Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F48 I1 R1
|
56 |
123.4 |
4244010 |
99.1% |
4205813 |
139.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,945,882 |
C→A |
noncoding (2179/2904 nt) |
rrlC → |
23S ribosomal RNA |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,945,882 | 0 | C | A | 100.0%
| 336.9
/ NA
| 125 | noncoding (2179/2904 nt) | rrlC | 23S ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (68/57); total (68/57) |
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
CCCGTGAACCTTTACTATAGCTTGACACTGAACATTGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAG > NC_000913/3945767‑3946018
|
cccGTGAACCTTTACTATAGCTTGACACTGAACATTGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTg < 1:1026651/140‑1 (MQ=11)
cccGTGAACCTTTACTATAGCTTGACACTGAACATTGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTg > 1:1623832/1‑140 (MQ=11)
cccGTGAACCTTTACTATAGCTTGACACTGAACATTGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTg > 2:1549311/1‑140 (MQ=11)
cccGTGAACCTTTACTATAGCTTGACACTGAACATTGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGCGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTg > 1:1058545/1‑140 (MQ=11)
cGTGAACCTTTACTATAGCTTGACACTGAACATTGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGa > 1:822282/1‑140 (MQ=17)
tGAACCTTTACTATAGCTTGACACTGAACATTGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGAcc > 1:312037/1‑140 (MQ=17)
tGAACCTTTACTATAGCTTGACACTGAACATTGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGAcc > 2:1363985/1‑140 (MQ=17)
gAACCTTTACTATAGCTTGACACTGAACATTGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGAccc < 2:1933687/140‑1 (MQ=17)
aGCTTGACACTGAACATTGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTg < 1:1539155/140‑1 (MQ=25)
aGCTTGACACTGAACATTGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTg < 1:1761009/140‑1 (MQ=37)
aGCTTGACACTGAACATTGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTg > 2:1408747/1‑140 (MQ=21)
gCTTGACACTGAACATTGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGTGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGc > 2:115122/1‑140 (MQ=21)
gCTTGACACTGAACATTGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGc > 1:778375/1‑140 (MQ=21)
gCTTGACACTGAACATTGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGc > 1:1170946/1‑140 (MQ=21)
cTTGACATTGAACATTGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCg > 2:1143497/1‑140 (MQ=21)
cTTGACACTGAACATTGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCg > 1:160254/1‑140 (MQ=21)
ttGACACTGAACATTGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCgg < 2:129347/140‑1 (MQ=37)
tGACACTGAACATTGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGa > 2:908860/1‑140 (MQ=21)
tGACACTGAACATTGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGa > 1:182205/1‑140 (MQ=21)
tGACACTGAACATTGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGa < 2:91098/140‑1 (MQ=25)
gACACTGAACATTGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCgg > 2:1156133/1‑138 (MQ=21)
acacTGAACATTGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACa < 1:243791/140‑1 (MQ=21)
acacTGAACATTGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACa < 2:815113/140‑1 (MQ=21)
acacTGAACATTGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGCCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACa > 2:1378088/1‑140 (MQ=19)
tGAACATTGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAgtgt > 2:608321/1‑140 (MQ=21)
tGAACATTGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAgtgt > 1:1140881/1‑140 (MQ=21)
aaCATTGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCt > 2:1246657/1‑140 (MQ=21)
aaCATTGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCt < 2:1332346/140‑1 (MQ=37)
aaCATTGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCt > 1:462301/1‑140 (MQ=21)
cTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGt > 2:385764/1‑140 (MQ=21)
cTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGt > 2:1042619/1‑140 (MQ=21)
tGATGTGTAGGATAGGAGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGttt > 1:1371385/1‑140 (MQ=21)
aTGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGa < 2:152234/140‑1 (MQ=21)
aTGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGa < 1:739788/140‑1 (MQ=21)
gtgtGGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACt < 2:973500/140‑1 (MQ=21)
aGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTgggg < 2:1410404/140‑1 (MQ=21)
gATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCg > 1:1030999/1‑140 (MQ=21)
gATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCg > 1:1097498/1‑140 (MQ=21)
tAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGt < 1:1363985/140‑1 (MQ=21)
tAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGt > 1:552697/1‑140 (MQ=21)
tAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGt < 2:1853516/140‑1 (MQ=21)
tAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGt > 1:1257447/1‑140 (MQ=21)
aGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGtc < 1:1414282/140‑1 (MQ=21)
aGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGtc < 2:212689/140‑1 (MQ=21)
aGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGtc < 1:1232939/140‑1 (MQ=21)
aGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGtc > 1:1594108/1‑140 (MQ=21)
aGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGtc < 2:1374727/140‑1 (MQ=21)
aGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGtc < 2:1097498/140‑1 (MQ=21)
aGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGtc < 2:1058545/140‑1 (MQ=21)
aGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGtc < 1:608321/140‑1 (MQ=21)
gTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGtctc < 1:908860/140‑1 (MQ=21)
gTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGtctc > 1:889532/1‑140 (MQ=21)
gTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGtctc < 2:462301/140‑1 (MQ=21)
gTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGtc < 2:2063816/138‑1 (MQ=21)
gTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGtc > 1:2063816/1‑138 (MQ=21)
gggAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTctcct > 1:1227506/1‑140 (MQ=21)
gggAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTctcct > 1:869639/1‑140 (MQ=21)
gggAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGAGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTctcct > 2:1746808/1‑140 (MQ=21)
ggAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTctcctc > 1:951087/1‑140 (MQ=21)
ggCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTa < 2:312037/140‑1 (MQ=21)
ggCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTa < 2:219190/140‑1 (MQ=21)
gCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTaa > 2:1690529/1‑140 (MQ=21)
gCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTaa > 2:538889/1‑140 (MQ=21)
cTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTaaa < 1:1849126/140‑1 (MQ=21)
tttGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAag < 1:1690529/140‑1 (MQ=21)
tttGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAag < 2:810928/140‑1 (MQ=21)
gtgGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACgg < 2:840826/140‑1 (MQ=21)
gtgGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACgg < 2:1611103/140‑1 (MQ=21)
tgGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACgga > 1:1694282/1‑140 (MQ=21)
gACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACggagg > 1:2103320/1‑140 (MQ=21)
gCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGc > 1:37320/1‑140 (MQ=21)
gCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGc > 2:873255/1‑140 (MQ=21)
aGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGCCTCCTCTTAAAGAGTAACGGAGGAGCAct > 2:1385402/1‑139 (MQ=255)
tCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATTCCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGaa > 1:1264175/1‑140 (MQ=21)
tCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGaa > 1:1441570/1‑140 (MQ=21)
tGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAgg < 1:504801/140‑1 (MQ=21)
tGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAgg < 1:530590/140‑1 (MQ=21)
tGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAgg < 2:822282/140‑1 (MQ=21)
tGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAgg < 2:1240642/140‑1 (MQ=21)
tGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAgg < 1:1396011/140‑1 (MQ=21)
ggAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTCGTTTGACTGGGGCGGTCTTCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGc < 2:160254/140‑1 (MQ=255)
ggAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGc < 1:115122/140‑1 (MQ=21)
ggAGCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGc < 2:1100832/140‑1 (MQ=21)
gCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTaa > 1:2112878/1‑140 (MQ=21)
gCCGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTaa > 2:1283562/1‑140 (MQ=21)
cGACCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATc > 2:1818885/1‑140 (MQ=25)
aCCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGTGGAGCACGAAGGTTGGTTTATCCt > 2:1492509/1‑140 (MQ=255)
aCCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGTACGAAGGTTGGCTAATCCt > 2:2014720/1‑140 (MQ=21)
aCCTTGAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCt > 1:143160/1‑140 (MQ=21)
gAAATACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCg > 2:418218/1‑140 (MQ=21)
gAAATACCACCATTTAATGTTTGATGGTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCg > 1:1839571/1‑140 (MQ=21)
aaaTACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCgg < 1:820929/140‑1 (MQ=21)
aaaTACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCgg < 1:113721/140‑1 (MQ=21)
aaaTACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCgg < 1:1378088/140‑1 (MQ=21)
aTACCACCATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGAc < 1:1378168/140‑1 (MQ=21)
ccaccaTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATc > 2:202050/1‑140 (MQ=37)
ccaccaTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATc > 1:2047811/1‑140 (MQ=21)
caccATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCa < 2:1916762/140‑1 (MQ=21)
accATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCag < 2:2047811/140‑1 (MQ=21)
accATTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCag < 2:1227506/140‑1 (MQ=21)
|
CCCGTGAACCTTTACTATAGCTTGACACTGAACATTGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTGTGGACGCCAGTCTGCATGGAGCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTGGACCCGTGATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAG > NC_000913/3945767‑3946018
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
