Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I52 R1
|
239 |
220.4 |
11079197 |
93.2% |
10325811 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,008,526 |
A→C |
I84L (ATC→CTC) |
yedE → |
UPF0394 family sulphur transport domain‑containing inner membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,008,526 | 0 | A | C | 99.4%
| 562.7
/ ‑4.3
| 159 | I84L (ATC→CTC) | yedE | UPF0394 family sulphur transport domain‑containing inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base C (73/85); total (74/85) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.65e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.69e-01 |
Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
GCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGATCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCC > NC_000913/2008429‑2008621
|
gCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTc < 2:1459548/100‑1 (MQ=255)
tCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCt > 1:2167551/1‑100 (MQ=255)
ccTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGctcctc > 2:4213461/1‑100 (MQ=255)
cTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCg < 1:2050960/100‑1 (MQ=255)
tGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCgg < 1:3495377/100‑1 (MQ=255)
tGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCgg < 1:5024842/100‑1 (MQ=255)
tGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCgg < 2:1532598/100‑1 (MQ=255)
tGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCgg > 2:2543150/1‑100 (MQ=255)
gCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGt > 1:1366504/1‑100 (MQ=255)
gCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGt > 1:5504106/1‑100 (MQ=255)
cAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTa < 1:1106751/100‑1 (MQ=255)
aaCTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTAt > 2:2119984/1‑100 (MQ=255)
aCTGTTCGGCGTCCGTGCTGAAGAGTAGGGTTACTTTTAAATTATCCATCTGGAAGGAGCGCCATTAACCCGCACGGACGGGATGATGCTCCTCGGTCTg > 2:4863555/1‑100 (MQ=255)
aCTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATg > 2:4328181/1‑100 (MQ=255)
cTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGt < 2:1427047/100‑1 (MQ=255)
gTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGttt < 1:4572777/100‑1 (MQ=255)
gTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGttt < 2:3498536/100‑1 (MQ=255)
ttCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTg < 1:3861762/100‑1 (MQ=255)
tCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATGTGAACGGCTCGCCATCAACCCGCATCGCAGGGTTGCTGCTCCTCGGTATGATTga > 2:4147939/1‑99 (MQ=255)
cGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTggc < 2:2395591/100‑1 (MQ=255)
gCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGCATGTTTggcgg > 2:2809802/1‑100 (MQ=255)
cGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTggcggc < 1:1691548/100‑1 (MQ=255)
cGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTggcggc < 2:4688598/100‑1 (MQ=255)
tCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGgctg < 1:1658255/100‑1 (MQ=255)
ccATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGgctgc > 2:2854135/1‑100 (MQ=255)
ccATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGgctgc > 1:3061509/1‑100 (MQ=255)
gCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTg < 1:779186/100‑1 (MQ=255)
cTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGc < 1:4368498/100‑1 (MQ=255)
gAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCg > 2:5435742/1‑100 (MQ=255)
gAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCg > 1:4301886/1‑100 (MQ=255)
aaGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGc < 2:1672112/100‑1 (MQ=255)
gagTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAg < 1:1846417/100‑1 (MQ=255)
gagTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAg < 2:1412178/100‑1 (MQ=255)
gagTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAg < 1:4997952/100‑1 (MQ=255)
gTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAgcg > 1:3978999/1‑100 (MQ=255)
gggTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCtg > 1:5488579/1‑100 (MQ=255)
ggTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCtgt > 1:3118386/1‑100 (MQ=255)
ggTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCtgt < 1:1193286/100‑1 (MQ=255)
gTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCtgtg > 1:1933119/1‑100 (MQ=255)
ttACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTgg < 1:844403/100‑1 (MQ=255)
ttACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTgg < 1:1268107/100‑1 (MQ=255)
ttACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATGAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTgg < 1:1906910/100‑1 (MQ=255)
aCTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGc < 2:3032970/100‑1 (MQ=255)
cTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGcc > 2:4783348/1‑100 (MQ=255)
cTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGcc < 2:2378777/100‑1 (MQ=255)
cTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGcc > 2:4882946/1‑100 (MQ=255)
cTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGcc > 1:4372597/1‑100 (MQ=255)
cTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGcc > 2:4876494/1‑100 (MQ=255)
cTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGGAGGTGTGGCGGCGTCTTGGCCGCAGCGgtgttgtcc > 1:3057022/1‑95 (MQ=255)
tttAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCca < 2:3199616/100‑1 (MQ=255)
ttAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCcaa > 2:5223148/1‑100 (MQ=255)
aaaaTTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCcaaca < 1:5509251/100‑1 (MQ=255)
aaaTTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCcaacaa > 1:3461337/1‑100 (MQ=255)
aaaTTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCcaacaa < 1:2187265/100‑1 (MQ=255)
aTTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATg < 1:4693494/100‑1 (MQ=255)
ttATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGt < 1:4397486/100‑1 (MQ=255)
tATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGATGGAATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTc > 2:4221131/1‑100 (MQ=255)
tATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTc < 2:4032327/100‑1 (MQ=255)
tATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTc < 1:655498/100‑1 (MQ=255)
aTCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATCTCa < 1:4285404/100‑1 (MQ=255)
tCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCaa < 1:4575567/100‑1 (MQ=255)
tCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCaa > 1:1456499/1‑100 (MQ=255)
cATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAAc < 1:5295074/100‑1 (MQ=255)
cATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAAc > 2:4543976/1‑100 (MQ=255)
aTCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACt > 2:2401214/1‑100 (MQ=255)
aTCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACt > 1:3682560/1‑100 (MQ=255)
cTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGc > 2:4437552/1‑100 (MQ=255)
cTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGc > 1:3919016/1‑100 (MQ=255)
tGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCg > 2:3290671/1‑100 (MQ=255)
tGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCg > 1:2030832/1‑100 (MQ=255)
tGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCg < 2:2826395/100‑1 (MQ=255)
ggAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGa < 2:933167/100‑1 (MQ=255)
ggAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGa > 2:3613578/1‑100 (MQ=255)
ggAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGa < 1:4092958/100‑1 (MQ=255)
naaGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCGGCTTTGCCGCAGCGCTGGGGGCCAACAATGGCAAACTGCTaa > 1:4457020/2‑100 (MQ=255)
aaGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGGTTGGCGGCGGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAAt < 2:2140479/100‑1 (MQ=255)
ggATCGCCATTAACCCGCGTCGACGAGATAATGCTCCTCGGTATATTTGGCGGCTGCTTAGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACCATGTCAGACTGCGAATGc > 2:391691/1‑100 (MQ=255)
aTCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCcg > 2:2511590/1‑100 (MQ=255)
ccATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCa > 2:5355486/1‑100 (MQ=255)
ccATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCa > 2:4193991/1‑100 (MQ=255)
aTTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGc < 1:106996/100‑1 (MQ=255)
aTTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGc < 2:1266983/100‑1 (MQ=255)
aTTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGc < 2:2104208/100‑1 (MQ=255)
tAACCCGCATCGGCCGGATCATGCTACTCGGTATGTTTGGCGGATGCTTTGACGCAGCGCTGTGGGCACACAATGTCAAACTGCGACTGCCGCGCAGCCg < 2:252280/100‑1 (MQ=255)
aCCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTa > 2:2709694/1‑100 (MQ=255)
cATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGc > 1:2688803/1‑100 (MQ=255)
tCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCAt > 2:1169332/1‑100 (MQ=255)
cGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCAtt < 1:2520758/100‑1 (MQ=255)
gACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTa < 2:5182753/100‑1 (MQ=255)
gggATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGc < 2:3118962/100‑1 (MQ=255)
ggATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCa > 2:458988/1‑100 (MQ=255)
ggATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCa < 2:1572559/100‑1 (MQ=255)
ggATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCa > 2:1770127/1‑100 (MQ=255)
gatgatgctCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAg < 1:2874402/100‑1 (MQ=255)
gatgatgctCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGACGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAg < 2:5430634/100‑1 (MQ=255)
atgatgctCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAgg < 2:108426/100‑1 (MQ=255)
atgatgctCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAgg < 1:3533186/100‑1 (MQ=255)
tgatgctCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGc < 1:1465124/100‑1 (MQ=255)
gatgctCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGcc < 1:1585150/100‑1 (MQ=255)
gatgctCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGcc > 1:1207218/1‑100 (MQ=255)
|
GCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGATCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCC > NC_000913/2008429‑2008621
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
