Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A10 F418 I3 R1
|
16 |
172.0 |
8631016 |
94.8% |
8182203 |
99.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,755,429 |
(T)5→4 |
intergenic (‑288/‑269) |
ydhZ ← / → pykF |
uncharacterized protein/pyruvate kinase I |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,755,425 | 0 | T | . | 95.4%
| 739.5
/ 28.5
| 175 | intergenic (‑284/‑273) | ydhZ/pykF | uncharacterized protein/pyruvate kinase I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (6/2); new base . (67/99); total (73/102) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.00e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 181 total aligned reads displayed.
CGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTGTTTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTC > NC_000913/1755328‑1755519
|
cgcAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTTTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCtgtt > 2:2985174/1‑99 (MQ=255)
cAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCtgtttt < 1:2419232/99‑1 (MQ=255)
aaaCAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATAGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCtgttttg > 2:3881999/1‑98 (MQ=255)
aCAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCtgttttgtt < 2:826986/99‑4 (MQ=255)
tGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTcc > 1:3847126/1‑99 (MQ=255)
tGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTcc > 1:3674440/1‑99 (MQ=255)
tGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTcc > 2:2770563/1‑99 (MQ=255)
tGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTAGTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTGTTTTTGTTTTc < 2:3646870/99‑1 (MQ=255)
aGTTTTTGCGTAACCTTTTTCCTGAAACGTCAAATCTTTAATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTATTTGAAACGCT‑CTTTTGTTTTCCttt < 2:260502/99‑1 (MQ=255)
gTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCtttt > 1:1060797/1‑99 (MQ=255)
gTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATCGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCtttt < 2:114019/99‑1 (MQ=255)
tttttGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTg < 1:3924371/99‑1 (MQ=255)
tttGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGa < 1:84039/99‑1 (MQ=255)
tttGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGa < 1:2756487/99‑1 (MQ=255)
gTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAAt > 2:3974184/1‑99 (MQ=255)
gTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAAt < 2:3102462/99‑1 (MQ=255)
gTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAAt > 1:1275705/1‑99 (MQ=255)
aCCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTc > 2:2012430/1‑99 (MQ=255)
ttttCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGc < 1:3936074/99‑1 (MQ=255)
ttttCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGc < 2:3907902/99‑1 (MQ=255)
ttttCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGc < 1:1726674/99‑1 (MQ=255)
ttttCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGc < 1:1396250/99‑1 (MQ=255)
ttttCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGc < 1:2353812/99‑1 (MQ=255)
tCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGCTTAATTTCAGCGta > 2:1442475/1‑99 (MQ=255)
ccTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGtata > 2:157314/1‑99 (MQ=255)
ccTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGtata > 1:2449544/1‑99 (MQ=255)
ccTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTAGTATATTTTTTGAAACGCTGTTTTT‑TTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGtata > 2:3850538/1‑99 (MQ=255)
cTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAACGTGTATATTTTCTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTCTTGGATTAATTTCAGCGTATaa > 2:1043246/1‑99 (MQ=255)
tGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAAt > 1:1591338/1‑99 (MQ=255)
gAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTATTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATgc > 2:782601/1‑99 (MQ=255)
aCGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATgcgc < 2:3015289/99‑1 (MQ=255)
aCGTTAAAACTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATgcgc > 2:1741302/1‑99 (MQ=255)
cGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGACACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATgcgcg < 2:836248/99‑1 (MQ=255)
cGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATgcgcg < 1:1450425/99‑1 (MQ=255)
gTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATgcgcgc > 2:2964152/1‑99 (MQ=255)
ttAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGcc > 2:3357409/1‑99 (MQ=255)
aaaTCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCaa < 1:1428034/99‑1 (MQ=255)
aaaTCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCaa > 2:4250701/1‑99 (MQ=255)
aTCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAAtt < 2:2871802/99‑1 (MQ=255)
aTCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAAtt < 1:1493590/99‑1 (MQ=255)
aTCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAAtt < 1:1647140/99‑1 (MQ=255)
ttGATAACAATTTATTGTCTAAGAAGTTGTATATTTTTTGAAACGATG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTAACCAGATATTGTGCGCTAATTAAct > 2:3581924/1‑99 (MQ=255)
ttGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGAct < 1:3030694/99‑1 (MQ=255)
tGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGActc < 2:2885021/99‑1 (MQ=255)
gATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGActct > 1:463183/1‑99 (MQ=255)
gATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGActct < 1:2555266/99‑1 (MQ=255)
aTAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCtt < 2:4172506/99‑1 (MQ=255)
aaCAATTTATTGTCTAACACGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGa > 1:3393637/1‑99 (MQ=255)
aaCAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGa > 2:2326042/1‑99 (MQ=255)
aaCAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCT‑TTTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATGTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGa > 1:3913992/1‑99 (MQ=255)
aCAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGaa < 2:1746530/99‑1 (MQ=255)
aCAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGaa < 1:675831/99‑1 (MQ=255)
cAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAAt < 1:6212/99‑1 (MQ=255)
cAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAAt < 2:2029811/99‑1 (MQ=255)
cAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAAt < 1:2254180/99‑1 (MQ=255)
cAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAAt < 1:2062305/99‑1 (MQ=255)
aaTTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTT‑TTATTTTTTTTTTGTTTTCCTCTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAAtc > 2:1790262/1‑98 (MQ=255)
tttATTGTCTAACAAGTTGTATCTTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGt < 1:4025352/99‑1 (MQ=255)
tATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGttt < 1:3614054/99‑1 (MQ=255)
aTTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTc < 1:3965218/99‑1 (MQ=255)
ttGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCa < 2:3760852/99‑1 (MQ=255)
ttGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCa < 2:1411297/99‑1 (MQ=255)
ttGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCa < 2:514419/99‑1 (MQ=255)
tGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAg < 1:3183369/99‑1 (MQ=255)
gTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGc > 1:881356/1‑99 (MQ=255)
tCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCa > 2:2739562/1‑99 (MQ=255)
tAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACt > 1:816547/1‑99 (MQ=255)
aCAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACttt < 1:3055771/99‑1 (MQ=255)
aCAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACttt < 1:543802/99‑1 (MQ=255)
aCAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACttt > 1:2841680/1‑99 (MQ=255)
cAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTg < 1:2741896/99‑1 (MQ=255)
aGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGa < 1:3655520/99‑1 (MQ=255)
aGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGa < 1:4212969/99‑1 (MQ=255)
aGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGa < 1:777968/99‑1 (MQ=255)
aGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGa > 1:2799116/1‑99 (MQ=255)
aGTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGa < 1:1620890/99‑1 (MQ=255)
gTTGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGAc < 2:1953890/99‑1 (MQ=255)
ttGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACt < 1:1940020/99‑1 (MQ=255)
tGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTg > 2:2929703/1‑99 (MQ=255)
tGTATATTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGCTTCAGCACTTTCGACTg < 1:3626796/99‑1 (MQ=255)
tGTATA‑TTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTACTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGt < 2:1323217/99‑1 (MQ=255)
tataTTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTa < 1:1257903/99‑1 (MQ=255)
tataTTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTa < 1:1104089/99‑1 (MQ=255)
tataTTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTa < 2:1606376/99‑1 (MQ=255)
tataTTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTa < 2:1470034/99‑1 (MQ=255)
atTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGaa < 2:3460084/99‑1 (MQ=255)
ttttttGAAACTCTG‑GTTTGTTGGCCTGTTGGATTAATTTCGTGTTATAATGGGCGCCAGTTGACTCTTTAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAAc > 2:1258498/1‑99 (MQ=255)
ttttttGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAAc > 2:1652095/1‑99 (MQ=255)
ttttttGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAAc < 1:3165341/99‑1 (MQ=255)
tttttGAAACGCTGTTTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAAc > 1:2940360/1‑99 (MQ=255)
tttttGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCACCACTTTGGACTGTAGAACt < 1:4328272/99‑1 (MQ=255)
tttGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCa > 2:182788/1‑99 (MQ=255)
ttGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCaa < 2:35978/99‑1 (MQ=255)
tGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAAc < 2:1428508/99‑1 (MQ=255)
tGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAAc < 1:2613726/99‑1 (MQ=255)
tGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAAc < 1:1171188/99‑1 (MQ=255)
tGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAAc < 2:3174425/99‑1 (MQ=255)
aaCGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGAc > 2:1544195/1‑99 (MQ=255)
aCGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACt < 2:57519/99‑1 (MQ=255)
cGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTc < 2:504619/99‑1 (MQ=255)
|
CGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTGTTTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTC > NC_000913/1755328‑1755519
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
