Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A6 F48 I1 R1
|
61 |
74.3 |
2613450 |
99.1% |
2589928 |
139.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,565,132 |
C→A |
V484L (GTG→TTG) |
glgP ← |
glycogen phosphorylase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,565,132 | 0 | C | A | 100.0%
| 342.4
/ NA
| 97 | V484L (GTG→TTG) | glgP | glycogen phosphorylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (52/45); total (52/45) |
TCTGCCAGACGCTTTTTGTTCTCCAGCTTCGCCTGATGCACAGCGTGATTAACCATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCACGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCAAACAACGATTGCACCATCAGATTAGAGTGCAGTTC > NC_000913/3564996‑3565267
|
tctGCCAGACGCTTTTTGTTCTCCAGCTTCGCCTGATGTACAGCGTGATTAACCATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGc > 1:242358/1‑140 (MQ=255)
tGCCAGACGCTTTTTGTTCTCCAGCTTCGCCTGATGCACAGCGTGATTAACCATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTg > 1:776191/1‑140 (MQ=255)
tGCCAGACGCTTTTTGTTCTCCAGCTTCGCCTGATGCACAGCGTGATTAACCATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTg < 2:685010/140‑1 (MQ=255)
tGCCAGACGCTTTTTGTTCTCCAGCTTCGCCTGATGCACAGCGTGATTAACCATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTg > 1:304402/1‑140 (MQ=255)
ccAGACGCTTTTTGTTCTCCAGCTTCGCCTGATGCACAGCGTGATTAACCATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGaa > 2:1258765/1‑140 (MQ=255)
cAGACGCTTTTTGTTCTCCAGCTTCGCCTGATGCACAGCGTGATTAACCATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGaaa > 1:660227/1‑140 (MQ=255)
cAGACGCTTTTTGTTCTCCAGCTTCGCCTGATGCACAGCGTGATTAACCATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGaaa > 2:248834/1‑140 (MQ=255)
gACGCTTTTTGTTCTCCAGCTTCGCCTGATGCACAGCGTGATTAACCATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGc > 1:314893/1‑140 (MQ=255)
gACGCTTTTTGTTCTCCAGCTTCGCCTGATGCACAGCGTGATTAACCATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGc > 2:736067/1‑140 (MQ=255)
gACGCTTTTTGTTCTCCAGCTTCGCCTGATGCACAGCGTGATTAACCATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGc > 2:907406/1‑140 (MQ=255)
aCGCTTTTTGTTCTCCAGCTTCGCCTGATGCACAGCGTGATTAACCATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCg > 1:991563/1‑140 (MQ=255)
gCTTTTTGTTCTCCAGCTTCGCCTGATGCACAGCGTGATTAACCATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGAt < 2:1016262/140‑1 (MQ=255)
tttGTTCTCCAGCTTCGCCTGATGCACAGCGTGATTAACCATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGt < 1:408201/140‑1 (MQ=255)
tttGTTCTCCAGCTTCGCCTGATGCACAGCGTGATTAACCATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGt > 1:626531/1‑140 (MQ=255)
gTTCTCCAGCTTCGCCTGATGCACAGCGTGATTAACCATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCg < 2:1181408/140‑1 (MQ=255)
ttCTCCAGCTTCGCCTGATGCACAGCGTGATTAACCATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGc < 2:972809/140‑1 (MQ=255)
tcCAGCTTCGCCTGATGCACAGCGTGATTAACCATTGGTAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTAc > 2:292971/1‑140 (MQ=255)
ccAGCTTCGCCTGATGCACAGCGTGATTAACCATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGAGGGGTTCGCTAcc > 1:1019559/1‑140 (MQ=255)
cTTCGCCTGATGCACAGCGTGATTAACCATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCgcca > 2:761173/1‑140 (MQ=255)
tCGCCTGATGCACAGCGTGATTAACCATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCgccagc > 2:1245172/1‑140 (MQ=255)
tGATGCACAGCGTGATTAACCATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTAGCTACCGCcagccagcc > 2:1057520/1‑139 (MQ=255)
tGCACAGCGTGATTAACCATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGAcg > 1:856666/1‑140 (MQ=255)
gCGTGATTAACCATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGt < 1:346420/140‑1 (MQ=255)
gCGTGATTAACCATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGt > 1:652020/1‑140 (MQ=255)
gTGATTAACCATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTca < 2:651804/140‑1 (MQ=255)
tGATTAACCATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTcac > 1:805074/1‑140 (MQ=255)
tGATTAACCATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTcac > 1:198622/1‑140 (MQ=255)
gATTAACCATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCTCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTcaca < 1:1258765/140‑1 (MQ=255)
gATTAACCATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTcaca < 1:907406/140‑1 (MQ=255)
gATTAACCATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTcaca > 1:1004696/1‑140 (MQ=255)
gATTAACCATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTcaca < 2:785877/140‑1 (MQ=255)
aTTAACCATTGGGAAATCACAGTGTTGGTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCacac > 1:1184661/1‑140 (MQ=255)
ttAACCATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACAcc > 1:58840/1‑140 (MQ=255)
aCCATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACcgtt > 2:421034/1‑140 (MQ=255)
aCCATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACcgtt < 1:203268/140‑1 (MQ=255)
aCCATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACcgtt > 2:64614/1‑140 (MQ=255)
cATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACcgttgt > 2:1060260/1‑139 (MQ=255)
cATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACcgttgg > 1:286213/1‑140 (MQ=255)
aTTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACcgttggt < 2:626531/140‑1 (MQ=255)
tGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCTAGCCAGCGACGCGGCGTCACACcgttggtga > 2:980773/1‑140 (MQ=255)
tGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACcgttggtga > 1:1156400/1‑140 (MQ=255)
gggAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACcgttggtgac > 1:71127/1‑140 (MQ=255)
ggAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACcgttggtgacg > 1:993755/1‑140 (MQ=255)
ggAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACcgttggtgacg < 2:195218/140‑1 (MQ=255)
ggAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACcgttggtgacg > 1:359369/1‑140 (MQ=255)
gAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACcgttggtgacgt < 2:805074/140‑1 (MQ=255)
aaTCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACcgttggtgacgttg < 2:304402/140‑1 (MQ=255)
aTCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACcgttggtgacgttgg < 2:1156400/140‑1 (MQ=255)
aTCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACcgttggtgacgttgg < 2:58840/140‑1 (MQ=255)
tCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACcgttggtgacgttggt > 2:20051/1‑140 (MQ=255)
tCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACcgttggtgacgttggt > 1:1017286/1‑140 (MQ=255)
caGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGaa < 1:1245172/140‑1 (MQ=255)
tgttgtTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACg > 1:757956/1‑140 (MQ=255)
ttgttgCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGAc < 1:675012/140‑1 (MQ=255)
ttgttgCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGAc < 2:757956/140‑1 (MQ=255)
gCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAg > 1:421615/1‑140 (MQ=255)
tCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGAt > 1:187069/1‑140 (MQ=255)
cATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGAtt > 1:1140112/1‑140 (MQ=255)
aGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGc < 2:187069/140‑1 (MQ=255)
gCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCa < 1:210415/140‑1 (MQ=255)
ggCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTCCCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAg < 1:927229/140‑1 (MQ=255)
gCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGt > 1:74076/1‑140 (MQ=255)
cTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTc > 1:616332/1‑140 (MQ=255)
ggTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCa > 2:777946/1‑140 (MQ=255)
cGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCAaac < 2:665065/140‑1 (MQ=255)
cGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCAaac < 2:1017286/140‑1 (MQ=255)
gTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCAaacaa < 1:1217868/140‑1 (MQ=255)
gTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCAaacaa > 1:830913/1‑140 (MQ=255)
gTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCAaacaa > 1:1288800/1‑140 (MQ=255)
gTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCAaacaa > 2:212107/1‑140 (MQ=255)
gTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCAaacaa > 1:1306053/1‑140 (MQ=255)
cgcCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCAAACAACGa > 1:1289599/1‑140 (MQ=255)
aGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCTAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCAAACAACGATTGc < 1:980773/140‑1 (MQ=255)
ttACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCAAACAACGATTGCAc < 2:616332/140‑1 (MQ=255)
ttACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCAAACAACGATTGCAc < 2:1012646/140‑1 (MQ=255)
ttACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCAAACAACGATTGCAc < 2:830913/140‑1 (MQ=255)
ttACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCAAACAACGATTGCAc < 2:1306053/140‑1 (MQ=255)
ttACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCAAACAACGATTGCAc < 1:860571/140‑1 (MQ=255)
ttACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAAGATGAAAGCGATGGGATCGCTACCGACAGCCAGCGACGCGGCGTCAAACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTAAGCAAAGAAGGCAAACAACGATTGCaa < 2:1229961/140‑2 (MQ=255)
aCGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCAAACAACGATTGCACCa < 1:20051/140‑1 (MQ=255)
cccAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCAAACAACGATTGCACCATCAg > 1:1242728/1‑140 (MQ=255)
cAGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCAAACAACGATTGCACCATCAGAt < 1:212107/140‑1 (MQ=255)
aGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCAAACAACGATTGCACCATCAGAtt > 2:15797/1‑140 (MQ=255)
aGGTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCAAACAACGATTGCACCATCAGAtt > 2:722463/1‑140 (MQ=255)
ggTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCAAACAACGATTGCACCATCAGATTa < 2:896877/140‑1 (MQ=255)
ggTGTTCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCAAACAACGATTGCACCATCAGATTa > 1:32682/1‑140 (MQ=255)
tCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCAAACAACGATTGCACCATCAGATTAGAGTg < 2:776191/140‑1 (MQ=255)
tCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCAAACAACGATTGCACCATCAGATTAGAGTg < 2:359369/140‑1 (MQ=255)
tCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCAAACAACGATTGCACCATCAGATTAGAGTg < 2:242358/140‑1 (MQ=255)
tCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCAAACAACGATTGCACCATCAGATTAGAGTg < 2:198622/140‑1 (MQ=255)
tCGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCAAACAACGATTGCACCATCAGATTAGAGTg < 1:777946/140‑1 (MQ=255)
cGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCAAACAACGATTGCACCATCAGATTAGAGTGc > 2:72986/1‑140 (MQ=255)
cGTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCAAACAACGATTGCACCATCAGATTAGAGTGc < 2:660227/140‑1 (MQ=255)
cGTCCAACAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCAAACAACGATTGCACCATCAGATTAGAGTGc > 1:1198100/1‑140 (MQ=255)
agTCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCAAACAACGATTGCACCATCAGATTAGAGTGc < 2:1184661/139‑1 (MQ=255)
tCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCAAACAACGATTGCACCATCAGATTAGAGTGCAg < 2:1004696/140‑1 (MQ=255)
tCCAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCAAACAACGATTGCACCATCAGATTAGAGTGCAg < 1:712455/140‑1 (MQ=255)
ccAGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCAAACAACGATTGCACCATCAGATTAGAGTGCAGt < 2:991563/140‑1 (MQ=255)
aGCAAGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCAAACAACGATTGCACCATCAGATTAGAGTGCAGTTc > 1:914609/1‑140 (MQ=255)
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TCTGCCAGACGCTTTTTGTTCTCCAGCTTCGCCTGATGCACAGCGTGATTAACCATTGGGAAATCACAGTGTTGTTGCAGCTCATTAAGCAGGCTAAGGTCGGTGCGCCAGTTACGGCCCAGGTGTTCGTCCAGCACGGCTGAAAGCGATGGGTTCGCTACCGCCAGCCAGCGACGCGGCGTCACACCGTTGGTGACGTTGGTGAAACGACCCGGGAAGATTTTCGCAAAGTCGGCAAACAACGATTGCACCATCAGATTAGAGTGCAGTTC > NC_000913/3564996‑3565267
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
