Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F48 I1 R1
|
56 |
123.4 |
4244010 |
99.1% |
4205813 |
139.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,937,824 |
C→A |
S119S (TCC→TCA) |
fucK → |
L‑fuculokinase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,937,824 | 0 | C | A | 100.0%
| 457.3
/ NA
| 129 | S119S (TCC→TCA) | fucK | L‑fuculokinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (57/72); total (57/72) |
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
TCCGCGGTATCGCCGTCACCACCTTTGGTGTGGATGGCGCTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCCGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTGAAAGAAAATCATCCACAACTGCTGGAACGCGCGCACGCCTGGCTCTTTATTTCGTCGCTGA > NC_000913/2937688‑2937957
|
tCCGCGGTATCGCCGTCACCACCTTTGGTGTGGATGGCGCTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGca < 2:1518635/140‑1 (MQ=255)
gcgGTATCGCCGTCACCACCTTTGGTGTGGATGGCGCTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAg > 2:1236162/1‑140 (MQ=255)
cgGTATCGCCGTCACCACCTTTGGTGTGGATGGCGCTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGc > 2:1982201/1‑140 (MQ=255)
gTATCGCCGTCACCACCTTTGGTGTGGATGGCGCTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCgt > 2:1758913/1‑139 (MQ=255)
tCGCCGTCACCACCTTTGGTGTGGATGGCGCTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTg < 1:1093964/140‑1 (MQ=255)
accaccTTTGGTGTGGATGGCGCTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTAt > 2:794144/1‑140 (MQ=255)
tGGTGTGGATGGCGCTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCg > 1:1981198/1‑140 (MQ=255)
ggTGTGGATGGCGCTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGt > 1:1771013/1‑140 (MQ=255)
gtgtGGATGGCGCTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTc < 2:831087/140‑1 (MQ=255)
gtgGATGGCGCTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCgg > 2:1772208/1‑140 (MQ=255)
tgGATGGCGCTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGa > 1:840966/1‑140 (MQ=255)
tgGATGGCGCTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGa < 1:1623615/140‑1 (MQ=255)
tgGATGGCGCTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGa < 2:1898443/140‑1 (MQ=255)
tgGATGGCGCTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGa < 2:2078267/140‑1 (MQ=255)
ggATGGCGCTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAg > 2:930963/1‑140 (MQ=255)
gATGGCGCTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGc > 2:646670/1‑140 (MQ=255)
gATGGCGCTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGc > 1:1364746/1‑140 (MQ=255)
gATGGCGCTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGc > 1:1240147/1‑140 (MQ=255)
gATGGCGCTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGc > 2:909947/1‑140 (MQ=255)
ggCGCTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCtt > 1:69706/1‑140 (MQ=255)
ggCGCTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCtt < 1:814969/140‑1 (MQ=255)
cgcTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCtttt > 2:539449/1‑139 (MQ=255)
cgcTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTa > 1:1907061/1‑140 (MQ=255)
cgcTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTa > 1:1914221/1‑140 (MQ=255)
gcTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAg > 1:680427/1‑140 (MQ=255)
tGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTc > 2:770826/1‑140 (MQ=255)
ggTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCa < 2:1683283/140‑1 (MQ=255)
ggTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCa < 1:746330/140‑1 (MQ=255)
gTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCaa < 1:1876727/140‑1 (MQ=255)
gTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCaa < 1:1144269/140‑1 (MQ=255)
aGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATa < 2:839794/140‑1 (MQ=255)
aGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATa < 1:930963/140‑1 (MQ=255)
aGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATa < 1:794144/140‑1 (MQ=255)
aGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATa < 1:770826/140‑1 (MQ=255)
aGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATa < 2:691534/140‑1 (MQ=255)
aGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATa < 1:360915/140‑1 (MQ=255)
aGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATa < 1:1984227/140‑1 (MQ=255)
aGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATa < 1:1331828/140‑1 (MQ=255)
aGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATa < 1:303715/140‑1 (MQ=255)
gATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATAc < 1:909947/140‑1 (MQ=255)
aTAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGACCGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACg < 2:1690298/140‑1 (MQ=255)
aTAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACg < 1:1772208/140‑1 (MQ=255)
aTAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACg < 1:1982201/140‑1 (MQ=255)
aTAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACg < 2:1334151/140‑1 (MQ=255)
aTAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACg < 1:1810327/140‑1 (MQ=255)
aTAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACg < 1:154613/140‑1 (MQ=255)
aTAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACg < 1:539449/140‑1 (MQ=255)
aaGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGtt < 2:840966/140‑1 (MQ=255)
gCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATGCGTtat > 2:311259/1‑140 (MQ=255)
gCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTtat > 1:78261/1‑140 (MQ=255)
gCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTtat > 2:1315060/1‑140 (MQ=255)
acAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTtat < 2:1895465/139‑1 (MQ=255)
cAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTtata > 1:442591/1‑140 (MQ=255)
cAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTtata < 2:69706/140‑1 (MQ=255)
aaGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTtatat > 1:1238764/1‑140 (MQ=255)
aaGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTtatat > 2:1492975/1‑140 (MQ=255)
gCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAg < 2:78261/140‑1 (MQ=255)
tCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTgg > 2:1892923/1‑140 (MQ=255)
cTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGgt < 1:576810/140‑1 (MQ=255)
tGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGgtg < 2:1606968/140‑1 (MQ=255)
tGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGgtg < 2:1981198/140‑1 (MQ=255)
tGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGgtg < 1:228823/140‑1 (MQ=255)
tGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGACGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGgtg < 1:1492975/140‑1 (MQ=255)
ctctATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGtgtg > 1:1549974/1‑140 (MQ=255)
ctATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGt < 1:629625/140‑1 (MQ=255)
ccGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTgaa > 2:1553876/1‑140 (MQ=255)
attattAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTgaaaga < 1:1758913/140‑1 (MQ=255)
ttattaGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTgaaagaa > 1:1293243/1‑140 (MQ=255)
ttattaGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTgaaagaa > 1:351484/1‑140 (MQ=255)
ttattaGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTgaaagaa > 2:895650/1‑140 (MQ=255)
attaGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTGAAAGaaaa < 1:681388/140‑1 (MQ=255)
attaGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTGAAAGaaaa < 2:533640/140‑1 (MQ=255)
attaGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTGAAAGaaaa < 1:646670/140‑1 (MQ=255)
aGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTGAAAGAAAatct > 1:338818/1‑139 (MQ=255)
gAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTGAAAGAAAATCATCcac < 2:680427/140‑1 (MQ=255)
gAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTGAAAGAAAATCATCcac < 1:44820/140‑1 (MQ=255)
gAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTGAAAGAAAATCATCcac < 2:313808/140‑1 (MQ=255)
gAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTGAAAGAAAATCATCcac < 2:1771013/140‑1 (MQ=255)
gAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTGAAAGAAAATCATCcac < 2:544665/140‑1 (MQ=255)
gAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTGAAAGAAAATCATCcac < 1:1654621/140‑1 (MQ=255)
gAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTGAAAGAAAATCATCcac < 1:1018740/140‑1 (MQ=255)
gAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTGAAAGAAAATCATCcac < 1:1236162/140‑1 (MQ=255)
gAAATGTCCGCGAACAGCAGAGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTGAAAGAAAATCATCcac < 2:1436008/140‑1 (MQ=255)
cgcgAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTGAAAGAAAATCATCCACAActgctg > 2:2092842/1‑140 (MQ=255)
gcagcGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTGAAAGAAAATCATCCACAACTGCTGGAAcgcgc < 1:222270/140‑1 (MQ=255)
aTGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTGAAAGAAAATCATCCACAACTGCTGGAACGCGCGCACGCCTg > 2:1971095/1‑140 (MQ=255)
aTGGACAATATTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTGAAAGAAAATCATCCACAACTGCTGGAACGCGCGCACGCCTg < 1:1315060/140‑1 (MQ=255)
cAATATTGAACCGTTAATCTCAGCACAGCGGGTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGCTTCAATACTGTTTATAAGTTTGGGTGGTTGTAAGAAAAACATCCACAACTGCTGGAACGCGCGCACGTCTGGctct > 2:1763099/1‑140 (MQ=255)
tatTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTGAAAGAAAATCATCCACAACTGCTGGAACGCGCGCACGCCTGGCTCTTTa > 1:1066995/1‑140 (MQ=255)
tatTGAACGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGCGTGGTTGAAAGAAAATCATCCACAACTGCTGGAACGCGCGCACGCCTGGCTCTTTa > 1:456827/1‑140 (MQ=255)
cGGTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTGAAAGAAAATCATCCACAACTGCTGGAACGCGCGCACGCCTGGCTCTTTATTtcgtc > 1:1472492/1‑140 (MQ=255)
gTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTGAAAGAAAATCATCCACAACTGCTGGAACGCGCGCACGCCTGGCTCTTTATTTCGTCGc < 2:1795057/140‑1 (MQ=255)
gTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTGAAAGAAAATCATCCACAACTGCTGGAACGCGCGCACGCCTGGCTCTTTATTTCGTCGc < 2:1549974/140‑1 (MQ=255)
gTTAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTGAAAGAAAATCATCCACAACTGCTGGAACGCGCGCACGCCTGGCTCTTTATTTCGTCGc < 1:2092842/140‑1 (MQ=255)
ttAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTGAAAGAAAATCATCCACAACTGCTGGAACGCGCGCACGCCTGGCTCTTTATTTCGTCGCt > 1:1306349/1‑140 (MQ=255)
ttAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTGAAAGAAAATCATCCACAACTGCTGGAACGCGCGCACGCCTGGCTCTTTATTTCGTCGCt > 2:1395780/1‑140 (MQ=255)
ttAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTGAAAGAAAATCATCCACAACTGCTGGAACGCGCGCACGCCTGGCTCTTTATTTCGTCGCt > 1:1906902/1‑140 (MQ=255)
ttAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTGAAAGAAAATCATCCACAACTGCTGGAACGCGCGCACGCCTGGCTCTTTATTTCGTCGCt > 1:96178/1‑140 (MQ=255)
ttAATCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTGAAAGAAAATCATCCACAACTGCTGGAACGCGCGCACGCCTGGCTCTTTATTTCGTCGCt > 1:820931/1‑140 (MQ=255)
aaTCTCAGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTGAAAGAAAATCATCCACAACTGCTGGAACGCGCGCACGCCTGGCTCTTTATTTCGTCGCTGa > 1:1579320/1‑140 (MQ=255)
|
TCCGCGGTATCGCCGTCACCACCTTTGGTGTGGATGGCGCTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCCGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTGAAAGAAAATCATCCACAACTGCTGGAACGCGCGCACGCCTGGCTCTTTATTTCGTCGCTGA > NC_000913/2937688‑2937957
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
