Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F1 I1 R1
|
82 |
28.6 |
1225488 |
97.4% |
1193625 |
116.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,907,713 |
(T)7→8 |
intergenic (‑122/+548) |
yobF ← / ← yebO |
DUF2527 family heat‑induced protein/putative inner membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,907,706 | 1 | . | T | 95.6%
| 232.6
/ 2.8
| 68 | intergenic (‑115/+555) | yobF/yebO | DUF2527 family heat‑induced protein/putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/1); new base T (35/30); total (37/31) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.96e-01 |
AAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCAC‑TTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTAACATAGTTCAATAAGTTCAGT > NC_000913/1907578‑1907822
|
aaaaTGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCAC‑tttttt‑ttgc > 1:565770/1‑136 (MQ=255)
aaaTGCCACACCTAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCAC‑tttttt‑ttgca < 2:395147/139‑5 (MQ=255)
aaaTGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCAC‑tttttt‑ttgca < 2:211272/139‑5 (MQ=255)
aaaTGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCAC‑tttttt‑ttgca < 2:610781/139‑5 (MQ=255)
aaaTGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCAC‑tttttt‑ttgca < 2:405759/139‑5 (MQ=255)
acaTAAACAGAACTGTACCTCGTTTAAACCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGc > 1:363651/1‑139 (MQ=255)
cAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGaa < 1:416728/139‑1 (MQ=255)
aaCTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATAc > 1:109086/1‑139 (MQ=255)
aCTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATAcg > 1:391434/1‑139 (MQ=255)
cTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATAcgc > 1:122792/1‑139 (MQ=255)
cTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATAcgc < 2:140515/139‑1 (MQ=255)
gttccTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCCCAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACgcgc < 1:403475/136‑1 (MQ=255)
tACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGcc > 1:160978/1‑139 (MQ=255)
aCCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCg < 1:199320/139‑1 (MQ=255)
cTCGTTTATCCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGat < 2:363651/139‑1 (MQ=255)
cTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGat > 2:564604/1‑139 (MQ=255)
tCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGata < 2:391434/139‑1 (MQ=255)
tttAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATAcgc < 1:15240/129‑1 (MQ=255)
tttAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATAcgc > 2:15240/1‑129 (MQ=255)
tAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCAC‑TTTTTTGTGCACACTTACGCAACGGAATACGCGCCGATATATCa > 1:388830/1‑139 (MQ=255)
gAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGc < 2:122792/139‑1 (MQ=255)
aTACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGtt < 2:109086/139‑1 (MQ=255)
tACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGc > 2:265293/1‑123 (MQ=255)
tACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGc < 1:265293/123‑1 (MQ=255)
tACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCAC‑tttttt‑ttg < 2:141405/82‑3 (MQ=255)
tACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCAC‑tttttt‑ttg > 1:141405/1‑80 (MQ=255)
cAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAGACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCAACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATAcg > 2:378741/1‑102 (MQ=255)
cAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATAcg < 1:378741/102‑1 (MQ=255)
cAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCAC‑tttttt‑ttgca < 2:586113/82‑5 (MQ=255)
cAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCAC‑tttttt‑ttgca > 1:586113/1‑78 (MQ=255)
cGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCa > 2:423780/1‑139 (MQ=255)
cGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCa > 2:441122/1‑139 (MQ=255)
cGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCa > 1:52326/1‑139 (MQ=255)
cGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCa < 1:310421/139‑1 (MQ=255)
ttAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATAcg < 1:551631/97‑1 (MQ=255)
ttAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATAcg > 2:551631/1‑97 (MQ=255)
tAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGAt > 1:303655/1‑139 (MQ=255)
aaTTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACgcgc < 1:345119/98‑1 (MQ=255)
aaTTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACgcgc > 2:345119/1‑98 (MQ=255)
aaTTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATa > 1:300915/1‑139 (MQ=255)
ggCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAg > 1:232430/1‑130 (MQ=255)
ggCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAg < 2:232430/130‑1 (MQ=255)
ggCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTaaa > 1:246441/1‑139 (MQ=255)
ggCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTaaa > 1:307309/1‑139 (MQ=255)
ggCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTaaa > 1:52192/1‑139 (MQ=255)
cAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACt > 2:194677/1‑139 (MQ=255)
aGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTgg > 1:73003/1‑139 (MQ=255)
gCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGc > 1:336762/1‑139 (MQ=255)
gCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGc > 1:318385/1‑139 (MQ=255)
ccATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCg < 2:565770/139‑1 (MQ=255)
aTTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTa < 2:73003/139‑1 (MQ=255)
cATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTAAc < 2:246441/139‑1 (MQ=255)
cATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTAAc < 2:300915/139‑1 (MQ=255)
tGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATAcgc > 2:321312/1‑71 (MQ=255)
tGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATAcgc < 1:321312/71‑1 (MQ=255)
gTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACgcgc > 1:472824/1‑72 (MQ=255)
gTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACgcgc < 2:472824/72‑1 (MQ=255)
gTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCg < 2:499958/125‑1 (MQ=255)
gTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCg > 1:499958/1‑125 (MQ=255)
gTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTAACATa > 1:260980/1‑139 (MQ=255)
gTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCAC‑TTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTAACAt > 1:482753/1‑137 (MQ=255)
gTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCAC‑TTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTAACAt < 2:482753/137‑1 (MQ=255)
gACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTa > 2:601961/1‑117 (MQ=255)
gACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTa < 1:601961/117‑1 (MQ=255)
gACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTAACATAGTTCAATAAg > 1:441557/1‑139 (MQ=255)
aCGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCAt > 2:89380/1‑72 (MQ=255)
aCGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCAt < 1:89380/72‑1 (MQ=255)
aCGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAAc < 2:113730/82‑1 (MQ=255)
aCGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAAc > 1:113730/1‑82 (MQ=255)
aCGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTAACATAGTTCAAt > 2:282406/1‑135 (MQ=255)
aCGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTAACATAGTTCAAt < 1:282406/135‑1 (MQ=255)
aCGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTAACATAGTTCAATAAGt > 1:154790/1‑139 (MQ=255)
gCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTAACATAGTTGAATAAGTTc > 2:390338/1‑139 (MQ=255)
acaAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTAACATAGTTCAATAAGTTCAg < 2:52192/139‑1 (MQ=255)
caAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTAACATAGTTCAATAAGTTCAgt < 2:441557/139‑1 (MQ=255)
caAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTAACATAGTTCAATAAGTTCAgt < 2:318385/139‑1 (MQ=255)
caAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTAACATAGTTCAATAAGTTCAgt < 1:441122/139‑1 (MQ=255)
|
AAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCAC‑TTTTTT‑TGCACACTTATGCAACGGAATACGCGCCGATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTAACATAGTTCAATAAGTTCAGT > NC_000913/1907578‑1907822
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
