Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,614,182 |
T→C |
F124L (TTC→CTC) |
nikC → |
NikC |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,614,182 | 0 | T | C | 100.0%
| 661.1
/ NA
| 207 | F124L (TTC→CTC) | nikC | NikC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (105/102); total (105/102) |
Only 100 of 217 total aligned reads displayed.
GGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTG > NC_000913/3614092‑3614271
|
ggcAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTc < 2:1417335/93‑1 (MQ=255)
ggcAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGGTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTc > 2:4686469/1‑93 (MQ=255)
cAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCtt < 2:1683539/93‑1 (MQ=255)
aGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCttt < 2:2179571/93‑1 (MQ=255)
gcgcCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTa > 1:2744529/1‑93 (MQ=255)
gcgcCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTa < 1:2047342/93‑1 (MQ=255)
cgcCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTAt < 1:3935991/93‑1 (MQ=255)
cgcCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTAt < 2:3881308/93‑1 (MQ=255)
gcCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATg < 2:421822/93‑1 (MQ=255)
cGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCCTCCCGACCTCCATTCTGTCGCTCTTTATGGt > 2:4319112/1‑93 (MQ=255)
gggTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGtt > 1:3395810/1‑93 (MQ=255)
ggTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTg > 1:2427023/1‑93 (MQ=255)
ggTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTg < 2:671230/93‑1 (MQ=255)
ggTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTg > 1:3982607/1‑93 (MQ=255)
ggTTGATTGGCGGGCGAGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGGCCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTAttgttg > 2:158559/1‑93 (MQ=255)
gTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGCTATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTttggttgg > 2:899110/1‑93 (MQ=255)
gTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTgg < 1:2801607/93‑1 (MQ=255)
ttGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGc < 2:2927684/93‑1 (MQ=255)
tGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCg > 1:213221/1‑93 (MQ=255)
tGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGGCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTggag > 1:1019767/1‑91 (MQ=255)
gATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGccg > 2:1471691/1‑91 (MQ=255)
gATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGt > 1:566170/1‑93 (MQ=255)
aTTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTg > 1:1095474/1‑93 (MQ=255)
ttGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGc < 2:3347546/93‑1 (MQ=255)
ttGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGc > 1:714220/1‑93 (MQ=255)
gcgggcgCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCg > 1:1791332/1‑93 (MQ=255)
cgggcgCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCgg < 1:1315708/93‑1 (MQ=255)
ggcgCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCa > 1:2864949/1‑93 (MQ=255)
gcgcGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCAc < 1:2908590/93‑1 (MQ=255)
gcgTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCg > 1:2298712/1‑93 (MQ=255)
gTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCggg < 2:3741944/93‑1 (MQ=255)
ttGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGc < 2:2410663/93‑1 (MQ=255)
tGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCt < 2:3286744/93‑1 (MQ=255)
gATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTg > 1:3267130/1‑93 (MQ=255)
aTCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGa < 2:2036193/93‑1 (MQ=255)
tCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGAc > 2:1865696/1‑93 (MQ=255)
cAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGAcc > 1:3473692/1‑93 (MQ=255)
aGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCa > 1:1785429/1‑93 (MQ=255)
ggCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCaa < 1:3886060/93‑1 (MQ=255)
ggCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCaa < 1:3637309/93‑1 (MQ=255)
ggCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCaa > 2:1360340/1‑93 (MQ=255)
caccaTGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCaaaga > 1:848458/1‑90 (MQ=255)
caTGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAAt > 2:861438/1‑93 (MQ=255)
aTGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAAtt > 1:3137989/1‑93 (MQ=255)
aTGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAAtt < 1:626096/93‑1 (MQ=255)
aTGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAAtt < 1:4642122/93‑1 (MQ=255)
gcgcGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTat < 1:189314/93‑1 (MQ=255)
gcgcGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTat < 2:2289380/93‑1 (MQ=255)
cgcgTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTatc < 1:2597526/93‑1 (MQ=255)
cgcgTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTatc < 1:2761464/93‑1 (MQ=255)
gcgTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTatcg > 2:71389/1‑93 (MQ=255)
cgTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTatcgc < 1:886327/93‑1 (MQ=255)
cgTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTatcgc > 1:4576924/1‑93 (MQ=255)
cGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTatcgccat < 2:4420489/93‑1 (MQ=255)
ccGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTatcgccatcg > 2:3262547/1‑93 (MQ=255)
cGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTatcgccatcgc < 1:2175622/93‑1 (MQ=255)
gATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTatcgccatcgcc > 2:3441136/1‑93 (MQ=255)
atatGTTTATGACCTTCTGGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGccc < 1:372016/93‑1 (MQ=255)
atatGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCTTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGccc < 1:3306574/93‑1 (MQ=255)
tatGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCt > 1:1488535/1‑93 (MQ=255)
tGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTCGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCtct > 2:1317043/1‑91 (MQ=255)
gTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTc < 2:3166133/93‑1 (MQ=255)
tttATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCg > 1:4437283/1‑93 (MQ=255)
tttATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGGAATTATCGTCATCGCACTGGCg > 2:4349498/1‑93 (MQ=255)
ttATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGc > 2:2230765/1‑93 (MQ=255)
gACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGGCCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTg < 2:2595127/93‑1 (MQ=255)
aCCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTgg < 1:374989/93‑1 (MQ=255)
aCCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTgg < 1:142162/93‑1 (MQ=255)
aCCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTgg < 1:4249136/93‑1 (MQ=255)
aCCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGGCGCACTgg < 2:4584840/93‑1 (MQ=255)
cTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGc > 1:2560330/1‑93 (MQ=255)
cTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGc < 2:1572131/93‑1 (MQ=255)
ttCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCg > 2:2537811/1‑93 (MQ=255)
ccGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTgg > 2:3252222/1‑93 (MQ=255)
gACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTa < 2:2806282/93‑1 (MQ=255)
gACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTa < 2:2842806/93‑1 (MQ=255)
gACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGGGGTa > 1:462399/1‑93 (MQ=255)
aCCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTAt > 2:2250421/1‑93 (MQ=255)
ccTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATg < 1:3321297/93‑1 (MQ=255)
cTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGc > 2:2002347/1‑93 (MQ=255)
tCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCa < 1:1924237/93‑1 (MQ=255)
tCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCa > 2:3987947/1‑93 (MQ=255)
cGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATGCAc > 2:77944/1‑93 (MQ=255)
gATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACg > 1:2020375/1‑93 (MQ=255)
gATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACg > 2:476622/1‑93 (MQ=255)
gATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACg > 1:2676100/1‑93 (MQ=255)
gATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGGAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACg > 2:1086172/1‑93 (MQ=255)
aTTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGc > 1:509539/1‑93 (MQ=255)
ttCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCa < 2:1775488/93‑1 (MQ=255)
ttCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCa > 2:4172762/1‑93 (MQ=255)
ttCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCa > 1:1296339/1‑93 (MQ=255)
tCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCAt < 2:1009072/93‑1 (MQ=255)
tCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCAt < 1:924199/93‑1 (MQ=255)
tCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCAt > 1:4333581/1‑93 (MQ=255)
tCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCAt < 1:4091767/93‑1 (MQ=255)
tGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATgg > 2:3688183/1‑93 (MQ=255)
gTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTTGTATGCACGCATGGt < 2:127352/93‑1 (MQ=255)
gTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGt < 2:1728667/93‑1 (MQ=255)
gTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGt < 2:1506495/93‑1 (MQ=255)
tCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTg > 1:4429922/1‑93 (MQ=255)
|
GGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTG > NC_000913/3614092‑3614271
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCA > NC_000913/3614090‑3614275
|
GCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCT < SRR4302535.1868796/94‑1 (MQ=60)
GCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCT < SRR4302535.2075051/94‑1 (MQ=60)
GCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCT > SRR4302535.3046847/1‑94 (MQ=60)
AGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTA > SRR4302535.2764093/1‑94 (MQ=60)
GCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTAT < SRR4302535.2062083/94‑1 (MQ=60)
atCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTAGATCAGACCACCATGAGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCAACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATG < SRR4302535.4714485/92‑1 (MQ=60)
GGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGACCAGGCCACCATGCGCGTCGCCTATATGTTTATGACCTTCCCGGCCTCGATTCTGTCGCTCTTTATG < SRR4302535.43714/94‑1 (MQ=60)
CGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATG < SRR4302535.3962843/94‑1 (MQ=60)
CCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGT < SRR4302535.3516325/94‑1 (MQ=60)
CCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGT < SRR4302535.625057/94‑1 (MQ=60)
CCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGGTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGT > SRR4302535.2499543/1‑94 (MQ=60)
CGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTT > SRR4302535.2817737/1‑94 (MQ=60)
CGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTT < SRR4302535.2684751/94‑1 (MQ=60)
CGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTT < SRR4302535.343801/94‑1 (MQ=60)
CGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTT > SRR4302535.3419434/1‑94 (MQ=60)
GGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTG > SRR4302535.2444512/1‑94 (MQ=60)
GGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTG > SRR4302535.4009817/1‑94 (MQ=60)
GTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGC < SRR4302535.2821535/94‑1 (MQ=60)
GTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGA > SRR4302535.2887717/1‑94 (MQ=60)
TTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCG > SRR4302535.214684/1‑94 (MQ=60)
TTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGGCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGAG > SRR4302535.1027011/1‑94 (MQ=60)
TGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGT > SRR4302535.570134/1‑94 (MQ=60)
TGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGT < SRR4302535.3535196/94‑1 (MQ=60)
GATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTG > SRR4302535.1103269/1‑94 (MQ=60)
ATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGC > SRR4302535.719236/1‑94 (MQ=60)
GGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCG > SRR4302535.1804285/1‑94 (MQ=60)
GGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCG > SRR4302535.304791/1‑94 (MQ=60)
GCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGG < SRR4302535.2172660/94‑1 (MQ=60)
CGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGC > SRR4302535.2117559/1‑94 (MQ=60)
CGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGC > SRR4302535.3765145/1‑94 (MQ=60)
CGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGC < SRR4302535.1325106/94‑1 (MQ=60)
CGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGC < SRR4302535.91647/94‑1 (MQ=60)
GGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCA > SRR4302535.2885244/1‑94 (MQ=60)
GGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCA > SRR4302535.3815011/1‑94 (MQ=60)
GCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACC < SRR4302535.4656838/94‑1 (MQ=60)
GCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACC < SRR4302535.2929147/94‑1 (MQ=60)
GCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACC < SRR4302535.747053/94‑1 (MQ=60)
CGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCG > SRR4302535.2315157/1‑94 (MQ=60)
GCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGG < SRR4302535.3998154/94‑1 (MQ=60)
CGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGG > SRR4302535.4082973/1‑94 (MQ=60)
CGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGG > SRR4302535.1870649/1‑94 (MQ=60)
TTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCT < SRR4302535.2877219/94‑1 (MQ=60)
TTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCT < SRR4302535.1541117/94‑1 (MQ=60)
TTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCT < SRR4302535.977224/94‑1 (MQ=60)
TGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTG > SRR4302535.3289826/1‑94 (MQ=60)
ATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGAC < SRR4302535.2308692/94‑1 (MQ=60)
TCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACC > SRR4302535.3497828/1‑94 (MQ=60)
CAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCA > SRR4302535.1798350/1‑94 (MQ=60)
AGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAA < SRR4302535.683348/94‑1 (MQ=60)
GGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAAC < SRR4302535.3662512/94‑1 (MQ=60)
GGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAAC < SRR4302535.3912717/94‑1 (MQ=60)
GGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAAC < SRR4302535.3192380/94‑1 (MQ=60)
CCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAAaga > SRR4302535.854426/1‑91 (MQ=60)
CACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTA < SRR4302535.892393/94‑1 (MQ=60)
CACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTA > SRR4302535.517629/1‑94 (MQ=60)
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CATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATT > SRR4302535.3159827/1‑94 (MQ=60)
ATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTA > SRR4302535.4106733/1‑94 (MQ=60)
ATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTA < SRR4302535.630451/94‑1 (MQ=60)
ATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTA < SRR4302535.4673588/94‑1 (MQ=60)
ATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTA > SRR4302535.1394018/1‑94 (MQ=60)
GCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATC < SRR4302535.1056043/94‑1 (MQ=60)
GCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATC < SRR4302535.190621/94‑1 (MQ=60)
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CGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCG < SRR4302535.4417882/94‑1 (MQ=60)
CGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCG < SRR4302535.2781140/94‑1 (MQ=60)
CGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCG > SRR4302535.3734125/1‑94 (MQ=60)
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TCGCCGATATTTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCAT < SRR4302535.1798489/94‑1 (MQ=60)
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ATATGTTTATGACCTTCTGGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCT < SRR4302535.374590/94‑1 (MQ=60)
ATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCTTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCT < SRR4302535.3329582/94‑1 (MQ=60)
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ATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCT > SRR4302535.192102/1‑94 (MQ=60)
ATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCT > SRR4302535.734804/1‑94 (MQ=60)
ATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGT > SRR4302535.4642638/1‑94 (MQ=60)
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GTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCG > SRR4302535.4467694/1‑94 (MQ=60)
ATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACT > SRR4302535.3370430/1‑94 (MQ=60)
ATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATAGCCATCGCCCTGTCGCACT > SRR4302535.1321242/1‑94 (MQ=60)
GACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGG > SRR4302535.430721/1‑94 (MQ=60)
ACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGG < SRR4302535.4278238/94‑1 (MQ=60)
ACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGG < SRR4302535.377584/94‑1 (MQ=60)
ACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGG < SRR4302535.143157/94‑1 (MQ=60)
CCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGC < SRR4302535.1302563/94‑1 (MQ=60)
CCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGC > SRR4302535.2578762/1‑94 (MQ=60)
CCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGCGC > SRR4302535.2641018/1‑94 (MQ=60)
CCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAACTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGC > SRR4302535.4580539/1‑94 (MQ=60)
CTTCCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCG > SRR4302535.3067231/1‑94 (MQ=60)
TACCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGT < SRR4302535.1790452/94‑1 (MQ=60)
CCCGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGG > SRR4302535.1938442/1‑94 (MQ=60)
CGACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGGGGTA > SRR4302535.465628/1‑94 (MQ=60)
GACCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTAT < SRR4302535.2764853/94‑1 (MQ=60)
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CCTCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGC < SRR4302535.3344406/94‑1 (MQ=60)
TCGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCAC < SRR4302535.1432751/94‑1 (MQ=60)
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CGATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACG > SRR4302535.2034943/1‑94 (MQ=60)
GATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGC > SRR4302535.513101/1‑94 (MQ=60)
ATTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCA > SRR4302535.1305586/1‑94 (MQ=60)
TTCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCAT > SRR4302535.4363218/1‑94 (MQ=60)
TTCTGTCGCTCTTTATGGATGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGCACTTATCGCCATCCCCCTGTCGCACTAAGCGTGGTATGCACGCAT > SRR4302535.450310/1‑94 (MQ=60)
TCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATG < SRR4302535.930745/94‑1 (MQ=60)
TCTGTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATG < SRR4302535.4119764/94‑1 (MQ=60)
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GTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTG > SRR4302535.4460273/1‑94 (MQ=60)
GTCGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCCTGGGATGCACGCATGGTG > SRR4302535.2343996/1‑94 (MQ=60)
CGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCG > SRR4302535.2215938/1‑94 (MQ=60)
CGCTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCG < SRR4302535.4672776/94‑1 (MQ=60)
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GCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCA > NC_000913/3614090‑3614275
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
