Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,660,679 |
T→C |
L879P (CTG→CCG) |
yhiV → |
putative transport system permease protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,660,679 | 0 | T | C | 99.6%
| 703.9
/ ‑4.8
| 224 | L879P (CTG→CCG) | yhiV | putative transport system permease protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (132/90); total (134/90) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.84e-01 |
Only 100 of 228 total aligned reads displayed.
TTCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACTGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCGTTG > NC_000913/3660589‑3660768
|
ttCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGTCCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTAAGCGATTTCACCgg < 2:4604928/93‑1 (MQ=255)
ttCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCgg < 1:364086/93‑1 (MQ=255)
ttCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCgg < 1:2941606/93‑1 (MQ=255)
ggCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCgt > 2:4162442/1‑93 (MQ=255)
cAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCgtgg < 1:3980375/93‑1 (MQ=255)
aGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCgtggt > 1:4429303/1‑93 (MQ=255)
aGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCgtggt > 1:215255/1‑93 (MQ=255)
ggCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCgtggtg < 2:1746183/93‑1 (MQ=255)
ggCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCgtggtg > 1:1917351/1‑93 (MQ=255)
gTCTGCGACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGAGTTCACCGGTCGTGGTGTTc < 2:4563893/93‑1 (MQ=255)
tCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcc < 1:760828/93‑1 (MQ=255)
tCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcc < 2:3715607/93‑1 (MQ=255)
cGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcct < 1:4375571/93‑1 (MQ=255)
ggCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcctc > 1:1441241/1‑93 (MQ=255)
gCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcctcg > 2:588333/1‑93 (MQ=255)
tACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcctcgcc < 2:2108523/93‑1 (MQ=255)
aCTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcctcgccc > 2:1980966/1‑93 (MQ=255)
aCTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcctcgccc < 1:3070389/93‑1 (MQ=255)
cTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcctcgccct < 1:4398934/93‑1 (MQ=255)
aTGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcctcgccctcgc > 1:1359767/1‑93 (MQ=255)
tGGATCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGGTCctcgccctcgcc > 2:4119005/1‑93 (MQ=255)
ccGGACTATCGTATCAGGAAGGGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGGGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTNNTGTTCCTCGCCCTCNCNGNAc > 1:1637156/1‑93 (MQ=255)
ccGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCAc < 1:4524967/93‑1 (MQ=255)
ccGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCAc > 2:1832121/1‑93 (MQ=255)
ccGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCAc > 1:2829621/1‑93 (MQ=255)
ggACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCActc > 2:1907006/1‑93 (MQ=255)
ggACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCActc < 1:2333890/93‑1 (MQ=255)
aCTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTa < 2:438627/93‑1 (MQ=255)
cTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTAt > 2:1512679/1‑93 (MQ=255)
tATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATg > 2:298642/1‑93 (MQ=255)
aTCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATga > 1:519417/1‑93 (MQ=255)
aTCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATga < 2:2427427/93‑1 (MQ=255)
tCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATgag > 1:3269391/1‑93 (MQ=255)
tCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATgag > 2:3177955/1‑93 (MQ=255)
tCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATgag > 1:4572271/1‑93 (MQ=255)
gTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGagag > 1:1194196/1‑93 (MQ=255)
aTCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCt > 2:1416499/1‑93 (MQ=255)
aTCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCt > 2:7609/1‑93 (MQ=255)
tCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTg > 2:3410012/1‑93 (MQ=255)
tCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTg > 1:1459529/1‑93 (MQ=255)
tCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTg > 2:4062665/1‑93 (MQ=255)
tCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTg > 2:382229/1‑93 (MQ=255)
cAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTgg < 2:326190/93‑1 (MQ=255)
aGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGt < 2:3982099/93‑1 (MQ=255)
ggAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTc > 2:2306611/1‑93 (MQ=255)
ggAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTc > 1:4129764/1‑93 (MQ=255)
ggAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTc > 2:4443137/1‑93 (MQ=255)
gAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCa > 2:1646023/1‑93 (MQ=255)
aGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAAt > 2:356097/1‑93 (MQ=255)
aGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAAt > 2:1201477/1‑93 (MQ=255)
gCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAAtt > 1:1017817/1‑93 (MQ=255)
gCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAAtt < 1:3463822/93‑1 (MQ=255)
gTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTcc < 1:1235031/93‑1 (MQ=255)
gTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTcc > 1:255425/1‑93 (MQ=255)
ttATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCg > 1:4070907/1‑93 (MQ=255)
ttATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCg > 2:2821027/1‑93 (MQ=255)
ttATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCATGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCg > 1:4357932/1‑93 (MQ=255)
aTCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGtt < 1:3489666/93‑1 (MQ=255)
aTCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGtt > 2:3136079/1‑93 (MQ=255)
aTCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGtt < 2:4236859/93‑1 (MQ=255)
aTCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGtt > 1:2777091/1‑93 (MQ=255)
tCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTtc > 2:4023188/1‑93 (MQ=255)
aaTCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTg > 1:823249/1‑93 (MQ=255)
aaTCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTg > 1:114993/1‑93 (MQ=255)
aGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATgt < 1:4192459/93‑1 (MQ=255)
aGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATgt > 1:978701/1‑93 (MQ=255)
ggCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATgtt < 2:2130881/93‑1 (MQ=255)
ggCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATgtt > 1:3682069/1‑93 (MQ=255)
ggCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATgtt < 2:4002907/93‑1 (MQ=255)
ggCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATgtt < 1:1763405/93‑1 (MQ=255)
gCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATgttg > 2:512241/1‑93 (MQ=255)
tCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATgttggt > 2:2625046/1‑93 (MQ=255)
tCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATgttggt > 2:3489954/1‑93 (MQ=255)
ccTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATgttggtt < 1:699833/93‑1 (MQ=255)
ccTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATgttggtt < 2:2803565/93‑1 (MQ=255)
ccTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATgttggtt > 1:342261/1‑93 (MQ=255)
cTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATgttggttg > 1:1121073/1‑93 (MQ=255)
tGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGgttgt < 2:3768812/93‑1 (MQ=255)
tGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGgttgt < 2:4634130/93‑1 (MQ=255)
cgcTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTc > 2:112066/1‑93 (MQ=255)
gcTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTcc > 2:3651083/1‑93 (MQ=255)
gcTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTcc < 1:2343418/93‑1 (MQ=255)
gcTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTcc > 2:2920922/1‑93 (MQ=255)
tGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGt > 2:1290040/1‑93 (MQ=255)
tATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTa > 2:2521073/1‑93 (MQ=255)
aTGCGATTTCAGCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAg < 1:3434274/93‑1 (MQ=255)
aTGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAg < 1:265185/93‑1 (MQ=255)
aTGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAg < 2:684684/93‑1 (MQ=255)
tGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAgg < 2:2698799/93‑1 (MQ=255)
gccaTTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGc < 2:3121059/90‑1 (MQ=255)
gATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGcgt < 2:1102595/93‑1 (MQ=255)
aTTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGcgtc > 2:2768846/1‑93 (MQ=255)
aTTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGcgtc > 1:4033721/1‑93 (MQ=255)
aTTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGcgtc > 1:1780963/1‑93 (MQ=255)
aTTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGcgtc > 2:935824/1‑93 (MQ=255)
tttCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGcgtcg > 1:2954570/1‑93 (MQ=255)
ttCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCGCTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGcgtcgt < 1:3062219/93‑1 (MQ=255)
ttCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGcgtcgt > 2:2913931/1‑93 (MQ=255)
tCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCGtt < 2:3007578/93‑1 (MQ=255)
cACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCGTTg < 1:2469112/93‑1 (MQ=255)
|
TTCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACTGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCGTTG > NC_000913/3660589‑3660768
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AACTTCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACTGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCGTTGG > NC_000913/3660586‑3660769
|
AACTTCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACC < SRR4302535.1004286/94‑1 (MQ=60)
AACTTCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACC < SRR4302535.2501292/94‑1 (MQ=60)
AACTTCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACC > SRR4302535.4415872/1‑94 (MQ=60)
ACTTCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCG < SRR4302535.2617469/94‑1 (MQ=60)
CTTCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGGCCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGG > SRR4302535.2406661/1‑94 (MQ=60)
CTTCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTAGCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCGCCTGTTCTGTATGCGATTTCACCGG < SRR4302535.1576572/94‑1 (MQ=60)
TTCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGT < SRR4302535.2962287/94‑1 (MQ=60)
TTCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGT < SRR4302535.366594/94‑1 (MQ=60)
TCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTC < SRR4302535.1116489/94‑1 (MQ=60)
CCGGCAGGCGTCGGCTGCTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCG < SRR4302535.3395713/94‑1 (MQ=60)
GGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTG > SRR4302535.283095/1‑94 (MQ=60)
GGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTG < SRR4302535.728394/94‑1 (MQ=60)
GCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGG < SRR4302535.1132137/94‑1 (MQ=60)
CAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGT < SRR4302535.3391463/94‑1 (MQ=60)
CAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGT > SRR4302535.4459648/1‑94 (MQ=60)
CAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGT < SRR4302535.4007569/94‑1 (MQ=60)
CAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGT > SRR4302535.216729/1‑94 (MQ=60)
CAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGT < SRR4302535.4465020/94‑1 (MQ=60)
CAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGT < SRR4302535.1179012/94‑1 (MQ=60)
AGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTG > SRR4302535.1931167/1‑94 (MQ=60)
TCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCT < SRR4302535.2540219/94‑1 (MQ=60)
TCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCT < SRR4302535.766190/94‑1 (MQ=60)
TCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCT > SRR4302535.2254995/1‑94 (MQ=60)
CGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGgtaccc > SRR4302535.4436459/1‑88 (MQ=60)
CGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTC < SRR4302535.4405510/94‑1 (MQ=60)
CGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTC > SRR4302535.1451550/1‑94 (MQ=60)
CTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCC > SRR4302535.1000078/1‑94 (MQ=60)
TACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCC < SRR4302535.1480759/94‑1 (MQ=60)
TACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCC > SRR4302535.2615704/1‑94 (MQ=60)
ACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCT < SRR4302535.3091832/94‑1 (MQ=60)
CTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTC < SRR4302535.4429043/94‑1 (MQ=60)
TCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCG < SRR4302535.795177/94‑1 (MQ=60)
CATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGC > SRR4302535.1369491/1‑94 (MQ=60)
GACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCA > SRR4302535.1800310/1‑94 (MQ=60)
GACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCA > SRR4302535.456570/1‑94 (MQ=60)
GACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCA > SRR4302535.4062709/1‑94 (MQ=60)
ACCGGACTATCGTATCAGGAAGGGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGGGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTNNTGTTCCTCGCCCTCNCNGNAC > SRR4302535.1648983/1‑94 (MQ=60)
ACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCAC > SRR4302535.2849705/1‑94 (MQ=60)
CCGGACTATCGTATCAGGAAGCTTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCGCT < SRR4302535.2567931/94‑1 (MQ=60)
CCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACT < SRR4302535.4555966/94‑1 (MQ=60)
GGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCT < SRR4302535.2350591/94‑1 (MQ=60)
TATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGA > SRR4302535.523051/1‑94 (MQ=60)
TATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGA < SRR4302535.2962539/94‑1 (MQ=60)
ATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAG > SRR4302535.4069049/1‑94 (MQ=60)
ATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAG > SRR4302535.3292103/1‑94 (MQ=60)
ATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAG < SRR4302535.2886791/94‑1 (MQ=60)
ATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAG > SRR4302535.4603442/1‑94 (MQ=60)
CGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAG > SRR4302535.1202751/1‑94 (MQ=60)
TATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCT > SRR4302535.3084356/1‑94 (MQ=60)
TATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCT < SRR4302535.34505/94‑1 (MQ=60)
TATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCT > SRR4302535.3751767/1‑94 (MQ=60)
TATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCT > SRR4302535.2761631/1‑94 (MQ=60)
TATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCT > SRR4302535.2352946/1‑94 (MQ=60)
ATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTG > SRR4302535.1469985/1‑94 (MQ=60)
ATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTG > SRR4302535.461820/1‑94 (MQ=60)
ATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGAGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTG > SRR4302535.3503328/1‑94 (MQ=60)
AGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTC > SRR4302535.4158023/1‑94 (MQ=60)
AGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATT > SRR4302535.1025052/1‑94 (MQ=60)
AGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGAGTTCACCGGTCGTGGTGCTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATT < SRR4302535.798260/94‑1 (MQ=60)
GCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTC < SRR4302535.3487897/94‑1 (MQ=60)
CGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCC > SRR4302535.257185/1‑94 (MQ=60)
GTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCG < SRR4302535.1243856/94‑1 (MQ=60)
GTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCG > SRR4302535.4098765/1‑94 (MQ=60)
GTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCT‑GCCCTCGCCcgactccatgaggggtgggcaaatccgt > SRR4302535.1780624/1‑66 (MQ=60)
GTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCATGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCG > SRR4302535.4387767/1‑94 (MQ=60)
TTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGT > SRR4302535.4361304/1‑94 (MQ=60)
TTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGT > SRR4302535.210902/1‑94 (MQ=60)
TATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTT > SRR4302535.2796861/1‑94 (MQ=60)
TATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCAGTT < SRR4302535.1459539/94‑1 (MQ=60)
ATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTC < SRR4302535.3513914/94‑1 (MQ=60)
CCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTC < SRR4302535.54829/94‑1 (MQ=60)
CTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCG > SRR4302535.305908/1‑94 (MQ=60)
TCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACTGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGG > SRR4302535.175393/1‑94 (MQ=60)
AAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTG > SRR4302535.115800/1‑94 (MQ=60)
AAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTG > SRR4302535.829019/1‑94 (MQ=60)
ATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGAT < SRR4302535.4140383/94‑1 (MQ=60)
CAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGT > SRR4302535.985659/1‑94 (MQ=60)
AGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTT > SRR4302535.3707551/1‑94 (MQ=60)
AGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTT > SRR4302535.1648779/1‑94 (MQ=60)
AGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTT < SRR4302535.4221149/94‑1 (MQ=60)
GGCTCCTGCGCTGTATTCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTG < SRR4302535.699815/94‑1 (MQ=60)
GGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTG < SRR4302535.1776178/94‑1 (MQ=60)
GCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGG‑GGTCCTCGCCCTTGGCGCACTCTAatggggcttgtcaatttccgtcttggttgtgttggt > SRR4302535.1760391/1‑58 (MQ=26)
CTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGT > SRR4302535.4396101/1‑94 (MQ=60)
TCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTT > SRR4302535.344633/1‑94 (MQ=60)
CCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTG > SRR4302535.1129068/1‑94 (MQ=60)
CCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTG < SRR4302535.704743/94‑1 (MQ=60)
CCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTG > SRR4302535.3691989/1‑94 (MQ=60)
CTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGT < SRR4302535.3106334/94‑1 (MQ=60)
TGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTT > SRR4302535.892899/1‑94 (MQ=60)
CGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCC < SRR4302535.4504317/94‑1 (MQ=60)
CGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCC < SRR4302535.4307929/94‑1 (MQ=60)
GCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCG < SRR4302535.2360188/94‑1 (MQ=60)
CTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGT > SRR4302535.4429579/1‑94 (MQ=60)
CTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGT > SRR4302535.3659587/1‑94 (MQ=60)
CTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGT > SRR4302535.3486240/1‑94 (MQ=60)
TGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTT < SRR4302535.134874/94‑1 (MQ=60)
GTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTA > SRR4302535.4426402/1‑94 (MQ=60)
GTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTA > SRR4302535.123865/1‑94 (MQ=60)
TATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAG > SRR4302535.2400505/1‑94 (MQ=60)
ATGCGATTTCAGCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGG < SRR4302535.3458141/94‑1 (MQ=60)
ATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGG < SRR4302535.4016231/94‑1 (MQ=60)
ATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGG < SRR4302535.140031/94‑1 (MQ=60)
ATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGG < SRR4302535.267027/94‑1 (MQ=60)
ATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGG > SRR4302535.3044118/1‑94 (MQ=60)
TGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGG > SRR4302535.4201092/1‑94 (MQ=60)
GCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCG > SRR4302535.1831143/1‑94 (MQ=60)
GATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTC > SRR4302535.1793851/1‑94 (MQ=60)
GATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTC > SRR4302535.4061322/1‑94 (MQ=60)
ATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCG > SRR4302535.2975322/1‑94 (MQ=60)
ATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCG > SRR4302535.1212062/1‑94 (MQ=60)
TTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCGCTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCGTT < SRR4302535.3083630/94‑1 (MQ=60)
TTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCGTT > SRR4302535.2782536/1‑94 (MQ=60)
TCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGCGATGTTGGTTGTTCCGTTAtgcggcggtg > SRR4302535.3559706/1‑84 (MQ=60)
CACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCGTTGG < SRR4302535.2486913/94‑1 (MQ=60)
|
AACTTCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACTGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCGTTGG > NC_000913/3660586‑3660769
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
