Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,212,918 |
A→G |
V66A (GTC→GCC) |
ygjF ← |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,212,918 | 0 | A | G | 99.4%
| 488.7
/ NA
| 157 | V66A (GTC→GCC) | ygjF | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (77/79); minor base T (0/1); total (77/80) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
TTTTTTCAATCAGCTTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGACGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGCCTGATATATCACCTTCCAGAAG > NC_000913/3212829‑3213007
|
ttttttCAATCAGCTTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGgcgc > 2:3086448/1‑93 (MQ=255)
ttCAATCAGCTTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCcaca < 2:4365546/93‑1 (MQ=255)
tCAATCAGCTTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACaa < 2:1661388/93‑1 (MQ=255)
tCAATCAGCTTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACaa < 1:4373321/93‑1 (MQ=255)
tCAATCAGCTTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACaa < 2:4004067/93‑1 (MQ=255)
tCAATCAGCTTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACaa < 2:4274324/93‑1 (MQ=255)
aaTCAGCTTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACg > 1:3409323/1‑93 (MQ=255)
aTCAGCTTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGa > 1:747159/1‑93 (MQ=255)
aTCAGCTTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGa < 1:2199259/93‑1 (MQ=255)
tCAGCTTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGAt > 2:1423887/1‑93 (MQ=255)
tCAGCTTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGAt > 2:385987/1‑93 (MQ=255)
tCAGCTTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGAt < 1:1951566/93‑1 (MQ=255)
tCAGCTTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGAt < 1:206739/93‑1 (MQ=255)
aGCTTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATaa > 2:1744800/1‑93 (MQ=255)
ttACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATcc > 1:1308894/1‑93 (MQ=255)
ttACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATcc < 1:2879415/93‑1 (MQ=255)
ttACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATcc > 1:296268/1‑93 (MQ=255)
ttACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATcc < 1:3256000/93‑1 (MQ=255)
ttACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATcc > 2:4557679/1‑93 (MQ=255)
tACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCca > 1:2899661/1‑93 (MQ=255)
gcccgccTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCcagca < 1:4337954/93‑1 (MQ=255)
gcccgccTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCcagca < 2:2974555/93‑1 (MQ=255)
cccgccTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCcagcag < 2:2069940/93‑1 (MQ=255)
cccgccTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCcagcag > 1:3256243/1‑93 (MQ=255)
cccgccTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCcagcag > 2:3116560/1‑93 (MQ=255)
ccgccTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGa > 1:3032221/1‑93 (MQ=255)
ccgccTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGa > 2:4592553/1‑93 (MQ=255)
ccgccTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGa < 1:368648/93‑1 (MQ=255)
cgccTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGAt < 2:3381727/93‑1 (MQ=255)
gccTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAACCTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATg < 2:2621257/93‑1 (MQ=255)
ccTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGc < 2:3835691/93‑1 (MQ=255)
ccTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGc > 2:2547796/1‑93 (MQ=255)
cTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCt < 2:2066554/93‑1 (MQ=255)
tGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAGCTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGTCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCtg < 2:1075136/93‑1 (MQ=255)
tGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCtg > 1:4070213/1‑93 (MQ=255)
gCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCtgt > 2:631034/1‑93 (MQ=255)
tgtAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGcc > 1:3131840/1‑93 (MQ=255)
tgtAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGcc > 1:2168326/1‑93 (MQ=255)
gtAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCCTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGATGTGcgc > 2:4100571/1‑91 (MQ=255)
tAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCCGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAACAGATGCTGTGcctc > 2:2379220/1‑93 (MQ=255)
tAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGcctc > 1:521530/1‑93 (MQ=255)
gCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGcctcct < 1:1345194/93‑1 (MQ=255)
cTCCTGCTTTGAATCTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGGCTCCTg > 2:107691/1‑93 (MQ=255)
cTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTg < 1:2707138/93‑1 (MQ=255)
cTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTg < 1:827940/93‑1 (MQ=255)
cTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTg < 1:1292613/93‑1 (MQ=255)
tCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTgg > 2:433289/1‑92 (MQ=255)
tCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGc > 1:3974565/1‑93 (MQ=255)
tCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGc > 1:1212461/1‑93 (MQ=255)
tCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGGCTACCCGATTGGTGGCGCCACAACGATAATTCAGCAGACGCTGTGCctgctgg > 2:3301376/1‑92 (MQ=255)
ccTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCg < 1:4229472/93‑1 (MQ=255)
cTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCgg > 2:3534/1‑93 (MQ=255)
cTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCgg < 2:4016273/93‑1 (MQ=255)
tGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGc < 2:1011791/93‑1 (MQ=255)
tGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGCTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGc < 2:869374/93‑1 (MQ=255)
gCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCt > 2:1230215/1‑93 (MQ=255)
gCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCt > 1:1999963/1‑93 (MQ=255)
gCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCt < 1:4524592/93‑1 (MQ=255)
ttGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCa > 2:2838574/1‑93 (MQ=255)
tGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCaa > 1:1912626/1‑93 (MQ=255)
gAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAAc > 2:3973999/1‑93 (MQ=255)
gAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAAc < 1:4538064/93‑1 (MQ=255)
gAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAAc < 2:2341960/93‑1 (MQ=255)
gAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAAc < 1:608816/93‑1 (MQ=255)
aaCTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGATTGAACTg > 1:1965043/1‑93 (MQ=255)
aaCGTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTg < 1:1847145/93‑1 (MQ=255)
aCTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGa > 2:4427987/1‑93 (MQ=255)
cTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGAc < 2:1861517/93‑1 (MQ=255)
tcgttGGCTTGCGCCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAAAGATAATCCAGCAGAGGCTGTCCCTCCTGCGGCTTCAACTGAcgg < 2:2299906/90‑1 (MQ=255)
tCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGAcgg < 1:4123925/93‑1 (MQ=255)
cATTGGCTTGCCCCGTTTGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGGGCCTCCTGCGGCTTCAACTGAcggt < 1:4144737/93‑1 (MQ=255)
cATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGAcggt < 2:2634601/93‑1 (MQ=255)
cATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGAcggt > 1:3681112/1‑93 (MQ=255)
aTTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGAcggtc > 1:2313517/1‑93 (MQ=255)
ttGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGAcggtcg < 2:4141301/93‑1 (MQ=255)
ggCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGAcggtcggt > 2:15186/1‑93 (MQ=255)
ttGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTcaa > 2:4545263/1‑93 (MQ=255)
ttGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTaaa > 1:1056658/1‑93 (MQ=255)
ttGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTaaa > 1:2951659/1‑93 (MQ=255)
tGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAAc > 2:531304/1‑93 (MQ=255)
gCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAAcc > 1:2877064/1‑93 (MQ=255)
gCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAAcc > 2:973748/1‑93 (MQ=255)
gCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAAcc > 1:65213/1‑93 (MQ=255)
ccGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACACgg > 2:684337/1‑93 (MQ=255)
gTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGcc < 1:3718414/93‑1 (MQ=255)
ttGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGCCt > 1:2998284/1‑93 (MQ=255)
gACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGCCTGat < 1:15394/93‑1 (MQ=255)
aCGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGCCTGata > 2:3842223/1‑93 (MQ=255)
aCGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGCCTGata < 2:434490/93‑1 (MQ=255)
gTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGCCTGatatat < 2:3065837/93‑1 (MQ=255)
gTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGCCTGatatat > 2:2889601/1‑93 (MQ=255)
cTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGCCTGATATATCa < 2:2210240/93‑1 (MQ=255)
tACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGCCTGATATATCAc < 2:2696553/93‑1 (MQ=255)
ccAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGCCTGATATATCACCt < 1:3157547/93‑1 (MQ=255)
ccAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGCCTGATATATCACCt > 2:4321583/1‑93 (MQ=255)
cAGTTTGGTGGCGGCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGCCTGATATATCACCtt > 2:4606833/1‑93 (MQ=255)
aGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGCCTGATATATCACCTTc < 2:1330928/93‑1 (MQ=255)
tttGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGCCTGATATATCACCTTCCa < 1:3511139/93‑1 (MQ=255)
gTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGCCTGATATATCACCTTCCAGAAg < 1:920780/93‑1 (MQ=255)
gTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGCCTGATATATCACCTTCCAGAAg < 2:3245487/93‑1 (MQ=255)
|
TTTTTTCAATCAGCTTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGACGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGCCTGATATATCACCTTCCAGAAG > NC_000913/3212829‑3213007
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TCAATTTTTTCAATCAGCTTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGACGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGCCTGATATATCACCTTCCAGAAGCGAT > NC_000913/3212825‑3213011
|
TCAATTTTTTCAATCAGCTTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGG < SRR4302535.994438/94‑1 (MQ=60)
TCAATTTTTTCAATCAGCTTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGG > SRR4302535.4076877/1‑94 (MQ=60)
CAATTTTTTCAATCAGCTTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGGCGGGCTACCAGTTTGGTGGC > SRR4302535.3653923/1‑94 (MQ=60)
TTTTTTCAATCAGCTTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCC < SRR4302535.975629/94‑1 (MQ=60)
TCAATCAGCTTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAAC < SRR4302535.4403241/94‑1 (MQ=60)
CAATCAGCTTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACG > SRR4302535.3433049/1‑94 (MQ=60)
AATCAGCTTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGA > SRR4302535.752417/1‑94 (MQ=60)
ATCAGCTTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGAT > SRR4302535.142922/1‑94 (MQ=60)
ATCAGCTTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGAT < SRR4302535.2214931/94‑1 (MQ=60)
TCAGCTTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATA < SRR4302535.1965611/94‑1 (MQ=60)
TCAGCTTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATA < SRR4302535.208157/94‑1 (MQ=60)
AGCTTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAAT > SRR4302535.3873667/1‑94 (MQ=60)
AGCTTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAAT > SRR4302535.709568/1‑94 (MQ=60)
CTTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCC > SRR4302535.298333/1‑94 (MQ=60)
CTTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCC > SRR4302535.1318246/1‑94 (MQ=60)
TTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCA > SRR4302535.2920162/1‑94 (MQ=60)
TTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCA < SRR4302535.2899800/94‑1 (MQ=60)
TTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCA < SRR4302535.3278623/94‑1 (MQ=60)
TTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCA > SRR4302535.4566630/1‑94 (MQ=60)
TACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAG < SRR4302535.1310064/94‑1 (MQ=60)
ACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGC > SRR4302535.816400/1‑94 (MQ=60)
GCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAG > SRR4302535.3278868/1‑94 (MQ=60)
GCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAG < SRR4302535.4367620/94‑1 (MQ=60)
GCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGGCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAG > SRR4302535.2299140/1‑94 (MQ=60)
CCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGA < SRR4302535.4591287/94‑1 (MQ=60)
CCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGA > SRR4302535.3053449/1‑94 (MQ=60)
CCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGAT < SRR4302535.371192/94‑1 (MQ=60)
CCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGAT < SRR4302535.371193/94‑1 (MQ=60)
CGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATG < SRR4302535.1567789/94‑1 (MQ=60)
GCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGC < SRR4302535.4374680/94‑1 (MQ=60)
CTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTG > SRR4302535.3343056/1‑94 (MQ=60)
CTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTG > SRR4302535.4098066/1‑94 (MQ=60)
GTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCC > SRR4302535.3153650/1‑94 (MQ=60)
GTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCC > SRR4302535.2183864/1‑94 (MQ=60)
TGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCT < SRR4302535.194121/94‑1 (MQ=60)
GTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTC > SRR4302535.525179/1‑94 (MQ=60)
GCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTG < SRR4302535.217977/94‑1 (MQ=60)
GCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTG < SRR4302535.1354799/94‑1 (MQ=60)
CTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGC < SRR4302535.833736/94‑1 (MQ=60)
CTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGC < SRR4302535.1301823/94‑1 (MQ=60)
CTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGC > SRR4302535.1221159/1‑94 (MQ=60)
CTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGC > SRR4302535.4001714/1‑94 (MQ=60)
CTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGC < SRR4302535.2726483/94‑1 (MQ=60)
CCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGG < SRR4302535.4258418/94‑1 (MQ=60)
TGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCT < SRR4302535.3276532/94‑1 (MQ=60)
TGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCT > SRR4302535.2014374/1‑94 (MQ=60)
GCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTT < SRR4302535.4555590/94‑1 (MQ=60)
TTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCA > SRR4302535.2905441/1‑94 (MQ=60)
TTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAA > SRR4302535.1926408/1‑94 (MQ=60)
TTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAA > SRR4302535.3614674/1‑94 (MQ=60)
GAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACT < SRR4302535.617394/94‑1 (MQ=60)
GAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACT < SRR4302535.613062/94‑1 (MQ=60)
GAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACT < SRR4302535.4569109/94‑1 (MQ=60)
AAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGATTGAACTG > SRR4302535.1979208/1‑94 (MQ=60)
AACGTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGA < SRR4302535.1860458/94‑1 (MQ=60)
ACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGAC < SRR4302535.2836439/94‑1 (MQ=60)
TCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGT < SRR4302535.4152145/94‑1 (MQ=60)
TCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGT > SRR4302535.3706589/1‑94 (MQ=60)
CATTGGCTTGCCCCGTTTGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGGGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTC < SRR4302535.4173118/94‑1 (MQ=60)
CATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTC > SRR4302535.2330072/1‑94 (MQ=60)
TGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGT > SRR4302535.2722779/1‑94 (MQ=60)
GGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTA > SRR4302535.1261968/1‑94 (MQ=60)
CTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAA > SRR4302535.1064170/1‑94 (MQ=60)
CTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAA > SRR4302535.3037472/1‑94 (MQ=60)
CTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAA > SRR4302535.2972395/1‑94 (MQ=60)
TTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAAC > SRR4302535.416122/1‑94 (MQ=60)
TTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAAC < SRR4302535.4135088/94‑1 (MQ=60)
TGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACC > SRR4302535.2897440/1‑94 (MQ=60)
TGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACC > SRR4302535.65704/1‑94 (MQ=60)
CGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGCC < SRR4302535.4270939/94‑1 (MQ=60)
GTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGCCT > SRR4302535.3019309/1‑94 (MQ=60)
GTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGCCT < SRR4302535.3744175/94‑1 (MQ=60)
TGGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACAGTCGGTAAACCCGGCCTGA < SRR4302535.3011831/94‑1 (MQ=60)
GGACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGCCTGAT < SRR4302535.3175993/94‑1 (MQ=60)
GACGGTCTACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGCCTGATA < SRR4302535.15508/94‑1 (MQ=60)
TACCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGCCTGATATATCACC < SRR4302535.207715/94‑1 (MQ=60)
CCAGTTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGCCTGATATATCACCTT < SRR4302535.3179467/94‑1 (MQ=60)
TTTGGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGCCTGATATATCACCTTCCAG < SRR4302535.3535536/94‑1 (MQ=60)
TTGGTGGCGCCACACCGATAATCCAGCAGATGCTGCGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAATCCCGGCCTGATATATCACCTTCCAGA < SRR4302535.3447772/94‑1 (MQ=60)
GGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGCCTGATATATCACCTTCCAGAAG < SRR4302535.1974511/94‑1 (MQ=60)
GGTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGCCTGATATATCACCTTCCAGAAG < SRR4302535.2971209/94‑1 (MQ=60)
GTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGCCTGATATATCACCTTCCAGAAGC > SRR4302535.1336787/1‑94 (MQ=60)
GTGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGCCTGATATATCACCTTCCAGAAGC < SRR4302535.927312/94‑1 (MQ=60)
TGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGCCTGATATATCACCTTCCAGAAGCG < SRR4302535.4554505/94‑1 (MQ=60)
TGGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGCCTGATATATCACCTTCCAGAAGCG < SRR4302535.4096529/94‑1 (MQ=60)
GGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGCCTGATATATCACCTTCCAGAAGCGA > SRR4302535.498415/1‑94 (MQ=60)
GGCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGCCTGATATATCACCTTCCAGAAGCGA < SRR4302535.1008601/94‑1 (MQ=60)
GCGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGCCTGATATATCACCTTCCAGAAGCGAT < SRR4302535.2088361/94‑1 (MQ=60)
|
TCAATTTTTTCAATCAGCTTACGCCCGCCTGCGTGTAGCTCCTGCTTTGAAACTTCATTGGCTTGCACCGTTGGACGGTCTACCAGTTTGGTGACGCCACAACGATAATCCAGCAGATGCTGTGCCTCCTGCGGCTTCAACTGACGGTCGGTAAACCCGGCCTGATATATCACCTTCCAGAAGCGAT > NC_000913/3212825‑3213011
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
