Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F48 I1 R1
|
79 |
90.7 |
3162666 |
99.0% |
3131039 |
139.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,983,675 |
G→T |
V150V (GTC→GTA) |
kduI ← |
5‑dehydro‑4‑deoxy‑D‑glucuronate isomerase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,983,675 | 0 | G | T | 100.0%
| 439.5
/ NA
| 123 | V150V (GTC→GTA) | kduI | 5‑dehydro‑4‑deoxy‑D‑glucuronate isomerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (66/57); total (66/57) |
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
TGACACGGCATGGTGTTCCACAAGTTACCCGGAGCCAGCTCCGTCAGCCCCATACTCAATTGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTGACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGCCGGTATCAATACTGGCAAAGACAACTTCTTTTGCACCTTTACCAACA > NC_000913/2983538‑2983810
|
gACACGGCATGGTGTTCCACAAGTTACCCGGAGCCAGCTCCGTCAGCCCCATACTCAATTGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACt > 1:526631/1‑140 (MQ=255)
aggCATGGTGTTCCACAAGTTACCCGGAGACAACTCCGTCAGTCCCATACTCAATTGGCAGGTTTCCAGTAGATCCCGGACAAAATATTTGTGAATCGTGCAACGGTTACTGGTGAGGCTATCGCCTAACGTTACTagag < 2:676918/139‑1 (MQ=255)
cATGGTGTTCCACAAGTTACCCGGAGCCAGCTCCGTCAGCCCCATACTCAATTGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATa > 1:471755/1‑140 (MQ=255)
ggTGTTCCACAAGTTACCCGGAGCCAGCTCCGTCAGCCCCATACTCAATTGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACtt > 2:368445/1‑140 (MQ=255)
cacaAGTTACCCGGAGCCAGCTCCGTCAGCCCCATACTCAATTGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCgg > 2:933869/1‑140 (MQ=255)
gTTACCCGGAGCCAGCTCCGTCAGCCCCATACTCAATTGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGTCAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGCAGATACTTCGTCCGGtgtgt > 2:1335816/1‑139 (MQ=255)
gTTACCCGGAGCCAGCTCCGTCAGCCCCATACTCAATTGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGa > 2:687132/1‑140 (MQ=255)
gTTACCCGGAGCCAGCTCCGTCAGCCCCATACTCAATTGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGa > 1:1528342/1‑140 (MQ=255)
tACCCGGAGCCAGCTCCGTCAGCCCCATACTCAATTGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGgt < 1:65547/134‑1 (MQ=255)
tACCCGGAGCCAGCTCCGTCAGCCCCATACTCAATTGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGgt > 2:65547/1‑134 (MQ=255)
tACCCGGAGCCAGCTCCGTCAGCCCCATACTCAATTGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACt > 1:663457/1‑140 (MQ=255)
aCCCGGAGCCAGCTCCGTCAGCCCCATACTCAATTGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACtt > 2:47845/1‑140 (MQ=255)
aCCCGGAGCCAGCTCCGTCAGCCCCATACTCAATTGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACtt > 2:929826/1‑140 (MQ=255)
cccGGAGCCAGCTCCGTCAGCCCCATACTCAATTGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACttt > 2:558419/1‑140 (MQ=255)
ccGGAGCCAGCTCCGTCAGCCCCATACTCAATTGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACtttt < 1:174513/140‑1 (MQ=255)
ccGGAGCCAGCTCCGTCAGCCCCATACTCAATTGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGAGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACtttt < 2:1263909/140‑1 (MQ=255)
gAGCCAGCTCCGTCAGCCCCATACTCAATTGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTtg < 2:206116/140‑1 (MQ=255)
gAGCCAGCTCCGTCAGCCCCATACTCAATTGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTtg < 1:47845/140‑1 (MQ=255)
aGCCAGCTCCGTCAGCCCCATACTCAATTGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTtgg > 2:742704/1‑140 (MQ=255)
gCCAGCTCCGTCAGCCCCATACTCAATTGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTtggt < 2:707361/140‑1 (MQ=255)
gCCAGCTCCGTCAGCCCCATACTCAATTGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTtggt > 1:163870/1‑140 (MQ=255)
gCCAGCTCCGTCAGCCCCATACTCAATTGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTtggt < 1:545053/140‑1 (MQ=255)
gCCAGCTCCGTCAGCCCCATACTCAATTGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTtggt > 1:344973/1‑140 (MQ=255)
gCTCCGTCAGCCCCATACTCAATTGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGa < 1:979739/140‑1 (MQ=255)
cTCCGTCAGCCCCATACTCAATTGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGAt > 2:1294323/1‑140 (MQ=255)
cGTCAGCCCCATACTCAATTGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATAcg < 2:578058/140‑1 (MQ=255)
tCAGCCCCATACTCAATTGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATAcgtc < 1:368445/140‑1 (MQ=255)
tCAGCCCCATACTCAATTGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATAcgtc > 1:986233/1‑140 (MQ=255)
tCAGCCCCATACTCAATTGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATAcgtc < 1:742704/140‑1 (MQ=255)
cAGCCCCATACGCAATTGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGGGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATAcgtct > 2:1243926/1‑139 (MQ=255)
cATACTCAATTGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATgcg < 1:1346135/140‑1 (MQ=255)
aaTTGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCTGGTgc > 1:1319540/1‑140 (MQ=255)
aaTTGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTgc > 2:1545325/1‑140 (MQ=255)
aaTTGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTgc > 1:116216/1‑140 (MQ=255)
aTTGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTgcg < 1:929826/140‑1 (MQ=255)
ttGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTgcgc < 2:1082054/140‑1 (MQ=255)
gCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAAt > 2:1500755/1‑140 (MQ=255)
gCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAAt > 2:277195/1‑140 (MQ=255)
gCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAAt < 2:933379/140‑1 (MQ=255)
gCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAAt > 1:209188/1‑140 (MQ=255)
ggTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGt > 2:1159205/1‑140 (MQ=255)
ttCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGtaat < 2:471755/140‑1 (MQ=255)
tCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGtaata > 1:515846/1‑140 (MQ=255)
cAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATaaa > 1:1116641/1‑140 (MQ=255)
cATCCGGGACAAAATATTTGTTTATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTc > 2:1061264/1‑140 (MQ=255)
ccGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGcc > 2:899718/1‑140 (MQ=255)
ccGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGcc > 1:980379/1‑140 (MQ=255)
cGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCg < 1:68964/140‑1 (MQ=255)
cGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCg < 1:1320205/140‑1 (MQ=255)
gggACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCgg < 2:639518/140‑1 (MQ=255)
ggACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGc > 1:383011/1‑136 (MQ=255)
ggACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGc < 2:383011/136‑1 (MQ=255)
ggACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGa > 1:1510260/1‑140 (MQ=255)
gACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAg > 1:1378444/1‑140 (MQ=255)
aCAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGt > 2:763827/1‑140 (MQ=255)
aCAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGt > 2:171824/1‑140 (MQ=255)
aCAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCACGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGt > 2:1347473/1‑140 (MQ=255)
cAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTg < 1:310097/140‑1 (MQ=255)
aaaaTATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGc < 1:687132/140‑1 (MQ=255)
aaaaTATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGc < 2:1163348/140‑1 (MQ=255)
aaaaTATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGc < 1:1500755/140‑1 (MQ=255)
aaaTATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGcc < 2:51713/140‑1 (MQ=255)
aaaTATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGcc < 2:370746/140‑1 (MQ=255)
aaaTATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGcc < 1:1243926/140‑1 (MQ=255)
aaaTATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGcc < 1:1260847/140‑1 (MQ=255)
aaaTATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGcc < 1:415629/140‑1 (MQ=255)
aaTATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGCCg > 2:250852/1‑140 (MQ=255)
tttGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGCCGGTAt < 1:558419/140‑1 (MQ=255)
ttGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGCCGGTATc > 1:871770/1‑140 (MQ=255)
tAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGCCGGTATCAATa < 1:160847/140‑1 (MQ=255)
aaTCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTAGAGAAACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACTTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGCCGGTATCAATAc > 1:1571448/1‑140 (MQ=255)
tCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGCCGGTATCAATACTg < 2:964341/140‑1 (MQ=255)
cGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGCCGGTATCAATACTgg > 2:1470847/1‑140 (MQ=255)
tGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGCCGGTATCAATACTGGCa > 1:1270588/1‑140 (MQ=255)
cGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGCCGGTATCAATACTGGCaaa > 1:60321/1‑140 (MQ=255)
gTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGCCGGTATCAATACTGGCAAAGACaa > 1:435113/1‑140 (MQ=255)
ttACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGCCGGTATCAATACTGGCAAAGACAAc < 1:933869/140‑1 (MQ=255)
ttACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGCCGGTATCAATACTGGCAAAGACAAc < 2:1378444/140‑1 (MQ=255)
tACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGCCGGTATCAATACCGGCAAAGACAAct < 1:502922/140‑1 (MQ=255)
tGAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGCCGGTATCAATACTGGCAAAGACAACTTCtttt > 2:459496/1‑140 (MQ=255)
ggAGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGCCGGTATCAATACTGGCAAAGACAACTTCtttt < 1:1092082/139‑1 (MQ=255)
aGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGCCGGTATCAATACTGGCa < 1:1212737/123‑1 (MQ=255)
aGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGCCGGTATCAATACTGGCAAAGACAACTTCTTTTGc > 1:979317/1‑140 (MQ=255)
aGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGCCGGTATCAATACTGGCAAAGACAACTTCTTTTGc > 1:101290/1‑140 (MQ=255)
aGGTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGCCGGTATCAATACTGGCAAAGACAACTTCTTTTGc > 1:1507079/1‑140 (MQ=255)
ggTTATCGCCTAATGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGCCGGTATCAATACTGGCAAAGACAACTTCTTTTGCa > 1:480823/1‑140 (MQ=255)
gTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGCCGGTATCAATACTGGCAAAGACACCTTCTTTTGCAc > 1:579834/1‑140 (MQ=255)
gTTATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGCCGGTATCAATACTGGCAAAGACAACTTCTTTTGCAc < 1:55399/140‑1 (MQ=255)
ttATCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGCCGGTATCAATACTGGCAAAGACAACTTCTTTTGCAcc < 2:1270588/140‑1 (MQ=255)
aTCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGTGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGCCGGTATCAATACTGGCAAAGACAACTTCTTTTGCACCtt < 2:701558/140‑1 (MQ=255)
aTCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCTATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGCCGGTATCAATACTGGCAAAGACAACTTCTTTTGCACCtt < 2:1468547/140‑1 (MQ=255)
aTCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGCCGGTATCAATACTGGCAAAGACAACTTCTTTTGCACCtt > 2:1346857/1‑140 (MQ=255)
aTCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGCCGGTATCAATACTGGCAAAGACAACTTCTTTTGCACCtt > 2:565814/1‑140 (MQ=255)
aTCGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGCCGGTATCAATACTGGCAAAGACAACTTCTTTTGCACCtt < 1:899718/140‑1 (MQ=255)
cGCCTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGCCGGTATCAATACTGGCAAAGACAACTTCTTTTGCACCTTTa < 2:663457/140‑1 (MQ=255)
ccTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGCCGGTATCAATACTGGCAAAGACAACTTCTTTTGCACCTTTAcc < 2:980379/140‑1 (MQ=255)
ccTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGCCGGTATCAATACTGGCAAAGACAACTTCTTTTGCACCTTTAcc < 2:979317/140‑1 (MQ=255)
cTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGCCGGTATCAATACTGGCAAAGACAACTTCTTTTGCACCTTTACCa > 1:941075/1‑140 (MQ=255)
cTAACGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGCCGGTATCAATACTGGCAAAGACAACTTCTTTTGCACCTTTACCa < 1:957967/140‑1 (MQ=255)
aCGTTACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGCCGGTATCAATACTGGCAAAGACAACTTCTTTTGCACCTTTACCAACa > 1:1558247/1‑140 (MQ=255)
|
TGACACGGCATGGTGTTCCACAAGTTACCCGGAGCCAGCTCCGTCAGCCCCATACTCAATTGGCAGGTTTCCAGTACATCCGGGACAAAATATTTGTTAATCGTGCGACGGTTACTGGTGAGGTTATCGCCTAACGTGACTGGAGATACTTCGTCCGGTGTGACTTTTTTGGTGGGATACGTCGTATGCGCGGGTGCGCAATTGTAATAAAACTTCGCCGGAGTGCCGGTATCAATACTGGCAAAGACAACTTCTTTTGCACCTTTACCAACA > NC_000913/2983538‑2983810
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
