Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F13 I1 R1
|
116 |
362.0 |
17214306 |
99.7% |
17162663 |
98.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,304,858 |
T→C |
intergenic (+465/+250) |
eco → / ← mqo |
serine protease inhibitor ecotin/malate:quinone oxidoreductase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,304,858 | 0 | T | C | 100.0%
| 345.0
/ NA
| 125 | intergenic (+465/+250) | eco/mqo | serine protease inhibitor ecotin/malate:quinone oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (76/49); total (76/49) |
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
GTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATC > NC_000913/2304760‑2304898
|
gTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAgcgc > 1:4150339/1‑101 (MQ=255)
gTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAgcgc > 2:4150340/1‑101 (MQ=255)
ttGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCt > 1:4150341/1‑101 (MQ=255)
ttGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCt > 1:4150342/1‑101 (MQ=255)
tGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTc < 1:4149782/101‑1 (MQ=255)
ggATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTcc > 2:4150348/1‑101 (MQ=255)
ggATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTcc > 1:4150345/1‑101 (MQ=255)
ggATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTcc > 1:4150346/1‑101 (MQ=255)
ggATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTcc > 1:4150347/1‑101 (MQ=255)
gATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCa > 2:4150351/1‑101 (MQ=255)
gATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCa > 1:4150350/1‑101 (MQ=255)
aTAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCAc < 2:4149906/101‑1 (MQ=255)
aTAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCAc > 2:4150353/1‑101 (MQ=255)
aTAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCAc > 2:4150352/1‑101 (MQ=255)
tAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGGCGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCAcc < 1:4149370/101‑1 (MQ=255)
tAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCAcc > 1:4150356/1‑101 (MQ=38)
tAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCAcc < 1:4149663/101‑1 (MQ=38)
aaGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCAccc > 1:4150357/1‑101 (MQ=25)
aaGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCAccc > 1:4150358/1‑101 (MQ=38)
aaGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCAccc > 1:4150360/1‑101 (MQ=38)
aGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCAcccc > 2:4150361/1‑101 (MQ=16)
aGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCAcccc < 1:4149469/101‑1 (MQ=25)
aGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCAcccc < 1:4149582/101‑1 (MQ=25)
ggCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCg < 1:4149754/101‑1 (MQ=25)
ggCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCg < 2:4150051/101‑1 (MQ=25)
cGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTa < 1:4149850/101‑1 (MQ=25)
cGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTa > 2:4150364/1‑101 (MQ=25)
cGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTa < 1:4149610/101‑1 (MQ=25)
cGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTa > 1:4150365/1‑101 (MQ=38)
cGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTa < 2:4149902/101‑1 (MQ=25)
ggTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAg > 2:4150367/1‑101 (MQ=38)
ggTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAg < 2:4150067/101‑1 (MQ=25)
ggTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAg > 1:4150368/1‑101 (MQ=25)
gTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAgg < 1:4149752/101‑1 (MQ=25)
ttACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGt > 2:4150369/1‑101 (MQ=25)
ttACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGt < 2:4149393/101‑1 (MQ=25)
tACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAgg > 2:4150372/1‑99 (MQ=25)
tACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTc < 1:4149703/101‑1 (MQ=18)
tACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTc > 1:4150371/1‑101 (MQ=18)
tACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTc < 2:4149698/101‑1 (MQ=18)
aCGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCg > 2:4150373/1‑101 (MQ=18)
cgccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGt < 2:4149694/94‑1 (MQ=18)
cgccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGt < 1:4149600/98‑1 (MQ=18)
cgccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCgg > 2:4150374/1‑101 (MQ=18)
gccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGa > 1:4150376/1‑101 (MQ=18)
gccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGa > 1:4150377/1‑101 (MQ=18)
ccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAg > 1:4150379/1‑94 (MQ=21)
ccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGAt > 1:4150378/1‑101 (MQ=17)
ccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGAt < 2:4149697/101‑1 (MQ=17)
cgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCgg < 2:4149928/98‑1 (MQ=18)
cgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATa < 1:4149838/101‑1 (MQ=17)
cgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATa < 1:4149686/101‑1 (MQ=17)
gcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTc < 2:4149932/82‑1 (MQ=18)
gcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATaa > 2:4150383/1‑101 (MQ=18)
gcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATaa < 1:4149729/101‑1 (MQ=17)
gcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATaa > 1:4150382/1‑101 (MQ=17)
gcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATaa > 1:4150381/1‑101 (MQ=17)
gcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATaa < 2:4149525/101‑1 (MQ=17)
gcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATaa < 1:4149700/101‑1 (MQ=17)
cATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCg > 1:4150387/1‑88 (MQ=18)
cATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAg > 1:4150385/1‑101 (MQ=18)
cATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAg > 2:4150386/1‑101 (MQ=18)
aTCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAgg > 2:4150391/1‑101 (MQ=18)
aTCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAgg > 2:4150389/1‑101 (MQ=17)
aTCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAgg > 2:4150388/1‑101 (MQ=18)
tCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGc < 1:4149810/101‑1 (MQ=17)
tCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGc > 2:4150392/1‑101 (MQ=18)
ccGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCg > 2:4150396/1‑101 (MQ=17)
ccGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCg > 1:4150395/1‑101 (MQ=18)
cGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCgg > 2:4150398/1‑101 (MQ=17)
cGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCgg > 1:4150397/1‑101 (MQ=17)
cGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCgg < 1:4149518/101‑1 (MQ=17)
cGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCgg > 1:4150399/1‑101 (MQ=17)
gACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGa > 1:4150402/1‑92 (MQ=18)
aCATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGtt < 1:4149939/101‑1 (MQ=17)
aCATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGtt > 2:4150405/1‑101 (MQ=17)
aCATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGtt > 2:4150403/1‑101 (MQ=17)
aCATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGtt < 1:4149735/101‑1 (MQ=17)
aCATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGtt > 1:4150404/1‑101 (MQ=17)
cATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGt < 1:4149649/99‑1 (MQ=18)
cATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTa < 1:4149777/101‑1 (MQ=17)
cATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTa > 2:4150407/1‑101 (MQ=17)
cATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTa > 2:4150406/1‑101 (MQ=17)
aTCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAc < 1:4149682/101‑1 (MQ=17)
aTCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAc < 1:4149592/101‑1 (MQ=17)
aTCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAc > 2:4150409/1‑101 (MQ=17)
tCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcg > 1:4150410/1‑101 (MQ=17)
tCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcg > 1:4150411/1‑101 (MQ=17)
tCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcg < 1:4150108/101‑1 (MQ=17)
tCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcg < 1:4149497/101‑1 (MQ=17)
ccAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgc > 2:4150413/1‑101 (MQ=17)
ccAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcg < 2:4149784/100‑1 (MQ=18)
cAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgcc > 1:4150415/1‑101 (MQ=17)
cAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgcc < 1:4149907/101‑1 (MQ=17)
aaCGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgccg > 2:4150416/1‑101 (MQ=17)
aCGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgccgc > 1:4150417/1‑101 (MQ=17)
gTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCAt > 1:4150419/1‑101 (MQ=14)
gTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCAt > 1:4150421/1‑101 (MQ=14)
tCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATc < 1:4149718/101‑1 (MQ=11)
tCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATc > 1:4150423/1‑101 (MQ=11)
|
GTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATC > NC_000913/2304760‑2304898
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
