Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I52 R1
|
239 |
220.4 |
11079197 |
93.2% |
10325811 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,151,093 |
T→G |
intergenic (‑108/‑92) |
yegI ← / → yegJ |
protein kinase‑related putative non‑specific DNA‑binding protein/uncharacterized protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,151,093 | 0 | T | G | 99.6%
| 808.3
/ ‑5.1
| 226 | intergenic (‑108/‑92) | yegI/yegJ | protein kinase‑related putative non‑specific DNA‑binding protein/uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base G (126/99); total (126/100) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.42e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.76e-01 |
Only 100 of 230 total aligned reads displayed.
CGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAA > NC_000913/2150995‑2151189
|
cgGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAtt > 2:903682/1‑100 (MQ=255)
gggTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAgtt < 2:2079499/100‑1 (MQ=255)
gTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTa < 1:1100852/100‑1 (MQ=255)
gTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCa < 1:2732542/100‑1 (MQ=255)
ttatattataTTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCAATCAAAAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAg < 2:47385/100‑1 (MQ=255)
tatattatatTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAgg < 2:3575887/100‑1 (MQ=255)
atattatattTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAGCCCACTCAAGAATCAAAATGATAATGAAAGTTTATCAGGa > 1:1615934/1‑100 (MQ=255)
atattatattTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGa > 2:125180/1‑100 (MQ=255)
tattatattTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGAt > 2:1766801/1‑100 (MQ=255)
cttatattTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATCGGGAAAACCCACTCCAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATa > 2:2489677/2‑100 (MQ=255)
attatattTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATa > 2:4235880/1‑100 (MQ=255)
ttatattTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATAc > 1:3743600/1‑100 (MQ=255)
atattTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATAcaa < 2:2842369/100‑1 (MQ=255)
atattTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATAcaa < 2:1862689/100‑1 (MQ=255)
tattACAATGAATAACAACAACTAACCATTAAAATTATTTATATATGGGGAAAACCCCCTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATAcact < 2:1910591/100‑3 (MQ=255)
attTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATAcaatt > 2:1057153/1‑100 (MQ=255)
tttCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATAcacttc > 2:625703/1‑100 (MQ=255)
tttCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATAcaattc > 2:286888/1‑100 (MQ=255)
tttCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATAcaattc < 2:5308928/100‑1 (MQ=255)
tttCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATAcaattc > 2:2267015/1‑100 (MQ=255)
tCAATGAATAATAACCACTAACCATTAAAACTATTTCTATGTGGGCAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATGATGCAAGTTTATCAGGATAcaattcaa > 1:4838028/1‑100 (MQ=255)
tCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATAcaattcaa > 2:4143071/1‑100 (MQ=255)
tCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATAcaattcaa > 2:1552756/1‑100 (MQ=255)
cAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATAcaattcaat < 2:2467974/100‑1 (MQ=255)
aaTGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATAcaattcaatt < 1:1502136/100‑1 (MQ=255)
tGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTc < 2:198327/100‑1 (MQ=255)
gAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCg > 1:2950585/1‑100 (MQ=255)
gAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCg < 2:3942204/100‑1 (MQ=255)
ataataACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGc > 2:1845499/1‑100 (MQ=255)
ataataACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGc < 1:2082806/100‑1 (MQ=255)
aataaCAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGAAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCt > 2:2752863/1‑100 (MQ=255)
aacaacTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGAt > 2:5478159/1‑100 (MQ=255)
aacaacTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGAt < 2:676569/100‑1 (MQ=255)
aacaacTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGAt > 2:3518412/1‑100 (MQ=255)
acTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATg > 1:1139502/1‑100 (MQ=255)
acTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATg > 1:228348/1‑100 (MQ=255)
cTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGa < 2:4482248/100‑1 (MQ=255)
cTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCATGATAATGa > 2:3211739/1‑100 (MQ=255)
tAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGAt > 2:5188192/1‑100 (MQ=255)
aaCCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACGATTCAATTTCGGCCTGATAATGAta > 1:1706436/1‑99 (MQ=255)
aaCCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGAtt > 1:1651860/1‑100 (MQ=255)
aCCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTa < 2:557272/100‑1 (MQ=255)
aCCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTa < 1:5551983/100‑1 (MQ=255)
naTTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAAc > 2:1580101/2‑100 (MQ=255)
cATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAAc > 1:679555/1‑100 (MQ=255)
aTTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACt > 2:5451443/1‑100 (MQ=255)
ttAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACtt > 1:976579/1‑100 (MQ=255)
tAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTc < 1:2888116/100‑1 (MQ=255)
aaaaTTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTcc > 2:5027355/1‑100 (MQ=255)
aaaaTTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTcc > 1:3485350/1‑100 (MQ=255)
aaaaTTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTcc > 1:1356139/1‑100 (MQ=255)
aaaTTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCca > 2:2604611/1‑100 (MQ=255)
aaTTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCcac < 2:2669485/100‑1 (MQ=255)
attattTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCcaca > 1:5321231/1‑100 (MQ=255)
tattTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAgg < 1:4274996/100‑1 (MQ=255)
tCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGtttt < 1:4898291/100‑1 (MQ=255)
cTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGttttt < 1:2319845/100‑1 (MQ=255)
cTATATGGGGAAAACCCACACAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGttttt < 2:2014331/100‑1 (MQ=255)
tataTGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTg < 2:3101844/100‑1 (MQ=255)
atatGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGc < 1:2577171/100‑1 (MQ=255)
tatGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCt > 2:4595721/1‑100 (MQ=255)
atGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTa < 1:2515477/100‑1 (MQ=255)
atGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTa > 1:3912267/1‑100 (MQ=255)
ggggAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAAc < 1:126475/100‑1 (MQ=255)
ggAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACtt > 1:5143872/1‑100 (MQ=255)
gAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACttt > 2:2528906/1‑100 (MQ=255)
aaaaCCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTg < 2:2226216/100‑1 (MQ=255)
aaaaCCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTg < 1:815235/100‑1 (MQ=255)
aaCCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGAc < 2:4704878/100‑1 (MQ=255)
aCCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACt < 2:5353386/100‑1 (MQ=255)
aCCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACt < 2:2538794/100‑1 (MQ=255)
aCCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACt > 2:383452/1‑100 (MQ=255)
aCCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATGCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACt < 2:4305994/100‑1 (MQ=255)
aCCCACTAAAAAAAAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACt < 2:669721/100‑1 (MQ=255)
cACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATGCAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACa < 2:3450664/100‑1 (MQ=255)
cACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACa > 2:3055036/1‑100 (MQ=255)
cACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACa < 1:3272012/100‑1 (MQ=255)
aCTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACaa < 1:2007949/100‑1 (MQ=255)
cAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAgg < 1:4169347/100‑1 (MQ=255)
cAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAgg > 1:2901803/1‑100 (MQ=255)
cAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAgg < 2:4834880/100‑1 (MQ=255)
cAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAgg > 1:2421225/1‑100 (MQ=255)
aaGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAggg < 1:1545976/100‑1 (MQ=255)
aGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGa > 1:1622320/1‑100 (MQ=255)
aTAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTc < 2:1602761/100‑1 (MQ=255)
tAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCt < 1:624312/100‑1 (MQ=255)
tAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCt < 1:5422670/100‑1 (MQ=255)
aaaaTGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTgg > 1:2614666/1‑100 (MQ=255)
aaaaTGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTgg > 1:3958123/1‑100 (MQ=255)
aaaTGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGga < 1:488285/100‑1 (MQ=255)
aaTGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGgag < 1:1915712/100‑1 (MQ=255)
aTGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGgaga < 1:1866309/100‑1 (MQ=255)
aTGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGgaga < 1:3869035/100‑1 (MQ=255)
aaaaTGCTAGTTTATCAAGATACCATTTAATTTCGGGCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTCCTAACTTTGACTACTAAGGGATGCTGGAGaaaa < 2:4217404/98‑1 (MQ=255)
tAATGCAAGTGTATCAGGCTACAATTGAAATTCAACCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTGTTTGCTAATTATGACTGCAAAGGGATTCTGAAGaaaaa < 2:543105/100‑1 (MQ=255)
aaTGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGaaaaaa > 1:437029/1‑100 (MQ=255)
tGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATg < 1:408900/100‑1 (MQ=255)
tGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATg > 2:2573595/1‑100 (MQ=255)
cAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGTTATTTTTTACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGaa > 2:1691091/1‑100 (MQ=255)
cAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGaa > 2:4446022/1‑100 (MQ=255)
|
CGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAA > NC_000913/2150995‑2151189
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
