Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A10 F418 I2 R1
|
17 |
222.3 |
11175291 |
94.5% |
10560649 |
99.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,755,429 |
(T)5→4 |
intergenic (‑288/‑269) |
ydhZ ← / → pykF |
uncharacterized protein/pyruvate kinase I |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,755,425 | 0 | T | . | 97.6%
| 957.5
/ 14.6
| 212 | intergenic (‑284/‑273) | ydhZ/pykF | uncharacterized protein/pyruvate kinase I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/3); new base . (79/128); total (81/131) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.92e-01 |
Only 100 of 240 total aligned reads displayed.
GCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTGTTTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTC > NC_000913/1755327‑1755519
|
cgcAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCtgtt < 2:4621273/99‑1 (MQ=255)
gcAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCtgttt > 1:1220130/1‑99 (MQ=255)
cAAACAGTGAAGTTTTTTTTTTATCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCtgtttt > 2:1660809/1‑99 (MQ=255)
cAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCtgtttt < 1:1413352/99‑1 (MQ=255)
aaaCAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCtgttttg < 2:1285856/99‑2 (MQ=255)
aaCAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACGAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCtgttttgt < 1:4519026/99‑3 (MQ=255)
aCAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCtgttttgtt < 2:2550851/99‑4 (MQ=255)
aCAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTGTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑ATTTTTGAAACGCtgttttgtt > 1:5258515/1‑96 (MQ=255)
cAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTTAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAACCGCtgttttgttt < 2:3729901/99‑5 (MQ=255)
aGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGTAATGct‑tttttgtttt > 2:2095002/1‑99 (MQ=255)
aGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGctg‑ttttgtttt < 2:3108023/99‑1 (MQ=255)
aGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGctg‑ttttgtttt > 2:2350740/1‑99 (MQ=255)
aGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCACTGGAACGTTAAATCTTTGATAACTATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGctg‑ttttgtttt < 2:3477500/99‑1 (MQ=255)
gTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTAGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTc > 2:1732349/1‑99 (MQ=255)
tGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTcc < 1:3616735/99‑1 (MQ=255)
gAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTcc > 2:4628509/1‑99 (MQ=255)
gAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCt < 1:4805624/99‑1 (MQ=255)
aGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCttt < 1:1978100/99‑1 (MQ=255)
gTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCtttt < 1:726315/99‑1 (MQ=255)
atttttGCGTAACCCTTTCGCTGGATTGTTTAATGTTTGGTAACAATTTGTTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGTGACGCTG‑TTGTGTTGTCCtttt < 2:2920289/98‑1 (MQ=255)
tttttGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTg < 2:631031/99‑1 (MQ=255)
tttttGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTg < 2:3807327/99‑1 (MQ=255)
tttttGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTg < 1:4441575/99‑1 (MQ=255)
tttGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGa < 1:4636235/99‑1 (MQ=255)
tttGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGa < 2:3558253/99‑1 (MQ=255)
gTAACCTTTTCCCTGTAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAAt < 1:3156234/99‑1 (MQ=255)
gTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTGTTTTTGTTTTCCTTTTGGATTaa > 2:314282/1‑99 (MQ=255)
gTAACCGTTGCCCTGGAAGGTTAAATGTTTGATAACAATGTATTGTTTAACAAGTTGTATA‑TTATTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTaag < 2:673533/99‑2 (MQ=255)
atccTTTTCCCTCGAACGTGAAATCTTTGGTGTCAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTCGTTGTAACGCTG‑TTTTGGTATCCTTTTGGATTAAttt < 2:1440209/97‑1 (MQ=255)
aaCCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAAttt > 1:3952545/1‑99 (MQ=255)
ccTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCa < 2:5478401/99‑1 (MQ=255)
ttttCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGc < 2:2963346/99‑1 (MQ=255)
tCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGta < 1:4718718/99‑1 (MQ=255)
ccTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCCG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGtata > 1:1698531/1‑99 (MQ=255)
cTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATaa > 2:4227345/1‑99 (MQ=255)
gAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATgc < 1:4169965/99‑1 (MQ=255)
gAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATgc > 1:331560/1‑99 (MQ=255)
gAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATgc > 1:2729687/1‑99 (MQ=255)
cGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATgcgcg > 1:1079123/1‑99 (MQ=255)
cGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATgcgcg > 2:889523/1‑99 (MQ=255)
gTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATgcgcgc > 2:4967081/1‑99 (MQ=255)
gTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATgcgcgc > 1:5488554/1‑99 (MQ=255)
aTCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAAtt < 1:5410371/99‑1 (MQ=255)
aTCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAAtt < 1:3859249/99‑1 (MQ=255)
tCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTg < 1:4308939/99‑1 (MQ=255)
cTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGa < 2:1516429/99‑1 (MQ=255)
cTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGa < 2:2643701/99‑1 (MQ=255)
tGATAACAATTTATTGTCTAACAATTAGTATA‑TTTGTTGAAACGCTG‑TTTTGTGTTCCTTTAGGATTAATTTCAGAGTATAATACGCGCCAAGTGAgtc < 2:2726663/99‑1 (MQ=255)
gATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGActct < 1:3027313/99‑1 (MQ=255)
gATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGActct > 1:2268069/1‑99 (MQ=255)
aTAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTGTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCtt < 2:5254300/99‑1 (MQ=255)
aaCAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGa < 1:4122398/99‑1 (MQ=255)
aaCAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGa < 2:4517907/99‑1 (MQ=255)
ccAATTCATTGTCTCACCAATTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGaa < 1:1668420/98‑1 (MQ=255)
aCAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGaa < 2:3590945/99‑1 (MQ=255)
aCAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGaa < 2:5432852/99‑1 (MQ=255)
aCAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGaa < 1:5565992/99‑1 (MQ=255)
cAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAAt > 2:3793384/1‑99 (MQ=255)
aaTTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATg < 1:3415257/99‑1 (MQ=255)
aaTTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTCTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCATTTTGGATTAATTTGAGCGTATAATGCGCGCAAATTGAGTCTTGAATg < 2:1332135/99‑1 (MQ=255)
aTTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATgg > 2:4155792/1‑99 (MQ=255)
tttATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGt > 2:2747999/1‑99 (MQ=255)
tATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGttt < 1:1855429/99‑1 (MQ=255)
aTTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTc < 2:1603429/99‑1 (MQ=255)
aTTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGATTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTc < 1:4984296/99‑1 (MQ=255)
ttGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCa > 2:2010322/1‑99 (MQ=255)
tGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGATACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGTATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGGCTCTTGAATGGTTTCAg < 2:2884570/99‑1 (MQ=255)
gTCTAACAAGTCGTATA‑TTTTTTGAAACGCAGTTTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTAAATGGTTTCAg < 1:3564290/99‑1 (MQ=255)
tCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCa > 1:867484/1‑99 (MQ=255)
tCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCa > 1:215662/1‑99 (MQ=255)
tAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACt > 1:1498806/1‑99 (MQ=255)
tAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACt > 1:4661825/1‑99 (MQ=255)
aaCAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACtt < 1:2565234/99‑1 (MQ=255)
aCAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCTCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACttt > 2:1229828/1‑99 (MQ=255)
aCAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACttt < 1:2350725/99‑1 (MQ=255)
aCAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACttt < 1:3101555/99‑1 (MQ=255)
aCAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACttt < 2:2218989/99‑1 (MQ=255)
gTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGAc > 1:3769996/1‑99 (MQ=255)
gTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGt > 1:1090249/1‑99 (MQ=255)
gTATA‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGt < 2:3963464/99‑1 (MQ=255)
tata‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGtc > 2:2478158/1‑98 (MQ=255)
tata‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTa > 1:1487424/1‑99 (MQ=255)
tata‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTa < 1:2072788/99‑1 (MQ=255)
tata‑TTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTa < 1:2676600/99‑1 (MQ=255)
ata‑tTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAg > 2:4866056/1‑99 (MQ=255)
a‑tTTTTTGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGaa < 1:1126436/99‑1 (MQ=255)
ttttttGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCTCTTGGAATTAATTAGAGCGTTTAATGCGTCTCAATTGACTCTTGAATTTTTCCACCCCTTTGCACTGTAAAAc > 2:584992/1‑99 (MQ=255)
ttttttGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGAATAATTTCAGCGTATACTGCGCGCCAATTGCCTCTTGAATGCTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAAc > 2:505832/1‑99 (MQ=255)
tttttGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGAGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTCGTATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACt < 2:847252/99‑1 (MQ=255)
ttttGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTc > 1:620090/1‑99 (MQ=255)
tttGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCa < 1:2883320/99‑1 (MQ=255)
tttGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCa > 2:329532/1‑99 (MQ=255)
ttGAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCaa < 1:1320097/99‑1 (MQ=255)
gAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACg > 1:3899673/1‑99 (MQ=255)
gAAACGCTG‑TTTTGTTTTCCATTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCCTGAATGGATTCAGCACTTTGGACAGTAGAAATAAACg > 2:530881/1‑99 (MQ=255)
gaaCGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTTAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGa > 2:3781395/2‑99 (MQ=255)
aaaCGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGa > 1:5620822/1‑99 (MQ=255)
aaCGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGAc > 2:3455824/1‑99 (MQ=255)
aaCGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGAc > 2:1043731/1‑99 (MQ=255)
aaCGCTG‑TTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGAc > 2:3692625/1‑99 (MQ=255)
|
GCGCAAACAGTGAAGTTTTTGCGTAACCTTTTCCCTGGAACGTTAAATCTTTGATAACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATA‑TTTTTTGAAACGCTGTTTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTC > NC_000913/1755327‑1755519
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
