Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F178 I1 R1
|
28 |
89.4 |
2015306 |
95.8% |
1930663 |
139.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
USA300TCH1516_ALE |
76,969 |
G→A |
intergenic (+509/‑107) |
USA300HOU_RS00140 → / → USA300HOU_RS00350 |
hypothetical protein/Monoacylglycerol lipase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | USA300TCH1516_ALE | 76,969 | 0 | G | A | 98.4%
| 176.5
/ NA
| 65 | intergenic (+509/‑107) | USA300HOU_RS00140/USA300HOU_RS00350 | hypothetical protein/Monoacylglycerol lipase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (24/39); total (25/40) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CTTCAGATCTACGGATTTTCGCCATGCCACGAAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAGGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGGTCAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTAAAATGCATTATATAAAATTTATTGAGTCAAA > USA300TCH1516_ALE/76832‑77104
|
ctTCAGATCTACGGATTTTCGCCATGCCACGAAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAagg > 2:494554/1‑140 (MQ=255)
ctTCAGATCTACGGATTTTCGCAATGCTCGGAGAGTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAagg > 1:485562/1‑140 (MQ=14)
ttaagagCTACGGAGTTTCGCCATGCAACGAAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTCGCTATATTTTGTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGt < 1:668114/137‑1 (MQ=14)
ttCAGATCTAGGGAGTTTCGCCATGCCACGAAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTAATTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGt < 2:660864/140‑1 (MQ=255)
ttCAGATCTACGGATTTTCGCCATGCCACGAAATTATCATCATGCTAGCAATTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGt < 1:795555/140‑1 (MQ=255)
gATCTACGGATTTTCGCCATGCCACGAAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAAt < 1:203930/140‑1 (MQ=255)
aCGGATTTTCGCCATGCCACGAAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTTTTTTGTTTTAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTACAAGGTTAATTtata > 2:294905/1‑140 (MQ=17)
ggATTTTCGCCATGCCACGAAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACACGGGCTTAAAAGGTTAATTtatata > 2:784719/1‑140 (MQ=255)
ttttCGCCATGCCACGAAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTa < 2:147242/140‑1 (MQ=255)
gtttCGCTATGCCACGAAACTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTa < 2:351555/139‑1 (MQ=255)
cGCCATGCCACGAAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGGATTAc > 1:506141/1‑140 (MQ=255)
ccATGCCACGAAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTg > 1:657973/1‑140 (MQ=255)
aTGCCACGAAATTTGTGTCATTCTATCAAGTTAAGCGAACGCTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACCTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCa < 1:879820/140‑1 (MQ=21)
cACGAAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACa < 1:53884/140‑1 (MQ=255)
aCGAAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACAt < 1:860377/140‑1 (MQ=255)
cGAAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACAtg > 2:993572/1‑139 (MQ=255)
aGCATCATGCTAGTAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTgg < 2:647293/140‑1 (MQ=255)
aGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTgg < 2:430106/140‑1 (MQ=255)
tcaaGCAAGCAAGTAAAACGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGACTTCGGTCa < 2:762851/140‑1 (MQ=25)
aatGCAAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAATGGTCAGCTGTGATTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGGTCaa < 2:707615/139‑1 (MQ=25)
ggTTAAGGGAACACTGTCATGATAAATTAGTGGTTAGCTAGATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGTCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGGTCTAAAATTAgggg < 2:867780/139‑1 (MQ=37)
aGTTGAGCGAACACTGAAATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTAATTAGCAAAAAAAAATAAAAAAGAGATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTTCTGCAAACATTGATTTGGGTCAAAAATAAgaaa < 2:384364/140‑4 (MQ=21)
aGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGGTCAAAAATTAgggg < 1:354892/140‑1 (MQ=255)
aaGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTAATTTGGGTCAAAAATTAGGGGAAtt > 2:434153/1‑140 (MQ=255)
cGAACAATGACATAATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGGTCAAAAATTAGGGGTATTaaa < 2:915193/140‑1 (MQ=37)
cacTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGGTCAAAAATTAGGGGTATTaaaaaaa > 2:517209/1‑140 (MQ=255)
gACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGGTCAAAAATTAGGGGTATTAAAAAaatgaa > 2:412562/1‑140 (MQ=255)
gACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGGTAAAAAATTAGAGGTATTAAAAAaatgaa > 2:412587/1‑140 (MQ=255)
gACATGATAAATTAGTGGATAGCTATATTTTTTTACTTTGAAACAGAACCTATAAAGAAGAGAGGCCTTAAAGCTTAATTTAAATAGACTTACCGCAATCATTGATTTGGGGCAAATATTAGGGGTATTAAAAAgatgat > 2:256830/1‑139 (MQ=16)
aaTTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGGTCAAAAATTAGGTGTATTAAAAAAATGAATGAATCATa > 1:592222/1‑140 (MQ=255)
aTTAGTGGTTAGCTATATTTTGTTACTCTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTTCAAACATTGATTTGGGTCAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATGAATGAATCATaa < 1:998795/140‑1 (MQ=255)
gTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTTTTACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGTGTCAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATGAATGAATCATAAtttt > 2:114523/1‑140 (MQ=255)
tGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGGTCAAAAATTAGGGGTATTAAAATAATGAATGAATCATAATTTTa < 1:517209/140‑1 (MQ=255)
tGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGGTCAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTa > 1:720426/1‑140 (MQ=255)
ttAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTCTATAGTATTAATGCAAACATTGATTTGAGTCAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTAtaa > 2:129104/1‑138 (MQ=255)
cTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGGTCAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCt > 1:403688/1‑140 (MQ=255)
tatTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGGTCAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGAt < 1:918037/140‑1 (MQ=255)
tatTTTTTTAATTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGGTCAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGAt < 1:208189/140‑1 (MQ=255)
taattttatACTTTACAACAGAACCAATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGGTCAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGAt < 1:778721/137‑1 (MQ=255)
atTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGGTCAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGAtt < 1:877423/140‑1 (MQ=255)
tttttttACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGGTCAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCCAGCTGATTg > 2:312090/1‑140 (MQ=255)
tttACTTTGCAACAGTACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAGGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGGTCAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATGAATGAAACATATTTTTATCAAGCTGATTGgaga < 2:215521/140‑1 (MQ=255)
tACTTTGTAACAGAACCTAGAAAAAACATGGGCTTAAAAGTTTTATTTATATAGTATTACTGCAAACATTAAAAAAGATAAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAgg < 2:14958/140‑1 (MQ=255)
tACGTTGCAAGAGAACCTATCAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGTGTCAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATGAATGATTCATAATTTTATCAAGCTGATTGGACAgg < 2:326927/140‑1 (MQ=255)
ttGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATCTGGGTCAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTaa < 2:504251/140‑1 (MQ=255)
gcaggaGAACCTATAATAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTGCTGCAAACATTAAAAAAAAAAAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTaaaa < 2:430281/135‑1 (MQ=255)
gCAACAGAACCTATAAAAAAAATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGGATTACTGCAACCATTGTTTTGGGTCAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATAAATGAATCATAATTTTATCAACCTGATTGGAGAGGTTacaa > 1:32649/1‑140 (MQ=255)
aaCTGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGGTCAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTAAAATg < 1:51630/140‑1 (MQ=255)
gAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGGTCAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGTGAGGTTAAAATGCAtt > 1:876660/1‑140 (MQ=255)
aaCCTATAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGGTCAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTAAAATGCATta < 1:699141/140‑1 (MQ=255)
aaCCTAGAAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGGTCAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTAAAATGCATta < 1:860320/140‑1 (MQ=255)
tataAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGGTCAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTAAAATGCATtctata > 2:150652/1‑140 (MQ=255)
tataAAAAACATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGGTCAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTAAAATGCATtatata < 2:364656/140‑1 (MQ=255)
aaaaCATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGGTCAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTAAAATGCATTATATAAAAtt > 1:130756/1‑140 (MQ=255)
cATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGGTCAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTAAAATGCATTATATAAAATTTAtt < 2:545016/140‑1 (MQ=255)
cATGGGCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGGTCAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTAAAATGCATTATATAAAATTTAtt < 1:402574/140‑1 (MQ=255)
cATGGGCTTAAAAGGTTAAATTATATAGGATTACTTGGAACATTGATTTGGGTCAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTAAAATGCATTATATAAAATTTAtt < 1:402390/140‑1 (MQ=255)
aTGGGTTTAAAAGTTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGGTCAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTAAAATGCATTATATAAAATTTATTg < 2:243248/140‑1 (MQ=255)
tGGGCTTAAAATGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGGTCAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTAAAATGAATTATATAAAATTTATTGa < 1:553059/140‑1 (MQ=255)
tGGGCTAAAAATGTTAATTTATATAGCATTACTGCGTATAGTGATCTGTGTAAAAAATTAAAAAAAAAAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTAAAATGCATTATATAAAATTTATTGa < 2:42102/140‑1 (MQ=255)
gggCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGGTCAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGGTAAAATGCATTATATAATATTTATTGAg > 1:950838/1‑140 (MQ=255)
gCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGGTCAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGGGAGGTTAAAATGCATTATATAAAATTTATTGAGTc > 1:314011/1‑140 (MQ=255)
gCTTAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGGTCAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTAAAATGCATTATATAAAATTTATTAAGTc > 1:929043/1‑140 (MQ=255)
tAAATGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGGTCAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTAAAATGCATTATATAAAATTTATTGAGTCaaa > 2:608947/1‑140 (MQ=255)
tAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTTCAAACATTGATTTCGTACAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGTTGATTGGAGAGGTTAAAATGCATTATATAAAATTTATTGAGTCaaa < 2:105092/140‑1 (MQ=255)
tAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGGTCAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTAAAATGCATTATATAAAATTTATTGAGTCaaa > 2:326991/1‑140 (MQ=255)
tAAAAGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGGTCAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTAAAATGCATTATATAAAATTTATTGAGTCaaa < 2:639468/140‑1 (MQ=255)
|
CTTCAGATCTACGGATTTTCGCCATGCCACGAAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCTATAAAAAACATGGGCTTAAAGGGTTAATTTATATAGTATTACTGCAAACATTGATTTGGGTCAAAAATTAGGGGTATTAAAAAAATGAATGAATCATAATTTTATCAAGCTGATTGGAGAGGTTAAAATGCATTATATAAAATTTATTGAGTCAAA > USA300TCH1516_ALE/76832‑77104
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
