Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F48 I1 R1
|
56 |
123.4 |
4244010 |
99.1% |
4205813 |
139.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,287,474 |
G→T |
A17S (GCA→TCA) |
yraH → |
putative fimbrial protein YraH |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,287,474 | 0 | G | T | 100.0%
| 740.5
/ NA
| 209 | A17S (GCA→TCA) | yraH | putative fimbrial protein YraH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (125/84); total (125/84) |
Only 100 of 213 total aligned reads displayed.
CTGCCTGTATAATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCGCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGAAAATTGAAGTTGCTCTTGGTCACTATAATGCCGAACAGTTTCGTAATAT > NC_000913/3287344‑3287610
|
cTGCCTGTATAATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATg > 1:1814257/1‑140 (MQ=255)
cTGCCTGTATAATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATg > 1:2118507/1‑140 (MQ=255)
tGCCTGTATAATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGc < 2:2051446/140‑1 (MQ=255)
cTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGa < 1:247117/140‑1 (MQ=255)
cTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGa < 1:1220309/140‑1 (MQ=255)
ttAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATACGATTATGTACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATg < 2:923139/140‑1 (MQ=255)
tAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATgg < 1:746107/140‑1 (MQ=255)
aaaGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGc < 2:479961/124‑1 (MQ=255)
aaaGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGt > 2:140972/1‑140 (MQ=255)
aaaGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGt > 2:1482065/1‑140 (MQ=255)
aaaGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGt > 1:131910/1‑140 (MQ=255)
aaaGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGt > 1:1419890/1‑140 (MQ=255)
aaaGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGt > 1:2099758/1‑140 (MQ=255)
aaaGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGt > 2:1307495/1‑140 (MQ=255)
aaaGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGt > 2:203326/1‑140 (MQ=255)
aTGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGaaa < 1:1050384/140‑1 (MQ=255)
aTGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGaaa < 2:1603643/140‑1 (MQ=255)
ttGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATat > 2:723574/1‑139 (MQ=255)
ttGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAg > 1:1031449/1‑140 (MQ=255)
ttGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAg > 2:1091114/1‑140 (MQ=255)
gAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGtt > 2:1831432/1‑140 (MQ=255)
tatatTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGa > 2:2077242/1‑140 (MQ=255)
atatTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGAt > 2:1500253/1‑140 (MQ=255)
ttCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGc < 2:1983580/140‑1 (MQ=255)
aTTAAATATGATTATGTACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGAt > 1:1061245/1‑140 (MQ=255)
aTTAAATATGATTATGTACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGAt > 1:1856518/1‑140 (MQ=255)
aTTAAATATGATTATGTACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGAt > 1:769164/1‑140 (MQ=255)
ttAAATATGATTATGTACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGAtt < 1:723574/140‑1 (MQ=255)
atGATTATGTACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTaaaa < 2:1856518/140‑1 (MQ=255)
aTTATGTACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATcc > 2:1048548/1‑140 (MQ=255)
tGTACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTTATGGCGATTTTTTAAAATCCGCtt > 1:1580031/1‑140 (MQ=255)
tGTACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCtt > 1:851282/1‑140 (MQ=255)
tGTACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCtt > 1:508760/1‑140 (MQ=255)
tGTACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCtt > 2:1027736/1‑140 (MQ=255)
tACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTtgt > 1:105615/1‑140 (MQ=255)
aCTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTtgtg < 1:58742/140‑1 (MQ=255)
aCTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTtgtg > 2:174766/1‑140 (MQ=255)
cTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGa > 2:672538/1‑140 (MQ=255)
ttGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACCTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGaa < 2:2067206/140‑1 (MQ=255)
tGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGaaa > 1:1708380/1‑140 (MQ=255)
gTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCTATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAAt > 1:1010453/1‑140 (MQ=255)
gTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAAt > 1:866049/1‑140 (MQ=255)
gTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAAt > 2:1192236/1‑140 (MQ=255)
gTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAAt > 2:1264668/1‑140 (MQ=255)
gTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAAt > 2:1426745/1‑140 (MQ=255)
gTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAAt > 1:956887/1‑140 (MQ=255)
gTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAAt > 2:806982/1‑140 (MQ=255)
ttACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATc > 2:1583912/1‑140 (MQ=255)
aCAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCaa > 2:1449249/1‑140 (MQ=255)
aCAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCaa < 1:1091114/140‑1 (MQ=255)
aCAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCaa > 1:326207/1‑140 (MQ=255)
aCAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCaa > 2:2097283/1‑140 (MQ=255)
aaGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATg < 1:2058657/140‑1 (MQ=255)
aaGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATg > 2:393860/1‑140 (MQ=255)
aGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGa < 2:2086354/140‑1 (MQ=255)
ggATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTtgtg < 1:411440/129‑1 (MQ=255)
gATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGAct > 1:1949617/1‑140 (MQ=255)
gATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGAct < 2:32625/140‑1 (MQ=255)
tAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGActct < 1:640929/140‑1 (MQ=255)
tAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGActct < 2:769164/140‑1 (MQ=255)
aaGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGActctt > 2:29333/1‑139 (MQ=255)
gTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGAct > 1:250228/1‑134 (MQ=255)
ttATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATaa < 1:1307495/140‑1 (MQ=255)
tatatGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGaa > 2:274428/1‑140 (MQ=255)
tatatGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGaa > 1:1541825/1‑140 (MQ=255)
tatatGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGaa > 2:1001674/1‑140 (MQ=255)
aaTAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGAAAATTGa > 2:974881/1‑140 (MQ=255)
aaTAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGAAAATTGa > 2:1438064/1‑140 (MQ=255)
aaTAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGAAAATTGa > 1:2087130/1‑140 (MQ=255)
aaTAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGAAAATTGa > 1:208515/1‑140 (MQ=255)
aTAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGAAAATTGaa < 2:1525179/140‑1 (MQ=255)
aTAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGAAAATTGaa > 1:1798261/1‑140 (MQ=255)
aTAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGAAAATTGaa > 1:1632359/1‑140 (MQ=255)
aTAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGAAAATTGaa > 1:1525996/1‑140 (MQ=255)
tAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGAAAATTGAAg < 1:1264668/140‑1 (MQ=255)
aaGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGAAAATTGAAGtt > 1:1696216/1‑140 (MQ=255)
aGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGAAAATTGAAGttt > 2:889706/1‑139 (MQ=255)
tACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGAAAATTGAAGTTGctc < 1:1432919/140‑1 (MQ=255)
aaaaaCAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGAAAATTGAAGTTGCTCTTg < 2:441008/140‑1 (MQ=255)
aaaCAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGAAAATTGAAGTTGCTCTTGGt < 1:1482065/140‑1 (MQ=255)
aaaCAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGAAAATTGAAGTTGCTCTTGGt < 1:1001674/140‑1 (MQ=255)
aaaCAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGAAAATTGAAGTTGCTCTTGGt < 2:1814257/140‑1 (MQ=255)
aaaCAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGAAAATTGAAGTTGCTCTTGGt < 2:1696216/140‑1 (MQ=255)
aaaCAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGAAAATTGAAGTTGCTCTTGGt < 1:986803/140‑1 (MQ=255)
gCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCACTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGAAAATTGAAGTTGCTCTTGGTCACta < 1:1575983/140‑1 (MQ=255)
aTTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGAAAATTGAAGTTGCTCTTGGTCACTATaa > 1:1836008/1‑140 (MQ=255)
cGGGCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGAAAATTGAAGTTGCTCTTGGTCACTATAATGcc > 1:685666/1‑140 (MQ=255)
ggCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGAAAATTGAAGTTGCTCTTGGTCACTATAATGCCGa > 2:1341726/1‑140 (MQ=255)
gCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGAAAATTGAAGTTGCTCTTGGTCACTATAATGCCGaa < 1:312227/140‑1 (MQ=255)
gCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGAAAATTGAAGTTGCTCTTGGTCACTATAATGCCGaa < 2:1055797/140‑1 (MQ=255)
gCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGAAAATTGAAGTTGCTCTTGGTCACTATAATGCCGaa < 2:508760/140‑1 (MQ=255)
gCTTACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGAAAATTGAAGTTGCTCTTGGTCACTATAATGCCGaa < 1:1172352/140‑1 (MQ=255)
tACTTGCGCTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGAAAATTGAAGTTGCTCTTGGTCACTATAATGCCGAACAg < 1:1378164/140‑1 (MQ=255)
gcgcTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGAAAATTGAAGTTGCTCTTGGTCACTATAATGCCGAACAGTTTCg < 2:2118507/140‑1 (MQ=255)
gcgcTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGAAAATTGAAGTTGCTCTTGGTCACTATAATGCCGAACAGTTTCg < 1:1449249/140‑1 (MQ=255)
gcgcTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGAAAATTGAAGTTGCTCTTGGTCACTATAATGCCGAACAGTTTCg < 1:456715/140‑1 (MQ=255)
gcTTTTCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGAAAATTGAAGTTGCTCTTGGTCACTATAATGCCGAACAGTTTCGTa > 2:1155604/1‑140 (MQ=255)
tttCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGAAAATTGAAGTTGCTCTTGGTCACTATAATGCCGAACAGTTTCGTAata < 2:1124301/140‑1 (MQ=255)
tttCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGAAAATTGAAGTTGCTCTTGGTCACTATAATGCCGAACAGTTTCGTAata < 2:24990/140‑1 (MQ=255)
tttCTCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGAAAATTGAAGTTGCTCTTGGTCACTATAATGCCGAACAGTTTCGTAata < 1:182385/140‑1 (MQ=255)
|
CTGCCTGTATAATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACAAGGATAAGGTTATATATGAATAAAGTTACAAAAACAGCTATTGCGGGCTTACTTGCGCTTTTCGCAGGTAATGCCGCTGCAACCGATGGTGAAATAGTTTTTGATGGCGAGATTTTAAAATCCGCTTGTGAAATCAATGACTCTGATAAGAAAATTGAAGTTGCTCTTGGTCACTATAATGCCGAACAGTTTCGTAATAT > NC_000913/3287344‑3287610
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
