Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F13 I1 R1
|
15 |
2083.3 |
68373553 |
99.6% |
68100058 |
141.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,584,362 |
A→G |
intergenic (+53/‑42) |
yrhA → / → yrhD |
putative uncharacterized protein YrhA/uncharacterized protein YrhD |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,584,362 | 0 | A | G | 99.8%
| 9493.8
/ NA
| 2254 | intergenic (+53/‑42) | yrhA/yrhD | putative uncharacterized protein YrhA/uncharacterized protein YrhD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (3/0); major base G (1322/925); minor base T (4/0); total (1329/925) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.49e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 2254 total aligned reads displayed.
TGAAATTAGAGATAATATTGGCACAGAAAATATATTCAGTTCGTTTAGTGATTTCTCTTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTACCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGTCTCTATTTTAGCCGAAATAGCTAATGGCTATGATGATTTTAATGAC > NC_000913/3584216‑3584508
|
gAAATTAGAGATAATATTGGCACAGAAAATATATTCAGTTCGTTTAGTGATTTCTCTTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCcag > 1:26283108/1‑150 (MQ=255)
gAAATTAGAGATAATATTGGCACAGAAAATATATTCAGTTCGTTTAGTGATTTCTCTTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCca < 1:26281694/149‑1 (MQ=255)
aaTTAGAGATAATATTGGCACAGAAAATATATTCAGTTCGTTTAGTGATTTCTCTTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCcagca < 1:26281440/150‑1 (MQ=255)
aaTTAGAGATAATATTGGCACAGAAAATATATTCAGTTCGTTTAGTGATTTCTCTTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCcag > 2:26283139/1‑148 (MQ=255)
agagATAATATTGGCACAGAAAATATATTCAGTTGGTTTAGTGATTTCTCTTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGaa > 1:26283198/1‑149 (MQ=255)
agagATAATATTGGCACAGAAAATATATTCAGTTCGTTTAGTGATTTCTCTTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGaa > 2:26283198/1‑149 (MQ=255)
taataTTGGCACAGAAAATATATTCAGTTCGTTTAGTGATTTCTCTTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTcc > 1:26283248/1‑150 (MQ=255)
aataTTGGCACAGAAAATATATTCAGTTCGTTTAGTGATTTCTCTTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCt > 2:26283260/1‑150 (MQ=255)
tatTGGCACAGAAAATATATTCAGTTCGTTTAGTGATTTCTCTTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTg > 1:26283300/1‑150 (MQ=255)
atTGGCACAGAAAATATATTCAGTTCGTTTAGTGATTTCTCTTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCttat > 2:26283323/1‑148 (MQ=255)
ttGGCACAGAAAATATATTCAGTTCGTTTAGTGATTTCTCTTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGt < 1:26281953/149‑1 (MQ=255)
ggCACAGAAAATATATTCAGTTCGTTTAGTGATTTCTCTTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTc > 1:26283359/1‑149 (MQ=255)
gCACAGAAAATATATTCAGTTCGTTTAGTGATTTCTCTTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGa < 1:26281348/150‑1 (MQ=255)
caGAAAATATATTCAGTTCGTTTAGTGATTTCTCTTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAAt > 2:26283382/1‑150 (MQ=255)
aGAAAATATATTCAGTTCGTTTAGTGATTTCTCTTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAAtt > 1:26283391/1‑150 (MQ=255)
gAAAATATATTCAGTTCGTTTAGTGATTTCTCTTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAAttt < 1:26281887/150‑1 (MQ=255)
aaTATATTCAGTTCGTTTAGTGATTTCTCTTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAg > 1:26283429/1‑149 (MQ=255)
tatatTCAGTTCGTTTAGTGATTTCTCTTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGct > 2:26283451/1‑148 (MQ=255)
atatTCAGTTCGTTTAGTGATTTCTCTTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGt > 1:26283462/1‑150 (MQ=255)
ttCAGTTCGTTTAGTGATTTCTCTTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGc < 1:26280589/149‑1 (MQ=255)
aGTTCGTTTAGTGATTTCTCTTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAg < 1:26281603/149‑1 (MQ=255)
aGTTCGTTTAGTGATTTCTCTTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGc > 2:26283505/1‑150 (MQ=255)
aGTTCGTTTAGTGATTTCTCTTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGc > 1:26283503/1‑150 (MQ=255)
tCGTTTAGTGATTTCTCTTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAAGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAAttt < 2:26279222/135‑1 (MQ=255)
cGTTTAGTGATTTCTCTTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAg > 1:26283552/1‑145 (MQ=255)
cGTTTAGTGATTTCTCTTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTCTAGAGATTGCCAGCAGAACATTCCTTGTTCGAAATTTAg > 2:26283552/1‑136 (MQ=255)
ttAGTGATTTCTCTTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGa > 2:26283592/1‑149 (MQ=255)
tAGTGATTTCTCTTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGaa > 1:26283604/1‑149 (MQ=255)
tGATTTCTCTTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAAc > 1:26283645/1‑150 (MQ=255)
tGATTTCTCTTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAAc > 2:26283650/1‑150 (MQ=255)
tttCTCTTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTa < 1:26280254/150‑1 (MQ=255)
ctctTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACaa > 1:26283690/1‑150 (MQ=255)
ctctTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACa < 2:26282736/149‑1 (MQ=255)
ctctTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACa < 2:26282272/149‑1 (MQ=255)
tctTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCg < 1:26280866/114‑1 (MQ=255)
tctTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAAc > 2:26283705/1‑150 (MQ=255)
ttCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACg > 1:26283730/1‑149 (MQ=255)
cATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGa < 1:26281785/149‑1 (MQ=255)
aTTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGaa < 1:26281523/149‑1 (MQ=255)
ttattAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGaa < 2:26280862/145‑1 (MQ=255)
ttCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAAc > 1:26283773/1‑149 (MQ=255)
ttCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAAc > 2:26283762/1‑149 (MQ=255)
cTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTa < 2:26282011/149‑1 (MQ=255)
tAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACa < 2:26281745/138‑1 (MQ=255)
gAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCtt < 2:26282090/150‑1 (MQ=255)
gAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCt > 2:26283812/1‑149 (MQ=255)
gAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCt > 1:26283812/1‑149 (MQ=255)
aaaTCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTa < 1:26282022/150‑1 (MQ=255)
aaTCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCtt > 1:26283852/1‑148 (MQ=255)
aTCATGGACAGTTGTTAATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAg < 1:26278212/150‑1 (MQ=255)
cATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGt > 2:26283865/1‑149 (MQ=255)
tGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTgag < 1:26283159/150‑1 (MQ=255)
ggACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGt > 1:26283893/1‑146 (MQ=255)
aCAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATg < 2:26281203/150‑1 (MQ=255)
cAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTACTTAAGTGAGAt > 2:26283924/1‑148 (MQ=255)
aGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTcc > 1:26283932/1‑136 (MQ=255)
gttCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCg < 1:26281211/149‑1 (MQ=255)
ttCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGa < 2:26282401/149‑1 (MQ=255)
tCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTATACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCg > 1:26283982/1‑147 (MQ=255)
tCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCg > 2:26283969/1‑147 (MQ=255)
tCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCAGCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTga < 2:26281566/138‑1 (MQ=255)
cATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAg < 2:26281907/149‑1 (MQ=255)
cATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAg < 2:26282519/149‑1 (MQ=255)
taataaTCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGTGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGAc > 2:26284012/1‑149 (MQ=255)
taatCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATg > 1:26284039/1‑149 (MQ=255)
tCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAg > 2:26284072/1‑149 (MQ=255)
tCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGt > 1:26284070/1‑150 (MQ=255)
aaaGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGtctc > 2:26284103/1‑150 (MQ=255)
aaGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGt > 1:26284133/1‑80 (MQ=255)
gAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGTCTCTAtt > 2:26284152/1‑150 (MQ=255)
aCAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGTCTCTAtttt < 1:26282361/149‑1 (MQ=255)
aCAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGTCTCTAttt > 1:26284179/1‑148 (MQ=255)
cAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGTCTCTATTTTAg < 2:26280325/150‑1 (MQ=255)
aaaaaTCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGTCTCTATTTTAGc > 2:26284195/1‑150 (MQ=255)
aaaaaTCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGTCTCTATTTTAGc < 1:26281063/150‑1 (MQ=255)
aTCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGTCTCTATTTTAGCCGa > 2:26284227/1‑149 (MQ=255)
tCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGTCTCTATTTTAGCCGaaa < 1:26282188/150‑1 (MQ=255)
cATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTTCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGTCTCTATTTTAGCCGaaa > 1:26284242/1‑149 (MQ=255)
aTTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGTCTCTATTTTAGCCGAAATa < 2:26280674/150‑1 (MQ=255)
aTTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGTCTCTATTTTAGCCGAAATa < 1:26282512/150‑1 (MQ=255)
ttGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGAc > 2:26284270/1‑116 (MQ=255)
tGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGTCTCTATTTTAGCCGAAATAGc > 1:26284279/1‑150 (MQ=255)
aaaCCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGTCTCTATTTTAGCCGAAATAGCTa < 2:26281642/149‑1 (MQ=255)
aaCCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGTCTCTATTTTAGCCGAAATAGCTAAt > 1:26284320/1‑150 (MQ=255)
aaCCATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATCCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAAc > 2:26284329/1‑83 (MQ=255)
cATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAACTTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGTCTCTATTTTAGCCGAAATAGCTAATGGc > 1:26284364/1‑150 (MQ=255)
cATGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGTCTCTATTTTAGCCGAAATAGCTAATgg < 2:26281833/149‑1 (MQ=255)
aTGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGTCTCTATTTTAGCCGAAATAGCTAATGGc < 1:26282101/149‑1 (MQ=255)
aTGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGTCTCTATTTTAGCCGAAATAGCTAATGGc > 2:26284376/1‑149 (MQ=255)
tGCCATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGTCTCTATTTTAGCCGAAATAGCTAATGGCTa < 2:26281029/150‑1 (MQ=255)
ccATCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGTCTCTATTTTAGCCGAAATAGCTAATGGCTat > 1:26284407/1‑149 (MQ=255)
aTCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGTCTCTATTTTAGCCGAAATAGCTAATGGCTatgat < 2:26282194/150‑1 (MQ=255)
aTCTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGTCTCTATTTTAGCCGAAATAGCTAATGGCTatgat > 2:26284425/1‑150 (MQ=255)
cTTTTTAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGCACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGTCTCTATTTTAGCCGAAATAGCTAATGGCTAtgatga > 1:26284444/1‑150 (MQ=255)
tttAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGt < 2:26281437/88‑1 (MQ=255)
tAGAGATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGTCTCTATTTTAGCCGAAATAGCTAATGGCTATGATGAtttt > 1:26284480/1‑149 (MQ=255)
agagATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGTCTCTATTTTAGCCGAAATAGCTAATGGCTATGATGATTTTaa > 2:26284483/1‑150 (MQ=255)
agagATTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGTCTCTATTTTAGCCGAAATAGCTAATGGCTATGATGATTTTa < 1:26282719/149‑1 (MQ=255)
gagaTTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGTCTCTATTTTAGCCGAAATAGCTAATGGCTATGATGATTTTaa < 2:26281328/149‑1 (MQ=255)
agaTTGCCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGTCTCTATTTTAGCCGAAATAGCTAATGGCTATGATGATTTTAAt < 2:26283010/149‑1 (MQ=255)
|
TGAAATTAGAGATAATATTGGCACAGAAAATATATTCAGTTCGTTTAGTGATTTCTCTTCATTCTTAAACGAAATCATGGACAGTTGTTCATAATAATCAAAAGGAAACAAAAATCATTGTAAACCATGCCATCTTTTTAGAGATTACCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGTCTCTATTTTAGCCGAAATAGCTAATGGCTATGATGATTTTAATGAC > NC_000913/3584216‑3584508
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
