Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I52 R1
|
239 |
220.4 |
11079197 |
93.2% |
10325811 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
546,173 |
T→G |
E64A (GAA→GCA) |
allD ← |
ureidoglycolate dehydrogenase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 546,173 | 0 | T | G | 99.1%
| 824.0
/ ‑4.4
| 232 | E64A (GAA→GCA) | allD | ureidoglycolate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base G (114/116); total (115/117) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
TGTTCCATACCCATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTTCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAACCAATA > NC_000913/546077‑546269
|
tGTTCCATACCCATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTACAATTGCCGAGCACGGCCCTGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTgcgc > 2:2355014/1‑100 (MQ=255)
gTTCCATACCCATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGcgcg > 1:857669/1‑100 (MQ=255)
gTTCCATACCCATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGcgcg > 1:1092138/1‑100 (MQ=255)
gTTCCATACCCATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGcgcg > 1:3468101/1‑100 (MQ=255)
gTTCCATACCCATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGcgcg > 1:2099406/1‑100 (MQ=255)
ttCCATACCCATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCgg < 2:3206065/100‑1 (MQ=255)
tCCATACCCATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGATTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGt > 2:5233940/1‑100 (MQ=255)
cATACCCATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTg < 2:956824/100‑1 (MQ=255)
tACCCATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGt < 1:3502112/100‑1 (MQ=255)
cccATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTgc > 1:126938/1‑100 (MQ=255)
cccATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTgc > 2:5200491/1‑100 (MQ=255)
cccATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTgc > 2:2207626/1‑100 (MQ=255)
cccATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTgc > 2:2291267/1‑100 (MQ=255)
ttCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCtt > 1:5193810/1‑100 (MQ=255)
tCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCttt < 2:2433741/100‑1 (MQ=255)
tCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCttt > 1:4863088/1‑100 (MQ=255)
gccgcGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCAGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTg > 2:900709/1‑100 (MQ=255)
gccgcGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACCGCCCGGCCTCCTCCAGACGACACTCCCGTGCGCGGGTGGTgccgcccggtg > 2:4577299/1‑95 (MQ=255)
cgcgACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGaa < 1:3704288/100‑1 (MQ=255)
cgcgACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGaa < 1:2043418/100‑1 (MQ=255)
cgACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAAt < 2:3797132/100‑1 (MQ=255)
gACCTGTCCGGCGGCATTGTAGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATg > 1:4340975/1‑100 (MQ=255)
aCCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGc < 1:417901/100‑1 (MQ=255)
aCCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGc > 1:397982/1‑100 (MQ=255)
cTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGt < 1:1919723/100‑1 (MQ=255)
gTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTc > 1:350724/1‑100 (MQ=255)
ccGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCcg > 1:1936672/1‑100 (MQ=255)
ggcggcATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCcgcg < 1:701803/100‑1 (MQ=255)
ggcggcATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCcgcg > 1:1571714/1‑100 (MQ=255)
ggcATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGCGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCgtag < 1:245888/100‑1 (MQ=255)
ggcATTGTCGGAAGGTAAAATTGGCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCGTTTGAAATGCGTTCCGCgtag < 2:4529891/100‑1 (MQ=255)
cATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCgtagta > 1:640144/1‑100 (MQ=255)
cATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCgtagta < 2:1578391/100‑1 (MQ=255)
cATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGAGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGCTACGCgtagta > 2:3397661/1‑100 (MQ=255)
aTTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATTCGTTCCGCGTAGTAt > 2:2414053/1‑100 (MQ=255)
aTTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTAt > 1:1928224/1‑100 (MQ=255)
gTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTcc > 1:2844655/1‑100 (MQ=255)
tCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCa < 2:2772309/100‑1 (MQ=255)
cGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCAc < 1:3204178/100‑1 (MQ=255)
cGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCAc > 1:2646949/1‑100 (MQ=255)
ggCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCAcg > 1:4947954/1‑100 (MQ=255)
gCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCAcgc > 1:4266234/1‑100 (MQ=255)
aTGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAACTGCGTTCCGCGTAGTATTCCACgcgc > 2:4386963/1‑100 (MQ=255)
aTGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACgcgc > 1:2392704/1‑100 (MQ=255)
aTGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACgcgc > 2:5073383/1‑100 (MQ=255)
aTGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACgcgc > 2:2097841/1‑100 (MQ=255)
tGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCa < 1:927438/100‑1 (MQ=255)
tGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCa < 2:3572615/100‑1 (MQ=255)
tGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCa > 1:4496186/1‑100 (MQ=255)
tGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCa < 1:3777635/100‑1 (MQ=255)
tGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCa > 1:5444909/1‑100 (MQ=255)
gTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCAc > 1:2487199/1‑100 (MQ=255)
aaaaTTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACcg > 2:1936759/1‑100 (MQ=255)
aTTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCgcgc < 2:1290667/100‑1 (MQ=255)
ttGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGcc < 1:3959384/100‑1 (MQ=255)
ttGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGcc < 2:1752727/100‑1 (MQ=255)
gCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCAt < 2:2808810/100‑1 (MQ=255)
gCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCAt > 2:676908/1‑100 (MQ=255)
ccGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATg < 2:1643657/100‑1 (MQ=255)
ccGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATg < 2:4451876/100‑1 (MQ=255)
ccGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATg < 1:5450748/100‑1 (MQ=255)
cGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATga > 1:5342277/1‑100 (MQ=255)
cGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAAAGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCCCGCCATga > 2:4997929/1‑100 (MQ=255)
aGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATgaga < 1:2598892/100‑1 (MQ=255)
cACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGt < 1:3550110/100‑1 (MQ=255)
aCGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTg < 2:1907081/100‑1 (MQ=255)
aCGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTg < 2:268991/100‑1 (MQ=255)
aCGGCCCGGGTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTg < 2:4769246/100‑1 (MQ=255)
cGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCAAGCGCACCGCGCCATGAGAGTgg < 1:695097/100‑1 (MQ=255)
ggCCCGGTTTCCTCAGTACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGACTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTACTACACGCACACCGCGCCATGAGAGAGGa < 2:1298612/100‑1 (MQ=255)
gCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGAAGTATTCAACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGAt > 2:2879850/1‑100 (MQ=255)
cccGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATc < 2:5393333/100‑1 (MQ=255)
ccGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGCTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATcc < 2:1380355/100‑1 (MQ=255)
cGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAAGGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATccc < 2:721930/100‑1 (MQ=255)
tCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTgg < 1:2686765/100‑1 (MQ=255)
tCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTgg < 1:1725475/100‑1 (MQ=255)
ccTCAAGACGAAACTCTGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGc < 2:3810246/100‑1 (MQ=255)
tCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCAt > 2:2559186/1‑100 (MQ=255)
cAAGACGAAACTCCGGTGTGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATc < 1:3438109/100‑1 (MQ=255)
cAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATc < 2:4031940/100‑1 (MQ=255)
cAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATc > 2:1539553/1‑100 (MQ=255)
aaGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCg < 1:1477720/100‑1 (MQ=255)
aGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAACTGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCTCGCCATGGGCGTTCATCCCTCTGGCATCgg < 2:4097068/100‑1 (MQ=255)
gACGAAACTCCGGTGTGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGc > 1:5481443/1‑100 (MQ=255)
aCGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCg < 1:2808136/100‑1 (MQ=255)
aCGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCg > 1:957878/1‑100 (MQ=255)
gAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTa > 1:5243291/1‑100 (MQ=255)
gAAACTCCAGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTa > 2:5274814/1‑100 (MQ=255)
aaCTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTaaa > 1:1184451/1‑100 (MQ=255)
aCTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAAc < 2:4182885/100‑1 (MQ=255)
aCTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAAc < 2:1683468/100‑1 (MQ=255)
aCTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAAc < 2:1220324/100‑1 (MQ=255)
cTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAAcc > 1:2156995/1‑100 (MQ=255)
cTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAAcc < 2:5314846/100‑1 (MQ=255)
cTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAAcc > 2:3117084/1‑100 (MQ=255)
ccGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAACCag > 1:2872330/1‑99 (MQ=255)
ccGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAACCaa > 1:3919019/1‑100 (MQ=255)
ccGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAACCaa < 1:5047122/100‑1 (MQ=255)
cGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAACCAAt < 2:3484661/100‑1 (MQ=255)
ggTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAACCAATa > 1:1842369/1‑100 (MQ=255)
|
TGTTCCATACCCATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTTCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAACCAATA > NC_000913/546077‑546269
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
