Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1696 |
279.3 |
15874187 |
97.8% |
15524954 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,991,845 |
T→C |
N62N (AAT→AAC) |
b2853 → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,991,845 | 0 | T | C | 100.0%
| 1055.3
/ NA
| 328 | N62N (AAT→AAC) | b2853 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (170/158); total (170/158) |
Only 100 of 332 total aligned reads displayed.
ACCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTT > NC_000913/2991756‑2991934
|
acCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCt < 1:687622/93‑1 (MQ=255)
ccAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTa > 2:4553129/1‑93 (MQ=255)
ccAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTa < 2:7415566/93‑1 (MQ=255)
ccAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTa < 1:5629030/93‑1 (MQ=255)
cAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTAt > 1:502677/1‑93 (MQ=255)
aGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTAtc > 1:1989583/1‑93 (MQ=255)
gTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTAtct > 2:2459058/1‑93 (MQ=255)
gTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACACTAtct > 1:4829967/1‑93 (MQ=255)
gCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCa < 1:1434855/93‑1 (MQ=255)
cTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCAc > 2:7219907/1‑93 (MQ=255)
cTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCAc < 2:5991935/93‑1 (MQ=255)
cTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCAc > 2:5251779/1‑93 (MQ=255)
cTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCAc < 2:407847/93‑1 (MQ=255)
aCTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCt > 2:854674/1‑93 (MQ=255)
tGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTa > 2:6824783/1‑93 (MQ=255)
tGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTa > 2:5127808/1‑93 (MQ=255)
gATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTAc > 1:758479/1‑93 (MQ=255)
gATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTAc < 2:1540395/93‑1 (MQ=255)
gATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTAc < 1:3282761/93‑1 (MQ=255)
aTACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACt > 1:5940844/1‑93 (MQ=255)
tACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACta < 1:4489482/93‑1 (MQ=255)
cAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACtata < 2:583430/93‑1 (MQ=255)
aTCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATaaaa > 2:4862387/1‑93 (MQ=255)
cAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAAtt > 1:910782/1‑93 (MQ=255)
cAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAAtt < 1:6493144/93‑1 (MQ=255)
aaTACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGa < 1:4142441/93‑1 (MQ=255)
aaTACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGa > 1:4062875/1‑93 (MQ=255)
tACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGt < 1:7213121/93‑1 (MQ=255)
tACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGt < 1:7426757/93‑1 (MQ=255)
aCAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTg < 1:1149969/93‑1 (MQ=255)
aCAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTg < 2:3510671/93‑1 (MQ=255)
aCAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTg < 1:4734396/93‑1 (MQ=255)
cAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTgg > 2:3461351/1‑93 (MQ=255)
aaGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGt > 2:7118703/1‑93 (MQ=255)
aGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTa < 2:4092161/93‑1 (MQ=255)
aGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTa < 1:7261509/93‑1 (MQ=255)
gCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAg < 2:4398787/93‑1 (MQ=255)
cATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGa > 1:6023937/1‑93 (MQ=255)
cATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGa < 1:2204170/93‑1 (MQ=255)
aTTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGAc < 1:2939848/93‑1 (MQ=255)
aTTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGAc < 2:1398916/93‑1 (MQ=255)
aTTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGAc > 2:5582952/1‑93 (MQ=255)
aTTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGAc > 2:4345645/1‑93 (MQ=255)
tttATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACg > 1:1053109/1‑93 (MQ=255)
ttATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGa > 2:3614380/1‑93 (MQ=255)
ttATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGa < 2:2034183/93‑1 (MQ=255)
ttATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGa > 2:6408341/1‑93 (MQ=255)
tataGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGAt < 2:1136485/93‑1 (MQ=255)
aGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGa > 2:4807500/1‑93 (MQ=255)
gTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGAc > 2:3140152/1‑93 (MQ=255)
gTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGAc > 1:4929194/1‑93 (MQ=255)
tttCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGAcc > 2:3926568/1‑93 (MQ=255)
tttCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGAcc > 2:2707876/1‑93 (MQ=255)
cAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCaaa > 2:4768657/1‑93 (MQ=255)
aaCATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCaaat > 2:2351619/1‑93 (MQ=255)
aaCATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCaaat > 1:5319518/1‑93 (MQ=255)
aaCATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCaaat > 1:6778313/1‑93 (MQ=255)
aCATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCaaata > 1:6295535/1‑93 (MQ=255)
cATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCaaataa < 1:1298033/93‑1 (MQ=255)
atggatggCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCaaataaa > 1:1842086/1‑93 (MQ=255)
atggatggCGACTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCaaataaa < 1:3752027/93‑1 (MQ=255)
tggatggCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCaaataaat > 2:1986421/1‑93 (MQ=255)
tggatggCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCaaataaat > 2:4024630/1‑93 (MQ=255)
atggCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCAt < 1:5577826/93‑1 (MQ=255)
atggCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCAt < 2:3784834/93‑1 (MQ=255)
tggCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATa < 1:2662926/93‑1 (MQ=255)
tggCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATa < 2:1744830/93‑1 (MQ=255)
gcgcCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAAc > 1:2397738/1‑93 (MQ=255)
cgcCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACg > 2:905088/1‑93 (MQ=255)
gcCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACga > 1:271172/1‑93 (MQ=255)
gcCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACga > 1:1884786/1‑93 (MQ=255)
ccTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTAACCAAATAAATCATAACgag > 2:6527277/1‑93 (MQ=255)
cTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACgaga > 2:5765562/1‑93 (MQ=255)
ttttCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGAt > 1:160902/1‑93 (MQ=255)
ttttCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGAt > 1:6329818/1‑93 (MQ=255)
tttCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATa < 2:5337033/93‑1 (MQ=255)
ttCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATAc < 2:7052129/93‑1 (MQ=255)
aaaaTGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACttt > 2:1061433/1‑93 (MQ=255)
tGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTtata > 1:4617962/1‑93 (MQ=255)
tGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTtata < 1:5375204/93‑1 (MQ=255)
tGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTtata > 2:7797559/1‑93 (MQ=255)
atatGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTataat < 1:3384784/93‑1 (MQ=255)
atatGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTataat > 2:1821819/1‑93 (MQ=255)
atatGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTataat > 2:7632594/1‑93 (MQ=255)
atatGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTataat > 1:2025406/1‑93 (MQ=255)
tatGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTataata > 1:34979/1‑93 (MQ=255)
tatGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTataata < 2:2842205/93‑1 (MQ=255)
atGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAg < 2:2144410/93‑1 (MQ=255)
atGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAg < 2:7276674/93‑1 (MQ=255)
tGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGt > 1:7902956/1‑93 (MQ=255)
gTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTa < 1:2294513/93‑1 (MQ=255)
tATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTAt > 1:7302068/1‑93 (MQ=255)
aTTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTAtc < 1:2018123/93‑1 (MQ=255)
aTTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTAtc < 2:6453282/93‑1 (MQ=255)
tCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTAtctc < 1:6093894/93‑1 (MQ=255)
cAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCg < 1:4410746/93‑1 (MQ=255)
aTAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCtt < 1:7521060/93‑1 (MQ=255)
aTAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCtt < 2:4933425/93‑1 (MQ=255)
tAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCttt > 2:7329588/1‑93 (MQ=255)
tAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCttt > 2:256551/1‑93 (MQ=255)
|
ACCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTT > NC_000913/2991756‑2991934
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CAACACCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCAT > NC_000913/2991752‑2991937
|
CAACACCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAAC > SRR4302543.6038506/1‑94 (MQ=60)
CAACACCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAAC > SRR4302543.6038505/1‑94 (MQ=60)
AACACCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACC > SRR4302543.7954533/1‑94 (MQ=60)
AACACCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACC > SRR4302543.7954532/1‑94 (MQ=60)
ACACCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCC < SRR4302543.2425996/94‑1 (MQ=60)
ACCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTA < SRR4302543.693944/94‑1 (MQ=60)
CCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTAT > SRR4302543.507344/1‑94 (MQ=60)
CCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTAT < SRR4302543.5680327/94‑1 (MQ=60)
CCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTAT > SRR4302543.5652266/1‑94 (MQ=60)
CAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATC > SRR4302543.2007412/1‑94 (MQ=60)
AGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACACTATCT > SRR4302543.4874034/1‑94 (MQ=60)
GTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTC > SRR4302543.3726505/1‑94 (MQ=60)
TGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCA > SRR4302543.4656808/1‑94 (MQ=60)
GCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCAC < SRR4302543.1447823/94‑1 (MQ=60)
CTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACC < SRR4302543.4673249/94‑1 (MQ=60)
CTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACC > SRR4302543.1951073/1‑94 (MQ=60)
CTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTA > SRR4302543.2090083/1‑94 (MQ=60)
CTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTA > SRR4302543.2376942/1‑94 (MQ=60)
CTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTA > SRR4302543.4054160/1‑94 (MQ=60)
TGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTAC > SRR4302543.765176/1‑94 (MQ=60)
GATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACT > SRR4302543.4366560/1‑94 (MQ=60)
GATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACT > SRR4302543.2027257/1‑94 (MQ=60)
GATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACT > SRR4302543.5995203/1‑94 (MQ=60)
GATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACT > SRR4302543.5995202/1‑94 (MQ=60)
GATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACT > SRR4302543.5031154/1‑94 (MQ=60)
GATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACT < SRR4302543.5072430/94‑1 (MQ=60)
GATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACT < SRR4302543.3312394/94‑1 (MQ=60)
ATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTA < SRR4302543.6143440/94‑1 (MQ=60)
ATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTA > SRR4302543.541029/1‑94 (MQ=60)
TACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTAT < SRR4302543.4530270/94‑1 (MQ=60)
TACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTAT < SRR4302543.4317262/94‑1 (MQ=60)
TACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTAT < SRR4302543.679579/94‑1 (MQ=60)
TACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTAT > SRR4302543.1701626/1‑94 (MQ=60)
TACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTAT < SRR4302543.1527432/94‑1 (MQ=60)
TACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTAT < SRR4302543.1329487/94‑1 (MQ=60)
ACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATA < SRR4302543.7366889/94‑1 (MQ=60)
GATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAA > SRR4302543.4710742/1‑94 (MQ=60)
TCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATT < SRR4302543.6099191/94‑1 (MQ=60)
TCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATT > SRR4302543.918789/1‑94 (MQ=60)
CAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTG > SRR4302543.3841507/1‑94 (MQ=60)
CAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTG < SRR4302543.225719/94‑1 (MQ=60)
CAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTG < SRR4302543.6554315/94‑1 (MQ=60)
AAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGA > SRR4302543.4099255/1‑94 (MQ=60)
AATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAG < SRR4302543.4179856/94‑1 (MQ=60)
ATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGT > SRR4302543.2717941/1‑94 (MQ=60)
ATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGT > SRR4302543.367614/1‑94 (MQ=60)
ATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGT > SRR4302543.6011290/1‑94 (MQ=60)
TACAAGCATTTATAGTTTCGACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTG > SRR4302543.937992/1‑94 (MQ=60)
TACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTG < SRR4302543.7497970/94‑1 (MQ=60)
TACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTG > SRR4302543.844876/1‑94 (MQ=60)
TACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTG < SRR4302543.7283044/94‑1 (MQ=60)
TACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTG < SRR4302543.7283043/94‑1 (MQ=60)
ACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGG < SRR4302543.7613569/94‑1 (MQ=60)
ACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGG < SRR4302543.4777665/94‑1 (MQ=60)
ACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGG > SRR4302543.3335928/1‑94 (MQ=60)
ACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGG < SRR4302543.1160451/94‑1 (MQ=60)
AAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTA < SRR4302543.2954243/94‑1 (MQ=60)
AGCATTTATAGTTTCATCATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAG < SRR4302543.7115982/94‑1 (MQ=60)
AGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAG < SRR4302543.7331678/94‑1 (MQ=60)
AGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAG > SRR4302543.1326523/1‑94 (MQ=60)
AGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAG < SRR4302543.7866565/94‑1 (MQ=60)
GCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGA > SRR4302543.6079933/1‑94 (MQ=60)
GCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGA < SRR4302543.1638183/94‑1 (MQ=60)
CATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGAC < SRR4302543.2224011/94‑1 (MQ=60)
ATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACG < SRR4302543.4135743/94‑1 (MQ=60)
ATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACG > SRR4302543.1062548/1‑94 (MQ=60)
ATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACG < SRR4302543.6088734/94‑1 (MQ=60)
ATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACG < SRR4302543.2966545/94‑1 (MQ=60)
TTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGAT > SRR4302543.4339059/1‑94 (MQ=60)
TATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATT < SRR4302543.4952810/94‑1 (MQ=60)
ccgatctccactctATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGA < SRR4302543.4146572/80‑1 (MQ=60)
TAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGA > SRR4302543.2043342/1‑94 (MQ=60)
AGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGAC > SRR4302543.6736496/1‑94 (MQ=60)
AGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGAC > SRR4302543.4974099/1‑94 (MQ=60)
GTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACC < SRR4302543.2487320/94‑1 (MQ=60)
TTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAA < SRR4302543.6296763/94‑1 (MQ=60)
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TCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAA < SRR4302543.2193183/94‑1 (MQ=60)
TAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAAT < SRR4302543.5500476/94‑1 (MQ=60)
CAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAAT > SRR4302543.5367583/1‑94 (MQ=60)
CAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAAT > SRR4302543.6842333/1‑94 (MQ=60)
CAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAAT < SRR4302543.7262697/94‑1 (MQ=60)
CAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGAAGATTGACaaaaa > SRR4302543.5367584/1‑89 (MQ=60)
AACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATA < SRR4302543.7593145/94‑1 (MQ=60)
AACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATA < SRR4302543.7378737/94‑1 (MQ=60)
AACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATA > SRR4302543.6354794/1‑94 (MQ=60)
ACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAA < SRR4302543.6507721/94‑1 (MQ=60)
CATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAA > SRR4302543.1858654/1‑94 (MQ=60)
CATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAA < SRR4302543.1309569/94‑1 (MQ=60)
ATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAAT > SRR4302543.1963015/1‑94 (MQ=60)
ATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAAT < SRR4302543.7329564/94‑1 (MQ=60)
ATGGATGGCGACTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAAT < SRR4302543.3785040/94‑1 (MQ=60)
TGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATC > SRR4302543.7572584/1‑94 (MQ=60)
TGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATC > SRR4302543.6854358/1‑94 (MQ=60)
TGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATC < SRR4302543.6439281/94‑1 (MQ=60)
TGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATC < SRR4302543.7469303/94‑1 (MQ=60)
TGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATC > SRR4302543.7572583/1‑94 (MQ=60)
TGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATA > SRR4302543.6854356/1‑94 (MQ=60)
GGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCA < SRR4302543.7817707/94‑1 (MQ=60)
GGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCA < SRR4302543.4746181/94‑1 (MQ=60)
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GATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCAT > SRR4302543.1872716/1‑94 (MQ=60)
ATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATA > SRR4302543.4789156/1‑94 (MQ=60)
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GGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAAC > SRR4302543.2419429/1‑94 (MQ=60)
GCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACG < SRR4302543.4482069/94‑1 (MQ=60)
CGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGA > SRR4302543.273557/1‑94 (MQ=60)
CGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGA > SRR4302543.1901724/1‑94 (MQ=60)
CCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGA > SRR4302543.1571136/1‑94 (MQ=60)
CTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGAT > SRR4302543.6389350/1‑94 (MQ=60)
CTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGAT > SRR4302543.5359872/1‑94 (MQ=60)
CTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGAT > SRR4302543.3405724/1‑94 (MQ=60)
CTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGAT > SRR4302543.162287/1‑94 (MQ=60)
CTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGAT > SRR4302543.1961365/1‑94 (MQ=60)
TTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATA > SRR4302543.3209693/1‑94 (MQ=60)
TTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATA < SRR4302543.3243340/94‑1 (MQ=60)
TTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATA < SRR4302543.3243341/94‑1 (MQ=60)
TTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATA > SRR4302543.7377299/1‑94 (MQ=60)
TTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATAC > SRR4302543.484631/1‑94 (MQ=60)
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AAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTT > SRR4302543.5641043/1‑94 (MQ=60)
AAAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTT > SRR4302543.5641039/1‑94 (MQ=60)
AAATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTA > SRR4302543.1217053/1‑94 (MQ=60)
AATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTAT < SRR4302543.6375821/94‑1 (MQ=60)
ATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAACTAAATCATAACGAGATACTTTTATA > SRR4302543.1153906/1‑94 (MQ=60)
ATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATA > SRR4302543.3527097/1‑94 (MQ=60)
ATGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATA > SRR4302543.4659921/1‑94 (MQ=60)
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TGATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAA > SRR4302543.1899730/1‑94 (MQ=60)
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ATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATA > SRR4302543.2875083/1‑94 (MQ=60)
ATATGTATTCAGAAGATAACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATA < SRR4302543.3415136/94‑1 (MQ=60)
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AACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCA < SRR4302543.4824481/94‑1 (MQ=60)
AACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCA > SRR4302543.2100691/1‑94 (MQ=60)
ACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCAT < SRR4302543.7418782/94‑1 (MQ=60)
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ACCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCAT > SRR4302543.6619998/1‑94 (MQ=60)
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CAACACCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCAT > NC_000913/2991752‑2991937
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
