Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,257,952 |
T→C |
D703G (GAT→GGT) |
tdcE ← |
putative formate acetyltransferase 3 |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,257,952 | 0 | T | C | 99.5%
| 627.4
/ ‑4.9
| 202 | D703G (GAT→GGT) | tdcE | putative formate acetyltransferase 3 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (107/94); total (107/95) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.70e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.75e-01 |
Only 100 of 210 total aligned reads displayed.
AGGTTAGGATATTTTTCCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACATCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAGCGCCGCAGGAACGATT > NC_000913/3257862‑3258041
|
tAGGATATTTTTCCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCtt > 1:1872777/1‑93 (MQ=255)
tAGGATATATTTCCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCtt > 2:4569830/1‑93 (MQ=255)
aGGATATTTTTCCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTc < 2:3789922/93‑1 (MQ=255)
aGGATATTTTTCCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTc > 1:200842/1‑93 (MQ=255)
gATATTTTTCCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCgt > 1:1640424/1‑93 (MQ=255)
gATATTTTTCCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCgt < 1:2971150/93‑1 (MQ=255)
tatTTTTCCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCgtgg > 2:4117195/1‑93 (MQ=255)
tatTTTTCCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCgtgg > 2:1058697/1‑93 (MQ=255)
atTTTTCCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCgtggt > 2:1012004/1‑93 (MQ=255)
tttttCCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCgtggtg < 2:3521346/93‑1 (MQ=255)
tttttCCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCgtggtg > 1:915957/1‑93 (MQ=255)
tCCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGaaa < 2:693018/93‑1 (MQ=255)
tCCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGaaa < 1:949846/93‑1 (MQ=255)
tCCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGaaa < 1:3827331/93‑1 (MQ=255)
ccGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAAt < 2:3043143/93‑1 (MQ=255)
cGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATa < 1:2683110/93‑1 (MQ=255)
gggTTCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATAc < 1:3195363/93‑1 (MQ=255)
gggTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATAc > 1:4133065/1‑93 (MQ=255)
ggTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATAcc > 2:1282808/1‑93 (MQ=255)
tGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCa < 2:3487381/93‑1 (MQ=255)
tGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCa > 1:3345351/1‑93 (MQ=255)
cTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATc < 2:219142/93‑1 (MQ=255)
tCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATcc > 1:3249257/1‑93 (MQ=255)
cGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCca < 1:1751791/93‑1 (MQ=255)
aTGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCcagc > 2:2897545/1‑93 (MQ=255)
tGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCcagca < 2:647508/93‑1 (MQ=255)
tGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCcagca > 1:1819006/1‑93 (MQ=255)
gCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGTCCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAgg < 2:3124665/93‑1 (MQ=255)
gCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAgg < 2:3206191/93‑1 (MQ=255)
aTCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGcc > 2:2370924/1‑93 (MQ=255)
tCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCg > 2:4249616/1‑93 (MQ=255)
tCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCg < 2:2628522/93‑1 (MQ=255)
gcagcaTTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACaa > 1:718026/1‑93 (MQ=255)
gcagcaTTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGCTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACaa > 2:2283752/1‑93 (MQ=255)
cagcaTTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAg < 1:1519078/93‑1 (MQ=255)
gcaTTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAggt < 2:3160593/93‑1 (MQ=255)
caTTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAggtt > 1:868422/1‑93 (MQ=255)
aTTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAggttg < 1:4330688/93‑1 (MQ=255)
aTTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAggttg < 1:2908242/93‑1 (MQ=255)
aTTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAggttg > 2:1469914/1‑93 (MQ=255)
aTTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAggttg > 2:1372080/1‑93 (MQ=255)
aTTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAggttg > 2:4670157/1‑93 (MQ=255)
aTTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAggttg < 1:1070937/93‑1 (MQ=255)
tttCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAggttgg > 1:3466450/1‑93 (MQ=255)
tttCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAggttgg > 1:1589344/1‑93 (MQ=255)
tttCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAggttgg > 1:4029885/1‑93 (MQ=255)
ttCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAggttggt < 2:1162426/93‑1 (MQ=255)
tCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAggttggtt < 2:3897496/93‑1 (MQ=255)
tCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAggttggtt > 1:4491282/1‑93 (MQ=255)
cccGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGttt < 2:3006942/93‑1 (MQ=255)
ccGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGtttt < 2:2683917/93‑1 (MQ=255)
cGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTa > 1:3674088/1‑93 (MQ=255)
cGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTa < 1:2230196/93‑1 (MQ=255)
aTTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACg < 1:4672982/93‑1 (MQ=255)
aTTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACg > 2:3470685/1‑93 (MQ=255)
aTTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCCACAAGGTTGGTTTTACg > 1:389808/1‑93 (MQ=255)
ttCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGt > 1:529654/1‑93 (MQ=255)
ttCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGt > 1:1428583/1‑93 (MQ=255)
tCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTa > 1:4554810/1‑93 (MQ=255)
tCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTa < 2:3593906/93‑1 (MQ=255)
tCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTa < 1:3309597/93‑1 (MQ=255)
cATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTAc > 1:425541/1‑93 (MQ=255)
cATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTAc > 1:2492123/1‑93 (MQ=255)
cATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGCTGGTTTTACGTAc > 1:54960/1‑93 (MQ=255)
cATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAAAACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTAc > 1:3186114/1‑93 (MQ=255)
aTTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACt > 1:2780340/1‑93 (MQ=255)
aTTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACt > 1:101177/1‑93 (MQ=255)
tACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTgg < 1:4032542/93‑1 (MQ=255)
cgttgacgttgaGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGAt < 1:1225021/93‑1 (MQ=255)
gttgacgttgaGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGAtc > 2:4021366/1‑93 (MQ=255)
gttgacgttgaGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGAtc > 1:2976394/1‑93 (MQ=255)
ttgacgttgaGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGAtct > 2:1573783/1‑93 (MQ=255)
ttgacgttgaGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCATGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGAtct < 1:56515/93‑1 (MQ=255)
gacgttgaGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGAtcttc < 2:4190961/93‑1 (MQ=255)
gacgttgaGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGAtcttc < 2:1935308/93‑1 (MQ=255)
gacgttgaGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGAtcttc < 1:3728796/93‑1 (MQ=255)
gacgttgaGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGAtcttc > 2:1451914/1‑93 (MQ=255)
cgttgaGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATcttctt < 2:3698008/93‑1 (MQ=255)
gttgaGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCttt < 2:1798495/93‑1 (MQ=255)
gttgaGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCCCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCACCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCttt > 2:3309137/1‑93 (MQ=255)
ttgaGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTg > 2:3341073/1‑93 (MQ=255)
tgaGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGc > 2:554576/1‑93 (MQ=255)
aGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGccc < 1:3878782/93‑1 (MQ=255)
ggTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCa < 1:208141/93‑1 (MQ=255)
ggTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCa > 2:3658175/1‑93 (MQ=255)
gtgtTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAg < 2:2553852/93‑1 (MQ=255)
tgtTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAgc < 2:3958045/93‑1 (MQ=255)
gtTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAgcg < 2:337871/93‑1 (MQ=255)
gtTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAgcg > 2:2229008/1‑93 (MQ=255)
tGACCGCCTGCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAGcgcc < 1:4376846/93‑1 (MQ=255)
aCCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAGcgccgc > 1:2250667/1‑93 (MQ=255)
cGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAGCGCCGCAg < 1:984370/93‑1 (MQ=255)
cGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAGCGCCGCAg > 1:2369312/1‑93 (MQ=255)
gCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAGCGCCGCAgg > 2:1701444/1‑93 (MQ=255)
cTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAGCGCCGCAGGaa < 2:4310480/93‑1 (MQ=255)
ttCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAGCGCCGCAGGAAc > 2:3104633/1‑93 (MQ=255)
ttCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAGCGCCGCAGGAAc > 2:2083622/1‑93 (MQ=255)
ttCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTATGCCCAGCGCCGCAGGAAc < 2:4543801/93‑1 (MQ=255)
gACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAGCGCCGCAGGAACGAt > 1:2466648/1‑93 (MQ=255)
acacCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAGCGCCGCAGGAACGAtt < 2:4657497/93‑1 (MQ=255)
|
AGGTTAGGATATTTTTCCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACATCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAGCGCCGCAGGAACGATT > NC_000913/3257862‑3258041
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GTCAGGTTAGGATATTTTTCCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACATCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAGCGCCGCAGGAACGATTGAGA > NC_000913/3257859‑3258045
|
GTCAGGTTAGGATATTTTTCCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACAC > SRR4302535.2639181/1‑94 (MQ=60)
TCAGGTTAGGATATTTTTCCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACC < SRR4302535.2098560/94‑1 (MQ=60)
TCAGGTTAGGATATTTTTCCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACAGCCTTCGACACC > SRR4302535.2542661/1‑94 (MQ=60)
GTTAGGATATTTTTCCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCT > SRR4302535.1699444/1‑94 (MQ=60)
TTAGGATATTTTTCCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTT > SRR4302535.1886271/1‑94 (MQ=60)
TAGGATATTTTTCCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTC > SRR4302535.202214/1‑94 (MQ=60)
GGATATTTTTCCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGT > SRR4302535.3207177/1‑94 (MQ=60)
GGATATTTTTCCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGT > SRR4302535.1652283/1‑94 (MQ=60)
GATATTTTTCCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTG < SRR4302535.2992003/94‑1 (MQ=60)
ATTTTTCCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTG > SRR4302535.922458/1‑94 (MQ=60)
ATTTTTCCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTG < SRR4302535.731943/94‑1 (MQ=60)
ATTTTTCCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTG > SRR4302535.4526893/1‑94 (MQ=60)
ATTTTTCCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTG < SRR4302535.3391182/94‑1 (MQ=60)
TTTCCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACATCCGCTTCGTGGTGGAA < SRR4302535.4059597/94‑1 (MQ=60)
TTCCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAA > SRR4302535.2214599/1‑94 (MQ=60)
TCCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAAT < SRR4302535.3853733/94‑1 (MQ=60)
TCCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAAT < SRR4302535.956572/94‑1 (MQ=60)
CCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATA < SRR4302535.332797/94‑1 (MQ=60)
CCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATA < SRR4302535.558082/94‑1 (MQ=60)
CGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATAC < SRR4302535.2086398/94‑1 (MQ=60)
CGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATAC < SRR4302535.2702299/94‑1 (MQ=60)
CGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATAC > SRR4302535.4161341/1‑94 (MQ=60)
CGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATAC > SRR4302535.154943/1‑94 (MQ=60)
GTGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACC < SRR4302535.4116523/94‑1 (MQ=60)
GGGTTCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACC < SRR4302535.3217475/94‑1 (MQ=60)
GGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACC > SRR4302535.1194993/1‑94 (MQ=60)
GGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACC > SRR4302535.507519/1‑94 (MQ=60)
GGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACC > SRR4302535.3757376/1‑94 (MQ=60)
GGGTGCTCGATGGCATCCAACAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACC > SRR4302535.448660/1‑94 (MQ=60)
GTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCA > SRR4302535.3368653/1‑94 (MQ=60)
CTCTATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCC < SRR4302535.910165/94‑1 (MQ=60)
CTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCC > SRR4302535.3271831/1‑94 (MQ=60)
CGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAG < SRR4302535.1764454/94‑1 (MQ=60)
ATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCA > SRR4302535.1891008/1‑94 (MQ=60)
ATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCA > SRR4302535.1832151/1‑94 (MQ=60)
CATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCC > SRR4302535.4577127/1‑94 (MQ=60)
ATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCG > SRR4302535.3767224/1‑94 (MQ=60)
CCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGAC < SRR4302535.3754087/94‑1 (MQ=60)
CCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGAC > SRR4302535.4272063/1‑94 (MQ=60)
CCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGAC > SRR4302535.1028441/1‑94 (MQ=60)
CAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACA < SRR4302535.589605/94‑1 (MQ=60)
AGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAA > SRR4302535.2927925/1‑94 (MQ=60)
AGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAA > SRR4302535.723069/1‑94 (MQ=60)
CAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGG < SRR4302535.1530019/94‑1 (MQ=60)
CAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGG > SRR4302535.3255796/1‑94 (MQ=60)
GCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTT > SRR4302535.874567/1‑94 (MQ=60)
CATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTG > SRR4302535.1988228/1‑94 (MQ=60)
ATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGG < SRR4302535.4360304/94‑1 (MQ=60)
ATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGG > SRR4302535.1600814/1‑94 (MQ=60)
ATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGG > SRR4302535.3490539/1‑94 (MQ=60)
ATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGG > SRR4302535.4057456/1‑94 (MQ=60)
ATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGG < SRR4302535.2928798/94‑1 (MQ=60)
ATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGG < SRR4302535.1078549/94‑1 (MQ=60)
TTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTT > SRR4302535.4522111/1‑94 (MQ=60)
CCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTT > SRR4302535.2977660/1‑94 (MQ=60)
CCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTA > SRR4302535.3699528/1‑94 (MQ=60)
CGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTAC > SRR4302535.2996693/1‑94 (MQ=60)
CGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTAC < SRR4302535.2246055/94‑1 (MQ=60)
CGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTAC > SRR4302535.334203/1‑94 (MQ=60)
CGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTAC > SRR4302535.4605862/1‑94 (MQ=60)
GATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCCACAAGGTTGGTTTTACG > SRR4302535.392522/1‑94 (MQ=60)
ATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGT < SRR4302535.4704538/94‑1 (MQ=60)
ATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGT > SRR4302535.533358/1‑94 (MQ=60)
ATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGT > SRR4302535.1438776/1‑94 (MQ=60)
TTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTA > SRR4302535.4585923/1‑94 (MQ=60)
TCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTAT > SRR4302535.3549350/1‑94 (MQ=60)
TCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTAC < SRR4302535.3332624/94‑1 (MQ=60)
TCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTAC > SRR4302535.428507/1‑94 (MQ=60)
TCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTAC > SRR4302535.2510107/1‑94 (MQ=60)
TCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGCTGGTTTTACGTAC > SRR4302535.55364/1‑94 (MQ=60)
TCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAAAACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTAC > SRR4302535.3208146/1‑94 (MQ=60)
CATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACT > SRR4302535.2800134/1‑94 (MQ=60)
CATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACT > SRR4302535.101891/1‑94 (MQ=60)
ATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTG < SRR4302535.4384609/94‑1 (MQ=60)
ATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTG < SRR4302535.2486642/94‑1 (MQ=60)
TACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGA > SRR4302535.2256661/1‑94 (MQ=60)
TACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGA < SRR4302535.4060129/94‑1 (MQ=60)
ACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGAT < SRR4302535.1844162/94‑1 (MQ=60)
ACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGAT < SRR4302535.3952187/94‑1 (MQ=60)
CGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATC < SRR4302535.1233781/94‑1 (MQ=60)
CGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATC > SRR4302535.2997278/1‑94 (MQ=60)
tgtACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTT < SRR4302535.971281/91‑1 (MQ=60)
TTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCATGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTT < SRR4302535.56923/94‑1 (MQ=60)
TACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCT < SRR4302535.2300690/94‑1 (MQ=60)
GACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCT > SRR4302535.3912105/1‑94 (MQ=60)
GACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCT < SRR4302535.3754621/94‑1 (MQ=60)
ACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTT < SRR4302535.2393691/94‑1 (MQ=60)
GTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTG > SRR4302535.1382003/1‑94 (MQ=60)
AGGTGTTGCCCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCA < SRR4302535.549720/94‑1 (MQ=60)
AGGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCA < SRR4302535.3905413/94‑1 (MQ=60)
GGTGTTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAG < SRR4302535.209571/94‑1 (MQ=60)
TTGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAGCGCC < SRR4302535.1524654/94‑1 (MQ=60)
TGACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAGCGCCG < SRR4302535.273437/94‑1 (MQ=60)
TGACCGCCTGCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAGCGCCG < SRR4302535.4406793/94‑1 (MQ=60)
GACCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAGCGCCGC > SRR4302535.2266694/1‑94 (MQ=60)
CCGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAGCGCCGCAG > SRR4302535.2386323/1‑94 (MQ=60)
CGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAGCGCCGCAGG < SRR4302535.991360/94‑1 (MQ=60)
CGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAGCGCCGCAGG > SRR4302535.1813751/1‑94 (MQ=60)
CGCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAGCGCCGCAGG < SRR4302535.4288090/94‑1 (MQ=60)
GCCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAGCGCCGCAGGA > SRR4302535.952621/1‑94 (MQ=60)
CCTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAGCGCCGCAGGAA > SRR4302535.2628831/1‑94 (MQ=60)
CTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAGCGCCGCAGGAAC > SRR4302535.3879516/1‑94 (MQ=60)
CTTCGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAGCGCCGCAGGAAC < SRR4302535.320854/94‑1 (MQ=60)
CGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAGCGCCGCAGGAACGAT > SRR4302535.2484429/1‑94 (MQ=60)
CGACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAGCGCCGCAGGAACGAT < SRR4302535.1612619/94‑1 (MQ=60)
GACACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAGCGCCGCAGGAACGATT > SRR4302535.2955381/1‑94 (MQ=60)
CACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAGCGCCGCAGGAACGATTGA > SRR4302535.4661670/1‑94 (MQ=60)
CACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAGCGCCGCAGGAACGATTGA < SRR4302535.1865336/94‑1 (MQ=60)
ACCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAGCGCCGCAGGAACGATTGAG < SRR4302535.2866533/94‑1 (MQ=60)
CCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGAaccacgcagatcggaagagcggttcagcaggaat > SRR4302535.3512080/1‑60 (MQ=60)
CCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAGCGCCGCAGGAACGATTGAGA > SRR4302535.3621764/1‑94 (MQ=60)
|
GTCAGGTTAGGATATTTTTCCGGGTGCTCGATGGCATCCAGCAGCATTTCCCGATTCATTACGTTGACGTTGAGGTGTTGACCGCCTTCGACATCCGCTTCGTGGTGGAAATACCCATCCAGCAGGCCGACAAGGTTGGTTTTACGTACTGGATCTTCTTTGCCCAGCGCCGCAGGAACGATTGAGA > NC_000913/3257859‑3258045
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
