Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F1 I2 R1
|
97 |
53.3 |
2484976 |
94.5% |
2348302 |
111.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,907,713 |
(T)7→8 |
intergenic (‑122/+548) |
yobF ← / ← yebO |
DUF2527 family heat‑induced protein/putative inner membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,907,706 | 1 | . | T | 100.0%
| 339.0
/ NA
| 95 | intergenic (‑115/+555) | yobF/yebO | DUF2527 family heat‑induced protein/putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base T (47/48); total (47/48) |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
TCTTTACTGAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCAC‑TTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTAACATAGTTCAATAAGTTCAGTTGTTCCAGGCCAGTGG > NC_000913/1907569‑1907838
|
cTGAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCAC‑ttttttt > 2:422572/1‑139 (MQ=255)
gAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCAC‑ttttttttg < 1:61887/139‑3 (MQ=255)
aaaTGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCAC‑ttttttttgca < 1:1110526/139‑5 (MQ=255)
aaaTGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCAC‑ttttttttgca < 2:178172/139‑5 (MQ=255)
aaaTGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCCTTTAACCCGAAATCTGTTATTACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACAGGTCTCGATCAGCCGCACAAATCTCGATACGTCTTCTAC‑ttttttttgca < 2:826401/139‑5 (MQ=255)
aaTGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCAC‑ttttttttgcac < 2:322928/139‑6 (MQ=255)
aaCAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATg > 2:191206/1‑133 (MQ=255)
aaCAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATg < 1:191206/133‑1 (MQ=255)
aaCTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCAC‑ttttttttg < 2:674981/118‑3 (MQ=255)
aaCTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCAC‑ttttttttg > 1:674981/1‑116 (MQ=255)
cTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATAcgc > 2:947633/1‑139 (MQ=255)
cTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATAcgc < 2:708639/139‑1 (MQ=255)
gTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACgcgc < 2:34368/139‑1 (MQ=255)
gTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACgcgc < 2:770585/139‑1 (MQ=255)
cGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATAcgcg > 2:606503/1‑132 (MQ=255)
cGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATAcgcg < 1:606503/132‑1 (MQ=255)
cGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATAcg < 1:801034/130‑1 (MQ=255)
cGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATAcg > 2:801034/1‑130 (MQ=255)
ttAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATc > 2:1005492/1‑139 (MQ=255)
tAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCa < 1:1005492/139‑1 (MQ=255)
aaCCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCAt > 1:1116830/1‑139 (MQ=255)
ttATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATAcgc > 1:178304/1‑113 (MQ=255)
ttATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATAcgc < 2:178304/113‑1 (MQ=255)
ttATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCg < 1:386154/117‑1 (MQ=255)
ttATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCg > 2:386154/1‑117 (MQ=255)
cAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAg > 2:1063792/1‑139 (MQ=255)
cGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATAcgc < 1:107022/100‑1 (MQ=255)
cGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATAcgc > 2:107022/1‑100 (MQ=255)
cGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACgcgc < 2:378153/102‑1 (MQ=255)
cGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACgcgc > 1:378153/1‑102 (MQ=255)
cGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCtt > 2:249147/1‑120 (MQ=255)
cGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGc < 1:391345/128‑1 (MQ=255)
cGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGtt > 2:42746/1‑133 (MQ=255)
cGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGtt < 1:42746/133‑1 (MQ=255)
cGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCa < 1:110445/139‑1 (MQ=255)
cGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCa > 1:71840/1‑139 (MQ=255)
cGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCa > 2:1097310/1‑139 (MQ=255)
cGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCa > 1:1160535/1‑139 (MQ=255)
cGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCa > 1:205889/1‑139 (MQ=255)
cGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCa > 1:205311/1‑139 (MQ=255)
cGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCa > 1:537353/1‑139 (MQ=255)
cGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCa < 1:396065/139‑1 (MQ=255)
cGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCa < 2:941464/139‑1 (MQ=255)
gTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAg < 2:71840/139‑1 (MQ=255)
ttAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGa > 1:252712/1‑139 (MQ=255)
aaTTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACgcgc > 2:8781/1‑98 (MQ=255)
aaTTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACgcgc < 1:8781/98‑1 (MQ=255)
aaTTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCAC‑ttttttttgca < 2:858312/75‑5 (MQ=255)
aaTTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCAC‑ttttttttgca > 1:858312/1‑71 (MQ=255)
aTGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTa > 1:145477/1‑139 (MQ=255)
ggCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACgcgc < 1:778713/92‑1 (MQ=255)
ggCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACgcgc > 2:778713/1‑92 (MQ=255)
ggCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTg < 1:849724/117‑1 (MQ=255)
ggCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTg > 2:849724/1‑117 (MQ=255)
ggCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGc < 2:478730/128‑1 (MQ=255)
ggCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGc > 1:478730/1‑128 (MQ=255)
ggCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTaaa > 2:115773/1‑139 (MQ=255)
ggCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTaaa < 1:571208/139‑1 (MQ=255)
ggCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTaaa > 1:1094323/1‑139 (MQ=255)
gCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAAc < 1:712732/139‑1 (MQ=255)
gCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCAC‑ttttttttgca < 1:232921/68‑5 (MQ=255)
gCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCAC‑ttttttttgca > 2:232921/1‑64 (MQ=255)
gCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGc > 2:927169/1‑139 (MQ=255)
gCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCAC‑ttttttttgcac < 1:203355/65‑6 (MQ=255)
gCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCAC‑ttttttttgcac > 2:203355/1‑60 (MQ=255)
ccATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCg < 1:422572/139‑1 (MQ=255)
aTTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTa < 2:205311/139‑1 (MQ=255)
aTTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTa < 1:480990/139‑1 (MQ=255)
aTTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTa < 2:1161936/139‑1 (MQ=255)
aaCATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGc > 2:73094/1‑103 (MQ=255)
aaCATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGc < 1:73094/103‑1 (MQ=255)
aTGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTAACa < 1:340515/139‑1 (MQ=255)
tGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCt < 1:229693/90‑1 (MQ=255)
gTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATg > 2:1204084/1‑57 (MQ=255)
gTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTa > 2:391225/1‑127 (MQ=255)
gTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTa < 1:391225/127‑1 (MQ=255)
gTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTAACATa > 2:766053/1‑139 (MQ=255)
tctcGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCa > 2:1021823/1‑108 (MQ=255)
tctcGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCa < 1:1021823/108‑1 (MQ=255)
tctcGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGc > 2:439643/1‑123 (MQ=255)
tctcGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGc < 1:439643/123‑1 (MQ=255)
aTCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTAACATAGTTCaa > 2:1038053/1‑139 (MQ=255)
tCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTAACATAGTTCAAt < 2:404612/139‑1 (MQ=255)
aCGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCacac < 1:179149/41‑1 (MQ=38)
aCGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCacac > 2:179149/1‑41 (MQ=255)
aCGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACtcgc > 1:482916/1‑61 (MQ=255)
aCGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACtcgc < 2:482916/61‑1 (MQ=255)
aCGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTa > 2:403449/1‑116 (MQ=255)
aCGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTa < 1:403449/116‑1 (MQ=255)
aCGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa > 1:814156/1‑124 (MQ=255)
aCGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa < 2:814156/124‑1 (MQ=255)
caAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTAACATAGTTCAATAAGTTCAgt < 1:115773/139‑1 (MQ=255)
caAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTAACATAGTTCAATAAGTTCAgt < 2:537353/139‑1 (MQ=255)
tctcGATACGTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTAACATAGTTCAATAAGTTCAgttgtt < 1:1054662/139‑1 (MQ=255)
gTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCa < 1:583099/53‑1 (MQ=255)
gTCTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTAACATAGTTCAATAAGTTCAGTTGTTCCAGGCCAg < 2:252712/139‑1 (MQ=255)
cTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACgcgc < 1:295800/41‑1 (MQ=255)
cTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACgcgc > 2:295800/1‑41 (MQ=255)
cTTCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTAACATAGTTCAATAAGTTCAGTTGTTCCAGGCCAGTg > 2:450703/1‑139 (MQ=255)
ttCCACTTTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTAACATAGTTCAATAAGTTCAGTTGTTCCAGGCCAGTgg > 2:637198/1‑139 (MQ=255)
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TCTTTACTGAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCAC‑TTTTTTTGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTAACATAGTTCAATAAGTTCAGTTGTTCCAGGCCAGTGG > NC_000913/1907569‑1907838
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
