Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F13 I1 R1
|
24 |
670.1 |
22273598 |
98.8% |
22006314 |
140.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,549,187 |
C→T |
A127V (GCG→GTG) |
fimH → |
type 1 fimbriae D‑mannose specific adhesin |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,549,187 | 0 | C | T | 98.1%
| 2961.9
/ 22.8
| 695 | A127V (GCG→GTG) | fimH | type 1 fimbriae D‑mannose specific adhesin |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (4/9); new base T (332/348); total (337/358) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.65e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.94e-01 |
Only 100 of 706 total aligned reads displayed.
CACTGCAACGAGGCTCGGCTTATGGCGGCGTGTTATCTAATTTTTCCGGGACCGTAAAATATAGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGCGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATAACAGCGATGATTTCCAGTTTGTGTGGAATATTTACGCCAATAATGATGTGG > NC_000913/4549040‑4549333
|
cacTGCAACGAGGCTCGGCTTATGGCGGCGTGTTATCTAATTTTTCCGGGACCGTAAAATATAGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCATCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGgtgc < 1:10826826/150‑1 (MQ=255)
cTGCAACGAGGCTCGGCTTATGGCGGCGTGTTATCTAATTTTTCCGGGACCGTAAAATATAGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCtt > 1:10827619/1‑150 (MQ=255)
aaCGAGGCTCGGCTTATGGCGGCGTGTTATCTAATTTTTCCGGGACCGTAAAATATAGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTAtt > 1:10827630/1‑150 (MQ=255)
gAGGCTCGGCTTATGGCGGCGTGTTATCTAATTTTTCCGGGACCGTAAAATATAGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGa < 1:10827157/150‑1 (MQ=255)
aGGCTCGGCTTATGGCGGCGTGTTATCTAATTTTTCCGGGACCGTAAAATATAGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGAc > 2:10827641/1‑150 (MQ=255)
cGGCTTATGGCGGCGTGTTATCTAATTTTTCCGGGACCGTAAAATATAGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGcc < 2:10826786/148‑1 (MQ=255)
cTTATGGCGGCGTGTTATCTAATTTTTCCGGGACCGTAAAATATAGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGa < 1:10827136/150‑1 (MQ=255)
cTTATGGCGGCGTGTTATCTAATTTTTCCGGGACCGTAAAATATAGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGCGCTTTATTTGACGCCTGTGa < 1:10827642/150‑1 (MQ=255)
ggcggcGTGTTATCTAATTTTTCCGGGACCGTAAAATATAGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGt > 1:10827665/1‑150 (MQ=255)
cggcgTGTTATCTAATTTTTCCGGGACCGTAAAATATAGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTgc < 1:10827111/150‑1 (MQ=255)
ggcgTGTTATCTAATTTTTCCGGGACCGTAAAATATAGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTgcg > 2:10827675/1‑150 (MQ=255)
gcgTGTTATCTAATTTTTCCGGGACCGTAAAATATAGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTgcgg > 1:10827676/1‑150 (MQ=255)
cgTGTTATCTAATTTTTCCGGGACCGTAAAATATAGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTgcgg < 1:10826418/149‑1 (MQ=255)
gtgtTATCTAATTTTTCCGGGACCGTAAAATATAGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTgcgggc < 2:10827141/150‑1 (MQ=255)
gtTATCTAATTTTTCCGGGACCGTAAAATATAGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTgcgggcgg > 1:10827687/1‑150 (MQ=255)
cTAATTTTTCCGGGACCGTAAAATATAGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTgt > 1:10827698/1‑149 (MQ=255)
tAATTTTTCCGGGACCGTAAAATATAGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTgg > 2:10827703/1‑149 (MQ=255)
aTTTTTCCGGGACCGTAAAATATAGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTg < 1:10827236/146‑1 (MQ=255)
aTTTTTCCGGGACCGTAAAATATAGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTg < 2:10826901/146‑1 (MQ=255)
tttttCCGGGACCGTAAAATATAGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGAt > 1:10827710/1‑150 (MQ=255)
ttttCCGGGACCGTAAAATATAGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTgcg < 1:10827267/135‑1 (MQ=255)
ttCCGGGACCGTAAAATATAGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTa < 2:10826852/149‑1 (MQ=255)
ttCCCGGACCGTAAAATATAGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTa < 1:10827203/149‑1 (MQ=255)
cGGGACCGTAAAATATAGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGa > 1:10827723/1‑122 (MQ=255)
cGGGACCGTAAAATATAGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAg < 1:10826964/149‑1 (MQ=255)
gggACCGTAAAATATAGTGGCAGTAGCTATCCATTGCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTgcg > 2:10827725/1‑129 (MQ=255)
ggACCGTAAAATATAGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATCCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGCGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTgcg < 2:10826665/128‑1 (MQ=255)
gACCGTAAAATATAGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTgg < 2:10827105/150‑1 (MQ=255)
ccGTAAAATATAGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCt > 2:10827736/1‑150 (MQ=255)
ccGTAAAATATAGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCt < 1:10827093/150‑1 (MQ=255)
cGTAAAATATAGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTc < 2:10826991/150‑1 (MQ=255)
aaaaTATAGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCa > 2:10827748/1‑148 (MQ=255)
aaaaTATAGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGAGTAAAGCTGGCTCAt > 1:10827745/1‑149 (MQ=255)
tataGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAAtt < 2:10827084/150‑1 (MQ=255)
ataGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTg > 1:10827761/1‑150 (MQ=255)
ataGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGGTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGAGGGGTGGCGATTCAAGCt > 2:10827764/1‑137 (MQ=255)
taGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTg < 2:10827028/137‑1 (MQ=255)
tGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGt < 2:10827190/150‑1 (MQ=255)
ggCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGt > 2:10827776/1‑149 (MQ=255)
ggCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTg > 1:10827775/1‑150 (MQ=255)
gCAGTAGCTATCCATTTCCGACCACCATCGAAACGCCGCGCGTTGCTTATAATTCCAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGc < 2:10827234/150‑1 (MQ=255)
aGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCtt < 1:10827463/150‑1 (MQ=255)
tAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTAt > 1:10827785/1‑150 (MQ=255)
tAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCGNGCTCATTAATTGCCGTGCTTAt > 2:10827788/1‑150 (MQ=255)
cTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCNGTGCGGGCGGGGTGGc > 2:10827800/1‑114 (MQ=255)
tATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTg > 1:10827802/1‑150 (MQ=255)
ccATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGCGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTaaa < 2:10826921/117‑1 (MQ=255)
cATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGa > 1:10827816/1‑149 (MQ=255)
tCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTAt > 1:10827823/1‑138 (MQ=255)
cTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGAcc > 2:10827827/1‑149 (MQ=255)
accaccAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACcaa > 1:10827833/1‑149 (MQ=255)
caccaGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACcaacaa < 1:10827425/150‑1 (MQ=255)
accaGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCaacaac < 1:10827655/150‑1 (MQ=255)
ccaGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACcaaca < 2:10826962/147‑1 (MQ=255)
ccaGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACt < 1:10826946/150‑1 (MQ=255)
caGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACta > 1:10827845/1‑150 (MQ=255)
caGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACt > 2:10827848/1‑149 (MQ=255)
gCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACtata < 2:10827221/150‑1 (MQ=255)
gCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACtata < 2:10827297/150‑1 (MQ=255)
cGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATaa < 2:10827282/150‑1 (MQ=255)
gAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATaa > 1:10827859/1‑149 (MQ=255)
aaaCGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGGGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATAAc < 1:10826647/149‑1 (MQ=255)
aaCGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATAACAg > 2:10827865/1‑150 (MQ=255)
aCGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATAACAGc < 1:10827382/150‑1 (MQ=255)
cgccgcGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATAACAGc > 2:10827875/1‑149 (MQ=255)
gccgcGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATAACAGCga < 1:10827564/150‑1 (MQ=255)
gccgcGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATAACAGCga > 1:10827877/1‑150 (MQ=255)
gcgcgTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATAACAGCgatga < 2:10827325/150‑1 (MQ=255)
gcgTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATAACAGCGATGAtt > 2:10827888/1‑150 (MQ=255)
gttgttTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGAcc < 2:10826354/126‑1 (MQ=255)
gttgttTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCTACAACTATAACAGCAATGATTTc > 1:10827896/1‑150 (MQ=255)
ttgttTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATAACAGCGATGATTTcc < 1:10827345/150‑1 (MQ=255)
tggttTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACg > 2:10827898/3‑53 (MQ=255)
gttTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATAACAGCGATGATTTCCa < 2:10826976/149‑1 (MQ=255)
tttATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCCGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATAACAGCGATGATTTCCAg < 2:10827252/149‑1 (MQ=255)
tttATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATAATAGCGATGATTTCCAGt < 2:10827659/150‑1 (MQ=255)
ttATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACCATAACa > 2:10827908/1‑134 (MQ=255)
tataATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATAACAGCGATGATTTCCAGtt < 2:10827050/149‑1 (MQ=255)
ataATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGGGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATCAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATAACAGCGATGATTTc > 1:10827916/1‑143 (MQ=255)
taATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATAACAGCGATGATTTCCAGTTtg < 1:10826996/149‑1 (MQ=255)
aaTTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTGTTGTGCGACAGACCAACAACTATAACAGCg > 2:10827922/1‑133 (MQ=255)
aaTTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATAACAGCGATGATTTCCAGTTtg < 2:10827490/148‑1 (MQ=255)
ttCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATAACAGCGATGATTTCCAGTTtgtgtg < 1:10827042/150‑1 (MQ=255)
tCGAGAACGGATAAGGCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATAACAGCgatga < 2:10827339/134‑1 (MQ=255)
cGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATAACAGCGATGATTTCCAGTTTGTGTgg < 1:10826884/149‑1 (MQ=255)
gagaACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATAACAGCGATGATTTCCAGTTTGTGTGGaa > 1:10827929/1‑150 (MQ=255)
aaCGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATAACAGCGATGATTTCCAGTTTGTGTGGAatat < 1:10827405/150‑1 (MQ=255)
aaCGGATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATAACAGCGATGATTTCCAGTTTGTGTGGAatat < 1:10827030/150‑1 (MQ=255)
ggATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATAACAGCGATGATTTCCAGTTTGTGTGGAATATTTa > 2:10827938/1‑150 (MQ=255)
gATAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATAACAGCGATGATTTCCAGTTTGTGTGGAATATTTa < 2:10827204/149‑1 (MQ=255)
aTAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATAACAGCGATGATTTCCAGTTTGTGTGGAATATTTACg > 1:10827942/1‑150 (MQ=255)
tAAGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATAACAGCGATGATTTCCAGTTTGTGTGGAATATTTACGc < 1:10827314/150‑1 (MQ=255)
aGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATAAc < 2:10827374/113‑1 (MQ=255)
aGCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATAACAGCGATGATTTCCAg > 2:10827952/1‑128 (MQ=255)
gCCGTGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATAACAGCGATGATTTCCAGTTTGTGTGGAATATTTACGCCaa > 1:10827954/1‑150 (MQ=255)
tGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATAACAGCGATGATTTCCAGTTTGTGTGGAATATTTa < 2:10827407/140‑1 (MQ=255)
tGGCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATAACAGCGATGATTTCCAGTTTGTGTGGAATATTTACGCCaataa < 1:10826745/149‑1 (MQ=255)
ggCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATAACAGCGATGATTTCCAGTTTGTGTGGAATATTTACGCCaataat > 1:10827965/1‑149 (MQ=255)
gCCGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGGAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCAtt < 2:10827169/66‑1 (MQ=255)
ccGGTGGTGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATAACAGCGATGATTTCCAGTTTGTGTGGAATATTTACGCCAATAatgat < 2:10827591/150‑1 (MQ=255)
|
CACTGCAACGAGGCTCGGCTTATGGCGGCGTGTTATCTAATTTTTCCGGGACCGTAAAATATAGTGGCAGTAGCTATCCATTTCCTACCACCAGCGAAACGCCGCGCGTTGTTTATAATTCGAGAACGGATAAGCCGTGGCCGGTGGCGCTTTATTTGACGCCTGTGAGCAGTGCGGGCGGGGTGGCGATTAAAGCTGGCTCATTAATTGCCGTGCTTATTTTGCGACAGACCAACAACTATAACAGCGATGATTTCCAGTTTGTGTGGAATATTTACGCCAATAATGATGTGG > NC_000913/4549040‑4549333
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
