Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1696 |
279.3 |
15874187 |
97.8% |
15524954 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,496,451 |
T→C |
G329G (GGT→GGC) |
cysG → |
uroporphyrinogen III methylase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,496,451 | 0 | T | C | 99.7%
| 1049.4
/ ‑5.2
| 332 | G329G (GGT→GGC) | cysG | uroporphyrinogen III methylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (149/182); total (149/183) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.59e-01 |
Only 100 of 347 total aligned reads displayed.
GAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACA > NC_000913/3496361‑3496540
|
gAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCAt > 2:1864919/1‑93 (MQ=255)
aaaGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCAtt < 2:4347460/93‑1 (MQ=255)
aGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTAc > 2:1099000/1‑93 (MQ=255)
cGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGc < 1:6269268/93‑1 (MQ=255)
cGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGc < 2:7757875/93‑1 (MQ=255)
aTCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCtt > 1:5387961/1‑93 (MQ=255)
tCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTc < 1:6597035/93‑1 (MQ=255)
tCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTc < 2:4887677/93‑1 (MQ=255)
ccGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCt < 1:818684/93‑1 (MQ=255)
gTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAATCACTGTGCAACGCGGTTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTgg < 2:7108639/93‑1 (MQ=255)
tttATTTTTGGCCGTGGTGGCTAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGt > 1:1378772/1‑93 (MQ=255)
tttATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGt < 2:5881902/93‑1 (MQ=255)
tttATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGt > 2:5114797/1‑93 (MQ=255)
ttttGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGctc < 2:2751164/93‑1 (MQ=255)
ttttGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGctc < 2:2560824/93‑1 (MQ=255)
ttttGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGctc < 2:4972455/93‑1 (MQ=255)
ttttGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGctc > 1:7549166/1‑93 (MQ=255)
ttttGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGctc < 2:660032/93‑1 (MQ=255)
tttGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGctct < 1:3912316/93‑1 (MQ=255)
ttGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTg < 2:5222136/93‑1 (MQ=255)
ccGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTa > 2:4485417/1‑93 (MQ=255)
gtggtgGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTAtt > 2:5339349/1‑93 (MQ=255)
gtggtgGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTAtt < 2:845128/93‑1 (MQ=255)
gtggtgGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTAtt < 1:3548998/93‑1 (MQ=255)
gtggtgGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTAtt < 2:7501970/93‑1 (MQ=255)
tggtggCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTc > 1:1006254/1‑93 (MQ=255)
gtggCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCgg < 2:1985701/93‑1 (MQ=255)
tggCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCggg > 1:5863248/1‑93 (MQ=255)
gCGAAGAGCTGGAAACCCTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTa < 2:2183181/93‑1 (MQ=255)
gCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTa < 2:359539/93‑1 (MQ=255)
gCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTa > 2:146330/1‑93 (MQ=255)
gCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTa < 2:42046/93‑1 (MQ=255)
gCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTa < 1:4404721/93‑1 (MQ=255)
cGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTAt < 2:469136/93‑1 (MQ=255)
gAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTAtt < 1:6346377/93‑1 (MQ=255)
gAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTAtt > 1:6808332/1‑93 (MQ=255)
aaGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTc > 1:3256571/1‑93 (MQ=255)
aaGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTc < 2:6663336/93‑1 (MQ=255)
aaGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTc > 2:1724965/1‑93 (MQ=255)
aaGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTc < 1:3645193/93‑1 (MQ=255)
agagCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTcc > 2:6151619/1‑93 (MQ=255)
agagCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTcc > 2:4719485/1‑93 (MQ=255)
agagCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTcc > 2:860127/1‑93 (MQ=255)
cTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCTGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTc > 1:6985013/1‑93 (MQ=255)
ggAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCAc > 1:4768415/1‑93 (MQ=255)
ggAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCAc > 1:7793858/1‑93 (MQ=255)
gAAACACTGTGCAACGCGGGTATCTCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACg > 2:3348686/1‑93 (MQ=255)
aaaCACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGc > 1:1698188/1‑93 (MQ=255)
aaCACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCa > 1:2444449/1‑93 (MQ=255)
aaCACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCa > 2:3082415/1‑93 (MQ=255)
aaCACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCa > 1:6935175/1‑93 (MQ=255)
acacTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCAt > 1:4531509/1‑93 (MQ=255)
cacTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATc < 2:5764207/93‑1 (MQ=255)
acTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCATGCATcg > 1:5165833/1‑93 (MQ=255)
acTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACCCATcg > 1:6424056/1‑93 (MQ=255)
tgtgCAACGCGGGCATCCCGTTCTCGGTTGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATcgcg > 2:5428367/1‑93 (MQ=255)
gCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGAtt > 2:1644889/1‑93 (MQ=255)
gCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGAtt > 1:61292/1‑93 (MQ=255)
cAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTCCCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTa < 2:6325561/93‑1 (MQ=255)
cAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCCCTCACGCATCGCGATTa < 1:2631181/93‑1 (MQ=255)
cAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTa < 2:4216897/93‑1 (MQ=255)
cAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTa < 2:3839649/93‑1 (MQ=255)
cgcgGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGc < 2:4627722/93‑1 (MQ=255)
cgGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGccc < 2:2409757/93‑1 (MQ=255)
cgGGAATCCCGTTCTCGGTGGTTCCTGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCTACTCACGCATCGCGATTATGccc > 2:4002717/1‑93 (MQ=255)
gggTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCa < 1:427924/93‑1 (MQ=255)
ggTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCag > 1:7065201/1‑93 (MQ=255)
gTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTACTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCaga < 1:6508614/93‑1 (MQ=255)
tATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCagag < 1:4700695/93‑1 (MQ=255)
atcccGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGc < 1:347750/90‑1 (MQ=255)
atcccGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGc < 1:4200540/90‑1 (MQ=255)
tcccGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCg > 2:6862526/3‑93 (MQ=255)
tcccGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCg > 2:3044198/3‑93 (MQ=255)
cccGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGt < 1:6707285/92‑1 (MQ=255)
ccGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTa < 2:7609194/93‑1 (MQ=255)
ccGTTCTCGGTGGTTCCGGGCAGTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCAGCGAGATTATCCCCAGAGCGTa < 2:719662/93‑1 (MQ=255)
cGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTAc > 2:2344468/1‑93 (MQ=255)
cGTTCTCGGTGGTGCCGCGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCCCTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTAc < 2:1139579/93‑1 (MQ=255)
cGTTCTCGGGGGTTCCGGGCATTCCCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGCTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTAc < 2:375813/93‑1 (MQ=255)
ttCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGc > 2:1899351/1‑93 (MQ=255)
ttCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGc > 1:1040517/1‑93 (MQ=255)
ttCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGc > 2:3301818/1‑93 (MQ=255)
ttCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGc > 1:3174259/1‑93 (MQ=255)
ctcGGTGGTTCCGGGCATTCCCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTAGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGAGTACACtt < 2:7036725/93‑1 (MQ=255)
tcGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTa > 1:4032794/1‑93 (MQ=255)
tcGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTa > 1:1186685/1‑93 (MQ=255)
cGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTaa < 1:7354902/93‑1 (MQ=255)
ggtggtTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAAt < 1:1562558/93‑1 (MQ=255)
ggtTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTAc < 2:1332858/93‑1 (MQ=255)
ggtTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTAc > 2:7322550/1‑93 (MQ=255)
ggtTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTAc > 2:5687302/1‑93 (MQ=255)
gtTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTAcc > 1:2244413/1‑93 (MQ=255)
ttCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCg < 1:2063164/93‑1 (MQ=255)
ccGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGa < 1:5494218/93‑1 (MQ=255)
cGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGac < 2:6318278/93‑1 (MQ=255)
cGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGac > 2:4528126/1‑93 (MQ=255)
cGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGac < 2:2707863/93‑1 (MQ=255)
gggCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGaca > 2:593082/1‑93 (MQ=255)
gggCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGaca > 1:1947946/1‑93 (MQ=255)
gggCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGaca > 2:4394781/1‑93 (MQ=255)
|
GAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACA > NC_000913/3496361‑3496540
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTA > NC_000913/3496358‑3496544
|
GCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGC < SRR4302543.5753834/94‑1 (MQ=60)
CTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCA > SRR4302543.6982967/1‑94 (MQ=60)
TGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCAT > SRR4302543.4031300/1‑94 (MQ=60)
TGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCAT > SRR4302543.2229939/1‑94 (MQ=60)
TGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCAT > SRR4302543.5514793/1‑94 (MQ=60)
TGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCAT < SRR4302543.7463499/94‑1 (MQ=60)
TGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCAT > SRR4302543.5010368/1‑94 (MQ=60)
GAAAGGTGGCGATCAGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATT > SRR4302543.843932/1‑94 (MQ=60)
AAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTA > SRR4302543.7838555/1‑94 (MQ=60)
AGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACC > SRR4302543.3272528/1‑94 (MQ=60)
GGTGGAGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCG > SRR4302543.7910466/1‑94 (MQ=60)
TGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGAATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCA > SRR4302543.3522327/1‑94 (MQ=60)
GCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGC < SRR4302543.6429632/94‑1 (MQ=60)
CGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCT < SRR4302543.6328388/94‑1 (MQ=60)
GATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTT > SRR4302543.5436915/1‑94 (MQ=60)
GATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTT > SRR4302543.72875/1‑94 (MQ=60)
GATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTT > SRR4302543.4364652/1‑94 (MQ=60)
ATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTC > SRR4302543.2827905/1‑94 (MQ=60)
TCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCTGGCATTACCGCAGCTTCT > SRR4302543.5592293/1‑94 (MQ=60)
TCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCT < SRR4302543.2854993/94‑1 (MQ=60)
TCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCT < SRR4302543.6659204/94‑1 (MQ=60)
CCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTG < SRR4302543.6783202/94‑1 (MQ=60)
CCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTG > SRR4302543.4866396/1‑94 (MQ=60)
CCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTG < SRR4302543.825890/94‑1 (MQ=60)
CGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGG < SRR4302543.3571953/94‑1 (MQ=60)
GTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCTAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGT > SRR4302543.1391166/1‑94 (MQ=60)
GTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGT > SRR4302543.4768600/1‑94 (MQ=60)
GTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGT < SRR4302543.6413895/94‑1 (MQ=60)
GTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGT > SRR4302543.4436290/1‑94 (MQ=60)
TTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTT < SRR4302543.3639083/94‑1 (MQ=60)
TTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTT < SRR4302543.6798049/94‑1 (MQ=60)
TTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTT < SRR4302543.7323332/94‑1 (MQ=60)
TTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTT < SRR4302543.6255466/94‑1 (MQ=60)
TTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTG < SRR4302543.3654620/94‑1 (MQ=60)
TATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGC > SRR4302543.4076054/1‑94 (MQ=60)
ATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCT < SRR4302543.1334663/94‑1 (MQ=60)
ATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCT < SRR4302543.688866/94‑1 (MQ=60)
TTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTC > SRR4302543.7621077/1‑94 (MQ=60)
TTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCT < SRR4302543.1614037/94‑1 (MQ=60)
TTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTG < SRR4302543.3946850/94‑1 (MQ=60)
TTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGC < SRR4302543.1580879/94‑1 (MQ=60)
GGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCT < SRR4302543.1139524/94‑1 (MQ=60)
CGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATT > SRR4302543.1329144/1‑94 (MQ=60)
CGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATT < SRR4302543.7355788/94‑1 (MQ=60)
CGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATT < SRR4302543.1674773/94‑1 (MQ=60)
GTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTC < SRR4302543.2538303/94‑1 (MQ=60)
GTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTC > SRR4302543.1015157/1‑94 (MQ=60)
GTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTC > SRR4302543.1015156/1‑94 (MQ=60)
GTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTC < SRR4302543.3580491/94‑1 (MQ=60)
GTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTC < SRR4302543.2139701/94‑1 (MQ=60)
TGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCG < SRR4302543.3357340/94‑1 (MQ=60)
TGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCG < SRR4302543.6751712/94‑1 (MQ=60)
GTGGCGAAGAGCTGGAAACCCTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGG < SRR4302543.3405667/94‑1 (MQ=60)
GTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGG > SRR4302543.5582729/1‑94 (MQ=60)
GTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGG > SRR4302543.5916614/1‑94 (MQ=60)
GGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTA < SRR4302543.5515187/94‑1 (MQ=60)
GCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTAT > SRR4302543.140281/1‑94 (MQ=60)
GCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTAT < SRR4302543.4444658/94‑1 (MQ=60)
GCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTAT < SRR4302543.1024791/94‑1 (MQ=60)
CGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATT < SRR4302543.5353181/94‑1 (MQ=60)
CGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATT < SRR4302543.7007303/94‑1 (MQ=60)
CGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATT > SRR4302543.6872616/1‑94 (MQ=60)
CGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATT > SRR4302543.4648732/1‑94 (MQ=60)
GAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTC < SRR4302543.6585689/94‑1 (MQ=60)
GAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTC > SRR4302543.3286009/1‑94 (MQ=60)
GAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTC < SRR4302543.6406049/94‑1 (MQ=60)
AAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCC < SRR4302543.3677247/94‑1 (MQ=60)
AAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCC > SRR4302543.7015598/1‑94 (MQ=60)
AGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCA > SRR4302543.259883/1‑94 (MQ=60)
AGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCCGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCA < SRR4302543.6337771/94‑1 (MQ=60)
AGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACT < SRR4302543.6890515/94‑1 (MQ=60)
GCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCTGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTC > SRR4302543.7050755/1‑94 (MQ=60)
CTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCA > SRR4302543.597311/1‑94 (MQ=60)
TGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCAC > SRR4302543.7867311/1‑94 (MQ=60)
TGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCAC > SRR4302543.4811998/1‑94 (MQ=60)
TGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCAC < SRR4302543.4744634/94‑1 (MQ=60)
TGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCAC < SRR4302543.5425970/94‑1 (MQ=60)
GGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACG > SRR4302543.4942258/1‑94 (MQ=60)
GAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGC > SRR4302543.1713415/1‑94 (MQ=60)
AAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCA > SRR4302543.2466482/1‑94 (MQ=60)
AAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCA > SRR4302543.2352054/1‑94 (MQ=60)
AAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCA > SRR4302543.6500470/1‑94 (MQ=60)
AAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCA > SRR4302543.7000409/1‑94 (MQ=60)
AACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCAT > SRR4302543.941098/1‑94 (MQ=60)
AACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCAT > SRR4302543.4572750/1‑94 (MQ=60)
ACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATC < SRR4302543.701924/94‑1 (MQ=60)
ACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATC > SRR4302543.6288954/1‑94 (MQ=60)
CACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCG < SRR4302543.70567/94‑1 (MQ=60)
CACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCATGCATCG > SRR4302543.5212503/1‑94 (MQ=60)
CACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACCCATCG > SRR4302543.6484589/1‑94 (MQ=60)
CACTGTGCAACGCAGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCG < SRR4302543.7058903/94‑1 (MQ=60)
ACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGC > SRR4302543.1860093/1‑94 (MQ=60)
CTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCG < SRR4302543.6846757/94‑1 (MQ=60)
CTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCG < SRR4302543.7889696/94‑1 (MQ=60)
TGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGA > SRR4302543.6007037/1‑94 (MQ=60)
TGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATT > SRR4302543.61832/1‑94 (MQ=60)
TGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATT < SRR4302543.2004450/94‑1 (MQ=60)
TGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATT > SRR4302543.6760125/1‑94 (MQ=60)
CAACGCTGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTAT < SRR4302543.198682/94‑1 (MQ=60)
CAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCCCTCACGCATCGCGATTAT < SRR4302543.2654999/94‑1 (MQ=60)
CAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTAT < SRR4302543.4466079/94‑1 (MQ=60)
CAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTAT < SRR4302543.639554/94‑1 (MQ=60)
CAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTAT > SRR4302543.3776573/1‑94 (MQ=60)
AACGCTGGTATCCCGTGCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATG < SRR4302543.1980019/94‑1 (MQ=60)
ACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGC > SRR4302543.4514247/1‑94 (MQ=60)
CGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCC < SRR4302543.1254466/94‑1 (MQ=60)
GCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCC < SRR4302543.3598796/94‑1 (MQ=60)
CGGGTATCTCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCA < SRR4302543.2450312/94‑1 (MQ=60)
CGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCA > SRR4302543.65350/1‑94 (MQ=60)
CGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCA < SRR4302543.4116211/94‑1 (MQ=60)
CGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCA > SRR4302543.6361837/1‑94 (MQ=60)
GGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAG > SRR4302543.7133798/1‑94 (MQ=60)
GGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAG < SRR4302543.431933/94‑1 (MQ=60)
GGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGA > SRR4302543.4592753/1‑94 (MQ=60)
GGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGA > SRR4302543.5518667/1‑94 (MQ=60)
GTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAG < SRR4302543.6568442/94‑1 (MQ=60)
GTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTACTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAG < SRR4302543.6569922/94‑1 (MQ=60)
TATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGC < SRR4302543.4743626/94‑1 (MQ=60)
ATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCG < SRR4302543.4238626/94‑1 (MQ=60)
ATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCG < SRR4302543.350962/94‑1 (MQ=60)
CCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTA < SRR4302543.6770610/94‑1 (MQ=60)
CCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTA > SRR4302543.4436980/1‑94 (MQ=60)
CCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTA > SRR4302543.3370178/1‑94 (MQ=60)
CCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTA > SRR4302543.4313418/1‑94 (MQ=60)
CCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTAC > SRR4302543.78566/1‑94 (MQ=60)
CGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACACACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACG > SRR4302543.1834548/1‑94 (MQ=60)
GTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGC > SRR4302543.4620694/1‑94 (MQ=60)
GTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGC > SRR4302543.3202857/1‑94 (MQ=60)
GTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGC > SRR4302543.1049786/1‑94 (MQ=60)
GTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGC > SRR4302543.1476018/1‑94 (MQ=60)
TCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTT < SRR4302543.2880622/94‑1 (MQ=60)
CTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTA > SRR4302543.1186825/1‑94 (MQ=60)
CTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTA > SRR4302543.1197390/1‑94 (MQ=60)
CTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTA > SRR4302543.4068858/1‑94 (MQ=60)
CGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAAT < SRR4302543.4314295/94‑1 (MQ=60)
CGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAAT < SRR4302543.5959025/94‑1 (MQ=60)
CGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAAT < SRR4302543.7425653/94‑1 (MQ=60)
CGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAAT < SRR4302543.7470635/94‑1 (MQ=60)
CGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAAT < SRR4302543.7556262/94‑1 (MQ=60)
GGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATT < SRR4302543.1576511/94‑1 (MQ=60)
TGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTAC > SRR4302543.663878/1‑94 (MQ=60)
GGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACC > SRR4302543.3850808/1‑94 (MQ=60)
GGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACC > SRR4302543.2264773/1‑94 (MQ=60)
TTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGG < SRR4302543.3271061/94‑1 (MQ=60)
TTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGG < SRR4302543.2081618/94‑1 (MQ=60)
CCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGAC > SRR4302543.7839826/1‑94 (MQ=60)
CCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGAC > SRR4302543.4142997/1‑94 (MQ=60)
CCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGAC < SRR4302543.2273832/94‑1 (MQ=60)
CCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGAC < SRR4302543.5544053/94‑1 (MQ=60)
CGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACA > SRR4302543.1965427/1‑94 (MQ=60)
CGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACA > SRR4302543.404643/1‑94 (MQ=60)
GGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACAC > SRR4302543.230478/1‑94 (MQ=60)
GGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACT < SRR4302543.7197261/94‑1 (MQ=60)
CATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTA > SRR4302543.2505362/1‑94 (MQ=60)
CATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTA > SRR4302543.5652679/1‑94 (MQ=60)
CATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTA > SRR4302543.3543439/1‑94 (MQ=60)
|
GCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTA > NC_000913/3496358‑3496544
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
