Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,496,451 |
T→C |
G329G (GGT→GGC) |
cysG → |
uroporphyrinogen III methylase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,496,451 | 0 | T | C | 100.0%
| 648.8
/ NA
| 204 | G329G (GGT→GGC) | cysG | uroporphyrinogen III methylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (108/96); total (108/96) |
Only 100 of 210 total aligned reads displayed.
GAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACA > NC_000913/3496361‑3496540
|
gAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCAt > 1:4609239/1‑93 (MQ=255)
gAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCAt > 1:4174809/1‑93 (MQ=255)
gAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCAt < 1:1347658/93‑1 (MQ=255)
aaGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTa < 1:458990/93‑1 (MQ=255)
aaGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTa < 2:3016488/93‑1 (MQ=255)
aGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTAc > 1:1158427/1‑93 (MQ=255)
aGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTAc > 1:2216373/1‑93 (MQ=255)
ggTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTAcc < 2:4260234/93‑1 (MQ=255)
ggTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTAcc < 1:1372172/93‑1 (MQ=255)
ggTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTAcc > 1:2147401/1‑93 (MQ=255)
cGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGc < 1:951492/93‑1 (MQ=255)
cGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGc < 2:1902499/93‑1 (MQ=255)
aTCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCtt > 1:388201/1‑93 (MQ=255)
aTCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCtt > 1:2641449/1‑93 (MQ=255)
tCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTc < 1:3275727/93‑1 (MQ=255)
tCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTc < 1:3160487/93‑1 (MQ=255)
tCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTc < 2:3251754/93‑1 (MQ=255)
tCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTc > 2:195368/1‑93 (MQ=255)
tCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTc > 1:2474196/1‑93 (MQ=255)
ccGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCt < 2:4357678/93‑1 (MQ=255)
gTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTgg < 1:3594019/93‑1 (MQ=255)
ttATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGATTTACGGCAGTTTCTgttg > 2:3065940/1‑90 (MQ=255)
ttATTTCTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGtt > 2:1494771/1‑93 (MQ=255)
aTTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGc < 2:4019923/93‑1 (MQ=255)
aTTGTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGc < 1:2025769/93‑1 (MQ=255)
tttttGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGct > 2:2441824/1‑93 (MQ=255)
ttttGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGctc > 1:3920525/1‑93 (MQ=255)
ttGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTg > 2:2336597/1‑93 (MQ=255)
tGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGc < 2:674674/93‑1 (MQ=255)
ggCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGcc > 2:3181599/1‑93 (MQ=255)
ccGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTa > 2:2795907/1‑93 (MQ=255)
cGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTAt < 2:4496733/93‑1 (MQ=255)
tggtggCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTc < 2:2323110/93‑1 (MQ=255)
tggtggCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTc < 2:713991/93‑1 (MQ=255)
gtggCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCgg < 2:2867467/93‑1 (MQ=255)
gtggCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCgg < 1:4049922/93‑1 (MQ=255)
gAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTAtt > 2:4073957/1‑93 (MQ=255)
aaGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTc < 2:4633897/93‑1 (MQ=255)
agagCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTcc < 2:2952085/93‑1 (MQ=255)
agagCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTcc > 1:2901423/1‑93 (MQ=255)
agagCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTcc < 1:4449796/93‑1 (MQ=255)
gagCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCa > 1:3179295/1‑93 (MQ=255)
gagCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCa > 2:4421276/1‑93 (MQ=255)
gagCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCa > 1:3029580/1‑93 (MQ=255)
agCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCAc > 2:3632745/1‑93 (MQ=255)
gCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACt > 2:2490550/1‑93 (MQ=255)
tGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCa > 2:141027/1‑93 (MQ=255)
tGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCa < 2:746143/93‑1 (MQ=255)
ggAAACACTGTGCAACGCGGGCATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGCTGCTCTGCCTATTAGGGTAGTCCACTCAc > 1:1596906/1‑93 (MQ=255)
gAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACg > 1:2018684/1‑93 (MQ=255)
gAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCACCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGGATTGCACTCACg > 1:2037944/1‑93 (MQ=255)
acacTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCAt > 1:257334/1‑93 (MQ=255)
cacTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATc > 2:1972099/1‑93 (MQ=255)
cTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATcgc > 1:3742507/1‑93 (MQ=255)
cTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATcgc < 2:1770117/93‑1 (MQ=255)
cTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATcgc < 2:63470/93‑1 (MQ=255)
tgCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGAt < 2:3751976/93‑1 (MQ=255)
tgCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGAt < 1:3376002/93‑1 (MQ=255)
tgCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGAt > 1:1255993/1‑93 (MQ=255)
cAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTa < 2:1029250/93‑1 (MQ=255)
aaCGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTAt < 2:254401/93‑1 (MQ=255)
aaCGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTAt < 2:144046/93‑1 (MQ=255)
cgcgGGTGTCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGc < 2:1684115/93‑1 (MQ=255)
cgcgGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGc > 2:574114/1‑93 (MQ=255)
cgGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGccc < 2:2847734/93‑1 (MQ=255)
cgGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGccc > 1:1037014/1‑93 (MQ=255)
gTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCaga < 1:270687/93‑1 (MQ=255)
gTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCaga < 1:4486168/93‑1 (MQ=255)
tcccGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCg < 2:1329279/91‑1 (MQ=255)
tcccGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCg > 2:4100419/3‑93 (MQ=255)
tcccGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCg > 1:625590/3‑93 (MQ=255)
cccGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGt < 2:3395735/92‑1 (MQ=255)
cccGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGt > 1:4446519/2‑93 (MQ=255)
ctgTTCTCAGTGGTTCCGTGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATGCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTa < 2:3594699/91‑1 (MQ=255)
ccGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTa > 2:477508/1‑93 (MQ=255)
ccGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTa < 2:417597/93‑1 (MQ=255)
gTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACg > 1:3319937/1‑93 (MQ=255)
gTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACg > 1:4302766/1‑93 (MQ=255)
tctcGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCt < 2:2688186/93‑1 (MQ=255)
tctcGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCt > 2:3936648/1‑93 (MQ=255)
tctcGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCt < 1:4129744/93‑1 (MQ=255)
ctcGGTCGTTTCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCtt < 1:1012034/93‑1 (MQ=255)
tcGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTa < 2:1651112/93‑1 (MQ=255)
cGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTaa > 1:4091480/1‑93 (MQ=255)
cGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTaa > 1:1134366/1‑93 (MQ=255)
cGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTaa < 1:3234682/93‑1 (MQ=255)
cGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTaa < 1:4534484/93‑1 (MQ=255)
ggtggtTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAAt < 2:1140842/93‑1 (MQ=255)
gtggtTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAAtt > 1:4683148/1‑93 (MQ=255)
gtggtTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAAtt < 2:3977351/93‑1 (MQ=255)
gtggtTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAAtt > 1:1004881/1‑93 (MQ=255)
tggtTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTa > 1:746911/1‑93 (MQ=255)
gtTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTAcc < 1:2326028/93‑1 (MQ=255)
gtTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTAcc < 1:1671887/93‑1 (MQ=255)
ttCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCg < 1:854073/93‑1 (MQ=255)
ttCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCg < 1:1876657/93‑1 (MQ=255)
ccGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGa < 1:950719/93‑1 (MQ=255)
cGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGac < 2:2423478/93‑1 (MQ=255)
cGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGac > 1:3990715/1‑93 (MQ=255)
gggCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGaca > 1:3063326/1‑93 (MQ=255)
|
GAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACA > NC_000913/3496361‑3496540
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTA > NC_000913/3496359‑3496544
|
CTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCA > SRR4302535.1654433/1‑94 (MQ=60)
TGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCAT > SRR4302535.4203382/1‑94 (MQ=60)
TGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCAT < SRR4302535.4570486/94‑1 (MQ=60)
TGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCAT > SRR4302535.4640561/1‑94 (MQ=60)
GAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATT < SRR4302535.1357278/94‑1 (MQ=60)
AAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTA < SRR4302535.1012607/94‑1 (MQ=60)
AAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTAC > SRR4302535.1166708/1‑94 (MQ=60)
AAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTAC < SRR4302535.462200/94‑1 (MQ=60)
AAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTAC > SRR4302535.2232154/1‑94 (MQ=60)
AGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACC < SRR4302535.697208/94‑1 (MQ=60)
AGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACC > SRR4302535.2162846/1‑94 (MQ=60)
AGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACC < SRR4302535.3156458/94‑1 (MQ=60)
GGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCG < SRR4302535.1381978/94‑1 (MQ=60)
GGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCG > SRR4302535.3658343/1‑94 (MQ=60)
GCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGC < SRR4302535.2119142/94‑1 (MQ=60)
CGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCT > SRR4302535.4673013/1‑94 (MQ=60)
CGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCT > SRR4302535.4493512/1‑94 (MQ=60)
CGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCT < SRR4302535.958238/94‑1 (MQ=60)
GATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTT > SRR4302535.2660369/1‑94 (MQ=60)
GATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTT > SRR4302535.390898/1‑94 (MQ=60)
GATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTT > SRR4302535.820999/1‑94 (MQ=60)
ATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTC > SRR4302535.2492042/1‑94 (MQ=60)
ATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTC < SRR4302535.1686875/94‑1 (MQ=60)
TCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCT < SRR4302535.3182414/94‑1 (MQ=60)
TCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCT < SRR4302535.3298478/94‑1 (MQ=60)
TCCGTATATTTTTGGCCGTGTTCGCGAAGAGCTGAAAACACTGTGCAACGCGTGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCT < SRR4302535.4454917/94‑1 (MQ=60)
GTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGT > SRR4302535.1233012/1‑94 (MQ=60)
GTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGT < SRR4302535.3618961/94‑1 (MQ=60)
ATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCT > SRR4302535.2306210/1‑94 (MQ=60)
ATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGCAAACACTGTGCAACGCGTGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCT < SRR4302535.3182589/94‑1 (MQ=60)
ATTGTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCT < SRR4302535.2040367/94‑1 (MQ=60)
TTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTC > SRR4302535.3947332/1‑94 (MQ=60)
TTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGC < SRR4302535.3603729/94‑1 (MQ=60)
GGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCT > SRR4302535.2599210/1‑94 (MQ=60)
GCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCAGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTT > SRR4302535.1353002/1‑94 (MQ=60)
CCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTAT > SRR4302535.3241094/1‑94 (MQ=60)
CGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATT > SRR4302535.3407215/1‑94 (MQ=60)
CGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATT < SRR4302535.4478901/94‑1 (MQ=60)
GTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGG < SRR4302535.4322769/94‑1 (MQ=60)
GTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGG < SRR4302535.4077649/94‑1 (MQ=60)
GCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTAT > SRR4302535.622875/1‑94 (MQ=60)
CGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATT < SRR4302535.1380401/94‑1 (MQ=60)
AAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCC > SRR4302535.2921932/1‑94 (MQ=60)
AAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCC > SRR4302535.4109626/1‑94 (MQ=60)
AGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCA > SRR4302535.3201277/1‑94 (MQ=60)
AGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCA < SRR4302535.4480317/94‑1 (MQ=60)
AGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCA > SRR4302535.3050787/1‑94 (MQ=60)
AGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACT > SRR4302535.3299812/1‑94 (MQ=60)
AGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACT < SRR4302535.987949/94‑1 (MQ=60)
AGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACT > SRR4302535.1040045/1‑94 (MQ=60)
AGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACT < SRR4302535.2052236/94‑1 (MQ=60)
CTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCA > SRR4302535.1911544/1‑94 (MQ=60)
TGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCAC < SRR4302535.294962/94‑1 (MQ=60)
TGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTCCCTATTCGGGTATTCCACTCAC > SRR4302535.2848732/1‑94 (MQ=60)
TGGAAACACTGTGCAACGCGGGCATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGCTGCTCTGCCTATTAGGGTAGTCCACTCAC > SRR4302535.1608424/1‑94 (MQ=60)
GGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACG > SRR4302535.3953064/1‑94 (MQ=60)
GGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACG > SRR4302535.2033231/1‑94 (MQ=60)
GGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACG > SRR4302535.180876/1‑94 (MQ=60)
GGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCACCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGGATTGCACTCACG > SRR4302535.2052621/1‑94 (MQ=60)
AAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCA > SRR4302535.957950/1‑94 (MQ=60)
AAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCA < SRR4302535.4638380/94‑1 (MQ=60)
AACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCAT > SRR4302535.259110/1‑94 (MQ=60)
AACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCAT < SRR4302535.2377647/94‑1 (MQ=60)
ACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGC > SRR4302535.3768402/1‑94 (MQ=60)
CTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCG > SRR4302535.4547957/1‑94 (MQ=60)
GTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGAT > SRR4302535.4200591/1‑94 (MQ=60)
GTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGAT > SRR4302535.1264976/1‑94 (MQ=60)
TGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATT < SRR4302535.3399480/94‑1 (MQ=60)
ACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGC < SRR4302535.2684909/94‑1 (MQ=60)
CGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCC < SRR4302535.3344479/94‑1 (MQ=60)
CGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCC < SRR4302535.91095/94‑1 (MQ=60)
CGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCC < SRR4302535.2679267/94‑1 (MQ=60)
GCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCC > SRR4302535.1044380/1‑94 (MQ=60)
GGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAG < SRR4302535.4024377/94‑1 (MQ=60)
GTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAG < SRR4302535.272570/94‑1 (MQ=60)
GTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAG < SRR4302535.4516963/94‑1 (MQ=60)
TATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGC < SRR4302535.2036443/94‑1 (MQ=60)
TATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGC < SRR4302535.3266485/94‑1 (MQ=60)
ATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCG > SRR4302535.3863787/1‑94 (MQ=60)
ATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCG > SRR4302535.629941/1‑94 (MQ=60)
ATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCG < SRR4302535.1097000/94‑1 (MQ=60)
TCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGT > SRR4302535.4477015/1‑94 (MQ=60)
ccctttagcaGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCTCCCACGCTTCGCGATTATGCCCAGAGCGTA < SRR4302535.3727123/84‑1 (MQ=60)
CCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTA > SRR4302535.3927111/1‑94 (MQ=60)
CCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTAC < SRR4302535.1521293/94‑1 (MQ=60)
CCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTAC > SRR4302535.917083/1‑94 (MQ=60)
CCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTAC < SRR4302535.2168578/94‑1 (MQ=60)
CGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACG > SRR4302535.4332203/1‑94 (MQ=60)
CGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACG > SRR4302535.3343038/1‑94 (MQ=60)
GTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGC > SRR4302535.4129119/1‑94 (MQ=60)
TCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTT < SRR4302535.4158003/94‑1 (MQ=60)
CTCGGTCGTTTCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTA < SRR4302535.1019226/94‑1 (MQ=60)
TCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAA > SRR4302535.1142460/1‑94 (MQ=60)
TCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAA > SRR4302535.4119476/1‑94 (MQ=60)
CGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAAT < SRR4302535.4565514/94‑1 (MQ=60)
CGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAAT < SRR4302535.3257131/94‑1 (MQ=60)
CGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAAT < SRR4302535.4454123/94‑1 (MQ=60)
GGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATT > SRR4302535.4714814/1‑94 (MQ=60)
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TGGTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTAC > SRR4302535.4565888/1‑94 (MQ=60)
GTTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCG < SRR4302535.1683988/94‑1 (MQ=60)
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TTCCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGG < SRR4302535.860089/94‑1 (MQ=60)
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CCGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGAC > SRR4302535.4018010/1‑94 (MQ=60)
CGGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACA > SRR4302535.3084741/1‑94 (MQ=60)
GGGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACAC > SRR4302535.4463604/1‑94 (MQ=60)
GGCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACT < SRR4302535.2782179/94‑1 (MQ=60)
GCATTACCGGAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTT > SRR4302535.2908672/1‑94 (MQ=60)
GCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTT > SRR4302535.4368967/1‑94 (MQ=60)
GCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTT > SRR4302535.4699581/1‑94 (MQ=60)
GCATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTT > SRR4302535.1619461/1‑94 (MQ=60)
CATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTA > SRR4302535.412780/1‑94 (MQ=60)
|
CTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTA > NC_000913/3496359‑3496544
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
