCtt > 1:1262365/1‑140 (MQ=255)
tcatcaATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTc < 1:86109/140‑1 (MQ=255)
catcaATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTcc > 1:1312667/1‑140 (MQ=255)
atcaATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCg < 1:603856/140‑1 (MQ=255)
tcaATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGt < 2:1188174/140‑1 (MQ=255)
tcaATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGt > 1:332254/1‑140 (MQ=255)
tataGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGTTGGa > 1:696016/1‑140 (MQ=255)
tataGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGTTGGa > 1:1249720/1‑140 (MQ=255)
ggTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGTTGGATAGGc > 2:274291/1‑140 (MQ=255)
ggTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGTTGGATAGGc > 2:1236081/1‑140 (MQ=255)
tttAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGTTGGATAGGCGa > 2:987921/1‑140 (MQ=255)
tAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGTTGGATAGGCGATg > 1:709672/1‑140 (MQ=255)
tAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGTTGGATAGGCGATg > 1:622254/1‑140 (MQ=255)
tAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGTTGGATAGGCGATg < 1:402200/140‑1 (MQ=255)
aaGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGTTGGATAGGCGATgc > 1:79663/1‑139 (MQ=255)
aaGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGTTGGATAGGCGATGa > 2:216592/1‑140 (MQ=255)
aaGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGTTGGATAGGCGATGa > 1:140783/1‑140 (MQ=255)
aaGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGTTGGATAGGCGATGa > 2:658120/1‑140 (MQ=255)
aaGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGTTGGATAGGCGATGa > 1:912765/1‑140 (MQ=255)
aaGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGTTGGATAGGCGATGa > 1:276129/1‑140 (MQ=255)
aaGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGTTGGATAGGCGATGa > 1:1275480/1‑140 (MQ=255)
aGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGTTGGATAGGCGATGac < 2:1361770/140‑1 (MQ=255)
aGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGTTGGATAGGCGATGac < 1:1273068/140‑1 (MQ=255)
gctCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGTTGGATAGGCGATGACACGt > 2:172892/1‑140 (MQ=255)
gctCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGTTGGATAGGCGATGACACGt > 2:9787/1‑140 (MQ=255)
ctCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGTTGGATAGGCGATGACACGtt < 2:709672/140‑1 (MQ=255)
ctCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGTTGGATAGGCGATGACACGtt > 1:436089/1‑140 (MQ=255)
ctCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGTTGGATAGGCGATGACACGtt > 1:738915/1‑140 (MQ=255)
ctCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGTTGGATAGGCGATCACACGtt < 1:1246747/140‑1 (MQ=255)
tCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGTTGGATAGGCGATGACACGttc > 1:433628/1‑140 (MQ=255)
tAATTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGTTGGATAGGCGATGACACGttcttc < 2:276129/140‑1 (MQ=255)
aaTTTGCTGCGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGTTGGATAGGCGATGACACGTTCTTCa < 1:9787/140‑1 (MQ=255)
tgctgcGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGTTGGATAGGCGATGACACGTTCTTCATTga < 2:332254/140‑1 (MQ=255)
tctgcGATTAAAATCAGGCCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGTTGGATAGGCGATGACACGTTCTTCATTgag < 1:514755/139‑1 (MQ=255)
gctgcGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGTTGGATAGGCGATGACACGTTCTTCATTgag > 2:750718/1‑140 (MQ=255)
ctgcGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCAACCAACACCGAAAACGGCTTACGTTGGATAGGCGATGACACGTTCTTCATTgaga < 2:521955/140‑1 (MQ=255)
gcGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGTTGGATAGGCGATGACACGTTCTTCATTGAGaaa > 2:658093/1‑139 (MQ=255)
gcGATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGTTGGATAGGCGATGACACGTTCTTCATTGAGAAc > 1:387915/1‑140 (MQ=255)
gATTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGTTGGATAGGCGATGACACGTTCTTCATTGAGAACAt > 1:600114/1‑140 (MQ=255)
aTTAAAATCAGACCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGTTGGATAGGCGATGACACGTTCTTCATTGAGAACATc > 1:381101/1‑140 (MQ=255)
|
GTTGTCGCAGGCGCGGGAAAGACAAAGGTGACAGGACCTGGCCAGCGGGAAAAAATGGTTTCACGCTGCACGTCAGTCAACATGGTGTCATCAATATAGGGTTTAAGCTGCTCGTAATTTGCTGCGATTAAAATCAGCCCCTTATCAACCGGACGCTGTTTTAACTCCAACAGTCGCATCACTGCTGTTTCGCTATCAGGATCGCACCCAACACCGAAAACGGCTTCCGTTGGATAGGCGATGACACGTTCTTCATTGAGAACATC > NC_000913/3431108‑3431373
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
