Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1696 |
279.3 |
15874187 |
97.8% |
15524954 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,198,625 |
A→G |
intergenic (‑19/‑223) |
ygiF ← / → ygiM |
hypothetical protein/hypothetical protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,198,625 | 0 | A | G | 99.7%
| 1230.9
/ NA
| 385 | intergenic (‑19/‑223) | ygiF/ygiM | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (195/189); minor base T (1/0); total (196/189) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 399 total aligned reads displayed.
ATTGAGATGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACGGGCAAT > NC_000913/3198535‑3198716
|
gagaTGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTca > 1:6545041/1‑93 (MQ=255)
gaTGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTcaca > 2:6573061/1‑93 (MQ=255)
gTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAg < 2:219527/93‑1 (MQ=255)
gTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAg < 1:3884732/93‑1 (MQ=255)
tCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGt > 1:7881449/1‑93 (MQ=255)
cACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTg > 1:3625899/1‑93 (MQ=255)
cAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGa < 1:3104828/93‑1 (MQ=255)
cAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGa < 2:5407036/93‑1 (MQ=255)
cAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGa < 2:7153509/93‑1 (MQ=255)
aaCGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGAt < 1:3764363/93‑1 (MQ=255)
aCGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATg > 1:1401804/1‑93 (MQ=255)
aCGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATg > 1:731919/1‑93 (MQ=255)
cGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGa < 2:2669496/93‑1 (MQ=255)
gCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACTTAAGTGACGATGaa > 1:1476451/1‑93 (MQ=255)
gCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGaa < 1:4173456/93‑1 (MQ=255)
ccTCAACGGCACTGTGATTAACTGTATACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTCTCGGTTGTGTCACATAAGTGACGCTGacc < 1:7045506/93‑3 (MQ=255)
tCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACgg > 1:7607814/1‑93 (MQ=255)
tCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACgg < 2:410308/93‑1 (MQ=255)
tCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACgg > 1:4942781/1‑93 (MQ=255)
cAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGc > 1:303106/1‑93 (MQ=255)
cAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGc < 2:4611880/93‑1 (MQ=255)
aaCGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCg > 1:4100484/1‑93 (MQ=255)
aCGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGa > 1:276117/1‑93 (MQ=255)
cGGCGCTGTGATTAAAAATAAGCTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGaa < 2:4009995/93‑1 (MQ=255)
ggCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAAc < 2:4847862/93‑1 (MQ=255)
gCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACt > 1:6760463/1‑93 (MQ=255)
cTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTGTCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTaa < 1:7134434/93‑1 (MQ=255)
cTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTaa < 2:91264/93‑1 (MQ=255)
cTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTaa > 2:4242119/1‑93 (MQ=255)
cTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTaa < 1:5501501/93‑1 (MQ=255)
cTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTaa < 1:3947567/93‑1 (MQ=255)
cTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACCATGAACGGCGAACTTaa > 2:352998/1‑93 (MQ=255)
tgtgATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAAt > 1:5067335/1‑93 (MQ=255)
tgtgATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAAt > 1:17224/1‑93 (MQ=255)
tgtgATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAAt > 1:2981998/1‑93 (MQ=255)
tgATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGc > 1:2089563/1‑93 (MQ=255)
gATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCg > 2:7433059/1‑93 (MQ=255)
aTTAACAATAAACTTTAATTCTATTTCCTGAGCCATGCCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGa < 2:778570/93‑1 (MQ=255)
ttAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGAt > 2:3389583/1‑93 (MQ=255)
ttAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGAt > 2:3052501/1‑93 (MQ=255)
tAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATc < 2:1955509/93‑1 (MQ=255)
tAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATc > 1:7451550/1‑93 (MQ=255)
aaCAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCt > 2:6014422/1‑93 (MQ=255)
aaCAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCt < 1:4396793/93‑1 (MQ=255)
aCAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCtt > 2:7683343/1‑93 (MQ=255)
aCAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCtt > 2:4210681/1‑93 (MQ=255)
cAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCttt > 2:176211/1‑93 (MQ=255)
cAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCttt > 1:2629925/1‑93 (MQ=255)
cAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCttt < 2:6405227/93‑1 (MQ=255)
aaTAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCtttt > 2:5277914/1‑93 (MQ=255)
aaTAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCtttt > 1:102893/1‑93 (MQ=255)
aaTAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCtttt > 2:6705999/1‑93 (MQ=255)
aTAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCttttt < 2:1421515/93‑1 (MQ=255)
tAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCtttttt > 1:954017/1‑93 (MQ=255)
aaaCTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAATGGCGAACTTAATGCGATCttttttc > 1:115468/1‑92 (MQ=255)
aCTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTc < 1:2208694/93‑1 (MQ=255)
aCTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTc > 1:3479610/1‑93 (MQ=255)
cTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCa < 2:6277922/93‑1 (MQ=255)
cTTAAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCa < 2:7276595/93‑1 (MQ=255)
tttAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAg > 2:697432/1‑93 (MQ=255)
tttAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAg < 1:7151418/93‑1 (MQ=255)
tttAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAg > 2:3755206/1‑93 (MQ=255)
tAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTa > 1:77701/1‑93 (MQ=255)
aaTTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAg > 2:1597002/1‑93 (MQ=255)
aaTTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGGGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATACGATCTTTTTTGTCAGTaa > 1:558232/1‑92 (MQ=255)
aTTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGa > 2:316071/1‑93 (MQ=255)
aTTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGa < 1:3299928/93‑1 (MQ=255)
tCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATa < 1:6247957/93‑1 (MQ=255)
tCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATa < 2:5915618/93‑1 (MQ=255)
tCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCAATCTTTTTTGTCAGTAGATa < 1:6510117/93‑1 (MQ=255)
cGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAg < 2:6147066/93‑1 (MQ=255)
gATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGt > 1:5948257/1‑93 (MQ=255)
aTTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTa > 1:1889946/1‑93 (MQ=255)
tttCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTAt > 1:4667579/1‑93 (MQ=255)
tCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTAttt < 2:4394352/93‑1 (MQ=255)
tCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTAttt < 2:2478291/93‑1 (MQ=255)
tCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTAttt > 2:4984554/1‑93 (MQ=255)
cTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTg > 1:1785716/1‑93 (MQ=255)
cTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTg > 1:6618112/1‑93 (MQ=255)
gAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTgcg > 2:3890487/1‑93 (MQ=255)
ccATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCa > 1:5364342/1‑93 (MQ=255)
cATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCaa > 2:5070637/1‑93 (MQ=255)
aTGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCaaa < 2:3020576/93‑1 (MQ=255)
aTGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCaaa < 2:2898057/93‑1 (MQ=255)
tGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAAt < 1:6021212/93‑1 (MQ=255)
tGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAAt < 2:1203637/93‑1 (MQ=255)
ggCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAAtt < 2:2800796/93‑1 (MQ=255)
ccTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGc < 2:7618567/93‑1 (MQ=255)
cTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGcc > 1:451276/1‑93 (MQ=255)
tttACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCa < 1:2347333/93‑1 (MQ=255)
tttACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGGAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGcaa > 2:5501123/1‑91 (MQ=255)
cttACTTATCCGTTTTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCa < 1:6387375/92‑1 (MQ=255)
cTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCa < 2:6779259/93‑1 (MQ=255)
ttATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCaa > 2:1276770/1‑93 (MQ=255)
ttATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCaa > 1:5877282/1‑93 (MQ=255)
tATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAAc < 2:5821234/93‑1 (MQ=255)
tATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAAc < 2:4757827/93‑1 (MQ=255)
tCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACgg < 1:428276/93‑1 (MQ=255)
tCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACgg > 1:1065291/1‑93 (MQ=255)
gTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACGGGCa > 2:5178052/1‑93 (MQ=255)
|
ATTGAGATGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACGGGCAAT > NC_000913/3198535‑3198716
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 212 total aligned reads displayed.
CGTATTGAGATGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACGGGCAATTT > NC_000913/3198532‑3198718
|
CGTATTGAGATGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTG > SRR4302543.6259826/1‑94 (MQ=60)
CGTATTGAGATGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTG > SRR4302543.1857747/1‑94 (MQ=60)
GTATTGAGATGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAGCTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGT < SRR4302543.6435084/94‑1 (MQ=60)
TATTGAGATGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTG > SRR4302543.6534579/1‑94 (MQ=60)
TATTGAGATGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTG > SRR4302543.1998690/1‑94 (MQ=60)
TATTGAGATGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTAATTATCGGTTGTG > SRR4302543.1001556/1‑94 (MQ=60)
ATTGAGATGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGT > SRR4302543.1587287/1‑94 (MQ=60)
ATTGAGATGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGT > SRR4302543.4065127/1‑94 (MQ=60)
TTGAGATGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTC < SRR4302543.4290730/94‑1 (MQ=60)
TGAGATGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCA > SRR4302543.6606641/1‑94 (MQ=60)
AGATGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACA > SRR4302543.5461320/1‑94 (MQ=60)
GATGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACAT < SRR4302543.1777928/94‑1 (MQ=60)
TGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAA > SRR4302543.7445799/1‑94 (MQ=60)
GGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAG < SRR4302543.1128222/94‑1 (MQ=60)
GGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAG > SRR4302543.5033956/1‑94 (MQ=60)
GTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGT < SRR4302543.7216633/94‑1 (MQ=60)
GTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGT < SRR4302543.3919027/94‑1 (MQ=60)
GTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGT > SRR4302543.7955618/1‑94 (MQ=60)
TCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTG > SRR4302543.3657835/1‑94 (MQ=60)
TCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTG < SRR4302543.2240217/94‑1 (MQ=60)
TCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTG < SRR4302543.6083714/94‑1 (MQ=60)
CACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGC > SRR4302543.2484170/1‑94 (MQ=60)
CACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGA < SRR4302543.1910769/94‑1 (MQ=60)
ACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGAC > SRR4302543.2448281/1‑94 (MQ=60)
ACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGAC > SRR4302543.5794534/1‑94 (MQ=60)
ACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGAC > SRR4302543.7907339/1‑94 (MQ=60)
CGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACG < SRR4302543.7641388/94‑1 (MQ=60)
GCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGA > SRR4302543.454718/1‑94 (MQ=60)
GCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGA < SRR4302543.5124836/94‑1 (MQ=60)
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CAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGAT > SRR4302543.1123696/1‑94 (MQ=60)
CAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGAT < SRR4302543.504775/94‑1 (MQ=60)
CAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGAT > SRR4302543.6658926/1‑94 (MQ=60)
CAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGAT < SRR4302543.3132759/94‑1 (MQ=60)
CAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGAT < SRR4302543.1844852/94‑1 (MQ=60)
AACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG > SRR4302543.1414456/1‑94 (MQ=60)
AACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG < SRR4302543.4453376/94‑1 (MQ=60)
AACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG < SRR4302543.3797495/94‑1 (MQ=60)
AACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATG > SRR4302543.738479/1‑94 (MQ=60)
CGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACTTAAGTGACGATGAA > SRR4302543.1489756/1‑94 (MQ=60)
GCCTGAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAAC < SRR4302543.4211252/94‑1 (MQ=60)
GCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAAC < SRR4302543.4211250/94‑1 (MQ=60)
CCTCAACGGCACTGTGATTAACTGTATACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTCTCGGTTGTGTCACATAAGTGACGCTGACCG < SRR4302543.7113722/94‑1 (MQ=60)
CTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGG < SRR4302543.6494206/94‑1 (MQ=60)
CTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGG > SRR4302543.4077435/1‑94 (MQ=60)
CTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGG > SRR4302543.4987789/1‑94 (MQ=60)
CTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGG > SRR4302543.7680044/1‑94 (MQ=60)
CTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGG > SRR4302543.7843572/1‑94 (MQ=60)
TCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGC > SRR4302543.305844/1‑94 (MQ=60)
CAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCG > SRR4302543.4137341/1‑94 (MQ=60)
CAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGAG > SRR4302543.3215828/1‑94 (MQ=60)
AACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGA < SRR4302543.4337565/94‑1 (MQ=60)
AACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGA > SRR4302543.1798250/1‑94 (MQ=60)
AACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGA > SRR4302543.278555/1‑94 (MQ=60)
AACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGA > SRR4302543.5568532/1‑94 (MQ=60)
ACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAA < SRR4302543.6729654/94‑1 (MQ=60)
ACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAA < SRR4302543.1124885/94‑1 (MQ=60)
GGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACT > SRR4302543.6824311/1‑94 (MQ=60)
GCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTT > SRR4302543.3679499/1‑94 (MQ=60)
ACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAA > SRR4302543.1884161/1‑94 (MQ=60)
ACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAA < SRR4302543.3903201/94‑1 (MQ=60)
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CTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAAT < SRR4302543.5551428/94‑1 (MQ=60)
CTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAAT > SRR4302543.5113334/1‑94 (MQ=60)
CTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAAT < SRR4302543.7203767/94‑1 (MQ=60)
CTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAAT > SRR4302543.17383/1‑94 (MQ=60)
TGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATG < SRR4302543.1282541/94‑1 (MQ=60)
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GTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGC > SRR4302543.2108232/1‑94 (MQ=60)
TGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCG < SRR4302543.6665098/94‑1 (MQ=60)
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ATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGAT > SRR4302543.3185406/1‑94 (MQ=60)
TTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATC < SRR4302543.3552526/94‑1 (MQ=60)
TTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATC > SRR4302543.7522954/1‑94 (MQ=60)
TAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGATGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCT < SRR4302543.1317285/94‑1 (MQ=60)
TAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCT > SRR4302543.7950243/1‑94 (MQ=60)
TAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCT < SRR4302543.2794355/94‑1 (MQ=60)
AACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATTGCCTTTACTTATCGGTTGTTTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTT < SRR4302543.2704812/94‑1 (MQ=60)
AACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTT > SRR4302543.5509700/1‑94 (MQ=60)
AACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTT < SRR4302543.2401922/94‑1 (MQ=60)
AACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTT > SRR4302543.6142557/1‑94 (MQ=60)
ACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTT < SRR4302543.6633710/94‑1 (MQ=60)
ACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTT > SRR4302543.2653724/1‑94 (MQ=60)
CAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTT > SRR4302543.103844/1‑94 (MQ=60)
AATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTT < SRR4302543.6021284/94‑1 (MQ=60)
AATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTT < SRR4302543.1785018/94‑1 (MQ=60)
ATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTT > SRR4302543.6572366/1‑94 (MQ=60)
ATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTT > SRR4302543.7052704/1‑94 (MQ=60)
ATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTT < SRR4302543.5618650/94‑1 (MQ=60)
ATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTT > SRR4302543.7156395/1‑94 (MQ=60)
ATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTT > SRR4302543.1552165/1‑94 (MQ=60)
TAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAATGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTC > SRR4302543.116516/1‑94 (MQ=60)
TAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTG < SRR4302543.7357166/94‑1 (MQ=60)
AAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGT > SRR4302543.5985192/1‑94 (MQ=60)
AACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTC > SRR4302543.710650/1‑94 (MQ=60)
AACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTC > SRR4302543.3510774/1‑94 (MQ=60)
AACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTC > SRR4302543.3510775/1‑94 (MQ=60)
ACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCA > SRR4302543.6725324/1‑94 (MQ=60)
ACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCA < SRR4302543.884890/94‑1 (MQ=60)
ACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCA > SRR4302543.1485797/1‑94 (MQ=60)
ACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCA < SRR4302543.2228589/94‑1 (MQ=60)
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CTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATATTTTTTGTCAG > SRR4302543.6037656/1‑94 (MQ=60)
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TTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTA > SRR4302543.218396/1‑94 (MQ=60)
TAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAG < SRR4302543.3514229/94‑1 (MQ=60)
TAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGGGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATACGATCTTTTTTGTCAGTAA > SRR4302543.563353/1‑94 (MQ=60)
ATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGGACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGAT > SRR4302543.3160505/1‑94 (MQ=60)
ATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGCACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGAT > SRR4302543.633687/1‑94 (MQ=60)
ATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGAT < SRR4302543.1689449/94‑1 (MQ=60)
ATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGAT < SRR4302543.4192943/94‑1 (MQ=60)
ATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGAT > SRR4302543.4708282/1‑94 (MQ=60)
ATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGAT > SRR4302543.6587507/1‑94 (MQ=60)
ATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGAT < SRR4302543.3329708/94‑1 (MQ=60)
ATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGAT > SRR4302543.5856755/1‑94 (MQ=60)
TTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATA > SRR4302543.7588376/1‑94 (MQ=60)
TTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATA < SRR4302543.4446793/94‑1 (MQ=60)
TCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAG < SRR4302543.6306896/94‑1 (MQ=60)
TCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCAATCTTTTTTGTCAGTAGATAG < SRR4302543.6571441/94‑1 (MQ=60)
CGATTTCCTGAGCCATGGCTTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGT < SRR4302543.3130881/94‑1 (MQ=60)
CGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGT > SRR4302543.5061922/1‑94 (MQ=60)
CGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGT > SRR4302543.6002694/1‑94 (MQ=60)
CGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGT < SRR4302543.4750357/94‑1 (MQ=60)
CGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGT > SRR4302543.4333/1‑94 (MQ=60)
GATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTA > SRR4302543.1906937/1‑94 (MQ=60)
GATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTA > SRR4302543.7959398/1‑94 (MQ=60)
ATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTAT < SRR4302543.3959706/94‑1 (MQ=60)
ATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTAT > SRR4302543.7714509/1‑94 (MQ=60)
ATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTAT > SRR4302543.4710116/1‑94 (MQ=60)
ATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTAT > SRR4302543.3047179/1‑94 (MQ=60)
TTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTT > SRR4302543.723656/1‑94 (MQ=60)
TTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTT < SRR4302543.2765538/94‑1 (MQ=60)
TTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTT > SRR4302543.3825564/1‑94 (MQ=60)
TTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTT > SRR4302543.3532/1‑94 (MQ=60)
TTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTT < SRR4302543.5383262/94‑1 (MQ=60)
TTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTT < SRR4302543.7818455/94‑1 (MQ=60)
TTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTT < SRR4302543.7710742/94‑1 (MQ=60)
TCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTT < SRR4302543.1174656/94‑1 (MQ=60)
CCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTG > SRR4302543.6056203/1‑94 (MQ=60)
CCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTG > SRR4302543.1801685/1‑94 (MQ=60)
CCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTG > SRR4302543.6680516/1‑94 (MQ=60)
TGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCG < SRR4302543.3747467/94‑1 (MQ=60)
TGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCG < SRR4302543.4417475/94‑1 (MQ=60)
TGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCG > SRR4302543.4175872/1‑94 (MQ=60)
TGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCG < SRR4302543.5789232/94‑1 (MQ=60)
TGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCG > SRR4302543.7415253/1‑94 (MQ=60)
AGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCC > SRR4302543.4121670/1‑94 (MQ=60)
AGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCC > SRR4302543.199516/1‑94 (MQ=60)
GCCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATGTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCA > SRR4302543.5412891/1‑94 (MQ=60)
CCATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAA > SRR4302543.3937752/1‑94 (MQ=60)
CATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACGTAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAA < SRR4302543.5290354/94‑1 (MQ=60)
ATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAAT < SRR4302543.5461154/94‑1 (MQ=60)
ATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAAT > SRR4302543.5994693/1‑94 (MQ=60)
ATGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAAT < SRR4302543.7146155/94‑1 (MQ=60)
TGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATT < SRR4302543.4232015/94‑1 (MQ=60)
TGGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATT < SRR4302543.6077078/94‑1 (MQ=60)
GTCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGGCGATGAACGGCGAACTGAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTG < SRR4302543.1048068/94‑1 (MQ=60)
GGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCCGGAGATAGTATTTTGCGCCAAATTG > SRR4302543.7991596/1‑94 (MQ=60)
GGCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTG < SRR4302543.1048069/94‑1 (MQ=60)
GCCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGC > SRR4302543.6347830/1‑94 (MQ=60)
CCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCC < SRR4302543.6760443/94‑1 (MQ=60)
CCTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCC > SRR4302543.455490/1‑94 (MQ=60)
CTTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCA > SRR4302543.1804029/1‑94 (MQ=60)
TTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCAT < SRR4302543.2368617/94‑1 (MQ=60)
TTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCAT < SRR4302543.3441003/94‑1 (MQ=60)
TTTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCAT < SRR4302543.7216960/94‑1 (MQ=60)
TTTACTTATCGGTTGAGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCAT > SRR4302543.2841840/1‑94 (MQ=60)
CTTACTTATCCGTTTTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCAT < SRR4302543.6447497/94‑1 (MQ=60)
TTACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATG < SRR4302543.7619225/94‑1 (MQ=60)
ACTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCA < SRR4302543.3013942/94‑1 (MQ=60)
CTTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAA > SRR4302543.5930825/1‑94 (MQ=60)
TTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAAC < SRR4302543.3092492/94‑1 (MQ=60)
TTATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAAC > SRR4302543.6479205/1‑94 (MQ=60)
TATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACG < SRR4302543.2722452/94‑1 (MQ=60)
ATCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACGG > SRR4302543.1074863/1‑94 (MQ=60)
TCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACGGG < SRR4302543.432290/94‑1 (MQ=60)
TCGGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACGGG < SRR4302543.2226452/94‑1 (MQ=60)
GGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACGGGCA > SRR4302543.6593251/1‑94 (MQ=60)
GGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACGGGCA > SRR4302543.5615539/1‑94 (MQ=60)
GGTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACGGGCA > SRR4302543.4167923/1‑94 (MQ=60)
GTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACGGGCAA > SRR4302543.3962007/1‑94 (MQ=60)
GTTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACGGGCAA < SRR4302543.23050/94‑1 (MQ=60)
TTGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTTATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTCTTTTGCGCCAAATTGCCATGCCACCGGCAAT > SRR4302543.3138841/1‑94 (MQ=60)
TGTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACGGGCAATT < SRR4302543.6187507/94‑1 (MQ=60)
TATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACGGGCAATT < SRR4302543.4719427/94‑1 (MQ=60)
GTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACGGGCAATTT > SRR4302543.329992/1‑94 (MQ=60)
GTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACGGGCAATTT < SRR4302543.5946527/94‑1 (MQ=60)
GTGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACGGGCAATTT > SRR4302543.5661303/1‑94 (MQ=60)
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CGTATTGAGATGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACGGGCAATTT > NC_000913/3198532‑3198718
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |