Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1696 |
279.3 |
15874187 |
97.8% |
15524954 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,316,316 |
T→C |
R13R (CGT→CGC) |
argG → |
argininosuccinate synthetase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,316,316 | 0 | T | C | 100.0%
| 1119.8
/ NA
| 350 | R13R (CGT→CGC) | argG | argininosuccinate synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (164/186); total (164/186) |
Only 100 of 357 total aligned reads displayed.
TGAGAGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGTATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACTGC > NC_000913/3316226‑3316405
|
tGAGAGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCAt > 2:6850994/1‑93 (MQ=255)
gagaGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCAtt > 2:7005450/1‑93 (MQ=255)
agagCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTg < 1:6674824/93‑1 (MQ=255)
gagCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTgg > 2:1245914/1‑93 (MQ=255)
cGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTAt > 1:2004646/1‑93 (MQ=255)
cGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTAt < 1:1119667/93‑1 (MQ=255)
cGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTAt < 1:828709/93‑1 (MQ=255)
ggAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATc > 2:4091376/1‑93 (MQ=255)
gAAATCCAGGCTCTTCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCg > 1:2478740/1‑93 (MQ=255)
aaTCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCt < 2:7399184/93‑1 (MQ=255)
aaTCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCt < 2:7091397/93‑1 (MQ=255)
tCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCttt > 2:2555735/1‑93 (MQ=255)
ccAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCtttt < 2:2292074/93‑1 (MQ=255)
aGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTc > 1:542196/1‑93 (MQ=255)
ggCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCt < 1:2649702/93‑1 (MQ=255)
ggCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCt > 1:5675035/1‑93 (MQ=255)
gCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTg > 2:348560/1‑93 (MQ=255)
cTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTgg > 2:1220482/1‑93 (MQ=255)
cTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTgg < 1:125771/93‑1 (MQ=255)
catcatcaGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCCACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGTCg > 1:4416062/1‑93 (MQ=255)
tcatcaGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGt < 1:6207581/93‑1 (MQ=255)
caGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTgg > 1:6814797/1‑93 (MQ=255)
ttaattaaGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGaca > 1:3676945/1‑93 (MQ=255)
attaaGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCa < 2:5763104/93‑1 (MQ=255)
attaaGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCa < 2:6981657/93‑1 (MQ=255)
ttaaGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAg > 2:3097349/1‑93 (MQ=255)
ttaaGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAg < 2:4218284/93‑1 (MQ=255)
taaGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGt > 1:3261855/1‑93 (MQ=255)
taaGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGt < 2:639683/93‑1 (MQ=255)
taaGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGt < 1:1874122/93‑1 (MQ=255)
aaGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTg > 1:5955924/1‑93 (MQ=255)
gCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGcc < 1:914428/93‑1 (MQ=255)
aGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGc > 1:5824612/1‑93 (MQ=255)
ggTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCAc < 2:1036562/93‑1 (MQ=255)
ggTGTTATTTTATGACGACGATTATCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCATTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCat > 1:7207626/1‑92 (MQ=255)
gtTATTTTATGACGACTATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCActgc < 2:7630638/93‑1 (MQ=255)
ttATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCActgct > 1:3917914/1‑93 (MQ=255)
ttATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCActgct > 1:2796541/1‑93 (MQ=255)
ttATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCActgct > 2:7460602/1‑93 (MQ=255)
tATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGCTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCActgctg < 2:6775640/93‑1 (MQ=255)
aTTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCtgt > 1:359684/1‑93 (MQ=255)
ttttATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCtgtg < 2:2719757/93‑1 (MQ=255)
ttttATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCtgtg > 1:6500451/1‑93 (MQ=255)
tttATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTgg > 2:7900978/1‑93 (MQ=255)
tttATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTgg < 2:1979510/93‑1 (MQ=255)
ttATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTTGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGa < 1:4708209/93‑1 (MQ=255)
ttATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGa > 2:7725622/1‑93 (MQ=255)
ttATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGa < 1:6872455/93‑1 (MQ=255)
ttATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGa < 2:6546799/93‑1 (MQ=255)
ttATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGa < 1:7767862/93‑1 (MQ=255)
ttATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGa < 2:5615264/93‑1 (MQ=255)
ttATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGa < 2:5142243/93‑1 (MQ=255)
ttATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTAGa < 2:2194130/93‑1 (MQ=255)
tATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGAt > 1:5904373/1‑93 (MQ=255)
tATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGAt < 1:3829464/93‑1 (MQ=255)
tGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGc < 1:3286329/93‑1 (MQ=255)
tGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGc < 1:7823764/93‑1 (MQ=255)
gacgacGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCg < 2:90205/93‑1 (MQ=255)
cgacgaTTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGAc > 2:1423436/1‑93 (MQ=255)
acgaTTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACaa < 2:4781891/93‑1 (MQ=255)
cgaTTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACaaa > 1:5722404/1‑93 (MQ=255)
gaTTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACaaaa > 1:7652197/1‑93 (MQ=255)
gaTTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACaaaa < 1:4048719/93‑1 (MQ=255)
aTTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAg > 2:4501300/1‑93 (MQ=255)
aTTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAg > 1:3894120/1‑93 (MQ=255)
ttCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAgg < 2:2263908/93‑1 (MQ=255)
ttCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAgg < 1:5267814/93‑1 (MQ=255)
tctcAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAggg < 2:6137341/93‑1 (MQ=255)
ctcAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGa > 2:5440397/1‑93 (MQ=255)
cAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGc > 1:7456183/1‑93 (MQ=255)
cAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTCTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGc < 2:6361285/93‑1 (MQ=255)
aaGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCg < 1:1807936/93‑1 (MQ=255)
aaGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCg > 1:1509174/1‑93 (MQ=255)
gCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGt > 2:3281551/1‑93 (MQ=255)
gCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGt < 2:2826196/93‑1 (MQ=255)
gCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGt < 1:694915/93‑1 (MQ=255)
gCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGt < 2:3880202/93‑1 (MQ=255)
aTCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTc < 1:2220049/93‑1 (MQ=255)
tctcCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTcc > 2:1781558/1‑93 (MQ=255)
tctcCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTcc < 2:4000631/93‑1 (MQ=255)
tctcCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTcc < 2:7822544/93‑1 (MQ=255)
tccccccGTAGGTGAACGCATTGGTAGCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACAACAGGGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTcc < 1:2669084/90‑1 (MQ=255)
ctcCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCt < 1:1714933/93‑1 (MQ=255)
cccGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTa < 1:5177245/93‑1 (MQ=255)
ccGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACACAAGGGAGCGGTTACTTAt > 2:1629030/1‑93 (MQ=255)
cGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATg < 2:5268301/93‑1 (MQ=255)
ggTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGc < 2:3644398/93‑1 (MQ=255)
gTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCa > 1:5312976/1‑93 (MQ=255)
gTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCa > 1:4197612/1‑93 (MQ=255)
gTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCa > 2:1905872/1‑93 (MQ=255)
ggTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTCTGCatat > 2:6264943/1‑93 (MQ=255)
ggTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCatat < 1:5046176/93‑1 (MQ=255)
gTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCAtata < 1:7304879/93‑1 (MQ=255)
tCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGGCACCAGTGCCGCCCTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATAc > 2:4173165/1‑93 (MQ=255)
tCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATAc > 1:2318417/1‑93 (MQ=255)
tCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATAc < 1:7073628/93‑1 (MQ=255)
cAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACt < 1:4842070/93‑1 (MQ=255)
aCGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACTGc > 2:6026297/1‑93 (MQ=255)
aCGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACTGc > 2:2960924/1‑93 (MQ=255)
aCGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACTGc < 2:2108574/93‑1 (MQ=255)
|
TGAGAGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGTATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACTGC > NC_000913/3316226‑3316405
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CAGTGAGAGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGTATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACTGCAAAC > NC_000913/3316223‑3316409
|
CAGTGAGAGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGC < SRR4302543.3849374/94‑1 (MQ=60)
AGTGAGAGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCA > SRR4302543.281826/1‑94 (MQ=60)
GTGAGAGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCAT < SRR4302543.2165393/94‑1 (MQ=60)
GAGAGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTG > SRR4302543.3741023/1‑94 (MQ=60)
GAGAGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTG < SRR4302543.6674131/94‑1 (MQ=60)
GAGAGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTG < SRR4302543.5288093/94‑1 (MQ=60)
GAGAGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGGTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTG < SRR4302543.5288091/94‑1 (MQ=60)
AGAGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGG > SRR4302543.2877800/1‑94 (MQ=60)
AGAGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGG < SRR4302543.6737844/94‑1 (MQ=60)
AGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTA < SRR4302543.3315777/94‑1 (MQ=60)
AGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTA < SRR4302543.3315778/94‑1 (MQ=60)
AGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTA > SRR4302543.2013892/1‑94 (MQ=60)
GCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTAT > SRR4302543.2022656/1‑94 (MQ=60)
GCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTAT < SRR4302543.1796138/94‑1 (MQ=60)
GCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGAGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTAT > SRR4302543.2022655/1‑94 (MQ=60)
CGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATC > SRR4302543.5919843/1‑94 (MQ=60)
CGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATC < SRR4302543.1129815/94‑1 (MQ=60)
CGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATC > SRR4302543.5423052/1‑94 (MQ=60)
CGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATC < SRR4302543.836014/94‑1 (MQ=60)
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GGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCC > SRR4302543.2253336/1‑94 (MQ=60)
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CAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTC < SRR4302543.5350484/94‑1 (MQ=60)
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TATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGT < SRR4302543.7965925/94‑1 (MQ=60)
TATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGT < SRR4302543.3944152/94‑1 (MQ=60)
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TCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGC > SRR4302543.7527612/1‑94 (MQ=60)
TCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGC > SRR4302543.735344/1‑94 (MQ=60)
TCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGC > SRR4302543.7527613/1‑94 (MQ=60)
TCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGC > SRR4302543.999075/1‑94 (MQ=60)
CAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCG > SRR4302543.6784824/1‑94 (MQ=60)
CAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCG < SRR4302543.7331730/94‑1 (MQ=60)
CAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCG < SRR4302543.2449775/94‑1 (MQ=60)
CAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCG > SRR4302543.1522727/1‑94 (MQ=60)
CAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCG < SRR4302543.7207136/94‑1 (MQ=60)
AAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGG < SRR4302543.1824118/94‑1 (MQ=60)
AAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGG > SRR4302543.6937057/1‑94 (MQ=60)
AAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGG < SRR4302543.6948491/94‑1 (MQ=60)
AAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGG > SRR4302543.6408975/1‑94 (MQ=60)
AGCCTCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGT < SRR4302543.2722570/94‑1 (MQ=60)
GCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTT < SRR4302543.701283/94‑1 (MQ=60)
GCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTT < SRR4302543.5068679/94‑1 (MQ=60)
ATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCC > SRR4302543.2216924/1‑94 (MQ=60)
ATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCC > SRR4302543.4021988/1‑94 (MQ=60)
ATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCC < SRR4302543.1674897/94‑1 (MQ=60)
ATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCC < SRR4302543.2240080/94‑1 (MQ=60)
ATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCC > SRR4302543.3679223/1‑94 (MQ=60)
ATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCC < SRR4302543.2495676/94‑1 (MQ=60)
TCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCT < SRR4302543.2693062/94‑1 (MQ=60)
TCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCT > SRR4302543.6781010/1‑94 (MQ=60)
TCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCT < SRR4302543.5976580/94‑1 (MQ=60)
TCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCT > SRR4302543.1518687/1‑94 (MQ=60)
TCCCCCCGTAGGTGAACGCATTGGTAGCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACAACAGGGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCT < SRR4302543.2693285/94‑1 (MQ=60)
CTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTT < SRR4302543.1730261/94‑1 (MQ=60)
CTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTT > SRR4302543.7472076/1‑94 (MQ=60)
CTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTT > SRR4302543.1672884/1‑94 (MQ=60)
CCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGTGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTAT > SRR4302543.7094511/1‑94 (MQ=60)
CCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGATAAAAGGGAGCGGTTCCTTAT < SRR4302543.7735553/94‑1 (MQ=60)
CCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTAT < SRR4302543.6725242/94‑1 (MQ=60)
CCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTAT < SRR4302543.5223981/94‑1 (MQ=60)
CCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTAT < SRR4302543.7877567/94‑1 (MQ=60)
CCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTAT > SRR4302543.3657411/1‑94 (MQ=60)
CCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATG < SRR4302543.5301487/94‑1 (MQ=60)
CCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATG > SRR4302543.2900931/1‑94 (MQ=60)
CCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATG > SRR4302543.429822/1‑94 (MQ=60)
GGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACACAAGGGAGCGGTTCCTTATGCA > SRR4302543.5360971/1‑94 (MQ=60)
GGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCA > SRR4302543.5360972/1‑94 (MQ=60)
GGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCA > SRR4302543.7420808/1‑94 (MQ=60)
GGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCA > SRR4302543.4235669/1‑94 (MQ=60)
GTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCAT < SRR4302543.4413971/94‑1 (MQ=60)
GTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCAT < SRR4302543.2680502/94‑1 (MQ=60)
GTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCAT < SRR4302543.696069/94‑1 (MQ=60)
TAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATA < SRR4302543.5966886/94‑1 (MQ=60)
TAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATA > SRR4302543.5754494/1‑94 (MQ=60)
GGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGGTGCGACAAAAGGTAGCGGTTCTTTAGGCATATG > SRR4302543.7686459/1‑94 (MQ=60)
GGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATA < SRR4302543.5092060/94‑1 (MQ=60)
GTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATAC > SRR4302543.2339495/1‑94 (MQ=60)
GTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATAC > SRR4302543.3880310/1‑94 (MQ=60)
GTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATAC < SRR4302543.7375321/94‑1 (MQ=60)
GTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATAC < SRR4302543.5419320/94‑1 (MQ=60)
TCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACT < SRR4302543.7142312/94‑1 (MQ=60)
TCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACT < SRR4302543.5009135/94‑1 (MQ=60)
CAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACTG < SRR4302543.7327459/94‑1 (MQ=60)
CAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACTG < SRR4302543.4886220/94‑1 (MQ=60)
ACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACTGCA < SRR4302543.5111862/94‑1 (MQ=60)
ACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACTGCA < SRR4302543.5735003/94‑1 (MQ=60)
CGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACTGCAA < SRR4302543.7818166/94‑1 (MQ=60)
CGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACTGCAA < SRR4302543.337997/94‑1 (MQ=60)
CGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACTGCAA > SRR4302543.5939243/1‑94 (MQ=60)
CGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACTGCAA > SRR4302543.5394886/1‑94 (MQ=60)
CATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACTGCAAAC < SRR4302543.3474878/94‑1 (MQ=60)
CATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACTGCAAAC < SRR4302543.3907547/94‑1 (MQ=60)
CATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACTGCAAAC < SRR4302543.1356138/94‑1 (MQ=60)
|
CAGTGAGAGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGTATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACTGCAAAC > NC_000913/3316223‑3316409
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
