Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F236 I1 R1
|
155 |
93.2 |
2393300 |
97.8% |
2340647 |
180.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,008,526 |
A→C |
I84L (ATC→CTC) |
yedE → |
UPF0394 family sulphur transport domain‑containing inner membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,008,526 | 0 | A | C | 98.6%
| 241.7
/ ‑6.8
| 70 | I84L (ATC→CTC) | yedE | UPF0394 family sulphur transport domain‑containing inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base C (38/31); minor base G (0/1); total (38/32) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.57e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 |
ATTCAAACACGCCTGGTTGATTAAATTCTGGGCCCCCATCCCTGCGGTCATCGCGGCGGGTATTCTCTCTACTTACTATTTTGGCATTACTGGCACCTTTTGGGCTGTCACGGGTGAATTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGATCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCTCAGTTCTCGCTGCATGCCTGGTTCTTTGCCATCGCCACTGCCATTGGTTCA > NC_000913/2008291‑2008753
|
aTTCAAACACGCATGGTTGATTAAATTCTGGGCCCCCATCCCTGCGGTCATCGCGGCGGGTATTCTCTCTACTTACTATTTTGGCATTACTGGCACCTTTTGGGCTGTCACGGGTGAATTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTcc < 1:796083/239‑1 (MQ=255)
ccTGGTTGATTAAATTCTGGGCCCCCATCCCTGCGGTCATCGCGGCGGGTATTTTCTCTTCTTACTATTTTTGGATTTCTGGCACCCTTTGGGCTGTCCCGGGGGAATTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCCACTGTTCGGCGTCCCTGGTGAAGAGTGGGGGTACTTTAAAATTCTCCCTCGGGGAGGGGCTCCATTCACCCTCATCGACTGGAGGATGCCTCTCGGTATGttt > 2:201141/1‑239 (MQ=255)
ggCCCCCATCCCTGCGGTCATCGCGGCGGGGATTTTCTCTACTTTCTATTTTGGCATTACTGGCACCCTTTGGGCTGTCACGGGGGAAATTACCCGTTGGGGCGGGCAGCCCCTGCCACTGTTCGGCGTCCATGCCGAAGAGTGGGGTTACTTTTAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGTTGCTCCTCGGTATGGTTGGTGGCCGCTTTCCCGCac > 2:285300/1‑238 (MQ=255)
ccATCCCTGCGGTCATCGCGGCGGGTATTCTCTCTACTTACTATTTTGGCATTACTGGCACCTTTTGGGCTGTCACGGGTGAATTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCtg < 1:786069/239‑1 (MQ=255)
cccTGCGGTCATCGCGGCGGGTATTCTCTCTACTTACTATTTTGGCATTACTGGCACCTTTTGGGCTGTCACGGGTGAATTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAgcgc < 1:261997/233‑1 (MQ=255)
ccTGCGGTCATCGCGGCGGGGATTTTCTCTACTTACTATTTTTGCATTTCTGGCACCTTTTGGGCTGTCACGGGTGAATTTTCCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTTGGCGTCCATGCTGGAGAGGGGGGGTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCCTCGACGGGGTGATGCCCCTCGGTATGTTTGGCGGGCGCTTTTCCCCAGAGGTGTggg > 2:134549/1‑238 (MQ=255)
tctACTTACTATTTTGGCATTACTGGCACCTTTTGGGCTGTCACGGGTGAATTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCcgcg < 1:134549/239‑1 (MQ=255)
ctACTTACTATTTTGGCATTACTGGCACCTTTTGGGCTGTCACGGGTGAATTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCCCTGTGTGCCACCCATGTCAAACTGCGAATGCCgcgc > 2:546651/1‑239 (MQ=255)
acttactATTTTGGCATTACTGGCACCTTTTGGGCTGTCACGGGTGAATTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCa > 2:165794/1‑238 (MQ=255)
acttactATTTTGGCATTACTGGCACCTTTTGGGCTGTCACGGGTGAATTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCa > 1:142586/1‑238 (MQ=255)
actATTTTGGCATTACTGGCACCTTTTGGGCTGTCACGGGTGAATTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAg < 2:102650/195‑1 (MQ=255)
actATTTTGGCATTACTGGCACCTTTTGGGCTGTCACGGGTGAATTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAg > 1:102650/1‑195 (MQ=255)
actATTTTGGCATTACTGGCACCTTTTGGGCTGTCACGGGTGAATTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTgg < 2:1067032/203‑1 (MQ=255)
actATTTTGGCATTACTGGCACCTTTTGGGCTGTCACGGGTGAATTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTgg > 1:1067032/1‑203 (MQ=255)
actATTTTGGCATTACTGGCACCTTTTGGGCTGTCACGGGTGAATTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGt > 2:627464/1‑239 (MQ=255)
tATTTTGGCATTACTGGCACCTTTTGGGCTGTCACGGGTGAATTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTAt < 2:951201/239‑1 (MQ=255)
tATTTTGGCATTACTGGCACCTTTTGGGCTGTCACGGGTGAATTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTAt < 2:1046160/239‑1 (MQ=255)
tGGCATTACTGGCACCTTTTGGGCTGTCACGGGTGAATTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCa > 1:1131457/1‑239 (MQ=255)
tGGCATTACTGGCACCTTTTGGGCTGTCACGGGTGAATTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCa > 1:47449/1‑239 (MQ=255)
tGGCATTACTGGCACCTTTTGGGCTGTCACGGGTGAATTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCa < 2:47449/239‑1 (MQ=255)
ttACTGGCACCTTTTGGGCTGTCACGGGTGAATTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTAt > 1:550984/1‑238 (MQ=255)
aCCTTTTGGGCTGTCACGGGTGAATTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCcaa < 2:1063189/188‑1 (MQ=255)
aCCTTTTGGGCTGTCACGGGTGAATTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCcaa > 1:1063189/1‑188 (MQ=255)
ggCTGTCACGGGTGAATTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACGGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTggcg > 2:826098/1‑239 (MQ=255)
gTCACGGGTGAATTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGt > 2:977865/1‑138 (MQ=255)
gTCACGGGTGAATTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGt < 1:977865/138‑1 (MQ=255)
gTCACGGGTGAATTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCAt > 2:1162378/1‑239 (MQ=255)
tCACGGGTGAATTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCAtt > 2:1047334/1‑239 (MQ=255)
tGAATTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCg > 2:74756/1‑239 (MQ=255)
aTTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGtt > 1:847005/1‑239 (MQ=255)
ccGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGgc > 2:824749/1‑238 (MQ=255)
tGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATg > 1:432634/1‑198 (MQ=255)
tGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATg < 2:432634/198‑1 (MQ=255)
ggggCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGGGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTTTCCCCGGTTTTGgcaccct > 2:260245/1‑233 (MQ=255)
cTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATgg > 2:245015/1‑238 (MQ=255)
tCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAAt < 1:1047334/235‑1 (MQ=255)
cTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTg < 2:550984/239‑1 (MQ=255)
ggCAACTGTTCGGTGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACGTTAAAATTATCCATCTGGAAGTATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATCCCGCGCAGCCGTATCCGCATGATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGt < 2:963870/238‑1 (MQ=255)
cAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCa > 2:470344/1‑175 (MQ=255)
cAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCa < 1:470344/175‑1 (MQ=255)
ttCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGc < 1:252975/200‑1 (MQ=255)
ttCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGc > 2:252975/1‑200 (MQ=255)
tCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTggcg < 1:825249/239‑1 (MQ=255)
cTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTAc < 1:802720/238‑1 (MQ=255)
tGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGAATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTAtt > 2:69940/1‑237 (MQ=255)
ggggTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCt < 1:627464/239‑1 (MQ=255)
ggggTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCt < 1:824749/239‑1 (MQ=255)
gggTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCTc > 1:1192952/1‑239 (MQ=255)
gggTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGGCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGAGGGGGTCTTTACCGGGATTCCt > 2:802720/1‑238 (MQ=255)
ggTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCTc < 2:847005/238‑1 (MQ=255)
aaaTTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCTCAGTtc < 1:756290/233‑1 (MQ=255)
aaaTTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCTCAGTtc > 2:756290/1‑233 (MQ=255)
aTCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCCGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCTCAGTTCTCGCTGTATg > 2:529317/1‑238 (MQ=255)
tCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCt < 1:98333/49‑1 (MQ=255)
tCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCt > 2:98333/1‑49 (MQ=255)
tCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCcgcg < 2:940176/115‑1 (MQ=255)
tCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCcgcg > 1:940176/1‑115 (MQ=255)
tCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCTCAGTTCTCGCTGCATg > 1:1193458/1‑237 (MQ=255)
tCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCTCAGTTCTCGCTGCATGcc < 2:1193458/239‑1 (MQ=255)
tCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCTCAGTTCTCGCTGCATGcc < 1:245015/239‑1 (MQ=255)
aTCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGgcggcg < 1:265872/190‑1 (MQ=255)
aTCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGgcggcg > 2:265872/1‑190 (MQ=255)
tCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGGTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCGGCGTTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCTCAGTTCTCGCTGCATGCCTGGTTCTTTGCCAt < 1:285300/239‑1 (MQ=255)
tCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAAt > 2:1061674/1‑170 (MQ=255)
tCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAAt < 1:1061674/170‑1 (MQ=255)
tAACCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCTCAGTTCTCGCTGCATGCCTGGTTCTTTGCCATCGCCACt < 1:74756/239‑1 (MQ=255)
aCCCGCATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCTCAGTTCTCGCTGNNNGCCTGGTTCTTTGCCATCGcc > 1:1115245/1‑234 (MQ=255)
cATCGACGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCaa > 2:494366/1‑155 (MQ=255)
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aCGGGATGATGCTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCTCAGTTCTCGCTGCATGCCTGGTTCTTTGCCATCGCCACTGCCATTGGTTCa > 1:943869/1‑239 (MQ=255)
atgatgctCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCTCAGTTCTCGCTGCATGCCt > 1:1149186/1‑202 (MQ=255)
atgatgctCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCTCAGTTCTCGCTGCATGCCt < 2:1149186/202‑1 (MQ=255)
|
ATTCAAACACGCCTGGTTGATTAAATTCTGGGCCCCCATCCCTGCGGTCATCGCGGCGGGTATTCTCTCTACTTACTATTTTGGCATTACTGGCACCTTTTGGGCTGTCACGGGTGAATTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGATCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCTCAGTTCTCGCTGCATGCCTGGTTCTTTGCCATCGCCACTGCCATTGGTTCA > NC_000913/2008291‑2008753
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
