Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I53 R1
|
229 |
158.0 |
8090706 |
91.1% |
7370633 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,151,093 |
T→G |
intergenic (‑108/‑92) |
yegI ← / → yegJ |
protein kinase‑related putative non‑specific DNA‑binding protein/uncharacterized protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,151,093 | 0 | T | G | 98.1%
| 526.5
/ 0.7
| 158 | intergenic (‑108/‑92) | yegI/yegJ | protein kinase‑related putative non‑specific DNA‑binding protein/uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/2); new base G (80/75); total (81/77) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.13e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.95e-01 |
Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
GGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAA > NC_000913/2150997‑2151189
|
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ggTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAgttt > 2:1969903/1‑100 (MQ=255)
aGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATc < 2:2501957/100‑1 (MQ=255)
aGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATc < 1:3336524/100‑1 (MQ=255)
gTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAGTTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCa > 1:83444/1‑100 (MQ=255)
gTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCa > 2:1609613/1‑100 (MQ=255)
gTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCa > 2:960955/1‑100 (MQ=255)
gTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCa < 2:732877/100‑1 (MQ=255)
gTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCa > 2:2415687/1‑100 (MQ=255)
gTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCa > 1:2126155/1‑100 (MQ=255)
gTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGAGAAAACCCACCCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCa > 2:3565152/1‑100 (MQ=255)
tatattatatTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAgg < 2:100251/100‑1 (MQ=255)
tatattatatTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAgg > 2:882359/1‑100 (MQ=255)
atattatattTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGa > 2:1724009/1‑100 (MQ=255)
atattatattTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGa > 2:526788/1‑100 (MQ=255)
attatattTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATa > 2:2048582/1‑100 (MQ=255)
ttatattTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATCGGGAAAACCCACTCCCGAATCAAAATGATAATGCCAGTTTATCAGGATAc > 2:816100/1‑100 (MQ=255)
tattTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATAcaat < 1:298528/100‑1 (MQ=255)
tttCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATAcaattc < 2:3410339/100‑1 (MQ=255)
tttCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATAcaattc < 2:1749726/100‑1 (MQ=255)
tCAATGAATAATAACAACTAACCATGAAAATTCTTTCTTTAGGGGGTACACCCAGTGAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCATGATAtaaataaa > 2:477366/1‑95 (MQ=255)
cAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATAcaattcaat > 1:1434995/1‑100 (MQ=255)
aactGACTAATAAAAACTAACCATTCCAATTAATTATATATGTGGAAAACCCAATAAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATAcaattcaat < 2:3995607/97‑1 (MQ=255)
aaTGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATAcaattcaatt < 2:1681633/100‑1 (MQ=255)
tGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTc < 1:1752594/100‑1 (MQ=255)
ataataatAGCAACTAACCACTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAAACCATTTAAGAATAAAAATCATAGTGCAAGTTTATCAGGATAcaattcaattcc < 2:1799512/98‑3 (MQ=255)
gAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCg < 2:2607870/100‑1 (MQ=255)
aataatAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCgg > 2:3218616/1‑100 (MQ=255)
aataatAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCgg < 1:2587122/100‑1 (MQ=255)
taataaCAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGcc < 1:2959516/100‑1 (MQ=255)
taataaCAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGcc < 1:385425/100‑1 (MQ=255)
taataaCAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGcc < 1:1362852/100‑1 (MQ=255)
taataaCAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGcc < 2:1881638/100‑1 (MQ=255)
ataaCAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTg > 2:2040626/1‑100 (MQ=255)
aacaacTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGAt < 2:2806646/100‑1 (MQ=255)
acaacTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATa > 1:3884885/1‑100 (MQ=255)
caacTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATaa > 1:2226692/1‑100 (MQ=255)
acTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATg > 1:2357279/1‑100 (MQ=255)
cTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGa > 1:2203317/1‑100 (MQ=255)
tAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGAt > 1:1132152/1‑100 (MQ=255)
aCCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACGCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTa < 2:393676/100‑1 (MQ=255)
cATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAAc > 1:4059816/1‑100 (MQ=255)
cATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAAc > 2:3734644/1‑100 (MQ=255)
ctattattTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCca < 2:1319165/98‑1 (MQ=255)
aaaTTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCca < 2:2496381/100‑1 (MQ=255)
aaaTTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCca > 1:3753481/1‑100 (MQ=255)
aaTTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCcac > 2:1214576/1‑100 (MQ=255)
aaTTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCcac > 1:3189425/1‑100 (MQ=255)
aaTTATTCCTATATGGGGAAAACCCACTCCAGAATAAACATGATCATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATAACGGCCTGATAATGATTAACTTAcaa > 2:3858061/1‑99 (MQ=255)
attattTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCcaag > 1:1343432/1‑98 (MQ=255)
ttattTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAg < 2:2948587/100‑1 (MQ=255)
tttCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGtt > 1:3145694/1‑100 (MQ=255)
tCTATATGGGGAAAACCGTCTTAAGAATAAAATTCATAATACATGTTTATCAGGATAAAAAATAATTATGCCTTAGTAATGATTGACTTCCACAGGgttg > 2:3996582/1‑99 (MQ=255)
tCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGtttt > 1:356585/1‑100 (MQ=255)
tCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGtttt < 2:2408155/100‑1 (MQ=255)
tataTGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTg > 1:870016/1‑100 (MQ=255)
atatGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGc < 2:2676591/100‑1 (MQ=255)
atatGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGc < 1:3216079/100‑1 (MQ=255)
atatGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGc < 1:985911/100‑1 (MQ=255)
atatGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGc < 2:1289433/100‑1 (MQ=255)
atatGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGc < 2:1494715/100‑1 (MQ=255)
tatGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCt < 1:111631/100‑1 (MQ=255)
atGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTa > 2:2939745/1‑100 (MQ=255)
ggggAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAAc < 1:2737719/100‑1 (MQ=255)
ggAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACtt > 1:426460/1‑100 (MQ=255)
ggAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACtt > 1:937437/1‑100 (MQ=255)
ggAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACtt > 1:2681827/1‑100 (MQ=255)
gAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACttt < 1:3842955/100‑1 (MQ=255)
aaaaCCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTg < 1:981470/100‑1 (MQ=255)
aaCCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGAc < 2:1609697/100‑1 (MQ=255)
aaCCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGAc < 1:2297518/100‑1 (MQ=255)
aaCCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGAc < 2:82040/100‑1 (MQ=255)
aaCCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGAc < 2:677070/100‑1 (MQ=255)
aaCCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGAc < 2:224984/100‑1 (MQ=255)
aaCCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGAc < 1:3986160/100‑1 (MQ=255)
aaCACACTCAAGAATAACAACGATAATTCAAGTTTATCAGGATACAATTCAAGTTCGGCCTAATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGAc < 2:374746/100‑1 (MQ=255)
aCCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACt < 2:1651329/100‑1 (MQ=255)
cccACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTATCttttccta > 2:283765/1‑95 (MQ=255)
cccACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTa > 2:2200076/1‑100 (MQ=255)
cccACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTa > 2:1099475/1‑100 (MQ=255)
cccACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGCTTATCAGGATACCATTCAATTTCGGCCTGATAATGCTTAACTTCAACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTa > 2:789904/1‑100 (MQ=255)
gaCTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACa < 1:4085302/99‑1 (MQ=255)
cACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACa < 2:851581/100‑1 (MQ=255)
aCTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACaa > 2:1673348/1‑100 (MQ=255)
cTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACaaa > 2:2163612/1‑100 (MQ=255)
cTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTAGGCATGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACaaa > 2:3953093/1‑100 (MQ=255)
tCAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAg < 2:1342148/100‑1 (MQ=255)
caacaaTAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCGGATAATTATTAACTTCCACCGGTTTTTGCTACCTTTGAGTACaaaat > 2:2556917/1‑98 (MQ=255)
cAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAgg < 1:221656/100‑1 (MQ=255)
cAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAgg > 1:3351793/1‑100 (MQ=255)
cAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAgg > 2:134124/1‑100 (MQ=255)
cAAGAATAAAAATGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAgg < 2:1105347/100‑1 (MQ=255)
aaaaaTGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTg < 1:561166/100‑1 (MQ=255)
aaaTGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGga < 1:1772267/100‑1 (MQ=255)
aaTGATAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGgag < 2:3098271/100‑1 (MQ=255)
aTAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGaaaa > 2:1068598/1‑100 (MQ=255)
tAATGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGaaaaa < 2:3642803/100‑1 (MQ=255)
aTGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAAt < 1:1925295/100‑1 (MQ=255)
tGCAAGTTTATCAGGATACATTTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCATAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATg > 2:3253957/1‑100 (MQ=255)
tGCAAGTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATg < 1:3769821/100‑1 (MQ=255)
|
GGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAA > NC_000913/2150997‑2151189
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
