Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,496,430 |
T→C |
I322I (ATT→ATC) |
cysG → |
uroporphyrinogen III methylase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,496,430 | 0 | T | C | 100.0%
| 609.1
/ NA
| 189 | I322I (ATT→ATC) | cysG | uroporphyrinogen III methylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (92/97); total (92/97) |
Only 100 of 198 total aligned reads displayed.
AGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAG > NC_000913/3496340‑3496519
|
aGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATccc < 1:2005841/93‑1 (MQ=255)
aGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATccc > 1:2313257/1‑93 (MQ=255)
ggCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCg < 2:2743951/93‑1 (MQ=255)
ggCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCg < 1:945109/93‑1 (MQ=255)
gCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGt > 2:2993519/1‑93 (MQ=255)
cAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGtt > 1:1452400/1‑93 (MQ=255)
aaaCGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTtc > 2:2792412/1‑93 (MQ=255)
aaCGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTtct < 1:2862103/93‑1 (MQ=255)
cgcgTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCg > 1:1806829/1‑93 (MQ=255)
gcgTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCgg < 1:1019143/93‑1 (MQ=255)
gtggtgCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGCGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCggtg > 1:3602438/1‑93 (MQ=255)
gtggtgCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATACCGTTCTCgggg > 2:819957/1‑91 (MQ=255)
tggtgCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCggtgg > 2:2942468/1‑93 (MQ=255)
tggtgCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCggtgg < 2:1650453/93‑1 (MQ=255)
ggtgCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCggtggt < 1:651349/93‑1 (MQ=255)
gtgCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGtt > 1:3929314/1‑93 (MQ=255)
tgCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTc < 1:4234447/93‑1 (MQ=255)
gCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTcc < 2:2079981/93‑1 (MQ=255)
gCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTcc < 2:1526943/93‑1 (MQ=255)
gCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCggg > 2:1215915/1‑93 (MQ=255)
gCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCggg > 1:3247832/1‑93 (MQ=255)
tGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCgggca < 1:4539437/93‑3 (MQ=255)
aaaGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCAtt < 1:1005462/93‑1 (MQ=255)
aaaGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCAtt < 2:17618/93‑1 (MQ=255)
aaGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTa > 2:4286723/1‑93 (MQ=255)
aGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTAc < 1:3134636/93‑1 (MQ=255)
aGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTAc > 1:2216373/1‑93 (MQ=255)
ggTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTAcc > 1:2147401/1‑93 (MQ=255)
ggTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTAcc > 2:3654348/1‑93 (MQ=255)
gCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAg < 1:2103969/93‑1 (MQ=255)
cGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGc < 1:951492/93‑1 (MQ=255)
gATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCt > 1:4641547/1‑93 (MQ=255)
aTCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCtt > 1:815283/1‑93 (MQ=255)
aTCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCtt > 2:4370232/1‑93 (MQ=255)
aTCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCtt < 1:1674749/93‑1 (MQ=255)
tCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTc < 2:3251754/93‑1 (MQ=255)
tCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTc > 1:2474196/1‑93 (MQ=255)
tCCGTATATTTTTGGCCGTGTTCGCGAAGAGCTGAAAACACTGTGCAACGCGTGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTc < 1:4424613/93‑1 (MQ=255)
cGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTg > 2:3388748/1‑93 (MQ=255)
tttATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGt > 1:1224254/1‑93 (MQ=255)
ttATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGATTTACGGCAGTTTCTgttg > 2:3065940/1‑90 (MQ=255)
aTTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGc < 2:4019923/93‑1 (MQ=255)
aTTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGCAAACACTGTGCAACGCGTGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGc < 1:3160662/93‑1 (MQ=255)
tttttGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGct > 2:551900/1‑93 (MQ=255)
tttttGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGct > 2:63889/1‑93 (MQ=255)
ttttGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGctc > 1:3920525/1‑93 (MQ=255)
ttGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTg < 1:3578922/93‑1 (MQ=255)
ttGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTg > 2:2336597/1‑93 (MQ=255)
ggCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGcc > 2:3181599/1‑93 (MQ=255)
gCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCt > 1:2580671/1‑93 (MQ=255)
ccGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTa > 2:2795907/1‑93 (MQ=255)
ccGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCAGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCtt > 1:1343413/1‑92 (MQ=255)
ccGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCATTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTa < 2:1850018/93‑1 (MQ=255)
cGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTAt > 1:3218795/1‑93 (MQ=255)
cGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTAt < 2:4496733/93‑1 (MQ=255)
gtggtgGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTAtt > 1:3383694/1‑93 (MQ=255)
tggtggCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTc < 2:2323110/93‑1 (MQ=255)
gtggCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCgg < 1:4049922/93‑1 (MQ=255)
gtggCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCgg < 2:2867467/93‑1 (MQ=255)
tggCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCggg > 2:196290/1‑93 (MQ=255)
tggCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCggg > 2:2431757/1‑93 (MQ=255)
tggCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCggg < 2:3562983/93‑1 (MQ=255)
ggCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGt > 2:580826/1‑93 (MQ=255)
ggCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGt > 2:1906256/1‑93 (MQ=255)
cGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTAt < 1:1370609/93‑1 (MQ=255)
gAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTAtt > 2:4073957/1‑93 (MQ=255)
gAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTAtt > 2:3459712/1‑93 (MQ=255)
aaGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTc < 2:4633897/93‑1 (MQ=255)
agagCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTcc < 1:4449796/93‑1 (MQ=255)
gagCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCa > 2:4421276/1‑93 (MQ=255)
agCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCAc < 1:2037562/93‑1 (MQ=255)
agCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCAc < 1:980979/93‑1 (MQ=255)
agCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCAc < 2:1214856/93‑1 (MQ=255)
gCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACt > 2:2490550/1‑93 (MQ=255)
gCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACt > 1:3277047/1‑93 (MQ=255)
tGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCa > 2:141027/1‑93 (MQ=255)
tGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCa < 2:746143/93‑1 (MQ=255)
tGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCa < 1:292914/93‑1 (MQ=255)
ggAAACACTGTGCAACGCGGGCATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGCTGCTCTGCCTATTAGGGTAGTCCACTCAc > 1:1596906/1‑93 (MQ=255)
gAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTACACTCACg > 2:4247074/1‑93 (MQ=255)
aaaCACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGc < 1:4607072/93‑1 (MQ=255)
cacTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATc < 2:1467242/93‑1 (MQ=255)
cacTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATc > 2:108409/1‑93 (MQ=255)
cTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATcgc > 1:3742507/1‑93 (MQ=255)
tgCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGAt > 1:4172031/1‑93 (MQ=255)
tgCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGAt < 2:3751976/93‑1 (MQ=255)
aaCGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTAt < 2:144046/93‑1 (MQ=255)
aaCGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTAt < 2:254401/93‑1 (MQ=255)
aCGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATg > 2:434048/1‑93 (MQ=255)
cgcgGGTGTCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGc < 2:1684115/93‑1 (MQ=255)
cgcgGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGc < 1:3321369/93‑1 (MQ=255)
cgcgGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGc < 1:2660211/93‑1 (MQ=255)
cgGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGccc < 2:2847734/93‑1 (MQ=255)
cgGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGccc > 1:1037014/1‑93 (MQ=255)
gggTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCa > 2:2592096/1‑93 (MQ=255)
gTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCaga < 1:4486168/93‑1 (MQ=255)
gTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCaga < 2:3950375/93‑1 (MQ=255)
gTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCaga < 1:270687/93‑1 (MQ=255)
tATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCagag > 2:687692/1‑93 (MQ=255)
tATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCagag < 1:2021869/93‑1 (MQ=255)
|
AGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAG > NC_000913/3496340‑3496519
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AAAGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTA > NC_000913/3496338‑3496523
|
AAAGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCC > SRR4302535.3743350/1‑94 (MQ=60)
AAAGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCC < SRR4302535.3200615/94‑1 (MQ=60)
AAAGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCC > SRR4302535.1610693/1‑94 (MQ=60)
AAAGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCC < SRR4302535.1136175/94‑1 (MQ=60)
AAGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCC > SRR4302535.2329812/1‑94 (MQ=60)
AGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCG < SRR4302535.2020289/94‑1 (MQ=60)
GGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGT < SRR4302535.951801/94‑1 (MQ=60)
GCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTT > SRR4302535.1462793/1‑94 (MQ=60)
AAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCT < SRR4302535.2169642/94‑1 (MQ=60)
AACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTC < SRR4302535.2882378/94‑1 (MQ=60)
ACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCG > SRR4302535.1819882/1‑94 (MQ=60)
GCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGT < SRR4302535.1026383/94‑1 (MQ=60)
GCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGT < SRR4302535.986580/94‑1 (MQ=60)
CGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGCGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTG > SRR4302535.3627436/1‑94 (MQ=60)
GGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTT < SRR4302535.3578073/94‑1 (MQ=60)
GGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTT > SRR4302535.3956152/1‑94 (MQ=60)
GGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTT < SRR4302535.655894/94‑1 (MQ=60)
GTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTC > SRR4302535.1500550/1‑94 (MQ=60)
TGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCC < SRR4302535.3341346/94‑1 (MQ=60)
TGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCC < SRR4302535.4263425/94‑1 (MQ=60)
GCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCG < SRR4302535.2135440/94‑1 (MQ=60)
GGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGG > SRR4302535.3270392/1‑94 (MQ=60)
CTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCA > SRR4302535.1654433/1‑94 (MQ=60)
TGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCAT > SRR4302535.4203382/1‑94 (MQ=60)
TGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCAT > SRR4302535.4640561/1‑94 (MQ=60)
TGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCAT < SRR4302535.4570486/94‑1 (MQ=60)
GAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATT < SRR4302535.1357278/94‑1 (MQ=60)
AAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTA < SRR4302535.1012607/94‑1 (MQ=60)
AAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTAC > SRR4302535.2232154/1‑94 (MQ=60)
AAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTAC > SRR4302535.1166708/1‑94 (MQ=60)
AAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTAC < SRR4302535.462200/94‑1 (MQ=60)
AGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACC < SRR4302535.3156458/94‑1 (MQ=60)
AGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACC > SRR4302535.2162846/1‑94 (MQ=60)
AGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACC < SRR4302535.697208/94‑1 (MQ=60)
GGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCG < SRR4302535.1381978/94‑1 (MQ=60)
GGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCG > SRR4302535.3658343/1‑94 (MQ=60)
GCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGC < SRR4302535.2119142/94‑1 (MQ=60)
CGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCT > SRR4302535.4493512/1‑94 (MQ=60)
CGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCT < SRR4302535.958238/94‑1 (MQ=60)
CGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCT > SRR4302535.4673013/1‑94 (MQ=60)
GATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTT > SRR4302535.390898/1‑94 (MQ=60)
GATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTT > SRR4302535.2660369/1‑94 (MQ=60)
GATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTT > SRR4302535.820999/1‑94 (MQ=60)
ATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTC > SRR4302535.2492042/1‑94 (MQ=60)
ATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTC < SRR4302535.1686875/94‑1 (MQ=60)
TCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCT < SRR4302535.3182414/94‑1 (MQ=60)
TCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCT < SRR4302535.3298478/94‑1 (MQ=60)
TCCGTATATTTTTGGCCGTGTTCGCGAAGAGCTGAAAACACTGTGCAACGCGTGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCT < SRR4302535.4454917/94‑1 (MQ=60)
GTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGT > SRR4302535.1233012/1‑94 (MQ=60)
GTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGT < SRR4302535.3618961/94‑1 (MQ=60)
ATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCT > SRR4302535.2306210/1‑94 (MQ=60)
ATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGCAAACACTGTGCAACGCGTGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCT < SRR4302535.3182589/94‑1 (MQ=60)
ATTGTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCT < SRR4302535.2040367/94‑1 (MQ=60)
TTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTC > SRR4302535.3947332/1‑94 (MQ=60)
TTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGC < SRR4302535.3603729/94‑1 (MQ=60)
GGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCT > SRR4302535.2599210/1‑94 (MQ=60)
GCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCAGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTT > SRR4302535.1353002/1‑94 (MQ=60)
CCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTAT > SRR4302535.3241094/1‑94 (MQ=60)
CGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATT < SRR4302535.4478901/94‑1 (MQ=60)
CGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATT > SRR4302535.3407215/1‑94 (MQ=60)
GTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGG < SRR4302535.4077649/94‑1 (MQ=60)
GTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGG < SRR4302535.4322769/94‑1 (MQ=60)
GCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTAT > SRR4302535.622875/1‑94 (MQ=60)
CGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATT < SRR4302535.1380401/94‑1 (MQ=60)
AAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCC > SRR4302535.4109626/1‑94 (MQ=60)
AAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCC > SRR4302535.2921932/1‑94 (MQ=60)
AGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCA < SRR4302535.4480317/94‑1 (MQ=60)
AGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCA > SRR4302535.3201277/1‑94 (MQ=60)
AGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCA > SRR4302535.3050787/1‑94 (MQ=60)
AGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACT < SRR4302535.987949/94‑1 (MQ=60)
AGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACT > SRR4302535.1040045/1‑94 (MQ=60)
AGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACT < SRR4302535.2052236/94‑1 (MQ=60)
AGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACT > SRR4302535.3299812/1‑94 (MQ=60)
CTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCA > SRR4302535.1911544/1‑94 (MQ=60)
TGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCAC < SRR4302535.294962/94‑1 (MQ=60)
TGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTCCCTATTCGGGTATTCCACTCAC > SRR4302535.2848732/1‑94 (MQ=60)
TGGAAACACTGTGCAACGCGGGCATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGCTGCTCTGCCTATTAGGGTAGTCCACTCAC > SRR4302535.1608424/1‑94 (MQ=60)
GGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACG > SRR4302535.3953064/1‑94 (MQ=60)
GGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACG > SRR4302535.180876/1‑94 (MQ=60)
GGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACG > SRR4302535.2033231/1‑94 (MQ=60)
GGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCACCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGGATTGCACTCACG > SRR4302535.2052621/1‑94 (MQ=60)
AAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCA < SRR4302535.4638380/94‑1 (MQ=60)
AAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCA > SRR4302535.957950/1‑94 (MQ=60)
AACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCAT < SRR4302535.2377647/94‑1 (MQ=60)
AACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCAT > SRR4302535.259110/1‑94 (MQ=60)
ACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGC > SRR4302535.3768402/1‑94 (MQ=60)
CTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCG > SRR4302535.4547957/1‑94 (MQ=60)
GTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGAT > SRR4302535.4200591/1‑94 (MQ=60)
GTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGAT > SRR4302535.1264976/1‑94 (MQ=60)
TGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATT < SRR4302535.3399480/94‑1 (MQ=60)
ACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGC < SRR4302535.2684909/94‑1 (MQ=60)
CGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCC < SRR4302535.2679267/94‑1 (MQ=60)
CGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCC < SRR4302535.3344479/94‑1 (MQ=60)
CGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCC < SRR4302535.91095/94‑1 (MQ=60)
GCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCC > SRR4302535.1044380/1‑94 (MQ=60)
GGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAG < SRR4302535.4024377/94‑1 (MQ=60)
GTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAG < SRR4302535.4516963/94‑1 (MQ=60)
GTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAG < SRR4302535.272570/94‑1 (MQ=60)
TATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGC < SRR4302535.2036443/94‑1 (MQ=60)
TATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGC < SRR4302535.3266485/94‑1 (MQ=60)
ATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCG > SRR4302535.3863787/1‑94 (MQ=60)
ATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCG < SRR4302535.1097000/94‑1 (MQ=60)
ATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCG > SRR4302535.629941/1‑94 (MQ=60)
TCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGT > SRR4302535.4477015/1‑94 (MQ=60)
CCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTA > SRR4302535.3927111/1‑94 (MQ=60)
|
AAAGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTA > NC_000913/3496338‑3496523
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
