Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A10 F320 I1 R1
|
17 |
123.6 |
2075634 |
95.0% |
1971852 |
284.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,755,429 |
(T)5→4 |
intergenic (‑288/‑269) |
ydhZ ← / → pykF |
uncharacterized protein/pyruvate kinase I |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,755,425 | 0 | T | . | 99.1%
| 474.1
/ ‑3.5
| 108 | intergenic (‑284/‑273) | ydhZ/pykF | uncharacterized protein/pyruvate kinase I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base . (67/40); total (67/41) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.80e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
CTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAGCATATATCAATCTAACCAATTAAACAAAAATCAAACAAAATCAGACAAATAACGCGATAAATTATTTTAACTGTAGCAATTGAGCGATGATATATTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTGTTTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACATTCCTCTGCACGCTTTTTCGATGTCACCTATCCTTAGAGCGAGGCACCACCACTTTCGTAATACCGGATTCGCTTTCCGGCAGTGCGCCCAGAAAGCAAGTTTCTCCCATCCTTCTCAACTTAAAGACTAAGACTGTCATGAAA > NC_000913/1755143‑1755703
|
cTTTATACCTATTTATCATGCCAACTATCAGCATATATCAATCTAACCAATTAAACAAAAATCAAACAAAATCAGACAAATAACGCGATAAATTATTTTAACTGTAGCAATTGAGCGATGATATATTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCtgttttgt < 2:727952/288‑3 (MQ=255)
tataCCTATTTATCATGCCAACTATCAGCATATATCAATCTAACCAATTAAACAAAAATCAAACAAAATCAGACAAATAACGCGATAAATTATTTTAACTGTAGCAATTGAGCGATGATATATTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCtgttttgtt < 1:12601/286‑4 (MQ=255)
tataCCTATTTATCATGCCAACTATCAGCATATATCAATCTAACCAATTAAACAAAAATCAAACAAAATCAGACAAATAACGCGATAAATTATTTTAACTGTAGCAATTGAGCGATGATATATTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTc > 1:224341/1‑289 (MQ=255)
cTATTTATCATGCCAACTATCAGCATATATCAATCTAACCAATTAAACAAAAATCAAACAAAATCAGACAAATAACGCGATAAATTATTTTAACTGTAGCAATTGAGCGATGATATATTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCtttt < 2:174452/289‑1 (MQ=255)
tttATCATGCCAACTATCAGCATATATCAATCTAACCAATTAAACAAAAATCAAACAAAATCAGACAAATAACGCGATAAATTATTTTAACTGTAGCAATTGAGCGATGATATATTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTgg < 2:389526/288‑1 (MQ=255)
tttATCATGCCAACTATCAGCATATATCAATCTAACCAATTAAACAAAAATCAAACAAAATCAGACAAATAACGCGATAAATTATTTTAACTGTAGCAATTGAGCGATGATATATTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGa > 2:252551/1‑289 (MQ=255)
gCCAACTATCAGCATATATCAATCTAACCAATTAAACAAAAATCAAACAAAATCAGACAAATAACGCGATAAATTATTTTAACTGTAGCAATTTAGCGATGCTATATTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCCTTGATAACCATTTATGTTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAAttc > 2:712638/1‑287 (MQ=255)
ccAACTATCAGCATATATCAATCTAACCAATTAAACAAAAATCAAACAAAATCAGACAAATAACGCGATAAATTATTTTAACTGTAGCAATTGAGCGATGATATATTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCa < 2:265490/289‑1 (MQ=255)
tatCAATCTAACCAATTAAACAAAAATCAAACAAAATCAGACAAATAACGCGATAAATTATTTTAACTGTAGCAATTGAGCGATGATATATTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATgcgcgc > 1:783611/1‑289 (MQ=255)
tatCAATCTAACCAATTAAACAAAAATCAAACAAAATCAGACAAATAACGCGATAAATTATTTTAACTGTAGCAATTGAGCGATGATATATTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATgcgcgc > 2:230373/1‑289 (MQ=255)
aTCTAACCAATTAAACAAAAATCAAACAAAATCAGACAAATAACGCGATAAATTATTTTAACTGTAGCAATTGAGCGATGATATATTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAAtt < 2:749109/289‑1 (MQ=255)
aTCTAACCAATTAAACAAAAATCAAACAAAATCAGACAAATAACGCGATAAATTATTTTAACTGTAGCAATTGAGCGATGATATATTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAAtt < 1:492886/289‑1 (MQ=255)
tCTAACCAATTAAACAAAAATCAAACAAAATCAGACAAATAACGCGATAAATTATTTTAACTGTAGCAATTGAGCGATGATATATTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGTCAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAAtt > 2:570115/1‑288 (MQ=255)
tCTAACCAATTAAACAAAAATCAAACAAAATCAGACAAATAACGCGATAAATTATTTTAACTGTAGCAATTGAGCGATGATATATTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCTAAtc > 2:787395/1‑287 (MQ=255)
tCTAACCAATTAAACAAAAATCAAACAAAATCAGACAAATAACGCGATAAATTATTTTAACTGTAGCAATTGAGCGATGATATATTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAAtt > 2:1004048/1‑288 (MQ=255)
aCCAATTAAACAAAAATCAAACAAAATCAGACAAATAACGCGATAAATTATTTTAACTGTAGCAATTGAGCGATGATATATTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGActc > 2:748384/1‑289 (MQ=255)
aCCAATTAAACAAAAATCAAACAAAATCAGACAAATAACGCGATAAATTATTTTAACTGTAGCAATTGAGCGATGATATATTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGActc > 2:765271/1‑289 (MQ=255)
ccAATTAAACAAAAATCAAACAAAATCAGACAAATAACGCGATAAATTATTTTAACTGTAGCAATTGAGCGATGATATATTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGActct > 1:120002/1‑289 (MQ=255)
ttAAACAAAAATCAAACAAAATCAGACAAATAACGCGATAAATTATTTTAACTGTAGCAATTGAGCGATGATATATTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAATCGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGaa > 1:341186/1‑289 (MQ=255)
aaaCAAAAATCAAACAAAATCAGACAAATAACGCGATAAATTATTTTAACTGTAGCAATTGAGCGATGATATATTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAAt < 2:224341/288‑1 (MQ=255)
aaaCAAAAATCAAACAAAATCAGACAAATAACGCGATAAATTATTTTAACTGTAGCAATTGAGCGATGATATATTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAAt < 2:647984/288‑1 (MQ=255)
aTCAAACAAAATCAGACAAATAACGCGATAAATTATTTTAACTGTAGCAATTGAGCGATGATATATTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAg > 1:22739/1‑288 (MQ=255)
caaaATCAGACAAATAACGCGATAAATTATTTTAACTGTAGCAATTGAGCGATGATATATTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTg < 2:120002/289‑1 (MQ=255)
aaaTCAGACAAATAACGCGATAAATTATTTTAACTGTAGCAATTGAGCGATGATATATTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGa < 1:951109/289‑1 (MQ=255)
aCGCGATAAATTATTTTAACTGTAGCAATTGAGCGATGATATATTTATACACCGGATGAACTTTCGCTTATCCTCACGCTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTGGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAAc < 2:176857/289‑1 (MQ=255)
aCGCGATAAATTATTTTAACTGTAGCAATTGAGCGATGATATATTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAAc < 2:149210/289‑1 (MQ=255)
gATAAATTATTTTAACTGTAGCAATTGAGCGATGATATATTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACt < 2:740896/289‑1 (MQ=255)
tattTTAACTGTAGCAATTGAGCGATGATATATTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCaaaaa > 1:80869/1‑288 (MQ=255)
attTTAACTGTAGCAATTGAGCGATGATATATTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAAc < 1:230373/288‑1 (MQ=255)
attTTAACTGTAGCAATTGAGCGATGATATATTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTAACACTGACAACGTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTGGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAAc < 1:261249/288‑1 (MQ=255)
tttAACTGTAGCAATTGAGCGATGATATATTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAACCAgg > 2:4321/1‑289 (MQ=255)
aGCAATTGAGCGATGATATATTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGt > 1:936091/1‑289 (MQ=255)
aGCAATTGAGCGATGATATATTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGt > 1:129073/1‑289 (MQ=255)
cGATGATATATTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTgaga < 2:641523/289‑1 (MQ=255)
atgatATATTTGTACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCCCACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGaca < 2:970039/289‑1 (MQ=255)
tgatATATTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCAc > 2:620866/1‑270 (MQ=255)
tgatATATTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCAc < 1:620866/270‑1 (MQ=255)
gagggaggtatgCACCGGATGAACGGGCAGGTATCGTCGGAGTGGCAACTACGGCAGCGGAAGTGGGGGAAAGCGTGAAGTGTGTGCGTAACCATTGGCCTGGAACGGTAAGTCTGGGATAGCAATTTATTGACTAGCAAGGTGTATAGTGGTTGAAACGCT‑TTTGTGGTTTCCTGTGGGATGAATGTCAGCGGATAAGGCGGGGCAAGGGACTCGTGAATGGTGTCAGCACTTGGGACTGTAGAACTGAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGAcaca < 2:497400/281‑1 (MQ=255)
atatatTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGAcaca > 1:778556/1‑288 (MQ=255)
atatatTTATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTGTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTGTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGACACaa < 2:35028/289‑1 (MQ=255)
tttATACACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGACACAAGcaca < 1:765271/289‑1 (MQ=255)
ataCACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGACACAAGcaccaat > 2:818863/1‑285 (MQ=255)
ataCACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACAt > 2:680411/1‑289 (MQ=255)
ataCACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACAt > 2:746058/1‑289 (MQ=255)
ataCACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACAt > 2:77184/1‑289 (MQ=255)
ataCACCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACAAGACGTTGAGCAAACAGTGAAGTTTTTGTGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCATTGATAACAATATATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTAAGCGTATAATGCGCGCAAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACGTTGGACTGTAGAACTCAACGACGTAAAAAAAGGCAATCACCTTGCGCTGACACACACGaacacct > 2:867097/1‑287 (MQ=255)
acacCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACATTc > 1:396978/1‑289 (MQ=255)
cacCGGATGAACTGTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTGTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACATTc < 2:336396/288‑1 (MQ=255)
acCGGCTGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCATCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTAAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGACACAACcaccaattatc > 2:887083/1‑281 (MQ=255)
acCGGATGAACTTTCACTTATCCTCACACTGACAACTTCGGCACCAGACGTTGCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACATTCct > 1:785238/1‑289 (MQ=255)
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|
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|
| Alignment Legend |
|---|
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
