Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I52 R1
|
239 |
220.4 |
11079197 |
93.2% |
10325811 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,291,339 |
T→G |
I288M (ATT→ATG) |
nrfD → |
formate‑dependent nitrite reductase, membrane subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,291,339 | 0 | T | G | 96.9%
| 781.4
/ 8.0
| 229 | I288M (ATT→ATG) | nrfD | formate‑dependent nitrite reductase, membrane subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (4/3); new base G (114/107); total (119/110) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 231 total aligned reads displayed.
GCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAA > NC_000913/4291242‑4291432
|
gCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGcc < 2:1099672/100‑1 (MQ=255)
gCGGTTTCGGGACGTGGTGGTTCTGGCTGGGTGGCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGcc < 1:183255/100‑1 (MQ=255)
cGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCt > 1:371268/1‑100 (MQ=255)
cGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCt < 2:1223527/100‑1 (MQ=255)
ggTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTg < 1:3141326/100‑1 (MQ=255)
tttCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCAtgcctgcc < 2:3684820/100‑1 (MQ=255)
cTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTg < 1:5390932/100‑1 (MQ=255)
cTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTg > 2:2031403/1‑100 (MQ=255)
tGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCTGCCGTGc < 1:1867684/100‑1 (MQ=255)
ggACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCt > 1:1652011/1‑100 (MQ=255)
gACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTg > 2:1742412/1‑100 (MQ=255)
gACGTGGTGGTTCTGGCCTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAAAGCTGCTCAAAACGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGTCTGCCCTGCtc > 2:3005393/1‑99 (MQ=255)
cGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTggc > 2:4288672/1‑100 (MQ=255)
cGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTggc < 1:2226357/100‑1 (MQ=255)
gtggtgGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTggcg < 1:1081733/100‑1 (MQ=255)
tggtggTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTggcgg < 1:388555/100‑1 (MQ=255)
ggtggtTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTggcggc > 1:2764938/1‑100 (MQ=255)
ggtggtTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTggcggc > 2:2636429/1‑100 (MQ=255)
ggtTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCgtg < 1:847639/100‑1 (MQ=255)
ggtTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCgtg < 1:688294/100‑1 (MQ=255)
ggtTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCgtg > 2:477392/1‑100 (MQ=255)
ggtTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCgtg < 1:3654821/100‑1 (MQ=255)
ggtTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCgtg > 1:3541292/1‑100 (MQ=255)
gtTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCgtgt < 2:4128958/100‑1 (MQ=255)
cTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTggg > 1:5054439/1‑100 (MQ=255)
cTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTggg > 2:3032796/1‑100 (MQ=255)
tGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTgggg < 1:2042515/100‑1 (MQ=255)
cTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCa > 1:4638932/1‑100 (MQ=255)
cTTGGTGTCACCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCa > 2:2880312/1‑100 (MQ=255)
tGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGt > 1:1162974/1‑100 (MQ=255)
tGGTGTCGCCGGGCTGGGACTGATTGGGGCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGTCAGt < 2:4656543/100‑1 (MQ=255)
ggTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTc < 1:2581042/100‑1 (MQ=255)
gtgtCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGtgt > 2:108300/1‑98 (MQ=255)
tgtCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTg > 1:1764184/1‑100 (MQ=255)
tgtCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTg > 1:3936796/1‑100 (MQ=255)
gtCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTgg > 1:1115924/1‑100 (MQ=255)
gtCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTgg > 1:2720734/1‑100 (MQ=255)
cGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTc > 2:2145048/1‑100 (MQ=255)
cGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTc < 1:4164704/100‑1 (MQ=255)
cGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTc > 1:2861411/1‑100 (MQ=255)
gCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCg < 1:5307269/100‑1 (MQ=255)
gggctggggctgATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCg < 2:490602/100‑1 (MQ=255)
gggctggggctgATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCg < 1:2394546/100‑1 (MQ=255)
ggctggggctgATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCgt > 1:5519415/1‑100 (MQ=255)
gctggggctgATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCgtg < 2:4719383/100‑1 (MQ=255)
ggggctgCTTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTGCCGGCATGGCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTg < 2:3138323/100‑1 (MQ=255)
gggctgATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGa < 1:3033684/100‑1 (MQ=255)
ggctgATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGAt < 2:628139/100‑1 (MQ=255)
ggctgATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGAt > 2:1323513/1‑100 (MQ=255)
ggctgATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGAt > 1:2534924/1‑100 (MQ=255)
ggctgATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGCGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGAt > 2:2849581/1‑100 (MQ=255)
ctgATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGAtgc > 1:4226728/1‑100 (MQ=255)
tgATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGAtgct < 1:320419/100‑1 (MQ=255)
gATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGAtgctg > 2:2928293/1‑100 (MQ=255)
aTTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGAtgctgc < 2:258278/100‑1 (MQ=255)
tgtgCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTgcgc > 2:3427564/1‑100 (MQ=255)
gtgCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCt < 2:2802424/100‑1 (MQ=255)
tgCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCtt < 1:3269104/100‑1 (MQ=255)
gCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCttt < 2:1266851/100‑1 (MQ=255)
gCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCttt < 1:1131041/100‑1 (MQ=255)
cAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCttttt > 1:557938/1‑100 (MQ=255)
cAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCttttt > 2:2110147/1‑100 (MQ=255)
cAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCttttt < 1:4996288/100‑1 (MQ=255)
cAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCttttt < 1:1893390/100‑1 (MQ=255)
cAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCttttt < 1:4712171/100‑1 (MQ=255)
aaTGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTc < 1:4881415/100‑1 (MQ=255)
aTGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCa > 1:1349971/1‑100 (MQ=255)
gctgctCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCAtt > 2:355054/1‑100 (MQ=255)
cgatctCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCAtt < 1:1530483/96‑1 (MQ=255)
ctgctCGAACCGGGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGGCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATtc < 2:2499977/100‑1 (MQ=255)
ctgctCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATtc > 2:713261/1‑100 (MQ=255)
ctgctCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATtc < 2:3972712/100‑1 (MQ=255)
ctgctCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATtc < 1:4401760/100‑1 (MQ=255)
ctgctCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATtc > 1:557045/1‑100 (MQ=255)
tgctCAAACCGTGGGTCAATCGCCGTTGCGGCATGCCTGCCGTCCTGGCAAGATGTGGTGCCACTCTGTTCGGCGTGTTTATGCTGCTCTTTTACATtct < 2:1029993/100‑1 (MQ=255)
gctCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATtctc > 1:1042906/1‑100 (MQ=255)
gctCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATtctc > 1:3332007/1‑100 (MQ=255)
gctCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATtctc > 1:3820078/1‑100 (MQ=255)
ctCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTctct > 2:4326124/1‑100 (MQ=255)
tCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTa > 2:3369380/1‑100 (MQ=255)
cAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTAc > 2:1934974/1‑100 (MQ=255)
aaCCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATACCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGc > 2:5086737/1‑100 (MQ=255)
ccGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTATGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCg < 1:923473/100‑1 (MQ=255)
cGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCgg < 1:4296262/100‑1 (MQ=255)
cGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCgg > 2:4193707/1‑100 (MQ=255)
tGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGGCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGACGCTGCGCGGTTTCATTCTCTACGCCGGAc < 2:3754190/100‑1 (MQ=255)
tGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGAc < 2:1983823/100‑1 (MQ=255)
tGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGACGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGan < 1:4446762/100‑2 (MQ=255)
gggTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACa > 2:5222164/1‑100 (MQ=255)
ggTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGCCAg > 1:2063407/1‑100 (MQ=255)
cAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTg > 1:2952527/1‑100 (MQ=255)
aTCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGAc > 1:3299171/1‑100 (MQ=255)
cGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACgg < 2:1186107/100‑1 (MQ=255)
cGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACgg > 2:1500650/1‑100 (MQ=255)
tctgTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGt < 1:1422846/97‑1 (MQ=255)
gCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGt > 1:5228317/1‑100 (MQ=255)
cAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTg > 2:604027/1‑100 (MQ=255)
gTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGtaga > 2:1404110/1‑97 (MQ=255)
ttCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCg < 1:2167682/100‑1 (MQ=255)
ccGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTa < 2:1864784/100‑1 (MQ=255)
|
GCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAA > NC_000913/4291242‑4291432
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
