Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F48 I1 R1
|
79 |
90.7 |
3162666 |
99.0% |
3131039 |
139.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,312,208 |
C→A |
D262Y (GAC→TAC) |
alsR ← |
DNA‑binding transcriptional repressor AlsR |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,312,208 | 0 | C | A | 100.0%
| 356.2
/ NA
| 101 | D262Y (GAC→TAC) | alsR | DNA‑binding transcriptional repressor AlsR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (47/54); total (47/54) |
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
ACTCCGCGATGGCGGAATTACCTTTTTCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTCCAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATCGGTGAAT‑GGTAGCTATGGGTTATACAAATAATCTTT > NC_000913/4312073‑4312344
|
aCTCCGCGATGGCGGAATTACCTTTTTCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGc > 1:1043738/1‑140 (MQ=255)
aCTCCGCGATGGCGGAATTACCTTTTTCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGc > 2:1558254/1‑140 (MQ=255)
cTCCGCGATGGCGGAATTACCTTTTTCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGTGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCa > 2:1398501/1‑140 (MQ=255)
cgcgATGGCGGAATTACCTTTTTCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAag < 2:1457948/140‑1 (MQ=255)
gcgATGGCGGAATTACCTTTTTCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAagt > 1:477527/1‑140 (MQ=255)
gcgATGGCGGAATTACCTTTTTCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAagt < 1:918321/140‑1 (MQ=255)
cgATGGCGGAATTACCTTTTTCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAagtt > 2:1033779/1‑140 (MQ=255)
cgATGGCGGAATTACCTTTTTCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAagtt > 1:316773/1‑140 (MQ=255)
gATGGCGGAATTACCTTTTTCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAagtta > 1:841644/1‑140 (MQ=255)
aTGGCGGAATTACCTTTTTCTTATTTGAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAagttag < 2:1422082/140‑1 (MQ=255)
aTGGCGGAATTACCTTTTTCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAagttag < 2:447526/140‑1 (MQ=255)
aTGGCGGAATTACCTTTTTCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAagttag < 1:696842/140‑1 (MQ=255)
aTGGCGGAATTACCTTTTTCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAagttag < 1:99066/140‑1 (MQ=255)
aggtggAATTAACTTTTTCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAagttagt < 2:703781/136‑1 (MQ=255)
cGGAATTACCTTTTTCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGt > 2:1449372/1‑140 (MQ=255)
cGGAATTACCTTTTTCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGt > 2:905908/1‑140 (MQ=255)
gAATTACCTTTTTCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTaa < 2:182653/140‑1 (MQ=255)
gAATTACCTTTTTCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTaa < 2:918143/140‑1 (MQ=255)
tttttCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCttt > 2:35217/1‑139 (MQ=255)
ttttCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGc > 2:38009/1‑140 (MQ=255)
ttCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCg < 2:477527/140‑1 (MQ=255)
aTTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCa > 2:1403527/1‑140 (MQ=255)
tttCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCAt > 2:210363/1‑140 (MQ=255)
cAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTAc < 1:991914/140‑1 (MQ=255)
gcgcgcCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGa < 2:911542/140‑1 (MQ=255)
cgcgcCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGAc > 2:1157752/1‑140 (MQ=255)
cgcgcCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGAc > 1:506259/1‑140 (MQ=255)
gcgcCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGAcc < 1:1403527/140‑1 (MQ=255)
caaTTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGCCCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCt < 1:484521/140‑1 (MQ=255)
aaTTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTg < 1:22533/140‑1 (MQ=255)
gcgcCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGa > 1:366191/1‑140 (MQ=255)
gcgcCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGa < 1:1565709/140‑1 (MQ=255)
gcgcCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGATGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTCCAGCAAAGTTAGGTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGCCTGGTgc > 2:1461908/1‑139 (MQ=255)
gcgcCGGTTTATTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGa < 1:35217/140‑1 (MQ=255)
gcCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGc < 1:38009/140‑1 (MQ=255)
ccGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCa < 1:1157752/140‑1 (MQ=255)
ccGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCa < 2:443073/140‑1 (MQ=255)
ccGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCa < 2:145432/140‑1 (MQ=255)
ccGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCa < 2:294902/140‑1 (MQ=255)
ccGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCa < 1:18611/140‑1 (MQ=255)
ccGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCa < 1:1558254/140‑1 (MQ=255)
ccGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCa < 2:734992/140‑1 (MQ=255)
ccGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCa < 2:868219/140‑1 (MQ=255)
ccGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTATTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCa < 1:846681/140‑1 (MQ=255)
ttttGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCa > 2:1293999/1‑134 (MQ=255)
ttttGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCa < 1:1293999/134‑1 (MQ=255)
attaatattaGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCgg > 2:1369050/1‑140 (MQ=255)
ttaatattaGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGc > 2:362728/1‑140 (MQ=255)
ataatattaGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGc < 2:672819/139‑1 (MQ=255)
ttaGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGttt > 2:312627/1‑140 (MQ=255)
aGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGCCCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCg < 1:1398501/140‑1 (MQ=255)
gCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGc > 1:19431/1‑140 (MQ=255)
gCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGc > 1:1548027/1‑140 (MQ=255)
gCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGc > 2:1407630/1‑140 (MQ=255)
cTTGTTGAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAACTTAGTTGTAATATTCTTGCCGTGTCATTACGACCTAATACCTGCGTTTCCTTGGCTGGTGAGCTAATAATATTATCGGTCAGTTTTGCt > 2:289343/1‑140 (MQ=255)
cTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCt > 2:9181/1‑140 (MQ=255)
ttGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCtt > 2:546685/1‑139 (MQ=255)
ttGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTa > 1:79034/1‑140 (MQ=255)
tGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTAt < 1:1542006/140‑1 (MQ=255)
tGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTAt < 1:1407630/140‑1 (MQ=255)
tGTTCAATGTTGAGCTAGGCGACAGAGTCAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCAGAGGCATTACGACCTAATAGCGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTAt < 2:1529207/140‑1 (MQ=255)
gTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATc > 2:1144657/1‑140 (MQ=255)
gTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATc > 2:1338579/1‑140 (MQ=255)
gTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATc > 1:1382277/1‑140 (MQ=255)
gTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATc > 2:1130362/1‑140 (MQ=255)
ttCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATCg > 2:131042/1‑140 (MQ=255)
ttCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATCg > 2:492477/1‑140 (MQ=255)
ttCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATCg > 2:1205833/1‑140 (MQ=255)
ttCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATCg > 1:771968/1‑140 (MQ=255)
ttCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATCg > 1:814972/1‑140 (MQ=255)
cAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATCGGt < 1:290651/140‑1 (MQ=255)
aaaTGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATCGGt < 2:127452/139‑1 (MQ=255)
aaTGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATCGGTg < 2:1548027/140‑1 (MQ=255)
tGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATCGGTGaa > 2:1570829/1‑140 (MQ=255)
ttGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATCGGTGAAT‑g < 2:1043738/140‑1 (MQ=255)
ttGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATCGGTGAAT‑g < 1:131042/140‑1 (MQ=255)
ttGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATCGGTGAAT‑g < 1:1033779/140‑1 (MQ=255)
aGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTAt > 1:1476906/1‑128 (MQ=255)
aGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTAt < 2:1476906/128‑1 (MQ=255)
aGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATCGGTg < 2:927132/133‑1 (MQ=255)
aGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATCGGTg > 1:927132/1‑133 (MQ=255)
aGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATCGGTGAAT‑GGTa > 1:459215/1‑140 (MQ=255)
aGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATCGGTGAAT‑GGTa > 2:565382/1‑140 (MQ=255)
aGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATCGGTGAAT‑GGTa > 1:727670/1‑140 (MQ=255)
aGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATCGGAGAAT‑GGtg > 2:367314/1‑139 (MQ=255)
tGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATCGGTGAAT‑GGTAGCt < 2:727670/140‑1 (MQ=255)
tGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATCGGTGAAT‑GGTAGCt < 1:905908/140‑1 (MQ=255)
tGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATCGGTGAAT‑GGTAGCt < 1:1558970/140‑1 (MQ=255)
ggCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATCGGTGAAT‑GGTAGCTAt > 2:868841/1‑140 (MQ=255)
ggCGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGGTTCGCTATCGGTGAATGGGTAGCTa > 1:1190819/1‑140 (MQ=255)
cGACAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATCGGTGAAT‑GGTAGCTATgg > 1:1336090/1‑140 (MQ=255)
aCAGAGACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATCGGTGAAT‑GGTAGCTATGGGt < 2:771968/140‑1 (MQ=255)
agagACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATCGGTGAAT‑GGTAGCTATGGGTta < 2:19431/140‑1 (MQ=255)
agagACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATCGGTGAAT‑GGTAGCTATGGGTta < 1:1205833/140‑1 (MQ=255)
agagACAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATCGGTGAAT‑GGTAGCTATGGGTta < 1:1130362/140‑1 (MQ=255)
aCAAAAAAAGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATCGGTGAAT‑GGTAGCTATGGGTTATACa > 1:116157/1‑140 (MQ=255)
aaaaaaGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATCGGTGAAT‑GGTAGCTATGGGTTATACAaat < 1:565382/140‑1 (MQ=255)
aaaaaaGCGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATCGGTGAAT‑GGTAGCTATGGGTTATACAaat < 2:1224826/140‑1 (MQ=255)
cGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATCGGTGAAT‑GGTAGCTATGGGTTATACAAATAATCttt > 1:1526726/1‑140 (MQ=255)
cGTACAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATCGGTGAAT‑GGTAGCTATGGGTTATACAAATAATCttt > 1:1255340/1‑140 (MQ=255)
|
ACTCCGCGATGGCGGAATTACCTTTTTCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAATATTAGCTTGTTCAATGTTGAGCTGGGCGACAGAGACAAAAAAAGCGTCCAGCAAAGTTAGTTGTAATATTCTTGCCGAGGCATTACGACCTAATAACGGCGTTTCCGGGGCTGGTGAGCAAATAATATAATCGGCCAGTTTCGCTATCGGTGAAT‑GGTAGCTATGGGTTATACAAATAATCTTT > NC_000913/4312073‑4312344
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
