Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I51 R1
|
223 |
69.9 |
1534784 |
95.1% |
1459579 |
214.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,291,339 |
T→G |
I288M (ATT→ATG) |
nrfD → |
formate‑dependent nitrite reductase, membrane subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,291,339 | 0 | T | G | 98.3%
| 201.7
/ NA
| 60 | I288M (ATT→ATG) | nrfD | formate‑dependent nitrite reductase, membrane subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base G (32/27); total (32/28) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.67e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TACACCGTATGGAAATCCCTGTGGTATGGGGTGAAATCTTCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCAT > NC_000913/4291125‑4291564
|
tACACCGGTTGGAAATCCCTGGGGTATGGGTTGAAATCTTCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCgtg < 2:688562/235‑1 (MQ=255)
gTATGGAAATCCCTGTGGTATGGGGTGAAATCTTCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGc < 1:670105/214‑1 (MQ=255)
gTATGGAAATCCCTGTGGTATGGGGTGAAATCTTCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGc > 2:670105/1‑214 (MQ=255)
gTATGGAAATCCCTGTGGTATGGGGTGAAATCTTCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCgtg > 1:568691/1‑229 (MQ=255)
gTATGGAAATCCCTGTGGTATGGGGTGAAATCTTCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCgtg < 2:568691/229‑1 (MQ=255)
gTATGGAAATCCCTGTGGTATGGGGTGAAATCTTCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGtgtg > 1:268639/1‑231 (MQ=255)
aTGGAAATCCCTGTGGTATGGGGTGAAATCTTCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGTTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCTTGCCTGCCGTGCTGGCGTCCTGTGGGGc > 2:313717/1‑233 (MQ=255)
tGGAAATCCCTGTGGTATGGGGTGAAATCTTCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTgggg < 2:589803/231‑1 (MQ=255)
tCCCTGTGGTATGGGGTGAAATCTTCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCgtg < 1:233774/220‑1 (MQ=255)
tCCCTGTGGTATGGGGTGAAATCTTCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCgtg > 2:233774/1‑220 (MQ=255)
ccTGTGGTATGGGGTGAAATCTTCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTgg > 1:436489/1‑232 (MQ=255)
ccTGTGGTATGGGGTGAAATCTTCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCG‑‑GGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATGGCAGTTCCGGCATGCCGTCCGTGCTGGCGTGGTGTGGGGCCAGTCTGATTGGCg > 2:635082/1‑236 (MQ=255)
tgtgGTATGGGGTGAAATCTTCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTACTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCg > 1:537883/1‑236 (MQ=255)
tCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGGGTTGATGCTGCGCctttt > 1:126546/1‑235 (MQ=255)
gctgGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGGGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGGGCctt > 2:381901/1‑229 (MQ=255)
ctgGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGACTGCCGTGCTGGCGGCgtg < 1:696845/191‑1 (MQ=255)
ctgGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCCGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGACTGCCGTGCTGGCGGCgtg > 2:696845/1‑191 (MQ=255)
ggtggCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCGGCCGTGCTGGCGGCGGGTGGGGCCAGGCTGGTCGGCGGGTTGTGGCTGCGGCTTTTCAtgact > 2:92672/1‑231 (MQ=255)
tggCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGGGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTAc > 1:303783/1‑236 (MQ=255)
tCTGGCGGTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACgg < 1:92672/236‑1 (MQ=255)
tGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGGGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTTGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTa < 1:326497/235‑1 (MQ=255)
ggCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCg < 2:104978/231‑1 (MQ=255)
ggCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCg > 1:104978/1‑231 (MQ=255)
ggCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGGTGATGCTTCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGCCAGGTGACGGGGGCGTATGc > 2:21484/1‑236 (MQ=255)
ggCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGCGTGGGGCCAGTCGGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATGCTCTACCCCCGACAGTTGCCgtgtgtgtaagc > 2:377677/1‑225 (MQ=255)
gCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGc < 1:431877/235‑1 (MQ=255)
gTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTggcgg < 2:406542/147‑1 (MQ=255)
gTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTggcgg > 1:406542/1‑147 (MQ=255)
aaaGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAgg < 2:436489/235‑1 (MQ=255)
cGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGCAAAGAGGTGGTTTc > 1:4437/1‑236 (MQ=255)
cGTGCGCGGGTGGCGGCATTAGGGGGCGGTTTCTGGCCGTGGTGTTTGTGGCTTGGTTTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTACTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTc < 2:537883/236‑1 (MQ=255)
tGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCt < 1:518257/235‑1 (MQ=255)
ggTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGtt > 2:12579/1‑236 (MQ=255)
cGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCgtt < 1:293899/236‑1 (MQ=255)
tggtggTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTa > 1:102061/1‑205 (MQ=255)
tggtggTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTa < 2:102061/205‑1 (MQ=255)
tggtggTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCgttg < 1:381901/235‑1 (MQ=255)
ggtggtTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGGGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCgttgtt > 1:8828/1‑236 (MQ=255)
gtggtTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGGTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTAGTCCTTACTGAAGTCGGTGTTCTTGGgttgttg > 2:262504/1‑236 (MQ=255)
gtTCTGGCTTGGGGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCgttgttgtt < 1:313717/235‑1 (MQ=255)
gCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGtctc > 1:111903/1‑236 (MQ=255)
gCTTGGTGTCGCAGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGtct < 2:211997/235‑1 (MQ=255)
cTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCg < 1:618878/236‑1 (MQ=255)
gtttCGCCGGGCTGGGCCTTATTGTGCCAATGCTGCTCAAGCCGGGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCgggg < 1:421436/232‑1 (MQ=255)
tgtCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTc < 1:49054/236‑1 (MQ=255)
gtCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCa < 1:17125/236‑1 (MQ=255)
gCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGCAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGGTAAGTCTCGTGGTCAACg > 2:259574/1‑236 (MQ=255)
tgtgCCAATGCTGCGCAATGCGTGGGTCAATCGCAGTGCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACg < 1:721833/236‑1 (MQ=255)
gCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTTACCCCGTTGACGGcc > 2:685131/1‑236 (MQ=255)
gCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGc < 1:259574/235‑1 (MQ=255)
gctCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGTCGTAAGCCAGAAAAGGGGTGGTTTCTGGACGGATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGTAGTTGTTGCTAAGGCCAGGGGTCAACGTGTTGAACCCGTTGTCGGCCTTcgatgc > 2:392365/1‑231 (MQ=255)
ctCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTAtt < 2:333347/156‑1 (MQ=255)
ctCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTAtt > 1:333347/1‑156 (MQ=255)
gggTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCTGGAGTGCGGt > 1:72999/1‑232 (MQ=255)
gggTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTGGTTGTTAAGTCTCGGGGTAAACGCGTTGAACCCTTTTAAGGACTTCGCGTGTGTGCggg > 2:518650/1‑231 (MQ=255)
gggTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGCCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGt > 1:417358/1‑232 (MQ=255)
gtCGCAGTCCCGTCATGCCTGCCGTGCCGGCGGCGTGTGGGCCCAGTATGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACATTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGc < 2:8828/234‑1 (MQ=255)
aTCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTgcgc > 1:531786/1‑231 (MQ=255)
cAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGcc < 2:268639/236‑1 (MQ=255)
ttCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCat > 1:135808/1‑235 (MQ=255)
|
TACACCGTATGGAAATCCCTGTGGTATGGGGTGAAATCTTCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCAT > NC_000913/4291125‑4291564
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
