Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,316,316 |
T→C |
R13R (CGT→CGC) |
argG → |
argininosuccinate synthetase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,316,316 | 0 | T | C | 100.0%
| 651.0
/ NA
| 203 | R13R (CGT→CGC) | argG | argininosuccinate synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (98/105); total (98/105) |
Only 100 of 208 total aligned reads displayed.
TGAGAGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGTATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACTGC > NC_000913/3316226‑3316405
|
tGAGAGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCAt < 1:929033/93‑1 (MQ=255)
tGAGAGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCAt < 2:2226863/93‑1 (MQ=255)
gagaGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCAtt > 1:4155258/1‑93 (MQ=255)
gagaGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCAtt < 1:4105934/93‑1 (MQ=255)
gagaGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCAtt < 1:4651092/93‑1 (MQ=255)
agagCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTACGTCAACGCATTg > 1:2208233/1‑93 (MQ=255)
gagCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTgg < 1:2493608/93‑1 (MQ=255)
gagCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTgg > 1:4391418/1‑93 (MQ=255)
gagCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTgg > 1:878570/1‑93 (MQ=255)
gagCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTgg < 2:4650248/93‑1 (MQ=255)
gCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTa > 1:2168172/1‑93 (MQ=255)
gCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTa > 2:542064/1‑93 (MQ=255)
gCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTa > 1:56795/1‑93 (MQ=255)
gCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTa > 2:426183/1‑93 (MQ=255)
cGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTAt < 1:2407677/93‑1 (MQ=255)
ggAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATCAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATc < 2:3208476/93‑1 (MQ=255)
gAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCg > 2:1850045/1‑93 (MQ=255)
aaaTCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGc < 1:1092130/93‑1 (MQ=255)
aaaTCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGc > 2:3308251/1‑93 (MQ=255)
aaaTCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGc > 1:1598067/1‑93 (MQ=255)
tCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCttt > 2:4601268/1‑93 (MQ=255)
tCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCttt > 2:3404431/1‑93 (MQ=255)
aGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTc < 2:4536583/93‑1 (MQ=255)
gCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTg > 1:3416686/1‑93 (MQ=255)
tcatcatcaGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGc > 2:279956/1‑93 (MQ=255)
tcatcatcaGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGc < 1:1876451/93‑1 (MQ=255)
tcatcatcaGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGc > 1:1665631/1‑93 (MQ=255)
atcatcaGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCgg < 2:3023832/93‑1 (MQ=255)
catcaGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTc < 1:2796244/93‑1 (MQ=255)
catcaGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTc > 2:831236/1‑93 (MQ=255)
catcaGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTc < 1:1053285/93‑1 (MQ=255)
atcaGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCt > 2:3885019/1‑93 (MQ=255)
tcaGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTg < 2:2978211/93‑1 (MQ=255)
tcaGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTg > 2:4330213/1‑93 (MQ=255)
aGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGa < 2:3115592/93‑1 (MQ=255)
aGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGa < 2:3181252/93‑1 (MQ=255)
aGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGa < 1:1807605/93‑1 (MQ=255)
gTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGac > 2:1895648/1‑93 (MQ=255)
gTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGac < 2:3593502/93‑1 (MQ=255)
ttaattaaGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGaca < 1:1741247/93‑1 (MQ=255)
taattaaGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGacac < 1:3053183/93‑1 (MQ=255)
attaaGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCa > 1:4059888/1‑93 (MQ=255)
attaaGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCa > 1:4622526/1‑93 (MQ=255)
taaGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGt < 1:4341660/93‑1 (MQ=255)
aaGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTg < 2:4477796/93‑1 (MQ=255)
aGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGc < 2:3471137/93‑1 (MQ=255)
aGCAGGGTATTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGc < 2:254714/93‑1 (MQ=255)
aGCAGGGGGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTTTGGGGGTCTGGGCACCAGTGc > 2:4143816/1‑93 (MQ=255)
gCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGcc < 2:2701843/93‑1 (MQ=255)
aGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACAACAGTGACGc > 2:4024602/1‑93 (MQ=255)
gtgtTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCAct > 1:1846477/1‑93 (MQ=255)
tgtTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCActg > 2:1608741/1‑93 (MQ=255)
gtTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCActgc < 1:3355667/93‑1 (MQ=255)
gtTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCActgc > 2:353218/1‑93 (MQ=255)
tttATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTgg > 2:3653028/1‑93 (MQ=255)
ttATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGa < 1:350320/93‑1 (MQ=255)
ttATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGa < 1:633058/93‑1 (MQ=255)
tATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGAAGGCAAACGCATTGGAATCGCTTTTTTTGGCGGTCTGGAAACCAGGGCCGAACTGCTGGGGag > 2:924914/1‑92 (MQ=255)
aTGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATg < 1:1494120/93‑1 (MQ=255)
tGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGc < 2:1982190/93‑1 (MQ=255)
tGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGc < 2:1192514/93‑1 (MQ=255)
gacgaTTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACa < 1:3848123/93‑1 (MQ=255)
acgaTTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACaa > 2:3415246/1‑93 (MQ=255)
acgaTTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACaa > 2:196995/1‑93 (MQ=255)
acgaTTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACaa > 1:2582551/1‑93 (MQ=255)
acgaTTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACaa > 1:2322324/1‑93 (MQ=255)
cgaTTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACaaa > 2:40918/1‑93 (MQ=255)
gaTTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACaaaa < 1:2236820/93‑1 (MQ=255)
ttCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAgg < 1:3977430/93‑1 (MQ=255)
ttCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAgg < 1:3557684/93‑1 (MQ=255)
ttCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAgg > 1:729923/1‑93 (MQ=255)
ttCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAgg < 2:4415369/93‑1 (MQ=255)
ctcAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGa > 1:1331348/1‑93 (MQ=255)
tcAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAg > 2:1998531/1‑93 (MQ=255)
tcAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAg > 2:158545/1‑93 (MQ=255)
cAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGc > 1:4246826/1‑93 (MQ=255)
aaGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCg > 2:1752718/1‑93 (MQ=255)
gCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGt < 1:1404813/93‑1 (MQ=255)
gCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGt > 1:1207249/1‑93 (MQ=255)
gCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGt > 1:4425390/1‑93 (MQ=255)
cATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGtt < 2:2064281/93‑1 (MQ=255)
aTCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTc > 1:2677998/1‑93 (MQ=255)
tctcCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTcc > 2:2581132/1‑93 (MQ=255)
ctcCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCt < 2:636893/93‑1 (MQ=255)
ccGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTAt < 2:3766322/93‑1 (MQ=255)
ccGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTAt > 1:655163/1‑93 (MQ=255)
cGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATg < 2:77833/93‑1 (MQ=255)
gTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCa < 2:3744044/93‑1 (MQ=255)
gTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCa < 1:455060/93‑1 (MQ=255)
aGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCata > 2:1040860/1‑93 (MQ=255)
aGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCata < 1:2148713/93‑1 (MQ=255)
ggTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCatat < 2:1833170/93‑1 (MQ=255)
ggTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCatat > 1:828407/1‑93 (MQ=255)
gTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCAtata < 1:4295408/93‑1 (MQ=255)
tCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATAc < 1:1267178/93‑1 (MQ=255)
cAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACt < 2:2777121/93‑1 (MQ=255)
cAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACt < 2:61072/93‑1 (MQ=255)
aaCGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACTg > 1:290874/1‑93 (MQ=255)
aaCGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACTg > 1:3658986/1‑93 (MQ=255)
aCGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACTGc < 2:2884217/93‑1 (MQ=255)
|
TGAGAGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGTATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACTGC > NC_000913/3316226‑3316405
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CAGTGAGAGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGTATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACTGCAAAC > NC_000913/3316223‑3316409
|
CAGTGAGAGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGC > SRR4302535.4335645/1‑94 (MQ=60)
AGTGAGAGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCA > SRR4302535.2888830/1‑94 (MQ=60)
TGAGAGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATT < SRR4302535.971759/94‑1 (MQ=60)
TGAGAGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATT < SRR4302535.935608/94‑1 (MQ=60)
TGAGAGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATT > SRR4302535.4183705/1‑94 (MQ=60)
GAGAGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTG < SRR4302535.4682587/94‑1 (MQ=60)
GAGAGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTG < SRR4302535.4134048/94‑1 (MQ=60)
GAGAGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTACGTCAACGCATTG > SRR4302535.2223962/1‑94 (MQ=60)
AGAGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGG > SRR4302535.884790/1‑94 (MQ=60)
AGAGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGG > SRR4302535.4421464/1‑94 (MQ=60)
GAGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGT < SRR4302535.3289184/94‑1 (MQ=60)
GAGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGT < SRR4302535.2511603/94‑1 (MQ=60)
AGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTA > SRR4302535.57208/1‑94 (MQ=60)
AGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTA > SRR4302535.2183709/1‑94 (MQ=60)
AGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTA < SRR4302535.717445/94‑1 (MQ=60)
AGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGATCAACGCATTGGTA > SRR4302535.2183710/1‑94 (MQ=60)
CGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATC < SRR4302535.4335815/94‑1 (MQ=60)
CGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATC < SRR4302535.2425007/94‑1 (MQ=60)
GGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCG > SRR4302535.1611874/1‑94 (MQ=60)
GGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCG > SRR4302535.2177489/1‑94 (MQ=60)
GAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGC > SRR4302535.1609595/1‑94 (MQ=60)
AAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCT < SRR4302535.1099910/94‑1 (MQ=60)
AAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCT > SRR4302535.884685/1‑94 (MQ=60)
ATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTT < SRR4302535.4572821/94‑1 (MQ=60)
CCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTT > SRR4302535.3388265/1‑94 (MQ=60)
CAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCACAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTC < SRR4302535.3797041/94‑1 (MQ=60)
GGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTG > SRR4302535.3440454/1‑94 (MQ=60)
CTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGG > SRR4302535.1247555/1‑94 (MQ=60)
CTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGC > SRR4302535.1677683/1‑94 (MQ=60)
TCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCG > SRR4302535.2750247/1‑94 (MQ=60)
TCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCG < SRR4302535.1889964/94‑1 (MQ=60)
ATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGCCGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGT > SRR4302535.613990/1‑94 (MQ=60)
ATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGT > SRR4302535.2434584/1‑94 (MQ=60)
CATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCT < SRR4302535.3478418/94‑1 (MQ=60)
CATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCT < SRR4302535.2816144/94‑1 (MQ=60)
CATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCT < SRR4302535.1060774/94‑1 (MQ=60)
CAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGA < SRR4302535.1580000/94‑1 (MQ=60)
AGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGAC < SRR4302535.1820687/94‑1 (MQ=60)
AGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGAC < SRR4302535.2045800/94‑1 (MQ=60)
TTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACAC < SRR4302535.1753833/94‑1 (MQ=60)
TAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACC > SRR4302535.1850602/1‑94 (MQ=60)
TAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACC < SRR4302535.3074563/94‑1 (MQ=60)
AATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCA > SRR4302535.4653924/1‑94 (MQ=60)
AATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCA > SRR4302535.4087676/1‑94 (MQ=60)
TAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTG < SRR4302535.4371354/94‑1 (MQ=60)
CAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGC > SRR4302535.922981/1‑94 (MQ=60)
GGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACT > SRR4302535.1859784/1‑94 (MQ=60)
GGTGTTATTTTATCACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACT < SRR4302535.3651592/94‑1 (MQ=60)
TGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGC > SRR4302535.4291396/1‑94 (MQ=60)
GTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCT < SRR4302535.3379032/94‑1 (MQ=60)
ATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTG > SRR4302535.1324928/1‑94 (MQ=60)
ATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGGCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTG > SRR4302535.2629489/1‑94 (MQ=60)
TTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGG < SRR4302535.1144978/94‑1 (MQ=60)
TTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGG < SRR4302535.4202577/94‑1 (MQ=60)
TTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGAT > SRR4302535.3558079/1‑94 (MQ=60)
TTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGAT < SRR4302535.637471/94‑1 (MQ=60)
TTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGAT < SRR4302535.652441/94‑1 (MQ=60)
TTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGAT < SRR4302535.352735/94‑1 (MQ=60)
ATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGC < SRR4302535.1504861/94‑1 (MQ=60)
ATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGC > SRR4302535.532072/1‑94 (MQ=60)
ATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGC < SRR4302535.760850/94‑1 (MQ=60)
ATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGC > SRR4302535.1861856/1‑94 (MQ=60)
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GACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAA > SRR4302535.2601106/1‑94 (MQ=60)
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GACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAA < SRR4302535.3874611/94‑1 (MQ=60)
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ATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGG > SRR4302535.1085217/1‑94 (MQ=60)
TTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGG < SRR4302535.3582358/94‑1 (MQ=60)
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TCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGC > SRR4302535.4275904/1‑94 (MQ=60)
AAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGG < SRR4302535.4419464/94‑1 (MQ=60)
AGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGT > SRR4302535.4455702/1‑94 (MQ=60)
AGCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGT > SRR4302535.1215925/1‑94 (MQ=60)
GCATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTT < SRR4302535.1414857/94‑1 (MQ=60)
CATCTCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTC > SRR4302535.2697158/1‑94 (MQ=60)
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TCCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTA < SRR4302535.1721511/94‑1 (MQ=60)
CCCGGTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTAT > SRR4302535.659738/1‑94 (MQ=60)
GTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCAT < SRR4302535.458245/94‑1 (MQ=60)
GTAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCAT > SRR4302535.224783/1‑94 (MQ=60)
TAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATA < SRR4302535.1708070/94‑1 (MQ=60)
TAGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATA > SRR4302535.4401869/1‑94 (MQ=60)
AGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATAT > SRR4302535.834213/1‑94 (MQ=60)
AGGTCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATAT < SRR4302535.2164165/94‑1 (MQ=60)
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TCAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACT < SRR4302535.1276242/94‑1 (MQ=60)
CAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACTG > SRR4302535.4433204/1‑94 (MQ=60)
CAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACTG > SRR4302535.292909/1‑94 (MQ=60)
CAACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACTG > SRR4302535.3684314/1‑94 (MQ=60)
ACGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACTGCA < SRR4302535.4676007/94‑1 (MQ=60)
CGCATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACTGCAA < SRR4302535.2803067/94‑1 (MQ=60)
CATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGGCACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACTGCAAAC > SRR4302535.1080851/1‑94 (MQ=60)
CATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACTGCAAAC < SRR4302535.517102/94‑1 (MQ=60)
CATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACTGCAAAC < SRR4302535.4264638/94‑1 (MQ=60)
|
CAGTGAGAGCGGAAATCCAGGCTCATCATCAGTTAATTAAGCAGGGTGTTATTTTATGACGACGATTCTCAAGCATCTCCCGGTAGGTCAACGTATTGGTATCGCTTTTTCTGGCGGTCTGGACACCAGTGCCGCACTGCTGTGGATGCGACAAAAGGGAGCGGTTCCTTATGCATATACTGCAAAC > NC_000913/3316223‑3316409
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
