Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F48 I1 R1
|
62 |
93.4 |
3176452 |
99.2% |
3151040 |
139.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,357,030 |
G→T |
P530T (CCG→ACG) |
cadA ← |
lysine decarboxylase 1 |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,357,030 | 0 | G | T | 100.0%
| 417.4
/ NA
| 117 | P530T (CCG→ACG) | cadA | lysine decarboxylase 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (62/55); total (62/55) |
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
TACAGAGACGGCAGCATGTTTTTCACACGCAGGTTCAGGTCGAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATAC > NC_000913/4356897‑4357166
|
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aCAGAGACGGCAGCATGTTTTTCACACGCAGGTTCAGGTCGAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGtt < 2:747656/140‑1 (MQ=255)
agagACGGCAGCATGTTTTTCACACGCAGGTTCAGGTCGAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGtttt > 2:1310225/1‑140 (MQ=255)
agagACGGCAGCATGTTTTTCACACGCAGGTTCAGGTCGAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGtttt > 1:1198722/1‑140 (MQ=255)
ggaCGGCAGCATGTTTTTCACACGCAGGTTCAGGTCGAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTtct > 1:457243/2‑140 (MQ=255)
agaCGGCAGCATGTTTTTCACACGCAGGTTCAGGTCGAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTtct > 2:647809/1‑140 (MQ=255)
gcagcaTGTTTTTCACACGCAGGTTCAGGTCGAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTcaaca > 1:598161/1‑140 (MQ=255)
gcagcaTGTTTTTCACACGCAGGTTCAGGTCGAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTcaaca > 2:605887/1‑140 (MQ=255)
gcagcaTGTTTTTCACACGCAGGTTCAGGTCGAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTcaaca > 2:1412182/1‑140 (MQ=255)
gcagcaTGTTTTTCACACGCAGGTTCAGGTCGAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTcaaca > 2:1370287/1‑140 (MQ=255)
gcagcaTGTTTTTCACACGCAGGTTCAGGTCGAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTCTCTcaaca > 2:35557/1‑140 (MQ=255)
gcaTGTTTTTCACACGCAGGTTCAGGTCGAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACg > 2:1477625/1‑140 (MQ=255)
tGTTTTTCACACGCAGGTTCAGGTCGAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATg < 2:1569399/140‑1 (MQ=255)
gTTTTTCACACGCAGGTTCAGGTCGAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGc > 2:1308216/1‑140 (MQ=255)
cacGCAGGTTCAGGTCGAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTtcg < 1:84110/140‑1 (MQ=255)
gCAGGTTCAGGTCGAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTtcgtcg > 2:1018745/1‑140 (MQ=255)
gCAGGTTCAGGTCGAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTtcgtcg < 1:372659/140‑1 (MQ=255)
gCAGGTTCAGGTCGAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTtcgtcg < 1:1337995/140‑1 (MQ=255)
ttCAGGTCGAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTa < 2:598161/140‑1 (MQ=255)
gAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCa < 1:1370287/140‑1 (MQ=255)
gAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGAAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCa < 1:1180364/140‑1 (MQ=255)
aaCGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCAc > 2:1182890/1‑140 (MQ=255)
aaCGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCAc > 2:1105642/1‑140 (MQ=255)
aaCGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCAc > 2:1098733/1‑140 (MQ=255)
aaCGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCAc > 1:853347/1‑140 (MQ=255)
aaCGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCAc > 2:1374084/1‑140 (MQ=255)
cACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATg < 1:647809/140‑1 (MQ=255)
aCGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGc > 1:1565835/1‑140 (MQ=255)
cGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCt > 1:162258/1‑140 (MQ=255)
cGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCt > 2:1418231/1‑140 (MQ=255)
cGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAACAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCt > 2:1378756/1‑140 (MQ=255)
ttAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGc < 1:1218844/140‑1 (MQ=255)
ttAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGc < 1:1231216/140‑1 (MQ=255)
ttAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGc < 2:1565835/140‑1 (MQ=255)
aaaGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCg < 1:1514165/140‑1 (MQ=255)
aaaGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCg < 1:1182890/140‑1 (MQ=255)
tcagAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCa > 2:151999/1‑140 (MQ=255)
tcagAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCa > 1:636824/1‑140 (MQ=255)
cagAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCaa < 1:1477625/140‑1 (MQ=255)
agagCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCaaa < 1:1412182/140‑1 (MQ=255)
agCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGt > 2:1197329/1‑140 (MQ=255)
cACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCg > 2:909246/1‑140 (MQ=255)
cagcagGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTct > 2:1450010/1‑139 (MQ=255)
cagcagGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCa < 2:1108555/140‑1 (MQ=255)
ggCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTg > 1:1245618/1‑140 (MQ=255)
ggCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTg < 1:1216473/140‑1 (MQ=255)
gCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGc > 2:1168142/1‑140 (MQ=255)
tCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCGCGATGCTGGCCGGAATCCCAAAGTCGCTCATGGTGCCg < 1:1105642/140‑1 (MQ=255)
aGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTc < 1:1197329/140‑1 (MQ=255)
gTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCt > 2:30832/1‑140 (MQ=255)
gTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCt > 1:322506/1‑140 (MQ=255)
gCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTGATGGTGCCGTCttt > 2:1525891/1‑140 (MQ=255)
gCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCttt > 2:540812/1‑140 (MQ=255)
ttGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTc < 2:659700/140‑1 (MQ=255)
tGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTcc > 1:445538/1‑140 (MQ=255)
ggTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCa < 2:322506/140‑1 (MQ=255)
ggTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCa < 2:829659/140‑1 (MQ=255)
tCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATc > 2:205408/1‑140 (MQ=255)
cTTAGCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGGTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGGGGTATTTCGCCGCGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATcc < 1:1123563/140‑1 (MQ=255)
ttATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATccc < 1:1310225/140‑1 (MQ=255)
ttAACGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTAATACGTACCGGTTTTCTAAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCCCGATGCTGGACGGAATACGAAAGTCGCGCATGGTGGCGTCTTTTTCCAcccc < 2:1576397/140‑1 (MQ=255)
aTCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCg > 2:156611/1‑140 (MQ=255)
cGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGa < 1:1374084/140‑1 (MQ=255)
aTACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGt < 1:834672/140‑1 (MQ=255)
tACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTc > 1:949886/1‑140 (MQ=255)
aCCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTca > 1:671741/1‑140 (MQ=255)
ccGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTcag < 1:605887/140‑1 (MQ=255)
ccGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTcag < 2:1173115/140‑1 (MQ=255)
ccGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTcag < 1:1538331/140‑1 (MQ=255)
aTGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTcagcag > 1:1281970/1‑140 (MQ=255)
aTGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTcagcag > 2:1192936/1‑140 (MQ=255)
aTGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACAATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTcagcag > 2:898401/1‑140 (MQ=255)
tGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAgg > 1:1160660/1‑140 (MQ=255)
tGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAgg < 1:569211/140‑1 (MQ=255)
tGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAgg < 1:62064/140‑1 (MQ=255)
gaacaggaacagCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAGAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGa > 1:1500267/1‑140 (MQ=255)
aacaggaacagTAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGAGGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGAc > 2:1250811/1‑140 (MQ=255)
aacaggaacagCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGAc > 1:1126192/1‑140 (MQ=255)
caggaacagCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACtt > 2:1371334/1‑140 (MQ=255)
gaacagCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTgt > 2:872389/1‑139 (MQ=255)
gaacagCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGa > 1:1101926/1‑140 (MQ=255)
aacagCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGAt < 2:1533481/140‑1 (MQ=255)
aacagCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGAt < 2:1036002/140‑1 (MQ=255)
aacagCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGAt < 2:636824/140‑1 (MQ=255)
aacagCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGAt < 1:312091/140‑1 (MQ=255)
aacagCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGAt < 2:671741/140‑1 (MQ=255)
aacagCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTGCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGAt < 1:620844/140‑1 (MQ=255)
aacagCAGGTTATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCACATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGAt < 1:1418231/140‑1 (MQ=255)
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ttATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAg > 2:757589/1‑140 (MQ=255)
ttATACGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAg < 2:1101926/140‑1 (MQ=255)
aCGTACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGCGACTTTGATCGGGTCAAGATAc > 1:712908/1‑140 (MQ=255)
|
TACAGAGACGGCAGCATGTTTTTCACACGCAGGTTCAGGTCGAACGCACGTTTAAAGTCAGTCAGAGCACGCAGCAGGCTCAGTGCTTTGGTCTTATCGATACCGATGCTGAACAGGAACAGCAGGTTATACGGACCGGTTTTCTCAACAACGATGCCATGTTCGTCGAGGTATTTCGCCACGATGCTGGCCGGAATACCAAAGTCGCTCATGGTGCCGTCTTTTTCCATCCCCGGAGTCAGCAGGGTGACTTTGATCGGGTCAAGATAC > NC_000913/4356897‑4357166
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
