Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,251,675 |
A→G |
R60R (CGT→CGC) |
yhaJ ← |
putative transcriptional regulator LYSR‑type |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,251,675 | 0 | A | G | 99.5%
| 662.4
/ ‑5.2
| 213 | R60R (CGT→CGC) | yhaJ | putative transcriptional regulator LYSR‑type |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (117/95); total (118/95) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.70e-01 |
Only 100 of 217 total aligned reads displayed.
AGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGCACGCGTCCC > NC_000913/3251585‑3251762
|
cTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGAt < 2:1848825/93‑1 (MQ=255)
tCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATgg < 2:1215480/93‑1 (MQ=255)
cGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGcc > 2:4002767/1‑93 (MQ=255)
gCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGccc > 2:1500199/1‑93 (MQ=255)
aTCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGa < 2:3530139/93‑1 (MQ=255)
aTCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGa < 1:1003492/93‑1 (MQ=255)
tCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAg > 1:1538506/1‑93 (MQ=255)
tCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAg < 1:3656733/93‑1 (MQ=255)
tCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAg < 1:1796126/93‑1 (MQ=255)
tCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAg > 1:1877851/1‑93 (MQ=255)
cAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGc > 2:3443959/1‑93 (MQ=255)
cAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGc < 2:3005880/93‑1 (MQ=255)
gtagtCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCGAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCGCCCGACATTGGTCAGTTTGGTGCGATGGCCCGAGCgg > 2:3035901/1‑93 (MQ=255)
tagtCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGt > 1:2886313/1‑93 (MQ=255)
tagtCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGt > 2:4278872/1‑93 (MQ=255)
tagtCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTACCGACATTGGCGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCggc > 2:3811480/1‑92 (MQ=255)
gtCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCa > 1:780219/1‑93 (MQ=255)
gtCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCa > 2:1302634/1‑93 (MQ=255)
gtCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCa > 1:3462991/1‑93 (MQ=255)
cAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCaaa < 2:2758973/93‑1 (MQ=255)
cAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCaaa < 1:1576545/93‑1 (MQ=255)
cAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACACCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCaaa < 1:2939189/93‑1 (MQ=255)
aGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAAc > 2:2451421/1‑93 (MQ=255)
aGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAAc < 1:1919844/93‑1 (MQ=255)
aGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAAc > 2:1613905/1‑93 (MQ=255)
gTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACa > 1:1388909/1‑93 (MQ=255)
tttATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAg < 2:3383921/93‑1 (MQ=255)
ttATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGc > 1:1185043/1‑93 (MQ=255)
tATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGcc > 2:11368/1‑92 (MQ=255)
tGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGcaccac < 1:2631675/93‑1 (MQ=255)
tCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGc > 1:4571813/1‑93 (MQ=255)
ccAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGct < 2:1676296/93‑1 (MQ=255)
cAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGctc > 1:269586/1‑93 (MQ=255)
aGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGTCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGctct < 2:3096887/93‑1 (MQ=255)
cAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCtcttc < 1:65165/93‑1 (MQ=255)
aaaaCGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCtcttct > 2:2190801/1‑93 (MQ=255)
aaaCGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTcttctt < 1:1095237/93‑1 (MQ=255)
aaCGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGTCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCttcttc < 1:1981027/93‑1 (MQ=255)
gcgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAg < 1:95492/93‑1 (MQ=255)
cgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGt > 1:2263677/1‑93 (MQ=255)
cgcCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGt < 2:1779022/93‑1 (MQ=255)
cccTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGttt < 1:3371159/93‑1 (MQ=255)
cTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCACGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGctttt > 1:438773/1‑93 (MQ=255)
cTCGCTCCAACAACACCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCCCATCCAGCTCTTCTTCCAGttttt < 1:2495334/93‑1 (MQ=255)
tCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTg > 1:2582871/1‑93 (MQ=255)
tCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTg > 2:697784/1‑93 (MQ=255)
tCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTg > 1:4142414/1‑93 (MQ=255)
tCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTg > 2:1769943/1‑93 (MQ=255)
tCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTg > 1:3928828/1‑93 (MQ=255)
cGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGTCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGc < 2:507050/93‑1 (MQ=255)
gCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCa < 2:1069728/93‑1 (MQ=255)
cTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCAt < 1:4658145/93‑1 (MQ=255)
tCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATg < 1:4353078/93‑1 (MQ=255)
ccAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGACCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATgg > 2:3179199/1‑93 (MQ=255)
aacaacATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGgtg > 2:434190/1‑93 (MQ=255)
aacaacATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGgtg > 2:3115246/1‑93 (MQ=255)
aacaacATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGgtg > 1:3635929/1‑93 (MQ=255)
aacaacATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGATTTTGCATGgtg > 2:2418814/1‑93 (MQ=255)
acaacaTCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGgtgt > 1:1108738/1‑93 (MQ=255)
acaacaTCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGgtgt > 2:3717320/1‑93 (MQ=255)
acaacaTCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGgtgt > 1:1951838/1‑93 (MQ=255)
caacaTCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCCTGGTGTa > 1:741036/1‑93 (MQ=255)
aacaTCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAg > 2:2669009/1‑93 (MQ=255)
acaTCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGc < 1:434140/93‑1 (MQ=255)
acaTCCTCCCGACATTGGCGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCAAGTTTTTGCATGGTGAAGc > 1:3758017/1‑93 (MQ=255)
acaTCCTCCCGACATTAGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGc < 2:4198354/93‑1 (MQ=255)
caTCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCt > 2:2059932/1‑93 (MQ=255)
aTCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTa > 2:223219/1‑93 (MQ=255)
tcctccCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTaa > 1:1166311/1‑93 (MQ=255)
ctccCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGt < 2:4404983/93‑1 (MQ=255)
ctccCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGt < 1:3678247/93‑1 (MQ=255)
ctccCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGt < 1:2230653/93‑1 (MQ=255)
tccCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTg > 2:1267180/1‑93 (MQ=255)
cccGACATTGGTGAATTTGGTGCGACGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGtcc < 1:4530871/93‑3 (MQ=255)
ccGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCg > 1:2445271/1‑93 (MQ=255)
ccGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCg < 2:3250588/93‑1 (MQ=255)
cGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCgg < 2:3852499/93‑1 (MQ=255)
gACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGa > 2:898374/1‑93 (MQ=255)
gACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGa > 2:1464729/1‑93 (MQ=255)
aCATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGaa > 2:829906/1‑93 (MQ=255)
aCATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGaa > 1:1614306/1‑93 (MQ=255)
cATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAg < 1:2154651/93‑1 (MQ=255)
aTTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAgg > 1:4180911/1‑93 (MQ=255)
aTTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAgg > 1:582970/1‑93 (MQ=255)
ttGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGc > 1:3272869/1‑93 (MQ=255)
ttGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGc < 2:3878761/93‑1 (MQ=255)
ttGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGc < 2:3634611/93‑1 (MQ=255)
ggTGAATTTGGTGCGATGTCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGCAc < 2:2025821/93‑1 (MQ=255)
ggTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGCAc < 1:1402753/93‑1 (MQ=255)
ggTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGCAc < 1:3001841/93‑1 (MQ=255)
ggTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGCAc > 2:4565703/1‑93 (MQ=255)
ggTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGCAc > 2:2623704/1‑93 (MQ=255)
tGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGCAcgc < 1:3727391/93‑1 (MQ=255)
gAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGCAcgcg < 1:4641949/93‑1 (MQ=255)
aaTTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGCAcgcgc > 2:685226/1‑92 (MQ=255)
aTTTGGTGCGATGTCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTTCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGTCACGCGTc < 2:608505/93‑1 (MQ=255)
aTTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGCACGCGTc < 1:3112657/93‑1 (MQ=255)
tttGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGCACGCGTcc > 2:3948814/1‑93 (MQ=255)
tttGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGCACGCGTcc > 1:4095441/1‑93 (MQ=255)
tttGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGCACGCGTcc > 2:3489905/1‑93 (MQ=255)
|
AGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGCACGCGTCCC > NC_000913/3251585‑3251762
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGCACGCGTCCCAGCTC > NC_000913/3251582‑3251767
|
GAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTG > SRR4302535.4679736/1‑94 (MQ=60)
GAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTG > SRR4302535.52440/1‑94 (MQ=60)
GAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTG < SRR4302535.1350734/94‑1 (MQ=60)
AGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGC > SRR4302535.1634041/1‑94 (MQ=60)
GAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCG > SRR4302535.2931816/1‑94 (MQ=60)
GCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGAT < SRR4302535.2615461/94‑1 (MQ=60)
TCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGC < SRR4302535.2500775/94‑1 (MQ=60)
CGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGTCCC < SRR4302535.160621/94‑1 (MQ=60)
CATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGA > SRR4302535.1015293/1‑94 (MQ=60)
ATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAG < SRR4302535.1986492/94‑1 (MQ=60)
ATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAG < SRR4302535.1010616/94‑1 (MQ=60)
ATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAG > SRR4302535.1891378/1‑94 (MQ=60)
ATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAG > SRR4302535.1549594/1‑94 (MQ=60)
TCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGC < SRR4302535.3682044/94‑1 (MQ=60)
TCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGC < SRR4302535.1809111/94‑1 (MQ=60)
GTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGT > SRR4302535.2906735/1‑94 (MQ=60)
TAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTC < SRR4302535.4257662/94‑1 (MQ=60)
AGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCA < SRR4302535.2123390/94‑1 (MQ=60)
AGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCA > SRR4302535.3487062/1‑94 (MQ=60)
AGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCA > SRR4302535.4479501/1‑94 (MQ=60)
AGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCA > SRR4302535.785695/1‑94 (MQ=60)
GTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAA > SRR4302535.2356983/1‑94 (MQ=60)
CAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAAC < SRR4302535.1587922/94‑1 (MQ=60)
CAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAAC > SRR4302535.4620949/1‑94 (MQ=60)
CAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACACCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAAC < SRR4302535.2959861/94‑1 (MQ=60)
CAGTTTATCTGAGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAAC > SRR4302535.3031495/1‑94 (MQ=60)
AGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACA < SRR4302535.1933682/94‑1 (MQ=60)
AGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACA > SRR4302535.1398823/1‑94 (MQ=60)
TTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGC > SRR4302535.1193510/1‑94 (MQ=60)
TTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCA > SRR4302535.3699034/1‑94 (MQ=60)
TATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCAC > SRR4302535.4151523/1‑94 (MQ=60)
TCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCA > SRR4302535.3316047/1‑94 (MQ=60)
TGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACA < SRR4302535.2650532/94‑1 (MQ=60)
TGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCAACACA > SRR4302535.536438/1‑94 (MQ=60)
GCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACAT < SRR4302535.3650432/94‑1 (MQ=60)
CGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATC > SRR4302535.709969/1‑94 (MQ=60)
CGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATC < SRR4302535.1510535/94‑1 (MQ=60)
CTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAG > SRR4302535.645487/1‑94 (MQ=60)
CTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAG > SRR4302535.3736571/1‑94 (MQ=60)
TTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGC > SRR4302535.4602983/1‑94 (MQ=60)
TTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGC > SRR4302535.785774/1‑94 (MQ=60)
CCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTC > SRR4302535.271460/1‑94 (MQ=60)
AGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTT > SRR4302535.3237472/1‑94 (MQ=60)
AGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTT > SRR4302535.2254601/1‑94 (MQ=60)
gcAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCT < SRR4302535.2946805/92‑1 (MQ=60)
CAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCT < SRR4302535.2576001/94‑1 (MQ=60)
CAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCT < SRR4302535.65656/94‑1 (MQ=60)
AAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTC < SRR4302535.1103031/94‑1 (MQ=60)
AGCGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGTCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCC < SRR4302535.1914073/94‑1 (MQ=60)
AACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGTCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCC < SRR4302535.1995291/94‑1 (MQ=60)
CGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTTAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAG < SRR4302535.4416329/94‑1 (MQ=60)
CGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAG > SRR4302535.4372008/1‑94 (MQ=60)
GCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGT < SRR4302535.96170/94‑1 (MQ=60)
GCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGT < SRR4302535.1407085/94‑1 (MQ=60)
GCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGT > SRR4302535.2279807/1‑94 (MQ=60)
GCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTT > SRR4302535.1153957/1‑94 (MQ=60)
GCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTT < SRR4302535.3766414/94‑1 (MQ=60)
CCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTT < SRR4302535.1940579/94‑1 (MQ=60)
CCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTT < SRR4302535.3394611/94‑1 (MQ=60)
CCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCACGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGCTTTT > SRR4302535.441841/1‑94 (MQ=60)
CTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTG > SRR4302535.2601429/1‑94 (MQ=60)
CTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTG > SRR4302535.4170779/1‑94 (MQ=60)
CTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTG < SRR4302535.1218298/94‑1 (MQ=60)
CTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTG > SRR4302535.3955664/1‑94 (MQ=60)
CTCGCTCCAACAACACCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCCCATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTG < SRR4302535.2513338/94‑1 (MQ=60)
GCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCAT < SRR4302535.4187631/94‑1 (MQ=60)
CTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATG < SRR4302535.4689658/94‑1 (MQ=60)
TCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGG < SRR4302535.4382869/94‑1 (MQ=60)
CCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGT > SRR4302535.757789/1‑94 (MQ=60)
CCAACAACAACCCCCCGACATTGGTTAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGT < SRR4302535.3494567/94‑1 (MQ=60)
CAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTG < SRR4302535.725374/94‑1 (MQ=60)
CAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTG > SRR4302535.3661125/1‑94 (MQ=60)
AACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGT > SRR4302535.1116658/1‑94 (MQ=60)
AACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGT > SRR4302535.1694440/1‑94 (MQ=60)
AACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGT > SRR4302535.1965885/1‑94 (MQ=60)
ACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCCTGGTGTA > SRR4302535.746243/1‑94 (MQ=60)
ACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTA < SRR4302535.1846635/94‑1 (MQ=60)
AACATCCTCCCGACATTGGCGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCAAGTTTTTGCATGGTGAAGC > SRR4302535.3784002/1‑94 (MQ=60)
ACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCT < SRR4302535.437163/94‑1 (MQ=60)
ACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCT < SRR4302535.4588254/94‑1 (MQ=60)
CATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTA > SRR4302535.1555353/1‑94 (MQ=60)
ATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAA < SRR4302535.3676447/94‑1 (MQ=60)
ATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAA > SRR4302535.1174642/1‑94 (MQ=60)
ATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAA > SRR4302535.2380572/1‑94 (MQ=60)
ATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGCTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATACAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAA > SRR4302535.461213/1‑94 (MQ=60)
CCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGT < SRR4302535.1399634/94‑1 (MQ=60)
CTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTG < SRR4302535.3703706/94‑1 (MQ=60)
CTCCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTG < SRR4302535.2246514/94‑1 (MQ=60)
CCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCG > SRR4302535.2462886/1‑94 (MQ=60)
CCCGACATTGGTGAATTTGGTGCGACGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTCCG < SRR4302535.4561885/94‑1 (MQ=60)
CCGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGG < SRR4302535.4120875/94‑1 (MQ=60)
CGACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGA > SRR4302535.2850127/1‑94 (MQ=60)
GACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAA > SRR4302535.1625941/1‑94 (MQ=60)
GCATTGGTGAATTTGGTGCGATGTCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAG < SRR4302535.1931408/94‑1 (MQ=60)
ACATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAG > SRR4302535.1182146/1‑94 (MQ=60)
CATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGG > SRR4302535.4209525/1‑94 (MQ=60)
CATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGG > SRR4302535.587059/1‑94 (MQ=60)
CATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGG < SRR4302535.2170134/94‑1 (MQ=60)
CATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGG < SRR4302535.2661423/94‑1 (MQ=60)
ATTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGC > SRR4302535.3295603/1‑94 (MQ=60)
TTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGCA < SRR4302535.2990024/94‑1 (MQ=60)
TTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGCA < SRR4302535.404422/94‑1 (MQ=60)
TTGGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGCA < SRR4302535.3932624/94‑1 (MQ=60)
TGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGCACG < SRR4302535.1103059/94‑1 (MQ=60)
GGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGCACG < SRR4302535.1412761/94‑1 (MQ=60)
GGTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGCACG < SRR4302535.3022884/94‑1 (MQ=60)
GTGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGCACGC > SRR4302535.4678893/1‑94 (MQ=60)
TGAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGCACGCG < SRR4302535.3753211/94‑1 (MQ=60)
GAATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGCACGCGT < SRR4302535.4673415/94‑1 (MQ=60)
ATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGCACGCGTCC > SRR4302535.4428230/1‑94 (MQ=60)
ATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGCACGCGTCC > SRR4302535.4123469/1‑94 (MQ=60)
ATTTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGCACGCGTCC < SRR4302535.3134326/94‑1 (MQ=60)
TTGGTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGCACGCGTCCCA < SRR4302535.3456080/94‑1 (MQ=60)
GTGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGCACGCGTCCCAGCT < SRR4302535.3797764/94‑1 (MQ=60)
TGCGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGCACGCGTCCCAGCTC < SRR4302535.3590572/94‑1 (MQ=60)
|
GAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGCACGCGTCCCAGCTC > NC_000913/3251582‑3251767
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 6 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
