Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,991,845 |
T→C |
N62N (AAT→AAC) |
b2853 → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,991,845 | 0 | T | C | 100.0%
| 657.6
/ NA
| 203 | N62N (AAT→AAC) | b2853 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (87/116); total (87/116) |
Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
CACCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTT > NC_000913/2991755‑2991934
|
cacCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAAccc < 1:4028579/93‑1 (MQ=255)
cacCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAAccc < 2:2953127/93‑1 (MQ=255)
acCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCt > 1:3724986/1‑93 (MQ=255)
ccAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTa < 2:4021618/93‑1 (MQ=255)
cAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTAt < 2:391948/93‑1 (MQ=255)
aGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTAtc > 2:1514063/1‑93 (MQ=255)
aGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTAtc < 1:1715563/93‑1 (MQ=255)
aGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTAtc < 2:3426635/93‑1 (MQ=255)
tGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTAtctc < 2:4149138/93‑1 (MQ=255)
gCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCa < 1:60414/93‑1 (MQ=255)
gCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCa < 1:1655109/93‑1 (MQ=255)
tACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCAcc > 1:1062806/1‑93 (MQ=255)
cTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCtt > 2:2279427/1‑93 (MQ=255)
gATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTAc < 1:1874286/93‑1 (MQ=255)
aTACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACt > 2:3469242/1‑93 (MQ=255)
tACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACta < 1:4449926/93‑1 (MQ=255)
tACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACta < 2:3853579/93‑1 (MQ=255)
tACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACta > 2:4065895/1‑93 (MQ=255)
aCAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACtat < 2:3155200/93‑1 (MQ=255)
gATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATaaa > 2:376603/1‑93 (MQ=255)
aTCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATaaaa > 1:2293790/1‑93 (MQ=255)
cAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAAtt < 1:2314025/93‑1 (MQ=255)
cAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAAtt > 2:1800178/1‑93 (MQ=255)
cAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAAtt > 2:4373760/1‑93 (MQ=255)
aaaTACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTg > 1:291570/1‑93 (MQ=255)
aaTACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGa > 2:762545/1‑93 (MQ=255)
aTACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAg < 1:926134/93‑1 (MQ=255)
aTACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAg < 1:2201803/93‑1 (MQ=255)
aTACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAg < 2:922145/93‑1 (MQ=255)
aTACAAGCATTTATAGTTTCAACACGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAg > 1:1132007/1‑93 (MQ=255)
cAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTgg < 2:3833690/93‑1 (MQ=255)
cAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTgg > 1:2161386/1‑93 (MQ=255)
aGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTa < 2:849322/93‑1 (MQ=255)
aTTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGAc < 1:4161138/93‑1 (MQ=255)
ttATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGa > 1:3532360/1‑93 (MQ=255)
ttATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGa > 1:526897/1‑93 (MQ=255)
tataGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGAt < 1:3495740/93‑1 (MQ=255)
ataGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGAtt < 2:3545571/93‑1 (MQ=255)
gTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGAc > 1:1400916/1‑93 (MQ=255)
tttCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGAcc > 2:1767013/1‑93 (MQ=255)
ttCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCa < 2:2417354/93‑1 (MQ=255)
ttCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCa > 2:1049788/1‑93 (MQ=255)
tCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCaa > 1:21020/1‑93 (MQ=255)
cAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCaaa < 1:4684668/93‑1 (MQ=255)
aaCATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCaaat > 2:1124071/1‑93 (MQ=255)
aCATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGACAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCaaata > 1:1554988/1‑93 (MQ=255)
cATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCaaataa < 2:4265013/93‑1 (MQ=255)
atggatggCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCaaataaa > 1:1764716/1‑93 (MQ=255)
atggatggCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCaaataaa < 1:1476471/93‑1 (MQ=255)
tggatggCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCaaataaat < 1:1517746/93‑1 (MQ=255)
ggatggCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATc < 2:1447181/93‑1 (MQ=255)
gatggCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCa > 1:4380888/1‑93 (MQ=255)
atggCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCAt < 2:4541457/93‑1 (MQ=255)
atggCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCAt > 1:3935708/1‑93 (MQ=255)
tggCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATa > 2:3354415/1‑93 (MQ=255)
tggCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATa < 2:1942026/93‑1 (MQ=255)
ggCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATaa < 2:457918/93‑1 (MQ=255)
ggCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATaa < 1:1295552/93‑1 (MQ=255)
gcgcCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAAc < 1:2872318/93‑1 (MQ=255)
gcgcCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAAc > 1:2541011/1‑93 (MQ=255)
gcgcCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAAc < 2:4328894/93‑1 (MQ=255)
gcgcCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAAc < 1:2787203/93‑1 (MQ=255)
gcgcCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAAc < 2:289286/93‑1 (MQ=255)
gcgcCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAAc < 2:2393418/93‑1 (MQ=255)
gcgcCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAAc < 1:4593568/93‑1 (MQ=255)
gcCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACga < 1:4418323/93‑1 (MQ=255)
ccTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACgag > 2:52643/1‑93 (MQ=255)
ttttCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGAt > 1:1739997/1‑93 (MQ=255)
ttttCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGAt < 2:633120/93‑1 (MQ=255)
ttCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATAc < 2:2875968/93‑1 (MQ=255)
aaaaTGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTTACCAAATAAATCATAACGAGATACttt < 1:2690425/93‑1 (MQ=255)
aaaaTGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACttt > 2:27041/1‑93 (MQ=255)
aaaaTGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACttt < 2:880730/93‑1 (MQ=255)
aaaTGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACtttt > 1:2635222/1‑93 (MQ=255)
aaaTGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACtttt > 2:372672/1‑93 (MQ=255)
aaTGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTta > 2:3045584/1‑93 (MQ=255)
aaTGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTta > 1:2812851/1‑93 (MQ=255)
aTGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTtat < 1:4487507/93‑1 (MQ=255)
tGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTtata > 2:1967091/1‑93 (MQ=255)
tGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTtata < 1:541059/93‑1 (MQ=255)
atatGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTataat < 1:360455/93‑1 (MQ=255)
atatGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTataat < 2:1620156/93‑1 (MQ=255)
atatGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTataat > 1:788851/1‑93 (MQ=255)
tatGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTataata > 2:3616125/1‑93 (MQ=255)
tatGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTataata < 1:4556714/93‑1 (MQ=255)
tatGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTataata < 2:2599513/93‑1 (MQ=255)
tatGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTataata < 2:1677727/93‑1 (MQ=255)
tGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGt > 2:4359567/1‑93 (MQ=255)
gTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTa < 2:2505848/93‑1 (MQ=255)
gTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTa < 1:1316215/93‑1 (MQ=255)
tATTCAGAAGATAACCCGAGCTAACCTTACTAAAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGGGATACGTTTATAATAGTAt < 2:1237264/93‑1 (MQ=255)
aTTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTAtc < 2:4434558/93‑1 (MQ=255)
aTTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTAtc < 2:815167/93‑1 (MQ=255)
tCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTAtctc < 1:3372641/93‑1 (MQ=255)
tCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTAtctc > 2:2793304/1‑93 (MQ=255)
gaagaTAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGtt < 1:3121977/93‑1 (MQ=255)
gaagaTAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGtt > 1:3285703/1‑93 (MQ=255)
gaTAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCt > 1:739341/1‑93 (MQ=255)
gaTAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTACt > 1:227794/1‑93 (MQ=255)
tAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCttt < 2:1185240/93‑1 (MQ=255)
|
CACCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTT > NC_000913/2991755‑2991934
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AACACCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCAT > NC_000913/2991753‑2991937
|
AACACCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACC > SRR4302535.767353/1‑94 (MQ=60)
AACACCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGATTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACC > SRR4302535.3317889/1‑94 (MQ=60)
ACACCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCC < SRR4302535.948120/94‑1 (MQ=60)
ACACCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCC > SRR4302535.2812250/1‑94 (MQ=60)
CACCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCT < SRR4302535.4056141/94‑1 (MQ=60)
CACCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCT > SRR4302535.3750793/1‑94 (MQ=60)
CAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATC < SRR4302535.2311939/94‑1 (MQ=60)
AGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCT < SRR4302535.1727973/94‑1 (MQ=60)
GCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCAC < SRR4302535.60861/94‑1 (MQ=60)
GCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCAC < SRR4302535.1667081/94‑1 (MQ=60)
CTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACC > SRR4302535.1070371/1‑94 (MQ=60)
CTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTA > SRR4302535.698029/1‑94 (MQ=60)
GATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACT < SRR4302535.1887788/94‑1 (MQ=60)
TACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTAT < SRR4302535.4480447/94‑1 (MQ=60)
ACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATA > SRR4302535.3374263/1‑94 (MQ=60)
GATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAA > SRR4302535.2310197/1‑94 (MQ=60)
TCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATT < SRR4302535.4488025/94‑1 (MQ=60)
TCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATT > SRR4302535.1765256/1‑94 (MQ=60)
CAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTG > SRR4302535.293611/1‑94 (MQ=60)
CAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTG < SRR4302535.2330580/94‑1 (MQ=60)
CAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTG > SRR4302535.1111035/1‑94 (MQ=60)
AAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGA > SRR4302535.3412502/1‑94 (MQ=60)
AAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGA > SRR4302535.4271341/1‑94 (MQ=60)
AATACAAGCATTTATAGTTTCAACACGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAG > SRR4302535.1140088/1‑94 (MQ=60)
ATGCAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTACAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGT < SRR4302535.2302510/94‑1 (MQ=60)
ATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGT > SRR4302535.2571155/1‑94 (MQ=60)
ATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGT < SRR4302535.1344167/94‑1 (MQ=60)
ATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGT < SRR4302535.2217496/94‑1 (MQ=60)
ATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGT < SRR4302535.932695/94‑1 (MQ=60)
TACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTG < SRR4302535.568526/94‑1 (MQ=60)
ACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGG > SRR4302535.2176900/1‑94 (MQ=60)
CAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGT < SRR4302535.508769/94‑1 (MQ=60)
CAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGT > SRR4302535.1673082/1‑94 (MQ=60)
AAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTA > SRR4302535.1469235/1‑94 (MQ=60)
AGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGCGGTAG < SRR4302535.2200151/94‑1 (MQ=60)
CATTTATAGTTTCCACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGAC < SRR4302535.2698135/94‑1 (MQ=60)
CATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCATAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGAC < SRR4302535.2535267/94‑1 (MQ=60)
ATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACG < SRR4302535.4189620/94‑1 (MQ=60)
TTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGA > SRR4302535.530576/1‑94 (MQ=60)
TTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGA > SRR4302535.3556884/1‑94 (MQ=60)
TATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATT < SRR4302535.2777229/94‑1 (MQ=60)
TATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATT < SRR4302535.3520030/94‑1 (MQ=60)
ATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTG < SRR4302535.4566170/94‑1 (MQ=60)
ATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTG > SRR4302535.612232/1‑94 (MQ=60)
TAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGA > SRR4302535.3251020/1‑94 (MQ=60)
AGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGAC < SRR4302535.4621170/94‑1 (MQ=60)
AGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGAC < SRR4302535.3817045/94‑1 (MQ=60)
AGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGAC > SRR4302535.1410912/1‑94 (MQ=60)
TTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCA > SRR4302535.1747491/1‑94 (MQ=60)
TTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAA > SRR4302535.21175/1‑94 (MQ=60)
TCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAA > SRR4302535.2862015/1‑94 (MQ=60)
CAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAAT < SRR4302535.4716366/94‑1 (MQ=60)
CAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAAT < SRR4302535.765590/94‑1 (MQ=60)
AACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGACAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATA > SRR4302535.1566194/1‑94 (MQ=60)
ACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAA < SRR4302535.1636445/94‑1 (MQ=60)
ACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAA > SRR4302535.3369482/1‑94 (MQ=60)
CATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAA > SRR4302535.1777509/1‑94 (MQ=60)
ATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAAT > SRR4302535.4426425/1‑94 (MQ=60)
ATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAAT < SRR4302535.1487039/94‑1 (MQ=60)
TGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATC < SRR4302535.1528679/94‑1 (MQ=60)
GGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCA > SRR4302535.4410861/1‑94 (MQ=60)
GATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCAT > SRR4302535.3962560/1‑94 (MQ=60)
ATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATA < SRR4302535.2545370/94‑1 (MQ=60)
ATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATA > SRR4302535.1880485/1‑94 (MQ=60)
GGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAAC > SRR4302535.2559314/1‑94 (MQ=60)
GGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAAC < SRR4302535.1304793/94‑1 (MQ=60)
GGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAAC < SRR4302535.819732/94‑1 (MQ=60)
GCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACG < SRR4302535.1519587/94‑1 (MQ=60)
GCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACG < SRR4302535.2892672/94‑1 (MQ=60)
GCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACG < SRR4302535.4624833/94‑1 (MQ=60)
GCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACG < SRR4302535.2807034/94‑1 (MQ=60)
CGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGA > SRR4302535.174682/1‑94 (MQ=60)
CGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGA < SRR4302535.4437795/94‑1 (MQ=60)
GCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAG > SRR4302535.1558746/1‑94 (MQ=60)
GCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAG < SRR4302535.4448574/94‑1 (MQ=60)
CTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGAT < SRR4302535.3618490/94‑1 (MQ=60)
CTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGAT > SRR4302535.1752571/1‑94 (MQ=60)
AAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTTACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTT < SRR4302535.2709655/94‑1 (MQ=60)
AAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTT > SRR4302535.2654105/1‑94 (MQ=60)
AAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTA > SRR4302535.2832839/1‑94 (MQ=60)
AATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTAT < SRR4302535.407324/94‑1 (MQ=60)
AATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTAT < SRR4302535.2964041/94‑1 (MQ=60)
ATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATA < SRR4302535.4518315/94‑1 (MQ=60)
ATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATA > SRR4302535.4015311/1‑94 (MQ=60)
TGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAA < SRR4302535.1305493/94‑1 (MQ=60)
TGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAA < SRR4302535.544837/94‑1 (MQ=60)
GATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAAT > SRR4302535.794390/1‑94 (MQ=60)
ATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATA < SRR4302535.362947/94‑1 (MQ=60)
TATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAG < SRR4302535.4587830/94‑1 (MQ=60)
TGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTA < SRR4302535.2268532/94‑1 (MQ=60)
GTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTAT < SRR4302535.1325616/94‑1 (MQ=60)
TATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATC > SRR4302535.2070503/1‑94 (MQ=60)
TATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATC > SRR4302535.2910842/1‑94 (MQ=60)
TATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATC > SRR4302535.4681206/1‑94 (MQ=60)
ATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCT < SRR4302535.1142367/94‑1 (MQ=60)
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AGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTT > SRR4302535.533000/1‑94 (MQ=60)
AGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTT > SRR4302535.354662/1‑94 (MQ=60)
AGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTT > SRR4302535.3308541/1‑94 (MQ=60)
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GATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGCGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTT > SRR4302535.3653584/1‑94 (MQ=60)
ATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTT > SRR4302535.4453281/1‑94 (MQ=60)
TAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTC < SRR4302535.2127529/94‑1 (MQ=60)
AACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCA > SRR4302535.449419/1‑94 (MQ=60)
ACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCAT < SRR4302535.2446322/94‑1 (MQ=60)
|
AACACCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCAT > NC_000913/2991753‑2991937
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
