Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I53 R1
|
229 |
158.0 |
8090706 |
91.1% |
7370633 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
546,173 |
T→G |
E64A (GAA→GCA) |
allD ← |
ureidoglycolate dehydrogenase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 546,173 | 0 | T | G | 97.0%
| 545.3
/ 3.4
| 168 | E64A (GAA→GCA) | allD | ureidoglycolate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/3); new base G (82/81); total (84/84) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.46e-01 |
Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
ATGTTCCATACCCATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTTCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAACCAATA > NC_000913/546076‑546269
|
tGTTCCATACCCATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACCCCGGTgcgc > 2:3456472/1‑100 (MQ=255)
tCCATACCCATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCgga > 2:418947/1‑99 (MQ=255)
ccATACCCATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGtt < 1:2931930/100‑1 (MQ=255)
acATACCCAATGTCGCGGCGACCTGTCCGGCGGCAGTGTCGGCATGTAAGGTTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCGAGACGAATCTCCGGTGAGCGGtt < 2:1495772/99‑1 (MQ=255)
cATACCCATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTg < 1:880250/100‑1 (MQ=255)
tACCCATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGt > 1:2534869/1‑100 (MQ=255)
cccATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGTCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTgc > 2:512698/1‑100 (MQ=255)
cccATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTgc > 1:3434064/1‑100 (MQ=255)
cccATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTgc > 1:3203388/1‑100 (MQ=255)
cccATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTgc > 2:1863559/1‑100 (MQ=255)
cccATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGGTGGTgc > 2:847379/1‑100 (MQ=255)
cctttgCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTgccg < 2:1700883/98‑1 (MQ=255)
aTTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTgccgc > 2:3154681/1‑100 (MQ=255)
tttCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCt < 1:1637988/100‑1 (MQ=255)
tttCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCt > 2:1193290/1‑100 (MQ=255)
tCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTTCGCGGTTGGTGCCGCCttt < 1:1458027/100‑1 (MQ=255)
cgccgcGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCtttt < 2:874417/100‑1 (MQ=255)
cgccgcGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGGTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCGtttt > 1:3656096/1‑100 (MQ=255)
gccgcGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTg < 1:1749337/100‑1 (MQ=255)
gccgcGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTg > 1:3487183/1‑100 (MQ=255)
gccgcGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTg < 1:164718/100‑1 (MQ=255)
cgcgACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATATAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGaa < 2:192677/100‑1 (MQ=255)
gcgACCGGTCCGGCGGCATTGTCGGCAGGTAAAATTGCCGGGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGGGGTTGGTGCCGCCTTTTGaaa < 2:482957/100‑1 (MQ=255)
cgACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAAt < 2:3088503/100‑1 (MQ=255)
gACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATg < 2:1196807/100‑1 (MQ=255)
ccTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCg > 2:3964847/1‑100 (MQ=255)
cTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCC‑TTTGAAATGCGtt < 2:1489584/100‑1 (MQ=255)
gTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTc > 2:110781/1‑100 (MQ=255)
ccGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCcg < 1:3138186/100‑1 (MQ=255)
ccGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCcg > 1:1088875/1‑100 (MQ=255)
cggcggCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCcgc > 1:2333199/1‑100 (MQ=255)
cggcggCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCcgc > 1:214266/1‑100 (MQ=255)
ggcggcATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCcgcg < 1:1103339/100‑1 (MQ=255)
gcggcATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCgt < 2:370962/100‑1 (MQ=255)
ggcATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCgtag < 1:3466823/100‑1 (MQ=255)
aTTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTAt > 2:1097500/1‑100 (MQ=255)
tGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTc > 1:3963831/1‑100 (MQ=255)
gTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTcc > 2:2279636/1‑100 (MQ=255)
tCGGCATGTAAAATTGCCGAGCATGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCa < 2:464618/100‑1 (MQ=255)
tCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCa < 2:2360283/100‑1 (MQ=255)
gatctaTGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCa < 1:2261299/95‑1 (MQ=255)
cGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGCAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCAc < 1:2662690/100‑1 (MQ=255)
cGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCAc < 2:2297576/100‑1 (MQ=255)
cGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCAc < 2:2516839/100‑1 (MQ=255)
cGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTGTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCAc > 2:1867304/1‑100 (MQ=255)
cGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTGTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTGGTGAAATTCGTTCCGCGTAGTGTTCCAc > 2:582354/1‑100 (MQ=255)
ggCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCAcg > 1:776341/1‑100 (MQ=255)
ggCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCAcg > 1:1177546/1‑100 (MQ=255)
gCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCAcgc < 2:3057059/100‑1 (MQ=255)
aTGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCaagatc > 2:2226650/1‑95 (MQ=255)
aTGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACgcgc > 2:2599425/1‑100 (MQ=255)
tGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCa > 1:474563/1‑100 (MQ=255)
tGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCa > 1:1847548/1‑100 (MQ=255)
tGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCa < 2:3851872/100‑1 (MQ=255)
tGTAAAATTACCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCGAGACGAAACTCCTGTGTGCGGGCGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGGAGTTTTGCTCGGGCa > 2:3208951/1‑100 (MQ=255)
gTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCAc > 2:3228709/1‑100 (MQ=255)
tAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGCTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCAcc > 1:431509/1‑100 (MQ=255)
gCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCAt > 1:2577726/1‑100 (MQ=255)
gCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCAt > 2:1133613/1‑100 (MQ=255)
ccGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCTGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATg > 2:3188676/1‑100 (MQ=255)
ccGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATg < 2:2728441/100‑1 (MQ=255)
ccGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATg > 1:1054190/1‑100 (MQ=255)
ccGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATg < 2:3407521/100‑1 (MQ=255)
ccGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGAGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATg < 2:332524/100‑1 (MQ=255)
cGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATga < 1:2248613/100‑1 (MQ=255)
cGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGGGGGTGCCGCCTTTTGACATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATga > 1:180839/1‑100 (MQ=255)
gAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATgag > 2:1792074/1‑100 (MQ=255)
gAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATgag < 1:1543780/100‑1 (MQ=255)
gCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGagag < 2:833819/100‑1 (MQ=255)
cACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGt > 1:3014399/1‑100 (MQ=255)
aCGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAACCTCCGGTGCGGGGTTGGTGGCGCCTTTTGAAATGCTTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGTCATGGGAGTg < 2:1447707/100‑1 (MQ=255)
ggCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGa > 1:622004/1‑100 (MQ=255)
ggCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGa > 2:2840612/1‑100 (MQ=255)
gCCCGGTTTCCTCAAGACGGAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTCGTATTCCACGCGCACCGCCCCATGACAGCGGAt > 2:3656176/1‑100 (MQ=255)
gCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGAt < 1:3336664/100‑1 (MQ=255)
cccGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATc > 1:3473530/1‑100 (MQ=255)
ccGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATcc < 2:3783339/100‑1 (MQ=255)
ccGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATcc < 1:847278/100‑1 (MQ=255)
tttCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCctct < 1:1370933/100‑1 (MQ=255)
ttCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCTGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTg < 2:3594230/100‑1 (MQ=255)
ttCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTg < 2:1114174/100‑1 (MQ=255)
tCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTgg < 2:2789216/100‑1 (MQ=255)
ccTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGc > 1:3039706/1‑100 (MQ=255)
cTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCGCCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCa < 1:4013998/100‑1 (MQ=255)
cTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCa > 1:884818/1‑100 (MQ=255)
cTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCa < 2:3161163/100‑1 (MQ=255)
tCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCAt < 1:2717079/100‑1 (MQ=255)
cAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATc < 2:2229967/100‑1 (MQ=255)
cAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCCGGCATc > 1:2075724/1‑100 (MQ=255)
aaGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCg < 1:112559/100‑1 (MQ=255)
gACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGc > 1:3545436/1‑100 (MQ=255)
gACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGc < 1:561313/100‑1 (MQ=255)
cGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGt > 1:2827913/1‑100 (MQ=255)
aaaCTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTaa > 2:721216/1‑100 (MQ=255)
aaaCTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTaa > 2:797357/1‑100 (MQ=255)
aaCTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTaaa > 2:997581/1‑100 (MQ=255)
aCTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTCCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAAc < 1:3898677/100‑1 (MQ=255)
cTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAAcc < 2:760058/100‑1 (MQ=255)
cTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAAcc > 2:2248124/1‑100 (MQ=255)
cTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAAcc < 1:1081256/100‑1 (MQ=255)
|
ATGTTCCATACCCATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTTCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAACCAATA > NC_000913/546076‑546269
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
