Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1696 |
279.3 |
15874187 |
97.8% |
15524954 |
93.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 260 total aligned reads displayed.
CGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAACCCGAGGTTGTCCTGCGC > NC_000913/1949380‑1949565
|
CGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑A > SRR4302543.5195072/1‑94 (MQ=60)
CGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑A > SRR4302543.894671/1‑94 (MQ=60)
GCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑AT > SRR4302543.540111/1‑94 (MQ=60)
GCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑AT > SRR4302543.7040487/1‑94 (MQ=60)
CCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑AT < SRR4302543.1540948/94‑1 (MQ=60)
ccttgtccgtaccgcGGAAGAGATCCTTCACGCGTCATGATTTACATCGGTCGGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCA < SRR4302543.1089438/79‑1 (MQ=60)
CCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCA < SRR4302543.1089439/94‑1 (MQ=60)
CCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCA < SRR4302543.2987169/94‑1 (MQ=60)
CCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCA > SRR4302543.4030596/1‑94 (MQ=60)
CGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCAC > SRR4302543.1954215/1‑94 (MQ=60)
CGTGTGCGTAGCGGGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGATGGGG‑ATCAC > SRR4302543.277172/1‑94 (MQ=60)
GTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACC > SRR4302543.5755741/1‑94 (MQ=60)
GTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACC > SRR4302543.1064188/1‑94 (MQ=60)
GTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACC > SRR4302543.3870637/1‑94 (MQ=60)
GTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACC < SRR4302543.3169182/94‑1 (MQ=60)
GTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACC > SRR4302543.2485059/1‑94 (MQ=60)
TGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCA < SRR4302543.5541726/94‑1 (MQ=60)
TGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCA > SRR4302543.7883410/1‑94 (MQ=60)
GTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAG < SRR4302543.6778016/94‑1 (MQ=60)
GTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAG > SRR4302543.7972231/1‑94 (MQ=60)
GTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAG < SRR4302543.2848022/94‑1 (MQ=60)
GTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAG < SRR4302543.2848021/94‑1 (MQ=60)
GTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAG < SRR4302543.924953/94‑1 (MQ=60)
GTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAG > SRR4302543.7157986/1‑94 (MQ=60)
GTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAC > SRR4302543.1347278/1‑94 (MQ=60)
CGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTACGGTTGGGT‑ATCACCAGCCT < SRR4302543.2561089/94‑1 (MQ=60)
CGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCT < SRR4302543.1926128/94‑1 (MQ=60)
GTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTT > SRR4302543.4429086/1‑94 (MQ=60)
GTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTT > SRR4302543.132355/1‑94 (MQ=60)
GAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTG < SRR4302543.3726058/94‑1 (MQ=60)
AGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGA < SRR4302543.6761128/94‑1 (MQ=60)
GCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAA < SRR4302543.4018240/94‑1 (MQ=60)
CGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAG < SRR4302543.4474144/94‑1 (MQ=60)
CGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAG < SRR4302543.5507990/94‑1 (MQ=60)
CGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAG < SRR4302543.1854976/94‑1 (MQ=60)
CGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAG > SRR4302543.1522518/1‑94 (MQ=60)
GTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGA > SRR4302543.1766570/1‑94 (MQ=60)
GTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGA < SRR4302543.3168886/94‑1 (MQ=60)
GTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGA < SRR4302543.2686975/94‑1 (MQ=60)
GTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGA > SRR4302543.882586/1‑94 (MQ=60)
GTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGA < SRR4302543.6145228/94‑1 (MQ=60)
TGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAG < SRR4302543.4640918/94‑1 (MQ=60)
TGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAG > SRR4302543.33901/1‑94 (MQ=60)
TGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCACAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAG < SRR4302543.7094137/94‑1 (MQ=60)
TGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAG > SRR4302543.2107417/1‑94 (MQ=60)
GAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTA > SRR4302543.5137911/1‑94 (MQ=60)
GAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTA < SRR4302543.4935837/94‑1 (MQ=60)
GAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTA > SRR4302543.2645910/1‑94 (MQ=60)
AAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTAT < SRR4302543.3432050/94‑1 (MQ=60)
AAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTAT > SRR4302543.6739258/1‑94 (MQ=60)
AAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTAT > SRR4302543.2203556/1‑94 (MQ=60)
AAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTAT < SRR4302543.7717598/94‑1 (MQ=60)
AAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTAT > SRR4302543.7527634/1‑94 (MQ=60)
AAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTAT < SRR4302543.5658425/94‑1 (MQ=60)
AAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTAT < SRR4302543.4459334/94‑1 (MQ=60)
AGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATG < SRR4302543.4158350/94‑1 (MQ=60)
AGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATG > SRR4302543.2281076/1‑94 (MQ=60)
AGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCC < SRR4302543.1561703/94‑1 (MQ=60)
AGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCC > SRR4302543.3128958/1‑94 (MQ=60)
AGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCC < SRR4302543.1482009/94‑1 (MQ=60)
GATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCC < SRR4302543.6766253/94‑1 (MQ=60)
GATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCC < SRR4302543.4617113/94‑1 (MQ=60)
GATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCC < SRR4302543.5280805/94‑1 (MQ=60)
GATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCC < SRR4302543.6946653/94‑1 (MQ=60)
GATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCC < SRR4302543.3740825/94‑1 (MQ=60)
GATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATCGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCC < SRR4302543.3740824/94‑1 (MQ=60)
ATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCG > SRR4302543.640876/1‑94 (MQ=60)
ATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCG > SRR4302543.5315723/1‑94 (MQ=60)
ATCCTCAAAGCGTTATGATTTACATCGGGCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCG < SRR4302543.603204/94‑1 (MQ=60)
CCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCC > SRR4302543.5958150/1‑94 (MQ=60)
cttcACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCA > SRR4302543.1614130/5‑94 (MQ=60)
ttcACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCAC > SRR4302543.4490260/4‑94 (MQ=60)
CACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTT > SRR4302543.4555680/1‑94 (MQ=60)
CCGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTT < SRR4302543.3288067/94‑1 (MQ=60)
CCGCGTTAGGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCCCCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTT < SRR4302543.4034711/94‑1 (MQ=60)
CGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTA > SRR4302543.633717/1‑94 (MQ=60)
CGCGTTATAATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTA < SRR4302543.3764836/94‑1 (MQ=60)
CGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAAC > SRR4302543.2047649/1‑94 (MQ=60)
CGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAAC < SRR4302543.910112/94‑1 (MQ=60)
CGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAAC > SRR4302543.1691934/1‑94 (MQ=60)
GTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACT > SRR4302543.3919356/1‑94 (MQ=60)
GTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACT > SRR4302543.1930019/1‑94 (MQ=60)
GTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACT > SRR4302543.2747166/1‑94 (MQ=60)
GTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACT > SRR4302543.5012392/1‑94 (MQ=60)
GTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACT > SRR4302543.7787413/1‑94 (MQ=60)
GTTATGATTTACATCGGTCTCCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACT < SRR4302543.6412006/94‑1 (MQ=60)
TTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTG < SRR4302543.2116638/94‑1 (MQ=60)
TATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGC > SRR4302543.43605/1‑94 (MQ=60)
tttatttacaccggcctgCCGCAATGGTCGCCTCCTAAAGGGGTGCGGTTGGGT‑ACCCCCACCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCG < SRR4302543.2580473/76‑1 (MQ=56)
atagtttacaggggtcgtccagAATGGTCGCATGCTAAATGGGTGGGGTTGGTT‑ATCCCCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCG < SRR4302543.4928512/72‑1 (MQ=60)
TTGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCG < SRR4302543.6704164/94‑1 (MQ=60)
ATGTTTTACATCAGGCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAGTGGGTGGGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCG < SRR4302543.7949822/94‑1 (MQ=60)
ATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCCCCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCG < SRR4302543.3632118/94‑1 (MQ=60)
TGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGT > SRR4302543.3824658/1‑94 (MQ=60)
TGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGT < SRR4302543.689494/94‑1 (MQ=60)
gttttccagCGGTCTCCCGCAATGGTCCCATCCAAAATGGGTGCGGTTGGTT‑CTCCCCACCCTTGAATATTATCCCCGCCACTTTAACTGCGTG < SRR4302543.1553381/85‑1 (MQ=17)
TATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAAGGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTG < SRR4302543.3975619/94‑1 (MQ=60)
GATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTG > SRR4302543.5096197/1‑94 (MQ=60)
GATTTACAGCGGTCTACCGCAATGTTCGCATCCTAAGTGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCACCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTG < SRR4302543.2607144/94‑1 (MQ=60)
ATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGA > SRR4302543.6525324/1‑94 (MQ=60)
ATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGA > SRR4302543.4392623/1‑94 (MQ=60)
TTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCTTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGac < SRR4302543.486377/94‑3 (MQ=60)
TTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTcggtgac > SRR4302543.1666750/1‑87 (MQ=60)
TTACATCGTTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAAGGGGGGCGTTGGGGT‑ATCCCCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacg < SRR4302543.265484/94‑4 (MQ=59)
TACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGG > SRR4302543.1110339/1‑94 (MQ=60)
ACATCGGTCTCCCGCAATGGCCGCATCCTAAATGGGTGCGGTGGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcg < SRR4302543.5139341/94‑6 (MQ=60)
ATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCA > SRR4302543.364594/1‑94 (MQ=60)
TCGGTCGGCCGCAAGGGTCGCATCCTAAGTGGGTGCGGTGGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggc < SRR4302543.2162021/94‑9 (MQ=60)
CGGTCGGCCGCAATGGTCGCATCCTAAAGGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggca < SRR4302543.627697/94‑10 (MQ=60)
GGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAGTGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcat < SRR4302543.7519012/94‑11 (MQ=60)
GGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcat > SRR4302543.1387108/1‑84 (MQ=60)
GGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcat > SRR4302543.6497208/1‑84 (MQ=60)
GGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcat > SRR4302543.2759680/1‑84 (MQ=60)
GGTCGGCCGCAATGGTCGCACCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCCCCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcat < SRR4302543.6220077/94‑11 (MQ=60)
GTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACAC > SRR4302543.5646922/1‑94 (MQ=60)
GTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACAC > SRR4302543.4852545/1‑94 (MQ=60)
GTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACAC > SRR4302543.3937276/1‑94 (MQ=60)
TCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattt < SRR4302543.6373220/94‑13 (MQ=60)
TCTCCCGCAATGGTCGCTCCCTAAATGGGTGCGTTGGGGG‑ATCACCAGCCTGGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACC < SRR4302543.3976347/94‑1 (MQ=60)
TCTCCCGAAAGGGTCGCATCCAAAGTGGGTGCGGTGGGTT‑ATCCCCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattt < SRR4302543.1812544/94‑13 (MQ=40)
TCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACC > SRR4302543.1920151/1‑94 (MQ=60)
CTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcatttt > SRR4302543.5675904/1‑81 (MQ=60)
CTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCA > SRR4302543.6699012/1‑94 (MQ=60)
TGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcatttta > SRR4302543.7207160/1‑80 (MQ=60)
TACCGCAATGGTCGCACCCAAAATGGGTGGGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCAC < SRR4302543.6864070/94‑1 (MQ=60)
GCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaa > SRR4302543.3837291/1‑79 (MQ=60)
GCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaa > SRR4302543.4693213/1‑79 (MQ=60)
GCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaa > SRR4302543.4693214/1‑79 (MQ=60)
CCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaa > SRR4302543.254712/1‑78 (MQ=60)
CGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaa > SRR4302543.6579577/1‑77 (MQ=60)
CGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCT > SRR4302543.2251482/1‑94 (MQ=60)
CGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCT > SRR4302543.6016470/1‑94 (MQ=60)
CGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCT > SRR4302543.4211697/1‑94 (MQ=60)
GCAATGGTAGCATCCTAAATGGGGGCGGATGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGACAGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTT > SRR4302543.2272723/1‑94 (MQ=60)
CACTGCTCGCATCATAAGTGGGTGCGGTGGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaat < SRR4302543.3260933/94‑20 (MQ=60)
CAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGTT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaat < SRR4302543.320302/94‑20 (MQ=60)
AAATGGTCGCATCCTAAAGGGGTGGGTTTGGGT‑ACCCCCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaat < SRR4302543.856500/94‑20 (MQ=51)
AATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCCCCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatc < SRR4302543.7437073/94‑21 (MQ=60)
ATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatca > SRR4302543.672695/1‑73 (MQ=60)
ATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatca > SRR4302543.8002500/1‑73 (MQ=60)
ATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTAC > SRR4302543.5761474/1‑94 (MQ=60)
ATGGTCGCATCCAAAAGGGGTGCGGTGGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatca < SRR4302543.1326837/94‑22 (MQ=60)
ATGGTCGCATCATAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatca < SRR4302543.3925322/94‑22 (MQ=60)
TGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcac > SRR4302543.2080375/1‑72 (MQ=60)
GTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcacta > SRR4302543.3214350/1‑70 (MQ=60)
GTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcacta > SRR4302543.3214141/1‑70 (MQ=60)
GCGCATCCTAAATGGGTGCGTTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaa < SRR4302543.6274618/94‑26 (MQ=60)
CGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCCCCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaa < SRR4302543.4514672/94‑27 (MQ=60)
GCATCCTAAGTGGGGGCGGTGGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTG < SRR4302543.7037543/94‑1 (MQ=60)
GCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGTT‑ATCCCCAGCCTGGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaag < SRR4302543.2405318/94‑28 (MQ=60)
CATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaaga > SRR4302543.339087/1‑66 (MQ=60)
CATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaaga > SRR4302543.3679960/1‑66 (MQ=60)
CATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaaga < SRR4302543.1376492/94‑29 (MQ=60)
CATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGC > SRR4302543.7428221/1‑94 (MQ=60)
ATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaa > SRR4302543.7059360/1‑65 (MQ=60)
ATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaa > SRR4302543.6141712/1‑65 (MQ=60)
ATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaa > SRR4302543.2790030/1‑65 (MQ=60)
ATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaa > SRR4302543.3341767/1‑65 (MQ=60)
ATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCC > SRR4302543.7278130/1‑94 (MQ=60)
ATCCTAAAGGGGTGCGTTTGGGT‑ACCACCAGCCTAGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaa < SRR4302543.5635204/94‑30 (MQ=47)
tcaaaaagGGGTGCGGTTGGTT‑ATCACCAGCTTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaac < SRR4302543.6258958/86‑31 (MQ=59)
TCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCCCCAGCTTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaac < SRR4302543.2266919/94‑31 (MQ=60)
TCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCCCCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaac < SRR4302543.7367289/94‑31 (MQ=60)
TCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCTTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaac < SRR4302543.496084/94‑31 (MQ=60)
CCTAAATGGGTGGGGTTGGGT‑ACCACCACCCTTAAAAAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaacg < SRR4302543.3540055/94‑32 (MQ=30)
CTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaacgc > SRR4302543.5615563/1‑62 (MQ=60)
TAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAC > SRR4302543.2457481/1‑94 (MQ=60)
AAATGGGTGCGTTGGGTT‑ATCACCAGCCTGGAAGAGTAGGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaacgccc < SRR4302543.3516787/94‑35 (MQ=28)
AAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAAC > SRR4302543.1418649/1‑94 (MQ=60)
AAAGGGGTGCGGTGGGGG‑ACCCCCACCCTTAAAGAGTACCCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAAC < SRR4302543.1755107/94‑1 (MQ=60)
AAAGGGGGGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGATTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAAC < SRR4302543.690825/94‑1 (MQ=60)
ATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaacgcccaa > SRR4302543.3691138/1‑58 (MQ=60)
ATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAACCC > SRR4302543.7149959/1‑94 (MQ=60)
ATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAACCC > SRR4302543.3968740/1‑94 (MQ=60)
AGGGGTGCGGTGGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGATTATCCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAACCC < SRR4302543.4477531/94‑1 (MQ=60)
TGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCTTGGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaacgcccaag < SRR4302543.5509278/94‑38 (MQ=60)
GGGTGCGGTTGGGA‑ATCACCAGCCTGGAAGATTATCCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAACCCGA < SRR4302543.3854483/94‑1 (MQ=60)
gggggGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTAAAATTTAGGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAACCCGAG < SRR4302543.4696153/89‑1 (MQ=60)
GTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAACCCGAGG > SRR4302543.7401559/1‑94 (MQ=60)
GTGCGGTTGGGA‑ACCACCAGCGTTGAAGAGTATCCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAACCCGAGG < SRR4302543.4798765/94‑1 (MQ=60)
TGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaacgcccaagagca > SRR4302543.2222296/1‑53 (MQ=60)
GCGGTTGGTT‑ATCACCAGCCTAGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaacgcccaagagcat < SRR4302543.1351700/94‑43 (MQ=49)
GCGGTGGGGT‑ATCCCCAGCCTGGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaacgcccaagagcat < SRR4302543.3088675/94‑43 (MQ=36)
gggtgGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAACCCGAGGTTG < SRR4302543.3130131/89‑1 (MQ=60)
GGGTTGGGG‑ATCACCACCCTTAAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAACCCGAGGTTG < SRR4302543.2424780/94‑1 (MQ=60)
GGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaacgcccaagagcatgt > SRR4302543.7004299/1‑50 (MQ=60)
GGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaacgcccaagagcatgt > SRR4302543.3589115/1‑50 (MQ=60)
GGTTGGGT‑ACCCCCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaacgcccaagagcatgt < SRR4302543.1999399/94‑45 (MQ=55)
GGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAACCCGAGGTTGT > SRR4302543.2924736/1‑94 (MQ=60)
GGTGGGGT‑ATCACCAGCTTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaacgcccaagagcatgt < SRR4302543.7021977/94‑45 (MQ=51)
GTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAACCCGAGGTTGTC > SRR4302543.4692550/1‑94 (MQ=60)
TGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaacgcccaagagcatgtgtt > SRR4302543.4235667/1‑47 (MQ=60)
TGGGGTATCACCAGCTTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaacgcccaagagcatgtgt < SRR4302543.4785666/94‑47 (MQ=60)
GGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaacgcccaagagcatgtgttt > SRR4302543.1216796/1‑46 (MQ=60)
GGGG‑ATCACCAGCCTGGAAGAGTATCCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAACCCGAGGTTGTCCTG < SRR4302543.7006607/94‑1 (MQ=60)
GGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaacgcccaagagcatgtgtttt > SRR4302543.595181/1‑45 (MQ=60)
GT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaacatcactaaagaacgcccaagagcatgtgttttc > SRR4302543.7709642/1‑44 (MQ=60)
GT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaacgcccaagagcatgtgttttc > SRR4302543.7583856/1‑44 (MQ=60)
G‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAACCCGAGGTTGTCCTGCGC < SRR4302543.7235077/94‑1 (MQ=60)
G‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAACCCGAGGTTGTCCTGCGC > SRR4302543.7917504/1‑94 (MQ=60)
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CGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAACCCGAGGTTGTCCTGCGC > NC_000913/1949380‑1949565
|
| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |