Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F36 I1 R1
|
10 |
110.6 |
3657964 |
98.0% |
3584804 |
143.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
756,633 |
C→A |
P243T (CCG→ACG) |
sdhA → |
succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 756,633 | 0 | C | A | 100.0%
| 339.7
/ NA
| 96 | P243T (CCG→ACG) | sdhA | succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (50/46); total (50/46) |
CCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATGGCGAACGTTTTATGGAGCGTTATGCGCCGAACGCCAAAGACCTGGCGGGCCGTGACGTGGTTGCGCG > NC_000913/756491‑756778
|
ccGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCGACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCg > 6:408725/1‑149 (MQ=255)
ccGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCg > 5:453366/1‑149 (MQ=255)
cgcgCTACCGTGATGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGCCTATCCGTGCCGGCGTACCGCTGAAGGATATGGAAATCTGGCATTACCACACGACCgg > 4:312699/1‑149 (MQ=255)
tACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTg > 8:384051/1‑149 (MQ=255)
tGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGt > 5:82562/1‑149 (MQ=255)
gCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCgg < 6:82562/148‑1 (MQ=255)
aCTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAAGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCg > 6:228999/1‑148 (MQ=255)
tGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTAc > 1:242128/1‑149 (MQ=255)
gCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTg < 8:466079/149‑1 (MQ=255)
gCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTg > 4:204238/1‑149 (MQ=255)
gCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTg > 5:301889/1‑149 (MQ=255)
gCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTg < 6:335013/149‑1 (MQ=255)
cGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCCACGCCCACATTAAGACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGGGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTgg < 3:312699/149‑1 (MQ=255)
cGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTgg < 6:453366/149‑1 (MQ=255)
ggAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGt > 4:352457/1‑149 (MQ=255)
gAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGt > 8:376897/1‑148 (MQ=255)
ggCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACACTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCg > 6:390737/1‑147 (MQ=255)
gCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTg > 7:444037/1‑128 (MQ=255)
gCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTg < 8:444037/128‑1 (MQ=255)
gCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAg < 1:13726/149‑1 (MQ=255)
gCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAg < 1:188419/149‑1 (MQ=255)
gTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGt < 7:197603/149‑1 (MQ=255)
tATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGtt > 1:292349/1‑149 (MQ=255)
tATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGtt < 2:60424/149‑1 (MQ=255)
aTTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTg > 4:355306/1‑149 (MQ=255)
tttCTCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGAATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGCCAGTTCCACACGACCTGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGc < 3:18481/149‑1 (MQ=255)
ttATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGcc > 5:282574/1‑149 (MQ=255)
tATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGATGGTTGcc < 8:221154/148‑1 (MQ=255)
tATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGcc < 1:251066/148‑1 (MQ=255)
aTCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTgg < 8:253028/132‑1 (MQ=255)
aTCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTgg > 7:253028/1‑132 (MQ=255)
aTCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCgt > 2:121455/1‑149 (MQ=255)
aTCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCgt > 8:461379/1‑149 (MQ=255)
cAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCgtgg > 5:376255/1‑149 (MQ=255)
aGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCgtggt < 7:78397/149‑1 (MQ=255)
gTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCgtggt > 7:373110/1‑148 (MQ=255)
tCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGa < 5:259186/149‑1 (MQ=255)
tCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGa < 6:282574/149‑1 (MQ=255)
caccaccaACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAg > 3:148562/1‑149 (MQ=255)
accaccaACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAgg < 3:204238/149‑1 (MQ=255)
accaccaACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAgg < 2:361207/149‑1 (MQ=255)
caACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGt > 4:425393/1‑148 (MQ=255)
aCGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTAt > 5:406824/1‑149 (MQ=255)
aCGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTAt > 2:102845/1‑149 (MQ=255)
gCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCgtggt < 8:154308/135‑1 (MQ=255)
gCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCgtggt > 7:154308/1‑135 (MQ=255)
ccACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATctgc < 7:65294/149‑1 (MQ=255)
ccACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATctgc > 7:443230/1‑149 (MQ=255)
cacaTTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCCGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATctgct < 4:341747/149‑1 (MQ=255)
acaTTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATctgct > 2:380416/1‑148 (MQ=255)
aTTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGaa < 7:461379/149‑1 (MQ=255)
aTTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGaa > 4:157428/1‑149 (MQ=255)
ttAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGaac < 1:380416/149‑1 (MQ=255)
ttAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGaac < 6:301889/149‑1 (MQ=255)
tAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGaac > 1:319205/1‑148 (MQ=255)
cacCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCgg > 4:6022/1‑132 (MQ=255)
cacCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCgg < 3:6022/132‑1 (MQ=255)
cacCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGaacaaa > 2:6950/1‑148 (MQ=255)
cGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATg < 3:352457/149‑1 (MQ=255)
gACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATGGCg > 4:333498/1‑148 (MQ=255)
cGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATGGCGAAc < 6:120602/149‑1 (MQ=255)
tgtCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATGGCGAACGtt < 3:355306/149‑1 (MQ=255)
ggCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATGGCGAACGTTTTa < 3:428718/148‑1 (MQ=255)
ggCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATGGCGAACGTTTTAt < 7:465676/149‑1 (MQ=255)
gCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATGGCGAACGTTTTATg < 3:157428/149‑1 (MQ=255)
aTGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATGGCGAACGTTTTATGGa < 1:121455/149‑1 (MQ=255)
aTGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCCGCTGCACAAACATGGCGAACGTTTTATg > 1:185159/1‑147 (MQ=255)
tGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATGGCGAACGTTTTATGGAg < 7:376897/149‑1 (MQ=255)
gCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATGGCGAAc < 4:23149/136‑1 (MQ=255)
gCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATGGCGAAc > 3:23149/1‑136 (MQ=255)
cTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGAGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATGGCGAACGTTTTATGGAGCGt > 7:364858/1‑149 (MQ=255)
tCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATGGCGCACGTTTTATGGAGCGTTAt > 8:214588/1‑149 (MQ=255)
cGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATGGCGAACGTTTTATGGAGCGTTATgc > 1:428611/1‑149 (MQ=255)
cGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATGGCGAACGTTTTATGGAGCGTTATGCGCCGAACg < 7:95998/149‑1 (MQ=255)
tACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATGGCGAACGTTTTATGGAGCGTTATGCGCCGAACGcc < 5:390737/149‑1 (MQ=255)
cGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTTGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATGGCGAACGTTTTATGGAGCGTTATGCGCCGAACGCCaaa < 7:384051/149‑1 (MQ=255)
cGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATGGCGAACGTTTTATGGAGCGTTATGCGCCGAACGCCaaa < 1:6950/149‑1 (MQ=255)
gATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATGGCGAACGTTTTATGGAGCGTTATGCGCCGAACGCCAAAGACCTGGc > 4:208479/1‑149 (MQ=255)
gATATGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATGGCGAACGTTTTATGGAGCGTTATGCGCCGAACGCCAAAGACCTGGc < 6:406824/149‑1 (MQ=255)
atGGAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATGGCGAACGTTTTATGGAGCGTTATGCGCCGAACGCCAAAGACCTGGCggg > 4:62043/1‑149 (MQ=255)
ggAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATGGCGAACGTTTTATGGAGCGTTATGCGCCg < 8:220019/127‑1 (MQ=255)
ggAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATGGCGAACGTTTTATGGAGCGTTATGCGCCg > 7:220019/1‑127 (MQ=255)
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ggAAATGTGGCAGTTCCACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATGGCGAACGTTTTATGGAGCGTTATGCGCCGAACGCCAAAGACCTGGCgg < 6:439552/146‑1 (MQ=255)
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CACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATGGCGAACGTTTTATGGAGCGTTATGCGCCGAACGCCAAAGACCTGGCGGG > NB501016:230:HFVJLAFXY:3:11606:24575:2435/1‑131 (MQ=60)
ACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATGGCGAACGTTTTATGGAGCGTTATGCGCCGAACGCCAAAGACCTGGCGGGCCGTGACGTGGTTGCGCGTTC < NB501016:230:HFVJLAFXY:2:11311:15340:4842/151‑1 (MQ=60)
ACACGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATGGCGAACGTTTTATGGAGCGTTATGCGCCGAACGCCAAAGACCTGGCGGGCCGTGACGTGGTTGCGCGTTC > NB501016:230:HFVJLAFXY:3:21404:6426:19805/1‑151 (MQ=60)
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CCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATGGCGAACGTTTTATGGAGCGTTATGCGCCGAACGCCAAAGACCTGGCGGGCCGTGACGTGGTTGCGCGTTC > NC_000913/756490‑756781
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
