Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,198,625 |
A→G |
intergenic (‑19/‑223) |
ygiF ← / → ygiM |
hypothetical protein/hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,198,625 | 0 | A | G | 100.0%
| 683.4
/ NA
| 212 | intergenic (‑19/‑223) | ygiF/ygiM | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (110/102); total (110/102) |
Only 100 of 215 total aligned reads displayed.
ATTGAGATGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACGGGCA > NC_000913/3198535‑3198714
|
tGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATa < 2:1048319/93‑1 (MQ=255)
tGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATa < 1:4251254/93‑1 (MQ=255)
tgTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATaa < 1:1059984/92‑1 (MQ=255)
ggTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATaa > 1:408866/1‑93 (MQ=255)
ggTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATaa < 1:2007701/93‑1 (MQ=255)
gTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAg > 2:199631/1‑93 (MQ=255)
gTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAg > 1:3873611/1‑93 (MQ=255)
tCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGt < 1:2250462/93‑1 (MQ=255)
cACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTg > 1:4151336/1‑93 (MQ=255)
cACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTg < 2:4310369/93‑1 (MQ=255)
cACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTg < 2:1346148/93‑1 (MQ=255)
aCGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGa > 2:4540041/1‑93 (MQ=255)
gCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACg > 1:3477461/1‑93 (MQ=255)
cAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGa < 1:1306570/93‑1 (MQ=255)
aaCGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGAt < 2:4071287/93‑1 (MQ=255)
aaCGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGAt > 1:1155876/1‑93 (MQ=255)
aaCGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGAt > 1:1935138/1‑93 (MQ=255)
aaCGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGAt > 1:4332094/1‑93 (MQ=255)
aaCGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGAt < 2:156141/93‑1 (MQ=255)
aCGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATg > 1:719566/1‑93 (MQ=255)
gCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑aa > 1:2352908/1‑93 (MQ=255)
gCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑aa < 2:2184092/93‑1 (MQ=255)
gCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑aa < 1:2933552/93‑1 (MQ=255)
ccTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AAc < 2:4508726/93‑1 (MQ=255)
tCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACgg < 1:977595/93‑1 (MQ=255)
tCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACgg > 1:2835199/1‑93 (MQ=255)
cAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGc < 2:2514952/93‑1 (MQ=255)
aaCGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCg < 1:2642191/93‑1 (MQ=255)
ggCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAAc < 2:3767850/93‑1 (MQ=255)
cTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTaa < 1:2995395/93‑1 (MQ=255)
tgtgATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAAt > 1:788482/1‑93 (MQ=255)
tgtgATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAAt < 2:3186263/93‑1 (MQ=255)
gtgATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATg > 1:4387635/1‑93 (MQ=255)
tgATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGc < 1:2223148/93‑1 (MQ=255)
gATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTTTCGGTTTTGTCCCATAAGTGACGATGAAACGGC‑AACTTaaatcg > 2:3845570/1‑89 (MQ=255)
gATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCg > 2:3350970/1‑93 (MQ=255)
gATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCg > 1:503156/1‑93 (MQ=255)
aTTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGa < 1:4522718/93‑1 (MQ=255)
aTTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGa > 2:3271648/1‑93 (MQ=255)
tAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATc < 1:2379799/93‑1 (MQ=255)
tAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATc > 1:2197173/1‑93 (MQ=255)
tAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATc < 1:3664559/93‑1 (MQ=255)
aCAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑CACGGCGAACTTAATGCGATCtt > 2:559530/1‑93 (MQ=255)
aCAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCtt > 2:4184929/1‑93 (MQ=255)
cAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCttt < 2:2256193/93‑1 (MQ=255)
aaTAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCtttt > 2:2326424/1‑93 (MQ=255)
aaTAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCtttt < 1:3578208/93‑1 (MQ=255)
aaTAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCtttt < 1:2703209/93‑1 (MQ=255)
aaTAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCtttt > 1:1038198/1‑93 (MQ=255)
aTAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGCACTTAATGCGATAttttt > 1:2752045/1‑93 (MQ=255)
aTAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCttttt < 1:2903172/93‑1 (MQ=255)
tAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCtttttt > 1:4049160/1‑93 (MQ=255)
tAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCtttttt < 2:4675206/93‑1 (MQ=255)
aCTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTc > 1:3403220/1‑93 (MQ=255)
aCTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTc < 2:4564721/93‑1 (MQ=255)
aCTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTc > 1:904507/1‑93 (MQ=255)
tttAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAg > 1:2036135/1‑93 (MQ=255)
tttAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAg < 1:1531540/93‑1 (MQ=255)
aaTTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAg > 1:4317630/1‑93 (MQ=255)
aaTTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAg > 1:2524780/1‑93 (MQ=255)
ttCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGAt > 2:4322352/1‑93 (MQ=255)
ttCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGAt > 1:1766993/1‑93 (MQ=255)
ttCGACTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGAt < 1:1560968/93‑1 (MQ=255)
tCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATa > 2:380731/1‑93 (MQ=255)
tCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATa < 2:554/93‑1 (MQ=255)
tCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATa < 1:809172/93‑1 (MQ=255)
tCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATa < 1:3223074/93‑1 (MQ=255)
tCGATGTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGGCGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATa < 1:1636771/93‑1 (MQ=255)
cGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAg < 2:1782637/93‑1 (MQ=255)
cGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAg > 2:2417603/1‑93 (MQ=255)
gATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGt > 1:40381/1‑93 (MQ=255)
gATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGt > 2:2634315/1‑93 (MQ=255)
aTTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTa > 2:1977071/1‑93 (MQ=255)
aTTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTa < 2:2840061/93‑1 (MQ=255)
tttCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTAt > 2:3075652/1‑93 (MQ=255)
ttCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTAtt > 2:362160/1‑93 (MQ=255)
tCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTAttt > 2:3012683/1‑93 (MQ=255)
cTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTg < 1:1218542/93‑1 (MQ=255)
tGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTgc > 2:120668/1‑93 (MQ=255)
tGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTgc > 2:1192501/1‑93 (MQ=255)
aGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTgcgc < 2:915903/93‑1 (MQ=255)
gCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGcc > 2:1602303/1‑93 (MQ=255)
cATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTTTCAGTAGATAGTATTTTGCGccca > 2:313131/1‑91 (MQ=255)
cATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCaa > 2:1282207/1‑93 (MQ=255)
cATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCaa > 1:1381355/1‑93 (MQ=255)
tGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAAt > 2:3570037/1‑93 (MQ=255)
tGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAAt > 1:4378433/1‑93 (MQ=255)
cTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGAGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGcc > 2:1317492/1‑93 (MQ=255)
ttACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCAt > 1:3944395/1‑93 (MQ=255)
ttACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCAt < 1:1023176/93‑1 (MQ=255)
tACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATg > 2:226916/1‑93 (MQ=255)
tcTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGc < 1:2429905/92‑1 (MQ=255)
aCTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGc > 2:1498921/1‑93 (MQ=255)
aCTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGc > 2:3742395/1‑93 (MQ=255)
cTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCa > 2:3400728/1‑93 (MQ=255)
tATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAAc < 2:1172949/93‑1 (MQ=255)
aTCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACg > 2:1596290/1‑93 (MQ=255)
tCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACgg < 2:3669478/93‑1 (MQ=255)
cGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACggg > 1:3346441/1‑93 (MQ=255)
gTTGTGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACGGGCa > 1:3139148/1‑93 (MQ=255)
|
ATTGAGATGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATG‑AACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACGGGCA > NC_000913/3198535‑3198714
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GTATTGAGATGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACGGGCAATT > NC_000913/3198533‑3198717
|
GTATTGAGATGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGT < SRR4302535.3566468/94‑1 (MQ=60)
GTATTGAGATGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGT > SRR4302535.4261224/1‑94 (MQ=60)
GTATTGAGATGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGT > SRR4302535.4542619/1‑94 (MQ=60)
TATTGAGATGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTG > SRR4302535.3455260/1‑94 (MQ=60)
TATTGAGATGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTG < SRR4302535.2056016/94‑1 (MQ=60)
TGAGATGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCA < SRR4302535.2705587/94‑1 (MQ=60)
GATGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACAT > SRR4302535.2254088/1‑94 (MQ=60)
TGGTCTCGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAA > SRR4302535.411736/1‑94 (MQ=60)
TGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAA > SRR4302535.411737/1‑94 (MQ=60)
TGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAA < SRR4302535.4280380/94‑1 (MQ=60)
TGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAG < SRR4302535.1067532/94‑1 (MQ=60)
GGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAG > SRR4302535.3900229/1‑94 (MQ=60)
GGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAG < SRR4302535.2022163/94‑1 (MQ=60)
GTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGT < SRR4302535.1036567/94‑1 (MQ=60)
TCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTG > SRR4302535.4179760/1‑94 (MQ=60)
TCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTG < SRR4302535.2266488/94‑1 (MQ=60)
TCACGCAACGCCGCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTG < SRR4302535.4584127/94‑1 (MQ=60)
CACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGA > SRR4302535.4364432/1‑94 (MQ=60)
CGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAACCTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACG < SRR4302535.2811215/94‑1 (MQ=60)
CGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACG < SRR4302535.2919199/94‑1 (MQ=60)
CGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACG > SRR4302535.3501627/1‑94 (MQ=60)
GCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGA > SRR4302535.3957238/1‑94 (MQ=60)
CAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGAT > SRR4302535.4361720/1‑94 (MQ=60)
CAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGAT > SRR4302535.2606459/1‑94 (MQ=60)
CAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGAT > SRR4302535.1089504/1‑94 (MQ=60)
CAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGAT > SRR4302535.1164135/1‑94 (MQ=60)
CAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGAT < SRR4302535.4069532/94‑1 (MQ=60)
CAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGAT < SRR4302535.1315901/94‑1 (MQ=60)
CAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGAT > SRR4302535.1949075/1‑94 (MQ=60)
AACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG > SRR4302535.724623/1‑94 (MQ=60)
agtCTCAACGGGACTGTGATTAACAATAAACTGTAATTCGATTTCCTGAGCCATGACCGTTACTTACGGGTTGTGTCACATAAGTGGCGATGAA < SRR4302535.427329/91‑1 (MQ=59)
CGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAA > SRR4302535.4250510/1‑94 (MQ=60)
CGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAA > SRR4302535.2369779/1‑94 (MQ=60)
GCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAAC < SRR4302535.476524/94‑1 (MQ=60)
GCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAAC < SRR4302535.2954200/94‑1 (MQ=60)
GCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAAC < SRR4302535.2994475/94‑1 (MQ=60)
CCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAAC < SRR4302535.2215433/94‑1 (MQ=60)
CTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGG > SRR4302535.2855319/1‑94 (MQ=60)
TCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGC < SRR4302535.984541/94‑1 (MQ=60)
CAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCG < SRR4302535.1906439/94‑1 (MQ=60)
AACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGA < SRR4302535.2661113/94‑1 (MQ=60)
GGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACT < SRR4302535.2970983/94‑1 (MQ=60)
CACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTA > SRR4302535.1544469/1‑94 (MQ=60)
CTGTGATTAACAATAATCTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAAT < SRR4302535.3375597/94‑1 (MQ=60)
CTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAAT < SRR4302535.3016392/94‑1 (MQ=60)
CTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAAT > SRR4302535.794018/1‑94 (MQ=60)
TGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCGCATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATG < SRR4302535.3573370/94‑1 (MQ=60)
TGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATG > SRR4302535.4417648/1‑94 (MQ=60)
TGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCG > SRR4302535.506675/1‑94 (MQ=60)
TGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCG > SRR4302535.3128581/1‑94 (MQ=60)
TGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCG < SRR4302535.2238973/94‑1 (MQ=60)
TGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCG > SRR4302535.1527463/1‑94 (MQ=60)
GATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGA > SRR4302535.857627/1‑94 (MQ=60)
ATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGAT < SRR4302535.4553708/94‑1 (MQ=60)
ATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGAT < SRR4302535.1607753/94‑1 (MQ=60)
ATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGAT < SRR4302535.805762/94‑1 (MQ=60)
TTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATC > SRR4302535.2212832/1‑94 (MQ=60)
TAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCT < SRR4302535.3689933/94‑1 (MQ=60)
TAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCT < SRR4302535.2396887/94‑1 (MQ=60)
TAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCT > SRR4302535.1050329/1‑94 (MQ=60)
TAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCT < SRR4302535.1539349/94‑1 (MQ=60)
ACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTT < SRR4302535.3179832/94‑1 (MQ=60)
CAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTT > SRR4302535.1045571/1‑94 (MQ=60)
CAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTT > SRR4302535.3624291/1‑94 (MQ=60)
AATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGCACTTAATGCGATATTTTT > SRR4302535.2771659/1‑94 (MQ=60)
AATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTT < SRR4302535.2722521/94‑1 (MQ=60)
AATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTT < SRR4302535.3603015/94‑1 (MQ=60)
ATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTT < SRR4302535.2923693/94‑1 (MQ=60)
ATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTT > SRR4302535.4076881/1‑94 (MQ=60)
AACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTC > SRR4302535.910926/1‑94 (MQ=60)
AACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTC > SRR4302535.3426905/1‑94 (MQ=60)
CTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAG > SRR4302535.2050801/1‑94 (MQ=60)
TTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGT < SRR4302535.1542576/94‑1 (MQ=60)
TTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATATTTTTTGTCAGT > SRR4302535.2426538/1‑94 (MQ=60)
TTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTA > SRR4302535.4358225/1‑94 (MQ=60)
TTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTA > SRR4302535.4414442/1‑94 (MQ=60)
TAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAG > SRR4302535.2542974/1‑94 (MQ=60)
TAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAG > SRR4302535.4347169/1‑94 (MQ=60)
ATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGAT < SRR4302535.665178/94‑1 (MQ=60)
ATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGAT > SRR4302535.1779805/1‑94 (MQ=60)
TTCGACTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATA < SRR4302535.1572214/94‑1 (MQ=60)
TCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAG < SRR4302535.814834/94‑1 (MQ=60)
TCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAG < SRR4302535.3245417/94‑1 (MQ=60)
TCGATGTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGGCGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAG < SRR4302535.1648594/94‑1 (MQ=60)
CGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGT > SRR4302535.40688/1‑94 (MQ=60)
GATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTTTCAGTAGATAGTA > SRR4302535.2523152/1‑94 (MQ=60)
GATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTA > SRR4302535.784482/1‑94 (MQ=60)
GATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTA > SRR4302535.4035112/1‑94 (MQ=60)
ATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTAT < SRR4302535.1329025/94‑1 (MQ=60)
TTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTCTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATT > SRR4302535.4551103/1‑94 (MQ=60)
TCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAATATTTT > SRR4302535.3369083/1‑94 (MQ=60)
CCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTG > SRR4302535.199761/1‑94 (MQ=60)
CCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTG > SRR4302535.2742756/1‑94 (MQ=60)
CCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTG < SRR4302535.171044/94‑1 (MQ=60)
CTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGC < SRR4302535.1227284/94‑1 (MQ=60)
TGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCG < SRR4302535.4130789/94‑1 (MQ=60)
CCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGAGGATGAACGGCGAACTTAATGCGGTCTTTTTTGTTAGTAGATAGTATTTTGCGGCAA > SRR4302535.1298638/1‑94 (MQ=60)
CCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAA < SRR4302535.2028190/94‑1 (MQ=60)
CCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAA > SRR4302535.1391206/1‑94 (MQ=60)
CCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAA > SRR4302535.1174649/1‑94 (MQ=60)
CATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAA > SRR4302535.4284056/1‑94 (MQ=60)
ATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAAT < SRR4302535.974379/94‑1 (MQ=60)
ATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAAT > SRR4302535.2487415/1‑94 (MQ=60)
ATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAAT > SRR4302535.4408391/1‑94 (MQ=60)
TGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATT > SRR4302535.4166508/1‑94 (MQ=60)
TGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATT < SRR4302535.3688793/94‑1 (MQ=60)
GGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTG > SRR4302535.2348148/1‑94 (MQ=60)
GGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGGGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATGTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGGCAAATTG > SRR4302535.991691/1‑94 (MQ=60)
CCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCC > SRR4302535.2137771/1‑94 (MQ=60)
CTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCA > SRR4302535.2931837/1‑94 (MQ=60)
TTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCAT > SRR4302535.3971328/1‑94 (MQ=60)
TTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATG < SRR4302535.1030445/94‑1 (MQ=60)
TCTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCA < SRR4302535.2447413/94‑1 (MQ=60)
ACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCA > SRR4302535.370706/1‑94 (MQ=60)
TCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACGGG < SRR4302535.2378985/94‑1 (MQ=60)
TCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACGGG > SRR4302535.3369753/1‑94 (MQ=60)
TCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACGGG < SRR4302535.2102886/94‑1 (MQ=60)
GGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACGGGCA > SRR4302535.3160992/1‑94 (MQ=60)
TTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACGGGCAAT > SRR4302535.692894/1‑94 (MQ=60)
TGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACGGGCAATT < SRR4302535.381983/94‑1 (MQ=60)
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GTATTGAGATGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACGGGCAATT > NC_000913/3198533‑3198717
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
