Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,316,106 |
A→G |
intergenic (‑176/‑172) |
metY ← / → argG |
tRNA‑Met/argininosuccinate synthetase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,316,106 | 0 | A | G | 99.5%
| 683.3
/ NA
| 215 | intergenic (‑176/‑172) | metY/argG | tRNA‑Met/argininosuccinate synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (113/100); total (114/101) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 215 total aligned reads displayed.
TGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATG > NC_000913/3316016‑3316195
|
tGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCt < 2:4605533/93‑1 (MQ=255)
cAGGCATTATAGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCttt < 1:1505327/93‑1 (MQ=255)
cAGGCATTATAGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCttt > 1:4026011/1‑93 (MQ=255)
cAGGCATTATAGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCttt > 2:3053183/1‑93 (MQ=255)
aGGCATTATAGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCtttt > 2:1053285/1‑93 (MQ=255)
aGGCATTATAGTGAGCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCtttt < 1:3193337/93‑1 (MQ=255)
ggCATTATAGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTg > 1:3607867/1‑93 (MQ=255)
cATTATAGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATTAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGcc < 2:401194/93‑1 (MQ=255)
aTTATAGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCt > 1:1833170/1‑93 (MQ=255)
ttATAGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCtt > 2:3771022/1‑93 (MQ=255)
ttATAGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCtt > 1:4631208/1‑93 (MQ=255)
ataGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTtct < 1:3858087/93‑1 (MQ=255)
taGTGATCCACGCCACGTTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTtctc > 2:3474620/1‑93 (MQ=255)
aGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTcc < 2:1085357/93‑1 (MQ=255)
tGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTg > 1:2753734/1‑93 (MQ=255)
tGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTg < 2:4080608/93‑1 (MQ=255)
gATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGc < 1:4547184/93‑1 (MQ=255)
tCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGctc < 2:1129740/93‑1 (MQ=255)
cACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCtctc < 1:1890442/93‑1 (MQ=255)
cACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCtctc > 2:279784/1‑93 (MQ=255)
cACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCtctc > 2:2148115/1‑93 (MQ=255)
aCGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTcc > 1:2796381/1‑93 (MQ=255)
aCGCCACATTTTGTCAACGATTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTcc > 2:4541753/1‑93 (MQ=255)
tccACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCt < 1:1682207/92‑1 (MQ=255)
gCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCt < 2:958069/93‑1 (MQ=255)
gCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCt > 1:2259990/1‑93 (MQ=255)
ccACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCtt > 1:2475515/1‑93 (MQ=255)
ccACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCtt > 1:1926696/1‑93 (MQ=255)
aTTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAgc > 1:3974911/1‑93 (MQ=255)
aTTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAgc > 2:3948579/1‑93 (MQ=255)
ttGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCa > 1:2912816/1‑93 (MQ=255)
tGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCat < 2:2453648/93‑1 (MQ=255)
gTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCatt < 2:1587525/93‑1 (MQ=255)
gTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCatt < 2:3875348/93‑1 (MQ=255)
tCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCatta > 2:2493608/1‑93 (MQ=255)
cAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCattat < 2:2948417/93‑1 (MQ=255)
cAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCattat > 2:350320/1‑93 (MQ=255)
aaCGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCattatt < 1:3661515/93‑1 (MQ=255)
aaCGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCattatt > 2:1494120/1‑93 (MQ=255)
aaCGTTTATTACTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCattatt < 2:649512/93‑1 (MQ=255)
aCGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTAttt > 2:3078055/1‑93 (MQ=255)
gTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTa < 1:3248494/93‑1 (MQ=255)
tttATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTAc < 1:3046489/93‑1 (MQ=255)
tttATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTAc > 2:1267178/1‑93 (MQ=255)
ttATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACa < 2:824901/93‑1 (MQ=255)
tATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACaa > 2:4651092/1‑93 (MQ=255)
aTTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACaaa > 2:1561799/1‑93 (MQ=255)
ttGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACaaaa < 2:3709560/93‑1 (MQ=255)
gCTAATCATGTGATTGCCTATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCATAACGCGCATTATTTTACaaaaaa < 2:4687733/93‑1 (MQ=255)
gCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACaaaaaa < 2:4461988/93‑1 (MQ=255)
tAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAaca > 1:3181252/1‑93 (MQ=255)
tAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAaca > 1:1569343/1‑93 (MQ=255)
aaTCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAacac > 1:2514595/1‑93 (MQ=255)
tCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCCCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAacacac < 2:3177785/93‑1 (MQ=255)
cATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACt < 2:3659966/93‑1 (MQ=255)
cATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACt > 2:3788962/1‑93 (MQ=255)
aTGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTa < 1:488803/93‑1 (MQ=255)
aTGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTa > 2:3058047/1‑93 (MQ=255)
tgtgAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTaa < 1:4131617/93‑1 (MQ=255)
gtgAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTaaa < 1:4670823/93‑1 (MQ=255)
gtgAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTaaa < 2:850034/93‑1 (MQ=255)
aatgaatATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAActc < 1:3916846/93‑1 (MQ=255)
aatgaatATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAActc > 2:2890313/1‑93 (MQ=255)
atgaatATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAActct > 1:1192514/1‑93 (MQ=255)
gaatATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTc < 1:4654937/93‑1 (MQ=255)
aatATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTcc < 2:1829538/93‑1 (MQ=255)
aatATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTcc < 2:1633877/93‑1 (MQ=255)
aatATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTcc > 2:4319287/1‑93 (MQ=255)
atatCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCt > 1:3761128/1‑93 (MQ=255)
atatCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCt > 2:2971524/1‑93 (MQ=255)
tatCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTg > 1:950032/1‑93 (MQ=255)
tCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGtc < 1:1602524/93‑1 (MQ=255)
tCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGtc > 1:581467/1‑93 (MQ=255)
ccAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGtct < 1:3370642/93‑1 (MQ=255)
cAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGtctc > 1:3536406/1‑93 (MQ=255)
cAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGtctc < 1:3080899/93‑1 (MQ=255)
gTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCg > 1:4410051/1‑93 (MQ=255)
ttCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGa > 2:539224/1‑93 (MQ=255)
ttCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGa < 2:728496/93‑1 (MQ=255)
tCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGAt < 1:2436126/93‑1 (MQ=255)
cACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATa < 1:2665582/93‑1 (MQ=255)
cTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATaaa > 1:3930583/1‑93 (MQ=255)
cTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATaaa > 1:786335/1‑93 (MQ=255)
tttCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATaaaa > 2:4295408/1‑93 (MQ=255)
tttCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATaaaa > 1:1426894/1‑93 (MQ=255)
tCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAga > 2:3432092/1‑93 (MQ=255)
cATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAgat > 2:1295793/1‑93 (MQ=255)
tttGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAgatga > 1:4278710/1‑93 (MQ=255)
tttGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAgatga < 1:4086387/93‑1 (MQ=255)
ttgttgAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAgatgat > 2:1404813/1‑93 (MQ=255)
ttgttgAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAgatgat < 1:3145536/93‑1 (MQ=255)
tgttgAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGAtt < 2:2592284/93‑1 (MQ=255)
gttgAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTa < 2:42277/93‑1 (MQ=255)
ttgAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTaa > 1:3031927/1‑93 (MQ=255)
tgAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTaaa < 1:631822/93‑1 (MQ=255)
tgAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTaaa < 2:4666175/93‑1 (MQ=255)
gAATTCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAACCTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAAt < 2:767956/93‑1 (MQ=255)
gAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAAt > 2:1741247/1‑93 (MQ=255)
gAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAAt > 1:105633/1‑93 (MQ=255)
aaTGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATg > 2:2038182/1‑93 (MQ=255)
|
TGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATG > NC_000913/3316016‑3316195
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAA > NC_000913/3316013‑3316199
|
ATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATG > SRR4302535.2999105/1‑94 (MQ=60)
ATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATG > SRR4302535.1360359/1‑94 (MQ=60)
ATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATG < SRR4302535.2338336/94‑1 (MQ=60)
ATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATG < SRR4302535.1665047/94‑1 (MQ=60)
TCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGC < SRR4302535.1563134/94‑1 (MQ=60)
CTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCT < SRR4302535.2211432/94‑1 (MQ=60)
GCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTT < SRR4302535.2747528/94‑1 (MQ=60)
GCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTT > SRR4302535.4053556/1‑94 (MQ=60)
CAGGCATTATAGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTT < SRR4302535.1516150/94‑1 (MQ=60)
AGGCATTATAGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTG > SRR4302535.3632888/1‑94 (MQ=60)
AGGCATTATAGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTG < SRR4302535.3980617/94‑1 (MQ=60)
AGGCATTATAGTGAGCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTG < SRR4302535.3215430/94‑1 (MQ=60)
GGCATTATAGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGC > SRR4302535.1871930/1‑94 (MQ=60)
CATTATAGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCT > SRR4302535.1846397/1‑94 (MQ=60)
ATTATAGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTT > SRR4302535.4662631/1‑94 (MQ=60)
ATTATAGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTT > SRR4302535.1458677/1‑94 (MQ=60)
TTATAGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTC > SRR4302535.61529/1‑94 (MQ=60)
TTATAGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTC > SRR4302535.1251392/1‑94 (MQ=60)
TTATAGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTC < SRR4302535.4639655/94‑1 (MQ=60)
ATAGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTC > SRR4302535.1696456/1‑94 (MQ=60)
ATAGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTC < SRR4302535.3884644/94‑1 (MQ=60)
ATAGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTC > SRR4302535.999324/1‑94 (MQ=60)
AGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCT < SRR4302535.2437219/94‑1 (MQ=60)
AGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCT < SRR4302535.4676173/94‑1 (MQ=60)
GTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTG > SRR4302535.2773359/1‑94 (MQ=60)
GATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCT < SRR4302535.4578275/94‑1 (MQ=60)
TCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCT < SRR4302535.346415/94‑1 (MQ=60)
CACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCC > SRR4302535.2816282/1‑94 (MQ=60)
CACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCC < SRR4302535.1904060/94‑1 (MQ=60)
ACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCC > SRR4302535.2482082/1‑94 (MQ=60)
CGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCT > SRR4302535.2276082/1‑94 (MQ=60)
TCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTT < SRR4302535.1694391/94‑1 (MQ=60)
GCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTT > SRR4302535.1940581/1‑94 (MQ=60)
GCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTT > SRR4302535.2493369/1‑94 (MQ=60)
GCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTT > SRR4302535.3618442/1‑94 (MQ=60)
CACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAA > SRR4302535.3655806/1‑94 (MQ=60)
ACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAG > SRR4302535.4618261/1‑94 (MQ=60)
CATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGC > SRR4302535.4002066/1‑94 (MQ=60)
ATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCG > SRR4302535.280014/1‑94 (MQ=60)
TTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCA > SRR4302535.2933394/1‑94 (MQ=60)
TTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCAT > SRR4302535.4135978/1‑94 (MQ=60)
GTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTA > SRR4302535.256472/1‑94 (MQ=60)
GTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTA < SRR4302535.2896762/94‑1 (MQ=60)
AACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTT < SRR4302535.3686862/94‑1 (MQ=60)
ACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGNNNTCCCTTAAGCGNTNTNTNTT > SRR4302535.2047650/1‑94 (MQ=60)
ACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTTAGCGCATTATTTT > SRR4302535.3061857/1‑94 (MQ=60)
ACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTT < SRR4302535.3249718/94‑1 (MQ=60)
GTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTAC < SRR4302535.3271059/94‑1 (MQ=60)
TTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACA < SRR4302535.3799381/94‑1 (MQ=60)
TTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACA < SRR4302535.400299/94‑1 (MQ=60)
TTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACA < SRR4302535.3067831/94‑1 (MQ=60)
TATTGCTAATCATGTGAATGAATATCGAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAA < SRR4302535.1082449/94‑1 (MQ=60)
TATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAA > SRR4302535.4700388/1‑94 (MQ=60)
ATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAA > SRR4302535.3205386/1‑94 (MQ=60)
ATTGCTAATCATGTCAATGAATATCCAGTTCACTTTCATATGCTGAATGCTTTCGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTAACAAAA < SRR4302535.2726637/94‑1 (MQ=60)
GCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAAC < SRR4302535.3350049/94‑1 (MQ=60)
CTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACA > SRR4302535.3203240/1‑94 (MQ=60)
CTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACA > SRR4302535.1580670/1‑94 (MQ=60)
TAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACAC < SRR4302535.4008358/94‑1 (MQ=60)
TAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACAC > SRR4302535.3616658/1‑94 (MQ=60)
TAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACAC > SRR4302535.2532723/1‑94 (MQ=60)
ATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACAC > SRR4302535.3086420/1‑94 (MQ=60)
TCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACT > SRR4302535.808609/1‑94 (MQ=60)
ATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAA < SRR4302535.492228/94‑1 (MQ=60)
TGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAA < SRR4302535.4159883/94‑1 (MQ=60)
GTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAAC < SRR4302535.4702373/94‑1 (MQ=60)
TGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACT < SRR4302535.1720341/94‑1 (MQ=60)
TGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACT > SRR4302535.1931654/1‑94 (MQ=60)
TGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACT < SRR4302535.4279031/94‑1 (MQ=60)
TGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACT > SRR4302535.4445172/1‑94 (MQ=60)
GAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTC > SRR4302535.3929088/1‑94 (MQ=60)
AATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCT > SRR4302535.479189/1‑94 (MQ=60)
AATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCT > SRR4302535.3137282/1‑94 (MQ=60)
AATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCT > SRR4302535.1201054/1‑94 (MQ=60)
AATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCT < SRR4302535.3943648/94‑1 (MQ=60)
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AATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCT > SRR4302535.3787120/1‑94 (MQ=60)
ATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTG > SRR4302535.956760/1‑94 (MQ=60)
ATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTGTACAAACAACACACTAAACTCTTCCTG > SRR4302535.410449/1‑94 (MQ=60)
TATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGT < SRR4302535.3948853/94‑1 (MQ=60)
ATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTC > SRR4302535.585550/1‑94 (MQ=60)
TCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCT < SRR4302535.1614086/94‑1 (MQ=60)
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CCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTC < SRR4302535.3394091/94‑1 (MQ=60)
CCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTC > SRR4302535.3560954/1‑94 (MQ=60)
CAGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCC < SRR4302535.3102377/94‑1 (MQ=60)
AGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCG < SRR4302535.2985579/94‑1 (MQ=60)
AGTTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCG > SRR4302535.4440231/1‑94 (MQ=60)
TTCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGAT > SRR4302535.54229/1‑94 (MQ=60)
TCACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATA < SRR4302535.2453679/94‑1 (MQ=60)
CACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAA < SRR4302535.2684666/94‑1 (MQ=60)
CACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAA < SRR4302535.1578222/94‑1 (MQ=60)
ACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAA > SRR4302535.791846/1‑94 (MQ=60)
ACTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAA > SRR4302535.3957423/1‑94 (MQ=60)
CTTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAA > SRR4302535.1437080/1‑94 (MQ=60)
TTTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAG > SRR4302535.2525124/1‑94 (MQ=60)
TTCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGA < SRR4302535.935928/94‑1 (MQ=60)
TCATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGAT < SRR4302535.1646137/94‑1 (MQ=60)
CATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATG > SRR4302535.3069715/1‑94 (MQ=60)
ATTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGA < SRR4302535.1610912/94‑1 (MQ=60)
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TTTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGAT < SRR4302535.3713678/94‑1 (MQ=60)
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TTGTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATT < SRR4302535.208498/94‑1 (MQ=60)
GTTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAA > SRR4302535.3053154/1‑94 (MQ=60)
TTGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAA < SRR4302535.2644268/94‑1 (MQ=60)
TGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAAT < SRR4302535.636228/94‑1 (MQ=60)
TGAATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAAT > SRR4302535.106384/1‑94 (MQ=60)
ATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAA < SRR4302535.653694/94‑1 (MQ=60)
ATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAA > SRR4302535.3450314/1‑94 (MQ=60)
ATGCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAA < SRR4302535.1429167/94‑1 (MQ=60)
GCTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAA > SRR4302535.2360443/1‑94 (MQ=60)
|
ATCTGCAGGCATTATAGTGATCCACGCCACATTTTGTCAACGTTTATTGCTAATCATGTGAATGAATATCCAGTTCACTTTCATTTGTTGAATACTTTTGCCTTCTCCTGCTCTCCCTTAAGCGCATTATTTTACAAAAAACACACTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAA > NC_000913/3316013‑3316199
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
