Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,143,530 |
T→C |
L748P (CTG→CCG) |
yegE → |
putative sensor‑type protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,143,530 | 0 | T | C | 100.0%
| 385.1
/ NA
| 122 | L748P (CTG→CCG) | yegE | putative sensor‑type protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (50/72); total (50/72) |
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
TTATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCTGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGC > NC_000913/2143440‑2143617
|
tATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAg > 1:3264904/1‑93 (MQ=255)
aTCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGt > 2:2029709/1‑93 (MQ=255)
cGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTAt < 1:3015233/93‑1 (MQ=255)
cGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTAt < 1:682574/93‑1 (MQ=255)
gATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGGGTCGTTAATGGCGAGTAtg > 1:196349/1‑93 (MQ=255)
gATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTAtg > 1:31035/1‑93 (MQ=255)
aTCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTAtgc > 2:649833/1‑93 (MQ=255)
aTCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTAtgc < 1:2494298/93‑1 (MQ=255)
tCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTAtgct > 2:3360950/1‑93 (MQ=255)
ttGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGTACTGGCGTCGTTAATGACGAGTAtgctgc > 1:3718118/1‑93 (MQ=255)
ttGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTAtgctgc < 1:221138/93‑1 (MQ=255)
ttGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTAtgctgc < 1:3665916/93‑1 (MQ=255)
ttGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTAtgctgc > 1:742220/1‑93 (MQ=255)
ttGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTAtgctgc < 2:4298045/93‑1 (MQ=255)
ttGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGAGACGCTTTGCTGCGCCGACTGGCGTCGTTAATGCCGAGGAtgctgc > 2:718671/1‑93 (MQ=255)
tGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCg > 2:777522/1‑93 (MQ=255)
aTCGCTTTAACGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGTGTATGCTGCGtt > 2:575518/1‑93 (MQ=255)
aTCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGtt > 2:2987986/1‑93 (MQ=255)
tCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTc < 2:2803742/93‑1 (MQ=255)
gCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCa > 2:3727818/1‑93 (MQ=255)
gCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCa < 2:3873074/93‑1 (MQ=255)
cTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAg < 1:2463742/93‑1 (MQ=255)
tttAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGc < 2:358297/93‑1 (MQ=255)
tttAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGc > 1:114471/1‑93 (MQ=255)
tttAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGc < 2:601229/93‑1 (MQ=255)
tAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGa > 2:3233934/1‑93 (MQ=255)
aaGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACg < 1:367318/93‑1 (MQ=255)
aaGCGGTGAATGACAGCGCCGAGCATGCGGCGGGCGACGCCTTGCTGAGCGAACTGGCGTCGTTGATGCCGAGTATGCTGAGCTCCAGCGACg > 2:2329077/1‑93 (MQ=255)
cGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGc < 2:3809928/93‑1 (MQ=255)
cGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGc < 1:1074327/93‑1 (MQ=255)
cGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGc < 2:3457112/93‑1 (MQ=255)
cGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGc < 1:2860069/93‑1 (MQ=255)
tGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTgg > 2:2554233/1‑93 (MQ=255)
gAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGGTTTGCTGCGCGGACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGGTCCAGCGACGTGCTggg > 1:3995915/1‑92 (MQ=255)
aaTGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGgcg > 2:1253777/1‑93 (MQ=255)
gACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGa > 2:3870622/1‑93 (MQ=255)
aCAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCCGCGACGTGCTGGCACGAc > 1:2736740/1‑93 (MQ=255)
gcgcCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGGATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCg > 1:2496277/1‑93 (MQ=255)
ctccGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACTTGCTGGCGCGACTCgg < 2:1048563/91‑1 (MQ=255)
cgcCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCgg < 1:3365113/93‑1 (MQ=255)
gcCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCggg > 2:1060426/1‑92 (MQ=255)
gcCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGt > 1:1375935/1‑93 (MQ=255)
ccGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTg < 1:201651/93‑1 (MQ=255)
cGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTgg < 2:1513508/93‑1 (MQ=255)
cGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTgg < 1:1058247/93‑1 (MQ=255)
cGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTgg < 1:1478543/93‑1 (MQ=255)
gggCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTggg < 1:3580799/93‑1 (MQ=255)
gggCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTggg < 1:2361443/93‑1 (MQ=255)
gggCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTggg > 2:2225246/1‑93 (MQ=255)
ggCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTgggg > 2:4215335/1‑93 (MQ=255)
gCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGa < 2:3550371/93‑1 (MQ=255)
aTGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATg > 2:2232560/1‑93 (MQ=255)
gcggcgGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGCCGCGACTCGGTGGGGATGaa < 2:21433/93‑1 (MQ=255)
cggcggGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAAt < 1:337233/93‑1 (MQ=255)
gcggGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAAttt > 1:2571422/1‑93 (MQ=255)
ggggTCACGCTTGTCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGGCGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTg < 1:473070/92‑1 (MQ=255)
cggGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTg < 1:473072/93‑1 (MQ=255)
ggTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGt < 2:4322413/93‑1 (MQ=255)
ggTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGt < 1:2280437/93‑1 (MQ=255)
gTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTc < 1:3229128/93‑1 (MQ=255)
gTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTc < 1:1756167/93‑1 (MQ=255)
gTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTc < 1:1843376/93‑1 (MQ=255)
aCGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTctgc < 1:4363701/93‑1 (MQ=255)
aCGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTctgc < 2:2477217/93‑1 (MQ=255)
aCGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTctgc > 2:3054945/1‑93 (MQ=255)
cGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTctgct < 1:438007/93‑1 (MQ=255)
tttGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGGATCGGTGGGGATGAATTTGGTCTgctgct > 2:1232538/1‑93 (MQ=255)
ctgcGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCa < 1:3905174/93‑1 (MQ=255)
ctgcGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCa < 1:3333905/93‑1 (MQ=255)
cgcgAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGAc < 2:2031040/93‑1 (MQ=255)
cgAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTg < 1:22370/93‑1 (MQ=255)
gAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGt < 1:2132599/93‑1 (MQ=255)
aaCTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTa > 1:653400/1‑93 (MQ=255)
aCTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAGTTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTaa < 2:4398731/93‑1 (MQ=255)
aCTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTaa < 1:3162600/93‑1 (MQ=255)
aCTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTaa < 1:2126782/93‑1 (MQ=255)
aCTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTaa < 2:2507791/93‑1 (MQ=255)
cTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAAt > 2:512391/1‑93 (MQ=255)
cTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAAt < 2:1275330/93‑1 (MQ=255)
cTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAAt < 1:2764945/93‑1 (MQ=255)
cTGGCGTCGTTAATGCCGAGCATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGGTGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAAt > 1:4409741/1‑93 (MQ=255)
ggCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGt < 1:223149/93‑1 (MQ=255)
gCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGtt > 1:98693/1‑93 (MQ=255)
gCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGtt < 2:503186/93‑1 (MQ=255)
cgtcgtTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTg < 1:1665342/93‑1 (MQ=255)
gtcgtTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGa < 2:3678077/93‑1 (MQ=255)
gtcgtTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGa > 1:1608218/1‑93 (MQ=255)
tcgtTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGaa > 1:1198429/1‑93 (MQ=255)
cgtTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGaaa < 1:1425440/93‑1 (MQ=255)
cgtTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGaaa < 1:4569066/93‑1 (MQ=255)
cgtTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGaaa < 2:3466541/93‑1 (MQ=255)
gtTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAg > 2:1485547/1‑93 (MQ=255)
gtTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAg < 1:2251384/93‑1 (MQ=255)
gtTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAg < 1:2875932/93‑1 (MQ=255)
gtTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAg > 2:1451495/1‑93 (MQ=255)
ttAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAgc > 2:1208873/1‑93 (MQ=255)
ttAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAgc < 2:723836/93‑1 (MQ=255)
aaTGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTTCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAgcgc < 2:2621237/93‑1 (MQ=255)
aaTGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAgcgc > 1:399274/1‑93 (MQ=255)
aaTGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAgcgc < 2:2048189/93‑1 (MQ=255)
|
TTATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCTGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGC > NC_000913/2143440‑2143617
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GTTTATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCTGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTT > NC_000913/2143438‑2143623
|
GTTTATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCG < SRR4302535.2784639/94‑1 (MQ=60)
TTATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAG > SRR4302535.3287580/1‑94 (MQ=60)
TATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGT > SRR4302535.2294301/1‑94 (MQ=60)
CGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGGGTCGTTAATGGCGAGTATG > SRR4302535.197700/1‑94 (MQ=60)
CGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATG < SRR4302535.3036364/94‑1 (MQ=60)
CGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATG > SRR4302535.31274/1‑94 (MQ=60)
CGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATG < SRR4302535.687353/94‑1 (MQ=60)
GATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGC > SRR4302535.4274855/1‑94 (MQ=60)
ATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCT < SRR4302535.2512295/94‑1 (MQ=60)
ATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCT > SRR4302535.2041259/1‑94 (MQ=60)
ATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCT > SRR4302535.2487406/1‑94 (MQ=60)
CTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGTACTGGCGTCGTTAATGACGAGTATGCTGC > SRR4302535.3743879/1‑94 (MQ=60)
CTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGC > SRR4302535.747434/1‑94 (MQ=60)
TTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCG < SRR4302535.222663/94‑1 (MQ=60)
TTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCG < SRR4302535.3691300/94‑1 (MQ=60)
TGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGT > SRR4302535.4483111/1‑94 (MQ=60)
GATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTT > SRR4302535.1339950/1‑94 (MQ=60)
ATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTC < SRR4302535.1827995/94‑1 (MQ=60)
GCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAG > SRR4302535.1617437/1‑94 (MQ=60)
CTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGC < SRR4302535.2481506/94‑1 (MQ=60)
CTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGC > SRR4302535.115276/1‑94 (MQ=60)
TTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGGGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCG > SRR4302535.3218646/1‑94 (MQ=60)
TAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGAC < SRR4302535.2241861/94‑1 (MQ=60)
AAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGT < SRR4302535.369853/94‑1 (MQ=60)
CGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCT < SRR4302535.1081966/94‑1 (MQ=60)
CGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCT < SRR4302535.2880327/94‑1 (MQ=60)
TGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGGTTTGCTGCGCGGACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGGTCCAGCGACGTGCTGGG > SRR4302535.4023255/1‑94 (MQ=60)
GACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCCGCGACGTGCTGGCACGAC > SRR4302535.2756262/1‑94 (MQ=60)
CAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTC > SRR4302535.1001116/1‑94 (MQ=60)
AGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGGATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCG > SRR4302535.2514285/1‑94 (MQ=60)
CGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGT < SRR4302535.3388530/94‑1 (MQ=60)
CGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGT > SRR4302535.1385761/1‑94 (MQ=60)
CCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGG < SRR4302535.203030/94‑1 (MQ=60)
CGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGG < SRR4302535.3849933/94‑1 (MQ=60)
CGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGG < SRR4302535.1065778/94‑1 (MQ=60)
CGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGG < SRR4302535.1489123/94‑1 (MQ=60)
GGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGG < SRR4302535.2378398/94‑1 (MQ=60)
GGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGG < SRR4302535.3605620/94‑1 (MQ=60)
ATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGA > SRR4302535.49090/1‑94 (MQ=60)
TGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGGGCTGGCGCGACTCGGTGGGGGTGAA > SRR4302535.1427763/1‑94 (MQ=60)
GCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAAT < SRR4302535.3360355/94‑1 (MQ=60)
CGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATT < SRR4302535.339568/94‑1 (MQ=60)
GGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTT > SRR4302535.2589908/1‑94 (MQ=60)
GGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTT < SRR4302535.3659734/94‑1 (MQ=60)
ggggtcacgcttgtCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGGCGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGG < SRR4302535.476381/80‑1 (MQ=60)
CGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGG < SRR4302535.476383/94‑1 (MQ=60)
GGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTC < SRR4302535.2296730/94‑1 (MQ=60)
GTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCT < SRR4302535.3251508/94‑1 (MQ=60)
GTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCT < SRR4302535.1768862/94‑1 (MQ=60)
GTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCT < SRR4302535.1856669/94‑1 (MQ=60)
ACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCT < SRR4302535.4393562/94‑1 (MQ=60)
CGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTG < SRR4302535.441071/94‑1 (MQ=60)
CTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAG > SRR4302535.2967371/1‑94 (MQ=60)
CTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAG < SRR4302535.3931921/94‑1 (MQ=60)
CTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAG < SRR4302535.3357127/94‑1 (MQ=60)
CGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGT < SRR4302535.22538/94‑1 (MQ=60)
GAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTA > SRR4302535.657962/1‑94 (MQ=60)
GAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTA > SRR4302535.2657082/1‑94 (MQ=60)
GAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTA < SRR4302535.2147972/94‑1 (MQ=60)
ACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAAT < SRR4302535.2142116/94‑1 (MQ=60)
ACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAAT < SRR4302535.3184535/94‑1 (MQ=60)
ACTGGCGTCGTTAATGCCGAGCATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGGTGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAAT > SRR4302535.4439918/1‑94 (MQ=60)
CTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATG < SRR4302535.2784638/94‑1 (MQ=60)
GGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTT > SRR4302535.99390/1‑94 (MQ=60)
GGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTT < SRR4302535.224685/94‑1 (MQ=60)
CGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGA > SRR4302535.1619816/1‑94 (MQ=60)
CGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGA < SRR4302535.1677393/94‑1 (MQ=60)
GTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAA > SRR4302535.1207014/1‑94 (MQ=60)
CGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAG < SRR4302535.1435616/94‑1 (MQ=60)
CGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAG < SRR4302535.4600225/94‑1 (MQ=60)
GTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGC < SRR4302535.2267418/94‑1 (MQ=60)
GTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGC < SRR4302535.2896304/94‑1 (MQ=60)
TAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGC > SRR4302535.402071/1‑94 (MQ=60)
CGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTT < SRR4302535.1483387/94‑1 (MQ=60)
CGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTT < SRR4302535.3891154/94‑1 (MQ=60)
CGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTT < SRR4302535.27251/94‑1 (MQ=60)
CGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTT < SRR4302535.1996112/94‑1 (MQ=60)
CGAGTAGGCTGCGTTCCAGCGACGTGCGGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTT < SRR4302535.1483386/94‑1 (MQ=60)
|
GTTTATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCTGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTT > NC_000913/2143438‑2143623
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
