Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I53 R1
|
229 |
158.0 |
8090706 |
91.1% |
7370633 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,008,526 |
A→C |
I84L (ATC→CTC) |
yedE → |
UPF0394 family sulphur transport domain‑containing inner membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,008,526 | 0 | A | C | 96.8%
| 422.5
/ 0.9
| 127 | I84L (ATC→CTC) | yedE | UPF0394 family sulphur transport domain‑containing inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/2); new base C (72/50); total (75/52) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.87e-01 |
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
GCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGATCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCA > NC_000913/2008429‑2008622
|
cTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCg < 1:842254/100‑1 (MQ=255)
cTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCg < 2:1015134/100‑1 (MQ=255)
tGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCgc > 1:2857129/1‑99 (MQ=255)
cAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTa > 1:2892761/1‑100 (MQ=255)
aCTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATg < 2:2269237/100‑1 (MQ=255)
cTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGt < 1:3722281/100‑1 (MQ=255)
tGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGtt < 1:2949533/100‑1 (MQ=255)
gTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGttt > 1:442537/1‑100 (MQ=255)
ttCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTg < 1:3437851/100‑1 (MQ=255)
ttCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTg < 1:1535504/100‑1 (MQ=255)
tCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTgg < 2:1269496/100‑1 (MQ=255)
cGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTggc < 2:878162/100‑1 (MQ=255)
ggCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTggcg > 1:25282/1‑100 (MQ=255)
ggCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCCGGAAGGAACGCCCTTAACCCGCATCGACGGGATGATGATACTCGGTATGTTTggcg > 2:2401953/1‑100 (MQ=255)
ggCGTCCATGCTGAAGAGAGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGAATCGCCATTAAAAAGCATAGAAGGGATGATGATACTCGGTATGTTTcgcg > 2:2401856/1‑100 (MQ=255)
cGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTggcggc < 1:3836264/100‑1 (MQ=255)
ccATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGgctgc < 2:1381333/100‑1 (MQ=255)
ccATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGgctgc > 1:2817651/1‑100 (MQ=255)
cATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGgctgct > 1:979732/1‑100 (MQ=255)
aTGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGATCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCtt < 1:2439289/100‑1 (MQ=255)
aTGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCAGTAACCCGCATCGACGGGATGATGATCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCtt < 1:2439389/100‑1 (MQ=255)
tGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCttt > 2:15722/1‑100 (MQ=255)
gCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTg > 1:1699464/1‑100 (MQ=255)
gCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTg > 1:1699131/1‑100 (MQ=255)
cTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGc > 1:2093883/1‑100 (MQ=255)
cTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGc > 2:36148/1‑100 (MQ=255)
cTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGc > 1:2161048/1‑100 (MQ=255)
cTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGc < 2:10852/100‑1 (MQ=255)
tGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGcc < 1:36772/100‑1 (MQ=255)
tGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGcc < 1:752884/100‑1 (MQ=255)
tGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGcc > 1:2670208/1‑100 (MQ=255)
gAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCg > 1:1391859/1‑100 (MQ=255)
aaGAGTGGGTTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATTGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGc < 2:3138641/100‑1 (MQ=255)
agcgTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCa < 1:395009/97‑1 (MQ=255)
gagTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAg > 2:1306700/1‑100 (MQ=255)
gagTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAg < 2:1227762/100‑1 (MQ=255)
gagTGGGGTCACGTGAAAATTATCCATCTGGAAGGAGCGCCATGAACCCGCAGCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAg > 2:1743873/1‑100 (MQ=255)
agTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAgc > 1:2465310/1‑100 (MQ=255)
agTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAgc > 2:1711885/1‑100 (MQ=255)
gTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAgcg < 2:2572320/100‑1 (MQ=255)
ggggTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCt > 2:2878782/1‑100 (MQ=255)
ggTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCtgt > 1:4042342/1‑100 (MQ=255)
ggTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCtgt > 1:1330050/1‑100 (MQ=255)
ggTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCtgt > 1:3380564/1‑100 (MQ=255)
ttACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTgg < 2:651996/100‑1 (MQ=255)
ttACGTTAAAATTATCCAGCTGGAAGGAGCGCCATTAACCCGCATCGACCGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTgg < 2:3939391/100‑1 (MQ=255)
tACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTACCGCAGCGCTGTggg < 1:1706964/100‑1 (MQ=255)
aCTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGc > 2:470128/1‑100 (MQ=255)
tcttAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGcc < 2:2420779/98‑1 (MQ=255)
cTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGcc > 1:3829766/1‑100 (MQ=255)
tttAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCGCCGCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCca < 2:3875750/100‑1 (MQ=255)
ttAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCGGTGGGCcaa > 2:2664493/1‑100 (MQ=255)
aaTTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAAt < 1:2844223/100‑1 (MQ=255)
aaTTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAAt < 2:1138542/100‑1 (MQ=255)
aTTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATg > 1:2267940/1‑100 (MQ=255)
aTTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATg < 1:765709/100‑1 (MQ=255)
aTTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATg < 1:1759061/100‑1 (MQ=255)
tATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTc > 1:3656898/1‑100 (MQ=255)
aTCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCa < 1:465158/100‑1 (MQ=255)
aTCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCa < 1:2731244/100‑1 (MQ=255)
ccATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCaaa > 1:2711306/1‑100 (MQ=255)
cagcTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGGCGGGATGATGCTCCGCGGTATGTTTGGCGGCGGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAAc < 2:3919850/97‑1 (MQ=255)
cATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAAc > 2:863313/1‑100 (MQ=255)
cATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAAc > 1:408211/1‑100 (MQ=255)
tCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTg < 1:1434691/100‑1 (MQ=255)
tGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCg > 2:2120474/1‑100 (MQ=255)
ggAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGa > 2:2832087/1‑100 (MQ=255)
ggAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGa > 1:1775752/1‑100 (MQ=255)
aaGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAAt < 1:416043/100‑1 (MQ=255)
aGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCCCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACACTGTCAAACTGCGAATg > 2:818631/1‑100 (MQ=255)
gATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGGTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGcc > 2:3601789/1‑100 (MQ=255)
tCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCcgc < 1:2179860/100‑1 (MQ=255)
cGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCcgcg > 2:1387177/1‑100 (MQ=255)
gCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCgcgc > 2:2225150/1‑100 (MQ=255)
ccATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCa > 2:2277694/1‑100 (MQ=255)
ccATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCa > 1:1336297/1‑100 (MQ=255)
ccATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCa > 1:3391508/1‑100 (MQ=255)
aTTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGc > 2:177336/1‑100 (MQ=255)
aTTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGc > 2:744856/1‑100 (MQ=255)
aaCCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGt > 1:40580/1‑100 (MQ=255)
aCCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTa > 1:2722420/1‑100 (MQ=255)
cccGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTAt > 1:1288390/1‑100 (MQ=255)
cccGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTAt > 1:2960155/1‑100 (MQ=255)
cccGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTAt > 1:546262/1‑100 (MQ=255)
cccGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTAt > 1:1821445/1‑100 (MQ=255)
cGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATcc < 2:2670079/100‑1 (MQ=255)
gCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATccn < 1:838877/100‑2 (MQ=255)
cATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGc > 2:3207511/1‑100 (MQ=255)
aTCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCa < 1:2124734/100‑1 (MQ=255)
tCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCAt < 1:2922596/100‑1 (MQ=255)
cGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCAtt > 1:83347/1‑100 (MQ=255)
gACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGGGGCGGCTTTGCCGAAACGCGGTGGGCCAACTATGTCAAACAGCGAGTGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTa > 2:338809/1‑100 (MQ=255)
gACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTa < 1:1194167/100‑1 (MQ=255)
gACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTa > 1:684042/1‑100 (MQ=255)
cGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATg < 2:1428038/100‑1 (MQ=255)
gggATGATGCGCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGGTGTGGGCCAACAATGGCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGc < 2:1669862/100‑1 (MQ=255)
atgatgctCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAgg > 2:2839420/1‑100 (MQ=255)
tgatgctCCTCGGTCTGTTTGGCGGCCCCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCCGGc > 2:1353516/1‑100 (MQ=255)
gatgctCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGcc > 2:3024930/1‑100 (MQ=255)
atgctCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCca > 2:403609/1‑100 (MQ=255)
|
GCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGATCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCA > NC_000913/2008429‑2008622
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
