Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,463,677 |
C→T |
G166G (GGC→GGT) |
hofD → |
leader peptidase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,463,677 | 0 | C | T | 100.0%
| 760.3
/ NA
| 216 | G166G (GGC→GGT) | hofD | leader peptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (109/107); total (109/107) |
Only 100 of 224 total aligned reads displayed.
GGTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTGCA > NC_000913/3463587‑3463766
|
gTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCa > 1:3023243/1‑93 (MQ=255)
gTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCa > 2:1238195/1‑93 (MQ=255)
gCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTTGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATg < 1:4618807/93‑1 (MQ=255)
gCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATg > 1:1268909/1‑93 (MQ=255)
tgtgGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGgt < 1:1473724/93‑1 (MQ=255)
tgtgGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGATACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGgt < 2:2129088/93‑1 (MQ=255)
gtggtgTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGgtg < 2:480299/93‑1 (MQ=255)
tggtgTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGgtgt < 2:1623989/93‑1 (MQ=255)
tggtgTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGgtgt < 2:4444356/93‑1 (MQ=255)
tggtgTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGgtgg > 2:884848/1‑92 (MQ=255)
tgtgtgtTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGtgtg < 2:2566698/92‑1 (MQ=255)
ggtgTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGtgtg > 1:3683154/1‑93 (MQ=255)
tgtgtTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGtggc > 2:3718775/1‑93 (MQ=255)
gtgtTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGtggct > 2:802365/1‑93 (MQ=255)
tttACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGtggctggc < 2:217991/93‑1 (MQ=255)
tttACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGtggctggc > 1:3976368/1‑93 (MQ=255)
tttACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGtggctggc > 2:3186322/1‑93 (MQ=255)
tttACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGtggctggc < 2:2003638/93‑1 (MQ=255)
tttACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGtggctgga > 2:1215632/1‑92 (MQ=255)
tACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCaa < 2:1725500/93‑1 (MQ=255)
gggCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGtt < 2:1006813/93‑1 (MQ=255)
gggCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGtt < 1:3885836/93‑1 (MQ=255)
ggCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTg > 1:3981648/1‑93 (MQ=255)
ggCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTg < 2:3877019/93‑1 (MQ=255)
gCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGc < 2:523701/93‑1 (MQ=255)
gTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCa > 2:2706306/1‑93 (MQ=255)
tCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCaa < 2:3242642/93‑1 (MQ=255)
tCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCaa > 2:623559/1‑93 (MQ=255)
cTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAAAGGTGGCAAt > 2:2492969/1‑93 (MQ=255)
ggTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAAAGTTGCCAATGa > 2:1022955/1‑93 (MQ=255)
gTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGGCAATGAt > 1:1171704/1‑93 (MQ=255)
gTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGGGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGaa > 1:1078074/1‑92 (MQ=255)
tAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATAc < 2:3922933/93‑1 (MQ=255)
tAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATAc < 2:571094/93‑1 (MQ=255)
aGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATAct > 1:1794338/1‑93 (MQ=255)
gTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATActg < 2:4090913/93‑1 (MQ=255)
gTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGGGTGGCTGGCAAACGTTGTCAATGATattt > 2:2851884/1‑90 (MQ=255)
tttGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATActgc < 1:3240339/93‑1 (MQ=255)
gTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGa > 1:2238815/1‑93 (MQ=255)
gTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGa > 1:871869/1‑93 (MQ=255)
tCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGAt > 1:3354852/1‑93 (MQ=255)
tCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGAt < 2:323006/93‑1 (MQ=255)
tCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGAt > 1:1818324/1‑93 (MQ=255)
cacaAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGAtt > 2:946127/1‑93 (MQ=255)
aaaGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATTCTGCTGATTGcc < 1:2457888/93‑1 (MQ=255)
aaaGAGGGATTGGGCTACGGTCATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGcc < 2:1393114/93‑1 (MQ=255)
aaGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGGCt > 1:1659468/1‑93 (MQ=255)
aaGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCt > 2:3377226/1‑93 (MQ=255)
aaGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCt > 2:40501/1‑93 (MQ=255)
agagGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTc < 2:4486032/93‑1 (MQ=255)
agGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGc < 2:2600652/93‑1 (MQ=255)
gggATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCt > 1:1587288/1‑93 (MQ=255)
gATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATAATGCTGATTGCCTCGCTgg > 1:1317264/1‑93 (MQ=255)
agtGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTggg < 1:2540590/91‑1 (MQ=255)
aTTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTggg < 1:4372288/93‑1 (MQ=255)
ttGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCACGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGt < 2:1417110/93‑1 (MQ=255)
tGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTg < 1:2626366/93‑1 (MQ=255)
gggCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTgg < 1:3163567/93‑1 (MQ=255)
ggCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGc > 2:3771516/1‑93 (MQ=255)
gCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTTGCTGGGGGGCa > 2:2078223/1‑93 (MQ=255)
gCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGct > 1:3828969/1‑92 (MQ=255)
gCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCa > 2:4415477/1‑93 (MQ=255)
gCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGGGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTTATTGCCCCGCGGGGAGGCa > 1:4679159/1‑93 (MQ=255)
cTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCAt > 1:922130/1‑93 (MQ=255)
cTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCAt > 2:3165443/1‑93 (MQ=255)
cTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCAt < 1:2366552/93‑1 (MQ=255)
tACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCAtt > 1:2812840/1‑93 (MQ=255)
tACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCAtt > 2:1783376/1‑93 (MQ=255)
aCGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTg > 1:2085343/1‑93 (MQ=255)
ggTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGt < 2:1094972/93‑1 (MQ=255)
tGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTa < 2:3456381/93‑1 (MQ=255)
tGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGGGGCATTGGTTa > 1:4241365/1‑93 (MQ=255)
gATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTAc < 1:1614871/93‑1 (MQ=255)
ttCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGcc > 2:3406180/1‑93 (MQ=255)
tCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCa < 1:454714/93‑1 (MQ=255)
tCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCa < 1:184971/93‑1 (MQ=255)
aaGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATc > 2:2629948/1‑93 (MQ=255)
aGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCg > 1:3781608/1‑93 (MQ=255)
aGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCg < 1:4003347/93‑1 (MQ=255)
gCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGt > 1:2850510/1‑93 (MQ=255)
gCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGt > 1:3049860/1‑93 (MQ=255)
cTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGtt < 2:3652820/93‑1 (MQ=255)
tACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGttt > 2:4012961/1‑93 (MQ=255)
tACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGttt > 2:232400/1‑93 (MQ=255)
tACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGttt > 1:201497/1‑93 (MQ=255)
tACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGttt > 1:825135/1‑93 (MQ=255)
aCTGGCCGTTGCAGGTGCATGGTGTGGCCGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTc < 2:729587/93‑1 (MQ=255)
aCTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTc < 2:3575112/93‑1 (MQ=255)
tGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTcac < 1:566974/93‑1 (MQ=255)
tGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTcac < 2:2905797/93‑1 (MQ=255)
gCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACaa > 1:2769747/1‑93 (MQ=255)
gCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACaa < 1:4514945/93‑1 (MQ=255)
gCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACtt > 1:2067232/1‑93 (MQ=255)
tGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCt > 2:4614382/1‑93 (MQ=255)
tGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCt > 2:4290512/1‑93 (MQ=255)
tGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCt < 2:2106488/93‑1 (MQ=255)
tGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCt < 1:1526840/93‑1 (MQ=255)
gCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTg > 1:1047650/1‑93 (MQ=255)
aGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTGCa > 1:2873392/1‑93 (MQ=255)
aGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTGCa > 1:322731/1‑93 (MQ=255)
|
GGTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTGCA > NC_000913/3463587‑3463766
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGGGGTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTGCAACG > NC_000913/3463584‑3463769
|
TGGGGTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGT < SRR4302535.2840740/94‑1 (MQ=60)
GGGGTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTG < SRR4302535.1774637/94‑1 (MQ=60)
GGTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCA > SRR4302535.3044410/1‑94 (MQ=60)
TGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATG > SRR4302535.1277980/1‑94 (MQ=60)
GCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTTGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGG < SRR4302535.4650191/94‑1 (MQ=60)
CTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTTGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGT < SRR4302535.3201757/94‑1 (MQ=60)
CTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGT > SRR4302535.2038267/1‑94 (MQ=60)
TGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTG < SRR4302535.1484275/94‑1 (MQ=60)
TGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTG > SRR4302535.3708640/1‑94 (MQ=60)
GGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGG < SRR4302535.2085376/94‑1 (MQ=60)
TGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCT > SRR4302535.2757334/1‑94 (MQ=60)
TGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCT < SRR4302535.2798546/94‑1 (MQ=60)
GTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTG < SRR4302535.1618524/94‑1 (MQ=60)
GTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTG < SRR4302535.3289193/94‑1 (MQ=60)
GTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGC > SRR4302535.4003533/1‑94 (MQ=60)
ACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAAC > SRR4302535.4067261/1‑94 (MQ=60)
CTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACG < SRR4302535.4173994/94‑1 (MQ=60)
TGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGCTTTCAAGCTACTAGCCGCTGCTGGAGCATGGTGTGGCTGGCTAACTT > SRR4302535.2565955/1‑94 (MQ=60)
GGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTT < SRR4302535.2486382/94‑1 (MQ=60)
GGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTG < SRR4302535.3605989/94‑1 (MQ=60)
GGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTG > SRR4302535.4008852/1‑94 (MQ=60)
GGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTG > SRR4302535.30483/1‑94 (MQ=60)
GGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTG < SRR4302535.3912490/94‑1 (MQ=60)
GGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGC < SRR4302535.2881370/94‑1 (MQ=60)
GTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAA < SRR4302535.2976338/94‑1 (MQ=60)
TCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAAT < SRR4302535.3147491/94‑1 (MQ=60)
CTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATG < SRR4302535.758692/94‑1 (MQ=60)
GGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGGCAATGAT > SRR4302535.1180071/1‑94 (MQ=60)
GGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGAT < SRR4302535.4279448/94‑1 (MQ=60)
GGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGGGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGAA > SRR4302535.1085744/1‑94 (MQ=60)
TAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACT > SRR4302535.1807310/1‑94 (MQ=60)
AGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCCATGATACTG > SRR4302535.1809339/1‑94 (MQ=60)
AGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTG > SRR4302535.1251601/1‑94 (MQ=60)
AGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTG < SRR4302535.1178046/94‑1 (MQ=60)
GTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGC < SRR4302535.3819368/94‑1 (MQ=60)
GTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGC > SRR4302535.1739230/1‑94 (MQ=60)
TTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCT < SRR4302535.3262839/94‑1 (MQ=60)
TTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTG > SRR4302535.1071625/1‑94 (MQ=60)
TGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGA > SRR4302535.2254743/1‑94 (MQ=60)
TGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGA > SRR4302535.878046/1‑94 (MQ=60)
GTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGAT > SRR4302535.3378213/1‑94 (MQ=60)
GTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGAT > SRR4302535.1831465/1‑94 (MQ=60)
CACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTG > SRR4302535.964181/1‑94 (MQ=60)
CACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTG > SRR4302535.568255/1‑94 (MQ=60)
CACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATAATGCTGATTG > SRR4302535.4005552/1‑94 (MQ=60)
CAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCC > SRR4302535.1963135/1‑94 (MQ=60)
AAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATTCTGCTGATTGCCT < SRR4302535.2475615/94‑1 (MQ=60)
AAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGGCT > SRR4302535.1671463/1‑94 (MQ=60)
AAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCT < SRR4302535.1542465/94‑1 (MQ=60)
AAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCCAACGGTGCCAATGATACTGCTGATTGGCTC > SRR4302535.4640736/1‑94 (MQ=60)
AAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTC < SRR4302535.3303004/94‑1 (MQ=60)
AAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTC > SRR4302535.4019639/1‑94 (MQ=60)
AGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCG < SRR4302535.3969211/94‑1 (MQ=60)
AGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCG > SRR4302535.4494150/1‑94 (MQ=60)
GAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGC > SRR4302535.285442/1‑94 (MQ=60)
AGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCT < SRR4302535.1501129/94‑1 (MQ=60)
AGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCT < SRR4302535.214207/94‑1 (MQ=60)
AGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCT > SRR4302535.1598742/1‑94 (MQ=60)
GGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTG < SRR4302535.1998273/94‑1 (MQ=60)
GGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGG < SRR4302535.3886801/94‑1 (MQ=60)
GGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATAATGCTGATTGCCTCGCTGG > SRR4302535.1326675/1‑94 (MQ=60)
GATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGG > SRR4302535.3869269/1‑94 (MQ=60)
GATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGG < SRR4302535.1654614/94‑1 (MQ=60)
ATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGT < SRR4302535.4402203/94‑1 (MQ=60)
AGTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGT < SRR4302535.2558890/94‑1 (MQ=60)
TTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTG < SRR4302535.853071/94‑1 (MQ=60)
TGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGG < SRR4302535.2645185/94‑1 (MQ=60)
GGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGC < SRR4302535.3185505/94‑1 (MQ=60)
GGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCT > SRR4302535.3855379/1‑94 (MQ=60)
GGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGGGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTTATTGCCCCGCGGGGAGGCA > SRR4302535.4710739/1‑94 (MQ=60)
GCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCAT > SRR4302535.928666/1‑94 (MQ=60)
CTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGGCAATGATAATGCTTATTGCCTCGCTGGGTGGCATT > SRR4302535.1669124/1‑94 (MQ=60)
CTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATT < SRR4302535.2383540/94‑1 (MQ=60)
CTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATT > SRR4302535.2832828/1‑94 (MQ=60)
TACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTG > SRR4302535.2100361/1‑94 (MQ=60)
ACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGG > SRR4302535.1339614/1‑94 (MQ=60)
CGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGT > SRR4302535.1850907/1‑94 (MQ=60)
CGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGT > SRR4302535.4582260/1‑94 (MQ=60)
CGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTCCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGT < SRR4302535.4559832/94‑1 (MQ=60)
GGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTT < SRR4302535.1298957/94‑1 (MQ=60)
GGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTT > SRR4302535.2759253/1‑94 (MQ=60)
GTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTA > SRR4302535.909559/1‑94 (MQ=60)
GTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGGGGCATTGGTTA > SRR4302535.4270394/1‑94 (MQ=60)
GATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACG < SRR4302535.1626512/94‑1 (MQ=60)
ATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGC > SRR4302535.872716/1‑94 (MQ=60)
TCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCAT < SRR4302535.186247/94‑1 (MQ=60)
TCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCAT < SRR4302535.457899/94‑1 (MQ=60)
AAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCG > SRR4302535.3807704/1‑94 (MQ=60)
AGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGT < SRR4302535.4030729/94‑1 (MQ=60)
AGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGT > SRR4302535.2870709/1‑94 (MQ=60)
AGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGT > SRR4302535.3071224/1‑94 (MQ=60)
CTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTT > SRR4302535.202875/1‑94 (MQ=60)
CTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTT > SRR4302535.830918/1‑94 (MQ=60)
TGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACA < SRR4302535.570944/94‑1 (MQ=60)
GGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAA > SRR4302535.4655037/1‑94 (MQ=60)
GGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAA > SRR4302535.2789468/1‑94 (MQ=60)
GCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAAC < SRR4302535.4545901/94‑1 (MQ=60)
GCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAAC < SRR4302535.2455387/94‑1 (MQ=60)
GCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAAC < SRR4302535.2362470/94‑1 (MQ=60)
CCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACT < SRR4302535.3255649/94‑1 (MQ=60)
CGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTT < SRR4302535.3017593/94‑1 (MQ=60)
CGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTT > SRR4302535.2318593/1‑94 (MQ=60)
CGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTT > SRR4302535.2082134/1‑94 (MQ=60)
GCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTAAGCCATCGTTTCACAACTTC > SRR4302535.3806509/1‑94 (MQ=60)
TGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTG < SRR4302535.1419674/94‑1 (MQ=60)
TGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTG > SRR4302535.1055079/1‑94 (MQ=60)
TGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTG < SRR4302535.1537841/94‑1 (MQ=60)
CAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTGCA > SRR4302535.324963/1‑94 (MQ=60)
CAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTGCA > SRR4302535.2893750/1‑94 (MQ=60)
AGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTGCAA > SRR4302535.40116/1‑94 (MQ=60)
GTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTGCAACG > SRR4302535.1899186/1‑94 (MQ=60)
|
TGGGGTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTGCAACG > NC_000913/3463584‑3463769
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
