Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I52 R1
|
239 |
220.4 |
11079197 |
93.2% |
10325811 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
564,046 |
T→G |
S145S (TCA→TCC) |
sfmZ ← |
response regulator family protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 564,046 | 0 | T | G | 98.5%
| 696.0
/ 0.3
| 195 | S145S (TCA→TCC) | sfmZ | response regulator family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/3); new base G (101/91); total (101/94) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.10e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.93e-01 |
Only 100 of 195 total aligned reads displayed.
TGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCTGAACGGCATGAAAA > NC_000913/563949‑564142
|
tGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGCTAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGa < 1:5245891/100‑1 (MQ=255)
tGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGa > 1:5397656/1‑100 (MQ=255)
gCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGaa > 2:5085555/1‑100 (MQ=255)
gCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGaa > 1:1525199/1‑100 (MQ=255)
cTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATATTCCGCTAATCAGATAACGTAATATGGTTACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAAc < 1:5179064/100‑1 (MQ=255)
cTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAAc > 1:740779/1‑100 (MQ=255)
tAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACt > 2:3288873/1‑100 (MQ=255)
tAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACt > 1:3083543/1‑100 (MQ=255)
gTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTAtt < 1:270544/100‑1 (MQ=255)
taataaCTTATCGTCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGACAACGTAATATGGTCACTTCACCATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTc < 2:1190791/100‑1 (MQ=255)
ataaCTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGt < 1:1086103/100‑1 (MQ=255)
ataaCTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGt > 2:5220646/1‑100 (MQ=255)
aCTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGtact < 2:2109625/100‑1 (MQ=255)
aCTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGtact > 1:4048313/1‑100 (MQ=255)
cTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGtacta > 2:308197/1‑100 (MQ=255)
cTTATCGGCAATTTCTTTATGAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGtacta > 1:4341191/1‑100 (MQ=255)
ttATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGtactac > 1:3689596/1‑100 (MQ=255)
ggCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTa > 2:4046252/1‑100 (MQ=255)
cAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTAtt < 2:1553229/100‑1 (MQ=255)
tttCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCt > 1:2909899/1‑100 (MQ=255)
tttCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACCTAATATGGTCACTTCACGATTAGACAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCt < 2:660220/100‑1 (MQ=255)
ttCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCtt < 1:3435354/100‑1 (MQ=255)
ttCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCtt > 2:3319640/1‑100 (MQ=255)
ttCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACAGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCtt > 1:5561782/1‑100 (MQ=255)
tCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCttt < 1:2340972/100‑1 (MQ=255)
cTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTGATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCtttt > 1:381969/1‑100 (MQ=255)
cTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCtttt < 1:2437345/100‑1 (MQ=255)
cTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCtttt > 1:428338/1‑100 (MQ=255)
tttATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCttttt < 1:1695072/100‑1 (MQ=255)
ttattaGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTGGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTta < 1:4959775/100‑1 (MQ=255)
tattaGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTtat < 2:3207550/100‑1 (MQ=255)
tattaGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTtat < 1:3559166/100‑1 (MQ=255)
tattaGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTtat < 1:2510828/100‑1 (MQ=255)
tattaGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTtat > 2:2696015/1‑100 (MQ=255)
tattaGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTtat < 2:4249985/100‑1 (MQ=255)
attaGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTtata > 2:4722783/1‑100 (MQ=255)
attaGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTtata > 1:1315486/1‑100 (MQ=255)
attaGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTtata > 1:3322492/1‑100 (MQ=255)
taGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTtatata > 2:3194993/1‑100 (MQ=255)
gATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGt < 2:1992354/100‑1 (MQ=255)
tAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTa > 2:3829737/1‑100 (MQ=255)
aaTCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTaa > 1:3100825/1‑100 (MQ=255)
aTCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTATATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAg < 1:64354/100‑1 (MQ=255)
aTCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAg > 1:954738/1‑100 (MQ=255)
tCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGc < 1:3496503/100‑1 (MQ=255)
cccccaaCCAGACAACATAACAGTTTCACTGCACGAGTAGAGAGCACAGGGACCGTGGAACTATTCGGACTACATTTATTGCTTTGGATATAGTTAATCg < 2:5487875/95‑1 (MQ=255)
tAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTc < 1:3865108/100‑1 (MQ=255)
tAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTc < 1:5026435/100‑1 (MQ=255)
aCCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGc < 2:1441912/100‑1 (MQ=255)
aCCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGc < 1:1214463/100‑1 (MQ=255)
aCCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGc > 2:1728227/1‑100 (MQ=255)
ccAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCt < 2:2167225/100‑1 (MQ=255)
aGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTCAATTTATTGCTTTTTATATATCTAACCGTCTCGCttt > 2:4592373/1‑98 (MQ=255)
aGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTgg < 2:3617635/100‑1 (MQ=255)
gATAACGTAATATGGTCACTTCACTATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTggg < 2:219218/100‑1 (MQ=255)
aTAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGa > 1:3956700/1‑100 (MQ=255)
tAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGaa < 2:3438280/100‑1 (MQ=255)
aCGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGaaaa > 2:4294423/1‑100 (MQ=255)
aCGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGaaaa < 1:1884604/100‑1 (MQ=255)
aaTATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACg < 1:1064534/100‑1 (MQ=255)
atatGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACgt < 2:4630432/100‑1 (MQ=255)
tatGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACgtg < 2:894563/100‑1 (MQ=255)
tatGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACgtg < 1:2740453/100‑1 (MQ=255)
tatGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACgtg < 1:3044746/100‑1 (MQ=255)
atGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACgtgt > 2:2400960/1‑100 (MQ=255)
atGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACgtgt < 1:1727029/100‑1 (MQ=255)
tGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGAAAAAAACGTGTa < 1:4789495/100‑1 (MQ=255)
ggTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACGTTTATTGCTTTTTGTATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTAt > 2:2502588/1‑100 (MQ=255)
ggTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTAt > 1:3002929/1‑100 (MQ=255)
cACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCg > 2:3088694/1‑100 (MQ=255)
cACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCg > 2:317146/1‑100 (MQ=255)
aCTTCCCGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCgg < 1:258209/100‑1 (MQ=255)
cTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGga > 2:404669/1‑100 (MQ=255)
ttCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGgag < 2:4118613/100‑1 (MQ=255)
tCACCATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTGATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAATAACGTGTAGCCGgaga < 2:5330034/100‑1 (MQ=255)
cACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGCAAAAACGTGTATCCGGagag > 2:3899834/1‑100 (MQ=255)
cACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGagag < 2:853586/100‑1 (MQ=255)
cACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGagag > 1:1909528/1‑100 (MQ=255)
cACGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGagag > 2:1405427/1‑100 (MQ=255)
aCGATTAGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCGTTTTATAGAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAgg < 1:5292549/100‑1 (MQ=255)
aGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGatcatc > 1:2943198/1‑100 (MQ=255)
aGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGatcatc < 2:2882430/100‑1 (MQ=255)
aGATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGatcatc < 2:4332606/100‑1 (MQ=255)
gATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCt > 1:2062155/1‑100 (MQ=255)
gATAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCt > 2:49923/1‑100 (MQ=255)
aTAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCTg > 2:2307406/1‑100 (MQ=255)
aTAGCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCTg < 1:1748567/100‑1 (MQ=255)
gCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCTGAAc < 1:5065790/100‑1 (MQ=255)
gCACAGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCTGAAc > 1:1584992/1‑100 (MQ=255)
acaGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCTGAACgg > 1:4574512/1‑100 (MQ=255)
caGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCTGAACGGc > 2:4875362/1‑100 (MQ=255)
caGTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCTGAACGGc > 1:5479697/1‑100 (MQ=255)
gTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCTGAACGGCAt > 2:3144985/1‑100 (MQ=255)
gTGACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTACATTGTTAATCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGCGGATCATCTGAACGGCAt > 2:1850130/1‑100 (MQ=255)
gACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCTGAACGGCATGa < 1:3594516/100‑1 (MQ=255)
gACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCTGAACGGCATGa > 2:5141995/1‑100 (MQ=255)
gACCGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCTGAACGGCATGa < 1:2227620/100‑1 (MQ=255)
ccGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCTGAACGGCATGaaa < 2:2824833/100‑1 (MQ=255)
ccGTGGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCTGAACGGCATGaaa > 1:1803864/1‑100 (MQ=255)
cGTGGATCTATTCGTACTACATTTATTCCTTTTTGTATAGTTAAGCGTTTCGCTGTGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCTGAACGGCATGaaaa < 2:5252515/100‑1 (MQ=255)
|
TGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCTGAACGGCATGAAAA > NC_000913/563949‑564142
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
